MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017269	TCT	3	9	690717	690725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423142
13002	NC_017269	GCC	2	6	690815	690820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423142
13003	NC_017269	GAT	2	6	690851	690856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423142
13004	NC_017269	AG	3	6	690863	690868	50 %	0 %	50 %	0 %	384423142
13005	NC_017269	GCG	2	6	690875	690880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423142
13006	NC_017269	CGC	2	6	690902	690907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423142
13007	NC_017269	GTCC	2	8	690963	690970	0 %	25 %	25 %	50 %	384423143
13008	NC_017269	ACC	2	6	691124	691129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423143
13009	NC_017269	GCT	3	9	691170	691178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423143
13010	NC_017269	ACC	2	6	691180	691185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423143
13011	NC_017269	GAT	2	6	691191	691196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423143
13012	NC_017269	GCT	2	6	691203	691208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423143
13013	NC_017269	CATGT	2	10	691240	691249	20 %	40 %	20 %	20 %	384423143
13014	NC_017269	ACG	2	6	691267	691272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423143
13015	NC_017269	TCA	2	6	691320	691325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423143
13016	NC_017269	ACG	2	6	691369	691374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423143
13017	NC_017269	GGC	2	6	691381	691386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423143
13018	NC_017269	CA	3	6	691500	691505	50 %	0 %	0 %	50 %	384423143
13019	NC_017269	CAC	2	6	691542	691547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423143
13020	NC_017269	GCA	2	6	691605	691610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423143
13021	NC_017269	TCC	2	6	691615	691620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423144
13022	NC_017269	TGC	2	6	691678	691683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423144
13023	NC_017269	GC	3	6	691723	691728	0 %	0 %	50 %	50 %	384423144
13024	NC_017269	AGC	2	6	691767	691772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423144
13025	NC_017269	GCC	3	9	691873	691881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423144
13026	NC_017269	AGCA	2	8	691890	691897	50 %	0 %	25 %	25 %	384423144
13027	NC_017269	TCT	2	6	691924	691929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423144
13028	NC_017269	ACT	2	6	691965	691970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423144
13029	NC_017269	TAA	2	6	691971	691976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423144
13030	NC_017269	TTC	2	6	692026	692031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423144
13031	NC_017269	A	6	6	692038	692043	100 %	0 %	0 %	0 %	384423144
13032	NC_017269	CTT	2	6	692105	692110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423144
13033	NC_017269	AACT	2	8	692148	692155	50 %	25 %	0 %	25 %	384423144
13034	NC_017269	TCA	2	6	692158	692163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423144
13035	NC_017269	ACA	2	6	692240	692245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423144
13036	NC_017269	ACG	2	6	692362	692367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423145
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13038	NC_017269	AAG	2	6	692482	692487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_017269	AGATA	2	10	692493	692502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017269	TCT	2	6	692548	692553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_017269	AAC	2	6	692556	692561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_017269	GAA	2	6	692578	692583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017269	CTCG	2	8	692696	692703	0 %	25 %	25 %	50 %	384423146
13044	NC_017269	ACG	2	6	692745	692750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423146
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13046	NC_017269	GCA	2	6	693002	693007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423146
13047	NC_017269	TTTAC	2	10	693049	693058	20 %	60 %	0 %	20 %	384423146
13048	NC_017269	TCA	2	6	693094	693099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423146
13049	NC_017269	TCA	2	6	693104	693109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423146
13050	NC_017269	GATA	2	8	693185	693192	50 %	25 %	25 %	0 %	384423146
13051	NC_017269	TGC	2	6	693391	693396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423146
13052	NC_017269	GCT	2	6	693413	693418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423146
13053	NC_017269	TTG	2	6	693483	693488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423146
13054	NC_017269	TTG	3	9	693516	693524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423146
13055	NC_017269	GGC	2	6	693646	693651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_017269	ATG	2	6	693722	693727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017269	AAT	2	6	693799	693804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017269	AAG	2	6	693805	693810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_017269	GCT	2	6	693845	693850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423147
13060	NC_017269	TCG	2	6	693879	693884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423147
13061	NC_017269	ACC	3	9	693912	693920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423147
