MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017269	TGC	2	6	823127	823132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423254
15502	NC_017269	GCA	2	6	823139	823144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423254
15503	NC_017269	ATA	2	6	823191	823196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423254
15504	NC_017269	GA	3	6	823219	823224	50 %	0 %	50 %	0 %	384423254
15505	NC_017269	TGC	2	6	823232	823237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423254
15506	NC_017269	AACTC	2	10	823307	823316	40 %	20 %	0 %	40 %	384423254
15507	NC_017269	GCC	2	6	823327	823332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423254
15508	NC_017269	ATT	2	6	823408	823413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_017269	CAAT	2	8	823427	823434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15510	NC_017269	ACG	3	9	823606	823614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423255
15511	NC_017269	ACC	2	6	823620	823625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423255
15512	NC_017269	AAAG	2	8	823665	823672	75 %	0 %	25 %	0 %	384423255
15513	NC_017269	CAT	2	6	823700	823705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423255
15514	NC_017269	GCAGC	2	10	823772	823781	20 %	0 %	40 %	40 %	384423255
15515	NC_017269	A	6	6	823798	823803	100 %	0 %	0 %	0 %	384423255
15516	NC_017269	CAA	2	6	823860	823865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423255
15517	NC_017269	A	7	7	823877	823883	100 %	0 %	0 %	0 %	384423255
15518	NC_017269	CGC	2	6	823924	823929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423255
15519	NC_017269	GCT	2	6	823973	823978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423255
15520	NC_017269	TGA	2	6	824012	824017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423255
15521	NC_017269	GC	3	6	824053	824058	0 %	0 %	50 %	50 %	384423255
15522	NC_017269	TTG	2	6	824127	824132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_017269	AGG	2	6	824165	824170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_017269	ATT	2	6	824183	824188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423256
15525	NC_017269	AACC	2	8	824191	824198	50 %	0 %	0 %	50 %	384423256
15526	NC_017269	AAC	2	6	824206	824211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423256
15527	NC_017269	GTG	2	6	824229	824234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423256
15528	NC_017269	CGCA	2	8	824252	824259	25 %	0 %	25 %	50 %	384423256
15529	NC_017269	CCCAA	2	10	824280	824289	40 %	0 %	0 %	60 %	384423256
15530	NC_017269	CAA	2	6	824307	824312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423256
15531	NC_017269	GAT	2	6	824358	824363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423256
15532	NC_017269	ACA	2	6	824444	824449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423256
15533	NC_017269	TGG	2	6	824596	824601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423256
15534	NC_017269	GTG	2	6	824646	824651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423256
15535	NC_017269	GGC	2	6	824666	824671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423256
15536	NC_017269	ATC	2	6	824761	824766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423256
15537	NC_017269	TGG	2	6	824780	824785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423256
15538	NC_017269	GTG	2	6	824820	824825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423256
15539	NC_017269	GTCA	2	8	824832	824839	25 %	25 %	25 %	25 %	384423256
15540	NC_017269	TTA	2	6	824881	824886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423256
15541	NC_017269	CAA	2	6	824920	824925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423256
15542	NC_017269	GAT	2	6	824994	824999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423256
15543	NC_017269	TCG	2	6	825061	825066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423256
15544	NC_017269	GC	3	6	825086	825091	0 %	0 %	50 %	50 %	384423256
15545	NC_017269	TGG	2	6	825221	825226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423256
15546	NC_017269	CGC	2	6	825312	825317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15547	NC_017269	AAC	2	6	825418	825423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_017269	CCA	2	6	825448	825453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15549	NC_017269	GCA	2	6	825485	825490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_017269	TTGA	2	8	825510	825517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_017269	GCGTAA	2	12	825521	825532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15552	NC_017269	AATCGA	2	12	825627	825638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15553	NC_017269	CA	3	6	825714	825719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15554	NC_017269	CAT	2	6	825738	825743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_017269	CG	3	6	825800	825805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15556	NC_017269	A	6	6	825919	825924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_017269	TGC	2	6	825928	825933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_017269	T	6	6	825960	825965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_017269	ATCA	2	8	825993	826000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15560	NC_017269	CGCC	2	8	826061	826068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15561	NC_017269	GTG	2	6	826072	826077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_017269	