MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017269	GCA	2	6	716955	716960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423160
13502	NC_017269	GCT	2	6	716974	716979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423160
13503	NC_017269	TGT	2	6	716995	717000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423160
13504	NC_017269	GAT	2	6	717077	717082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423160
13505	NC_017269	TCT	2	6	717087	717092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423160
13506	NC_017269	CAAA	2	8	717109	717116	75 %	0 %	0 %	25 %	384423160
13507	NC_017269	ATG	2	6	717136	717141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423160
13508	NC_017269	TCT	2	6	717156	717161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423160
13509	NC_017269	GA	3	6	717175	717180	50 %	0 %	50 %	0 %	384423160
13510	NC_017269	CCATC	2	10	717259	717268	20 %	20 %	0 %	60 %	384423160
13511	NC_017269	GTT	2	6	717314	717319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423160
13512	NC_017269	CTT	2	6	717337	717342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423160
13513	NC_017269	TTG	2	6	717368	717373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423160
13514	NC_017269	AGA	2	6	717458	717463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423160
13515	NC_017269	CTT	2	6	717476	717481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_017269	TTTTG	2	10	717484	717493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_017269	A	6	6	717565	717570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_017269	ATC	2	6	717674	717679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_017269	ATT	2	6	717697	717702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_017269	T	6	6	717725	717730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_017269	AGG	2	6	717776	717781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017269	GAC	2	6	717790	717795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423161
13523	NC_017269	AATG	2	8	717799	717806	50 %	25 %	25 %	0 %	384423161
13524	NC_017269	CAG	2	6	717828	717833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423161
13525	NC_017269	TTC	2	6	717845	717850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423161
13526	NC_017269	CT	3	6	717862	717867	0 %	50 %	0 %	50 %	384423161
13527	NC_017269	GTG	2	6	717900	717905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423161
13528	NC_017269	TACCC	2	10	717911	717920	20 %	20 %	0 %	60 %	384423161
13529	NC_017269	TGA	2	6	717975	717980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423161
13530	NC_017269	T	8	8	717994	718001	0 %	100 %	0 %	0 %	384423161
13531	NC_017269	ATC	2	6	718011	718016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423161
13532	NC_017269	ATC	2	6	718041	718046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423161
13533	NC_017269	TGG	2	6	718109	718114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423161
13534	NC_017269	AGA	2	6	718126	718131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423161
13535	NC_017269	AAG	2	6	718134	718139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423161
13536	NC_017269	TA	3	6	718149	718154	50 %	50 %	0 %	0 %	384423161
13537	NC_017269	TCT	2	6	718166	718171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423161
13538	NC_017269	GTGAT	2	10	718194	718203	20 %	40 %	40 %	0 %	384423161
13539	NC_017269	GT	3	6	718239	718244	0 %	50 %	50 %	0 %	384423161
13540	NC_017269	TAT	2	6	718336	718341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423161
13541	NC_017269	CCTT	2	8	718365	718372	0 %	50 %	0 %	50 %	384423161
13542	NC_017269	TGA	2	6	718381	718386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423161
13543	NC_017269	CGC	2	6	718609	718614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423161
13544	NC_017269	AAATA	2	10	718643	718652	80 %	20 %	0 %	0 %	384423161
13545	NC_017269	AGAA	2	8	718657	718664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017269	GAA	2	6	718707	718712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423162
13547	NC_017269	T	7	7	718783	718789	0 %	100 %	0 %	0 %	384423162
13548	NC_017269	CAT	2	6	718814	718819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423162
13549	NC_017269	ATT	2	6	718914	718919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423162
13550	NC_017269	CTTT	2	8	718933	718940	0 %	75 %	0 %	25 %	384423162
13551	NC_017269	A	6	6	718947	718952	100 %	0 %	0 %	0 %	384423162
13552	NC_017269	ATAG	2	8	719079	719086	50 %	25 %	25 %	0 %	384423162
13553	NC_017269	T	6	6	719133	719138	0 %	100 %	0 %	0 %	384423162
13554	NC_017269	CGT	2	6	719145	719150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423162
13555	NC_017269	TCC	2	6	719160	719165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423162
13556	NC_017269	CT	3	6	719187	719192	0 %	50 %	0 %	50 %	384423162
13557	NC_017269	AAG	2	6	719203	719208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423162
13558	NC_017269	TGG	2	6	719315	719320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423162
13559	NC_017269	TAC	2	6	719413	719418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_017269	GAT	2	6	719438	719443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_017269	ATTG	2	8	719501	719508	25 %	50 %	25 %	0 %	384423163
13562	NC_017269	TGG	2	6	719539	719544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423163
13563	NC_017269	CTG	2	6	719563	719568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423163