13062	NC_017269	CCA	2	6	694020	694025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423147
13063	NC_017269	TCG	2	6	694196	694201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423147
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13065	NC_017269	AGT	2	6	694310	694315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423147
13066	NC_017269	GCG	2	6	694360	694365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423147
13067	NC_017269	ACAG	2	8	694388	694395	50 %	0 %	25 %	25 %	384423147
13068	NC_017269	ATTT	2	8	694440	694447	25 %	75 %	0 %	0 %	384423147
13069	NC_017269	ATG	2	6	694486	694491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423147
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13072	NC_017269	CGG	2	6	694646	694651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423147
13073	NC_017269	TCG	2	6	694772	694777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423147
13074	NC_017269	GATG	2	8	694793	694800	25 %	25 %	50 %	0 %	384423147
13075	NC_017269	ATCA	2	8	694806	694813	50 %	25 %	0 %	25 %	384423147
13076	NC_017269	GTG	2	6	694860	694865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423147
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13080	NC_017269	AGT	2	6	695028	695033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423147
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13085	NC_017269	GC	3	6	695273	695278	0 %	0 %	50 %	50 %	384423147
13086	NC_017269	AAT	2	6	695310	695315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423147
13087	NC_017269	GAT	2	6	695336	695341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423147
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13090	NC_017269	GAATG	2	10	695715	695724	40 %	20 %	40 %	0 %	384423147
13091	NC_017269	ATC	2	6	695803	695808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423147
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13093	NC_017269	CGTT	2	8	695875	695882	0 %	50 %	25 %	25 %	384423147
13094	NC_017269	CTC	2	6	695955	695960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_017269	ATC	2	6	695975	695980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_017269	ACTG	2	8	695992	695999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_017269	TGA	2	6	696056	696061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017269	A	6	6	696089	696094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_017269	ACA	2	6	696117	696122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_017269	A	7	7	696289	696295	100 %	0 %	0 %	0 %	384423148
13101	NC_017269	CAATAA	2	12	696307	696318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384423148
13102	NC_017269	AGC	2	6	696351	696356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423148
13103	NC_017269	TGC	2	6	696371	696376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423148
13104	NC_017269	TTC	2	6	696391	696396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423148
13105	NC_017269	AGG	2	6	696415	696420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_017269	TGT	2	6	696428	696433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423149
13107	NC_017269	GCG	2	6	696550	696555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423149
13108	NC_017269	GCC	2	6	696592	696597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423149
13109	NC_017269	ATG	2	6	696598	696603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423149
13110	NC_017269	TCG	2	6	696641	696646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423149
13111	NC_017269	CAA	2	6	696675	696680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423149
13112	NC_017269	CTC	2	6	696701	696706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423149
13113	NC_017269	TTA	2	6	696726	696731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423149
13114	NC_017269	CGAC	2	8	696794	696801	25 %	0 %	25 %	50 %	384423149
13115	NC_017269	CTCA	2	8	696843	696850	25 %	25 %	0 %	50 %	384423149
13116	NC_017269	GTCA	2	8	696852	696859	25 %	25 %	25 %	25 %	384423149
13117	NC_017269	CGC	2	6	696927	696932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423149
13118	NC_017269	GCG	2	6	696980	696985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423149
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13120	NC_017269	CG	3	6	697100	697105	0 %	0 %	50 %	50 %	384423149
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13235	NC_017269	TCAA	2	8	703813	703820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13236	NC_017269	A	7	7	703858	703864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13237	NC_017269	ACT	2	6	703899	703904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_017269	AAAAT	2	10	703945	703954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13239	NC_017269	ACGT	2	8	704031	704038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13240	NC_017269	ATG	2	6	704089	704094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13241	NC_017269	A	7	7	704108	704114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_017269	ACC	2	6	704167	704172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13243	NC_017269	GATT	2	8	704193	704200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_017269	GTT	2	6	704246	704251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_017269	CA	3	6	704267	704272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13247	NC_017269	GTC	2	6	704341	704346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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