MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017269	CAACC	2	10	847727	847736	40 %	0 %	0 %	60 %	384423282
16002	NC_017269	AGC	2	6	847834	847839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423282
16003	NC_017269	A	6	6	847921	847926	100 %	0 %	0 %	0 %	384423282
16004	NC_017269	TCCT	2	8	847956	847963	0 %	50 %	0 %	50 %	384423282
16005	NC_017269	CCGA	2	8	847988	847995	25 %	0 %	25 %	50 %	384423282
16006	NC_017269	TCTAC	2	10	848024	848033	20 %	40 %	0 %	40 %	384423282
16007	NC_017269	A	6	6	848100	848105	100 %	0 %	0 %	0 %	384423282
16008	NC_017269	CCA	2	6	848272	848277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423282
16009	NC_017269	AAG	2	6	848344	848349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423282
16010	NC_017269	TCGA	2	8	848497	848504	25 %	25 %	25 %	25 %	384423282
16011	NC_017269	ACC	2	6	848520	848525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423282
16012	NC_017269	CGG	2	6	848540	848545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423282
16013	NC_017269	GCA	2	6	848594	848599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423282
16014	NC_017269	TGA	2	6	848666	848671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423282
16015	NC_017269	GAT	2	6	848715	848720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423282
16016	NC_017269	ACTC	2	8	848759	848766	25 %	25 %	0 %	50 %	384423282
16017	NC_017269	T	6	6	848837	848842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_017269	A	6	6	848889	848894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_017269	ATT	2	6	848903	848908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423283
16020	NC_017269	T	6	6	848925	848930	0 %	100 %	0 %	0 %	384423283
16021	NC_017269	GGTA	2	8	848972	848979	25 %	25 %	50 %	0 %	384423283
16022	NC_017269	TGT	2	6	849026	849031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423283
16023	NC_017269	CAT	2	6	849035	849040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423283
16024	NC_017269	A	7	7	849236	849242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_017269	TTGG	2	8	849348	849355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_017269	T	6	6	849377	849382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_017269	CTTA	2	8	849407	849414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16028	NC_017269	TTTG	2	8	849449	849456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_017269	CAT	2	6	849491	849496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_017269	GCA	2	6	849544	849549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423284
16031	NC_017269	CA	3	6	849572	849577	50 %	0 %	0 %	50 %	384423284
16032	NC_017269	CAAC	2	8	849601	849608	50 %	0 %	0 %	50 %	384423284
16033	NC_017269	TGG	2	6	849642	849647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423284
16034	NC_017269	CAC	2	6	849650	849655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423284
16035	NC_017269	CGT	2	6	849714	849719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423284
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16038	NC_017269	ACA	2	6	849788	849793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423284
16039	NC_017269	CTT	2	6	849795	849800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423284
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16041	NC_017269	CTG	2	6	849835	849840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423284
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16044	NC_017269	GTG	2	6	849926	849931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423284
16045	NC_017269	TCT	2	6	849970	849975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423284
16046	NC_017269	CT	4	8	849974	849981	0 %	50 %	0 %	50 %	384423284
16047	NC_017269	ATCA	2	8	850051	850058	50 %	25 %	0 %	25 %	384423284
16048	NC_017269	CTG	2	6	850096	850101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423284
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16050	NC_017269	GGCACT	2	12	850143	850154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384423284
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16052	NC_017269	ACC	2	6	850181	850186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423284
16053	NC_017269	CTGCA	2	10	850199	850208	20 %	20 %	20 %	40 %	384423284
16054	NC_017269	GT	3	6	850231	850236	0 %	50 %	50 %	0 %	384423284
16055	NC_017269	TCAA	2	8	850329	850336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16056	NC_017269	TAA	2	6	850339	850344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_017269	CGC	2	6	850353	850358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16058	NC_017269	TC	3	6	850379	850384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_017269	AAG	2	6	850415	850420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_017269	CTT	2	6	850570	850575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423285
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16080	NC_017269	A	6	6	851715	851720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_017269	TCC	2	6	851731	851736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16082	NC_017269	TCG	2	6	851745	851750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16090	NC_017269	ACAA	2	8	852155	852162	75 %	0 %	0 %	25 %	384423286
16091	NC_017269	ATC	2	6	852293	852298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423286
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16093	NC_017269	CCT	2	6	852498	852503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423286
16094	NC_017269	CAA	2	6	852528	852533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423286
16095	NC_017269	TAA	2	6	852577	852582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423286
16096	NC_017269	T	7	7	852616	852622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_017269	TCA	2	6	852631	852636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_017269	ATATG	2	10	852717	852726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_017269	A	7	7	852734	852740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16101	NC_017269	ATC	3	9	852844	852852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_017269	AGA	2	6	852881	852886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_017269	ACC	2	6	852991	852996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16104	NC_017269	TAC	3	9	853075	853083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_017269	TTA	2	6	853127	853132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_017269	ACC	2	6	853153	853158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_017269	CAT	2	6	853254	853259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_017269	GTA	2	6	853283	853288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_017269	GC	3	6	853318	853323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16110	NC_017269	TCA	2	6	853410	853415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_017269	CAGTT	2	10	853418	853427	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16112	NC_017269	GAA	2	6	853530	853535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_017269	TAT	2	6	853540	853545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_017269	AG	3	6	853568	853573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_017269	ACC	3	9	853604	853612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16116	NC_017269	GTA	2	6	853667	853672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_017269	CTT	2	6	853696	853701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_017269	ATTGA	2	10	853734	853743	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_017269	T	6	6	853774	853779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_017269	TCA	2	6	853786	853791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_017269	TAG	2	6	853864	853869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_017269	GAC	2	6	853889	853894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_017269	T	7	7	853903	853909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_017269	GCA	2	6	854020	854025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_017269	ACTT	2	8	854031	854038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16126	NC_017269	T	6	6	854037	854042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_017269	GCA	2	6	854121	854126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16129	NC_017269	TGT	2	6	854159	854164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16131	NC_017269	TCC	2	6	854206	854211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16132	NC_017269	G	6	6	854228	854233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_017269	TGT	2	6	854262	854267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16234	NC_017269	TACC	2	8	859672	859679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16253	NC_017269	ATC	2	6	861002	861007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423289
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16498	NC_017269	TCA	2	6	872856	872861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423299
16499	NC_017269	CAAAGT	2	12	872871	872882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384423299
16500	NC_017269	CCG	2	6	872924	872929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423299

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