MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017269	A	7	7	796876	796882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_017269	ATC	2	6	796913	796918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_017269	TTTA	2	8	796920	796927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15007	NC_017269	CTGA	2	8	797050	797057	25 %	25 %	25 %	25 %	384423237
15008	NC_017269	TGC	2	6	797132	797137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423237
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15012	NC_017269	TGCG	2	8	797339	797346	0 %	25 %	50 %	25 %	384423237
15013	NC_017269	CAGC	2	8	797349	797356	25 %	0 %	25 %	50 %	384423237
15014	NC_017269	CGC	2	6	797422	797427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423237
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15017	NC_017269	GCA	2	6	797528	797533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423237
15018	NC_017269	TGGCT	2	10	797562	797571	0 %	40 %	40 %	20 %	384423237
15019	NC_017269	CT	3	6	797573	797578	0 %	50 %	0 %	50 %	384423237
15020	NC_017269	AGA	2	6	797638	797643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423237
15021	NC_017269	TTCA	2	8	797680	797687	25 %	50 %	0 %	25 %	384423237
15022	NC_017269	TCA	2	6	797748	797753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423237
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15034	NC_017269	CAT	2	6	798372	798377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423237
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15039	NC_017269	A	6	6	798661	798666	100 %	0 %	0 %	0 %	384423238
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15042	NC_017269	AAT	2	6	798772	798777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_017269	TTG	2	6	798838	798843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_017269	AG	4	8	798862	798869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_017269	CAT	2	6	798940	798945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423239
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15092	NC_017269	GCTC	2	8	801117	801124	0 %	25 %	25 %	50 %	384423239
15093	NC_017269	ATCG	2	8	801140	801147	25 %	25 %	25 %	25 %	384423239
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15106	NC_017269	TCAA	2	8	801692	801699	50 %	25 %	0 %	25 %	384423240
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15120	NC_017269	ATCC	2	8	802157	802164	25 %	25 %	0 %	50 %	384423241
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15122	NC_017269	GAA	2	6	802190	802195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423241
15123	NC_017269	AAC	2	6	802356	802361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423241
15124	NC_017269	CGG	2	6	802438	802443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423241
15125	NC_017269	TCA	2	6	802557	802562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423241
15126	NC_017269	GTG	2	6	802619	802624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423241
15127	NC_017269	TTG	2	6	802629	802634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423241
15128	NC_017269	AC	3	6	802719	802724	50 %	0 %	0 %	50 %	384423241
15129	NC_017269	CAG	2	6	802840	802845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423241
15130	NC_017269	CAAG	2	8	802891	802898	50 %	0 %	25 %	25 %	384423241
15131	NC_017269	GAA	2	6	803044	803049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423241
15132	NC_017269	ATC	2	6	803114	803119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423241
15133	NC_017269	TCA	2	6	803137	803142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423241
15134	NC_017269	CA	3	6	803145	803150	50 %	0 %	0 %	50 %	384423241
15135	NC_017269	GAA	2	6	803192	803197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423241
15136	NC_017269	CGG	2	6	803245	803250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423241
15137	NC_017269	GATTGC	2	12	803263	803274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384423241
15138	NC_017269	CCTT	2	8	803294	803301	0 %	50 %	0 %	50 %	384423241
15139	NC_017269	TTG	2	6	803306	803311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423241
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15142	NC_017269	A	6	6	803531	803536	100 %	0 %	0 %	0 %	384423241
15143	NC_017269	GCT	2	6	803543	803548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423241
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15146	NC_017269	TTA	2	6	803613	803618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15147	NC_017269	TGAA	2	8	803620	803627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15148	NC_017269	GCC	2	6	803671	803676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15149	NC_017269	ACA	2	6	803678	803683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15150	NC_017269	T	6	6	803707	803712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_017269	TGC	2	6	803722	803727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15152	NC_017269	TTA	2	6	803815	803820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423242
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15154	NC_017269	TTGG	2	8	803895	803902	0 %	50 %	50 %	0 %	384423242
15155	NC_017269	CCA	2	6	803954	803959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423242
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15157	NC_017269	TCAT	2	8	804052	804059	25 %	50 %	0 %	25 %	384423242
15158	NC_017269	TAA	2	6	804155	804160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423242
15159	NC_017269	TC	3	6	804210	804215	0 %	50 %	0 %	50 %	384423242
15160	NC_017269	CTT	2	6	804254	804259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423242
15161	NC_017269	CAT	2	6	804263	804268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423242
15162	NC_017269	CGG	2	6	804329	804334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423242
15163	NC_017269	TGC	2	6	804361	804366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423242
15164	NC_017269	ACA	2	6	804445	804450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423242
15165	NC_017269	TCA	2	6	804473	804478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423242
15166	NC_017269	TTCC	2	8	804561	804568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15167	NC_017269	AGC	2	6	804577	804582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15170	NC_017269	TCTGC	2	10	804654	804663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15171	NC_017269	TGAT	2	8	804667	804674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15172	NC_017269	CTG	2	6	804756	804761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15174	NC_017269	AGT	2	6	804770	804775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15176	NC_017269	TCG	2	6	804890	804895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15182	NC_017269	AAC	2	6	805114	805119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15183	NC_017269	TTCA	2	8	805162	805169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15184	NC_017269	GGC	2	6	805210	805215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15189	NC_017269	CGAGC	2	10	805623	805632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15190	NC_017269	TTC	2	6	805636	805641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15195	NC_017269	CA	3	6	805994	805999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15196	NC_017269	GCAC	2	8	806095	806102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15197	NC_017269	T	6	6	806205	806210	0 %	100 %	0 %	0 %	384423243