GC	3	6	826202	826207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15563	NC_017269	GGC	2	6	826292	826297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_017269	GCA	2	6	826325	826330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_017269	ATA	2	6	826370	826375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_017269	TCA	2	6	826381	826386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15567	NC_017269	TGA	2	6	826440	826445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_017269	A	6	6	826477	826482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_017269	ACG	2	6	826583	826588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_017269	CT	3	6	826700	826705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15571	NC_017269	CCCA	2	8	826799	826806	25 %	0 %	0 %	75 %	384423257
15572	NC_017269	TC	3	6	826903	826908	0 %	50 %	0 %	50 %	384423257
15573	NC_017269	TGG	2	6	826930	826935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423257
15574	NC_017269	TATTGG	2	12	827005	827016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384423257
15575	NC_017269	CTG	2	6	827049	827054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423257
15576	NC_017269	CCA	2	6	827057	827062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423257
15577	NC_017269	GTTG	2	8	827095	827102	0 %	50 %	50 %	0 %	384423257
15578	NC_017269	TGA	2	6	827209	827214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423257
15579	NC_017269	TGTA	2	8	827233	827240	25 %	50 %	25 %	0 %	384423257
15580	NC_017269	TGGC	2	8	827313	827320	0 %	25 %	50 %	25 %	384423257
15581	NC_017269	TTACG	2	10	827324	827333	20 %	40 %	20 %	20 %	384423257
15582	NC_017269	A	6	6	827361	827366	100 %	0 %	0 %	0 %	384423257
15583	NC_017269	TGA	2	6	827398	827403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423257
15584	NC_017269	TCG	2	6	827413	827418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423257
15585	NC_017269	GAA	2	6	827484	827489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423257
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15587	NC_017269	TGC	2	6	827591	827596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423257
15588	NC_017269	ACC	2	6	827616	827621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423257
15589	NC_017269	TTGCGG	2	12	827644	827655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384423257
15590	NC_017269	TCACCG	2	12	827770	827781	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384423257
15591	NC_017269	TGG	2	6	827803	827808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423257
15592	NC_017269	TGG	2	6	827816	827821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423257
15593	NC_017269	TGA	2	6	827831	827836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423257
15594	NC_017269	ATCTCA	2	12	827878	827889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423257
15595	NC_017269	ATG	2	6	827974	827979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423257
15596	NC_017269	AG	3	6	827981	827986	50 %	0 %	50 %	0 %	384423257
15597	NC_017269	GCA	2	6	828043	828048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423257
15598	NC_017269	ACA	2	6	828100	828105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423257
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15601	NC_017269	CT	3	6	828249	828254	0 %	50 %	0 %	50 %	384423257
15602	NC_017269	GGA	2	6	828255	828260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423257
15603	NC_017269	TC	3	6	828280	828285	0 %	50 %	0 %	50 %	384423257
15604	NC_017269	GCG	2	6	828357	828362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423257
15605	NC_017269	AG	3	6	828368	828373	50 %	0 %	50 %	0 %	384423257
15606	NC_017269	GATTGC	2	12	828404	828415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384423257
15607	NC_017269	TTG	2	6	828475	828480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423257
15608	NC_017269	TGA	2	6	828566	828571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423257
15609	NC_017269	AGA	2	6	828581	828586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423257
15610	NC_017269	TTA	2	6	828767	828772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423258
15611	NC_017269	CCAT	2	8	828881	828888	25 %	25 %	0 %	50 %	384423258
15612	NC_017269	GCC	2	6	828958	828963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423258
15613	NC_017269	TGA	2	6	828974	828979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423258
15614	NC_017269	T	6	6	828988	828993	0 %	100 %	0 %	0 %	384423258
15615	NC_017269	GC	3	6	829037	829042	0 %	0 %	50 %	50 %	384423258
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15989	NC_017269	AGA	2	6	846896	846901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423282
15990	NC_017269	GAA	2	6	846999	847004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423282
15991	NC_017269	TG	3	6	847048	847053	0 %	50 %	50 %	0 %	384423282
15992	NC_017269	CG	3	6	847086	847091	0 %	0 %	50 %	50 %	384423282
15993	NC_017269	AG	3	6	847154	847159	50 %	0 %	50 %	0 %	384423282
15994	NC_017269	GCATG	2	10	847223	847232	20 %	20 %	40 %	20 %	384423282
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15997	NC_017269	GGA	3	9	847508	847516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423282
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15999	NC_017269	TCG	2	6	847613	847618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423282
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