13564	NC_017269	ACG	2	6	719658	719663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423163
13565	NC_017269	TCA	2	6	719671	719676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423163
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13568	NC_017269	TGC	2	6	719792	719797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423163
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13570	NC_017269	TGC	2	6	719965	719970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423163
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13572	NC_017269	AGCGC	2	10	720020	720029	20 %	0 %	40 %	40 %	384423163
13573	NC_017269	AC	4	8	720129	720136	50 %	0 %	0 %	50 %	384423163
13574	NC_017269	GGT	2	6	720260	720265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423163
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13578	NC_017269	CTCG	2	8	720465	720472	0 %	25 %	25 %	50 %	384423164
13579	NC_017269	CCTG	2	8	720559	720566	0 %	25 %	25 %	50 %	384423164
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13585	NC_017269	AGC	2	6	720897	720902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_017269	TCG	2	6	720916	720921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_017269	GCG	2	6	721034	721039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_017269	CCA	2	6	721043	721048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13589	NC_017269	CAC	2	6	721052	721057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13590	NC_017269	CGC	2	6	721151	721156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13591	NC_017269	AAT	2	6	721177	721182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_017269	ATC	2	6	721241	721246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_017269	ATG	3	9	721419	721427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_017269	TCC	2	6	721572	721577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13595	NC_017269	AAGA	2	8	721592	721599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_017269	CAG	2	6	721617	721622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_017269	CAC	2	6	721679	721684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13598	NC_017269	CG	3	6	721717	721722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13599	NC_017269	ATC	2	6	721765	721770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_017269	CGC	2	6	721779	721784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13601	NC_017269	TCAA	2	8	721789	721796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13602	NC_017269	CAAT	2	8	721814	721821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13603	NC_017269	GCT	2	6	722030	722035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_017269	TCA	3	9	722104	722112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_017269	AAC	2	6	722113	722118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_017269	CAACAT	2	12	722139	722150	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_017269	CAC	2	6	722157	722162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13608	NC_017269	ACG	2	6	722214	722219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13609	NC_017269	GCC	2	6	722224	722229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13610	NC_017269	GTA	2	6	722242	722247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_017269	T	6	6	722271	722276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_017269	GTTATT	2	12	722343	722354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_017269	A	6	6	722425	722430	100 %	0 %	0 %	0 %	384423165
13614	NC_017269	CGT	2	6	722451	722456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423165
13615	NC_017269	TG	3	6	722473	722478	0 %	50 %	50 %	0 %	384423165
13616	NC_017269	TGA	2	6	722494	722499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423165
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13618	NC_017269	CAG	2	6	722655	722660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423165
13619	NC_017269	AAC	2	6	722718	722723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_017269	ACT	2	6	722742	722747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_017269	GT	3	6	722773	722778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_017269	GTT	2	6	722808	722813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_017269	TTCC	2	8	722829	722836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13624	NC_017269	AGGA	2	8	722857	722864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13657	NC_017269	CTTA	2	8	724667	724674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13743	NC_017269	TGG	2	6	729232	729237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423169
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13992	NC_017269	GTA	2	6	741922	741927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423181
13993	NC_017269	ACG	2	6	741985	741990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423181
13994	NC_017269	AATC	2	8	742001	742008	50 %	25 %	0 %	25 %	384423181
13995	NC_017269	GTAGA	2	10	742080	742089	40 %	20 %	40 %	0 %	384423181
13996	NC_017269	TTG	2	6	742107	742112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423181
13997	NC_017269	CAC	2	6	742143	742148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423181
13998	NC_017269	ATC	2	6	742155	742160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423181
13999	NC_017269	TCA	2	6	742255	742260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423181
14000	NC_017269	GA	3	6	742358	742363	50 %	0 %	50 %	0 %	384423181

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