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15232	NC_017269	ATT	2	6	808009	808014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15233	NC_017269	A	6	6	808028	808033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15234	NC_017269	AAC	2	6	808059	808064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15235	NC_017269	A	6	6	808079	808084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15236	NC_017269	CAA	2	6	808086	808091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15237	NC_017269	ATGA	2	8	808181	808188	50 %	25 %	25 %	0 %	384423245
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15240	NC_017269	GCCA	2	8	808258	808265	25 %	0 %	25 %	50 %	384423245
15241	NC_017269	CGC	2	6	808484	808489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423245
15242	NC_017269	CAT	3	9	808498	808506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423245
15243	NC_017269	GCG	2	6	808559	808564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423245
15244	NC_017269	GCC	2	6	808568	808573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423245
15245	NC_017269	CTG	2	6	808577	808582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423245
15246	NC_017269	GCG	2	6	808607	808612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423245
15247	NC_017269	ATG	2	6	808625	808630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423245
15248	NC_017269	TTG	2	6	808677	808682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423245
15249	NC_017269	CAA	2	6	808687	808692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423245
15250	NC_017269	GCT	2	6	808723	808728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423245
15251	NC_017269	GCA	2	6	808759	808764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423245
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15256	NC_017269	GCCTT	2	10	808908	808917	0 %	40 %	20 %	40 %	384423245
15257	NC_017269	CTCA	2	8	808966	808973	25 %	25 %	0 %	50 %	384423245
15258	NC_017269	A	6	6	809015	809020	100 %	0 %	0 %	0 %	384423245
15259	NC_017269	CTT	2	6	809023	809028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423245
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15271	NC_017269	CTG	2	6	809744	809749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423245
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15284	NC_017269	GGCT	2	8	810661	810668	0 %	25 %	50 %	25 %	384423246
15285	NC_017269	ATC	2	6	810742	810747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423246
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15320	NC_017269	TCA	3	9	812790	812798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423247
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15352	NC_017269	AAACTC	2	12	814432	814443	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384423248
15353	NC_017269	GCAT	2	8	814460	814467	25 %	25 %	25 %	25 %	384423248
15354	NC_017269	CAC	2	6	814492	814497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423248
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15356	NC_017269	ATG	2	6	814568	814573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423248
15357	NC_017269	CAT	3	9	814605	814613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423248
15358	NC_017269	GCA	2	6	814776	814781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423248
15359	NC_017269	T	6	6	814911	814916	0 %	100 %	0 %	0 %	384423248
15360	NC_017269	TCT	2	6	815028	815033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423248
15361	NC_017269	ATA	2	6	815072	815077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15362	NC_017269	T	7	7	815138	815144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15363	NC_017269	CGG	2	6	815258	815263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423249
15364	NC_017269	CTCG	2	8	815273	815280	0 %	25 %	25 %	50 %	384423249
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15366	NC_017269	CGA	2	6	815405	815410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423249
15367	NC_017269	CAAC	2	8	815522	815529	50 %	0 %	0 %	50 %	384423249
15368	NC_017269	TGAT	2	8	815530	815537	25 %	50 %	25 %	0 %	384423249
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15402	NC_017269	AG	3	6	817600	817605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15403	NC_017269	AATCAC	2	12	817698	817709	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15437	NC_017269	T	6	6	819436	819441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15438	NC_017269	CT	3	6	819451	819456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15465	NC_017269	TG	3	6	821130	821135	0 %	50 %	50 %	0 %	384423252
15466	NC_017269	AC	3	6	821282	821287	50 %	0 %	0 %	50 %	384423252
15467	NC_017269	TGC	2	6	821307	821312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423252
15468	NC_017269	ACGT	2	8	821343	821350	25 %	25 %	25 %	25 %	384423252
15469	NC_017269	GCT	2	6	821392	821397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423252
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15471	NC_017269	T	6	6	821540	821545	0 %	100 %	0 %	0 %	384423252
15472	NC_017269	TGC	2	6	821604	821609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423252
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15479	NC_017269	TGC	2	6	821973	821978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423252
15480	NC_017269	TGAG	2	8	822039	822046	25 %	25 %	50 %	0 %	384423252
15481	NC_017269	TGC	2	6	822099	822104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423252
15482	NC_017269	CGCCAA	2	12	822173	822184	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384423252
15483	NC_017269	GA	3	6	822287	822292	50 %	0 %	50 %	0 %	384423252
15484	NC_017269	A	6	6	822326	822331	100 %	0 %	0 %	0 %	384423253
15485	NC_017269	TCT	2	6	822435	822440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15486	NC_017269	CT	3	6	822439	822444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15487	NC_017269	ACT	2	6	822458	822463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423254
15488	NC_017269	TCAA	2	8	822493	822500	50 %	25 %	0 %	25 %	384423254
15489	NC_017269	GGC	2	6	822539	822544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423254
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15491	NC_017269	GCT	2	6	822632	822637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423254
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