MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017269	GCC	2	6	662898	662903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423123
12502	NC_017269	CG	3	6	662915	662920	0 %	0 %	50 %	50 %	384423123
12503	NC_017269	TGA	2	6	662921	662926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423123
12504	NC_017269	GCCA	2	8	662958	662965	25 %	0 %	25 %	50 %	384423123
12505	NC_017269	ACA	2	6	663044	663049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423123
12506	NC_017269	GT	3	6	663138	663143	0 %	50 %	50 %	0 %	384423123
12507	NC_017269	CAAA	2	8	663164	663171	75 %	0 %	0 %	25 %	384423123
12508	NC_017269	CGC	2	6	663264	663269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423123
12509	NC_017269	TGAG	2	8	663313	663320	25 %	25 %	50 %	0 %	384423123
12510	NC_017269	AGC	2	6	663370	663375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423123
12511	NC_017269	TACG	2	8	663395	663402	25 %	25 %	25 %	25 %	384423123
12512	NC_017269	AAG	2	6	663412	663417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423123
12513	NC_017269	GTGA	2	8	663483	663490	25 %	25 %	50 %	0 %	384423123
12514	NC_017269	TCC	3	9	663513	663521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_017269	ATTA	2	8	663570	663577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017269	TATT	2	8	663595	663602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_017269	TCG	2	6	663630	663635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_017269	GCG	2	6	663676	663681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017269	TCG	2	6	663800	663805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423124
12520	NC_017269	ATT	2	6	663861	663866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423124
12521	NC_017269	GC	3	6	663924	663929	0 %	0 %	50 %	50 %	384423124
12522	NC_017269	CTC	2	6	663999	664004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423124
12523	NC_017269	CTC	2	6	664015	664020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423124
12524	NC_017269	TGG	2	6	664096	664101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423124
12525	NC_017269	ATT	2	6	664244	664249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423124
12526	NC_017269	CCGAT	2	10	664259	664268	20 %	20 %	20 %	40 %	384423124
12527	NC_017269	GAT	3	9	664266	664274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423124
12528	NC_017269	TTG	2	6	664342	664347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423124
12529	NC_017269	CA	3	6	664382	664387	50 %	0 %	0 %	50 %	384423124
12530	NC_017269	GAT	2	6	664492	664497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423124
12531	NC_017269	AGA	2	6	664509	664514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423124
12532	NC_017269	GCA	2	6	664539	664544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423124
12533	NC_017269	GGC	2	6	664551	664556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423124
12534	NC_017269	TTACC	2	10	664558	664567	20 %	40 %	0 %	40 %	384423124
12535	NC_017269	GCG	2	6	664648	664653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423125
12536	NC_017269	TGA	2	6	664679	664684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423125
12537	NC_017269	ACTCG	2	10	664685	664694	20 %	20 %	20 %	40 %	384423125
12538	NC_017269	CACC	2	8	664700	664707	25 %	0 %	0 %	75 %	384423125
12539	NC_017269	ACC	2	6	664767	664772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423125
12540	NC_017269	CAG	2	6	664832	664837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423125
12541	NC_017269	TAA	2	6	664904	664909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423125
12542	NC_017269	AG	4	8	664937	664944	50 %	0 %	50 %	0 %	384423125
12543	NC_017269	A	6	6	664997	665002	100 %	0 %	0 %	0 %	384423125
12544	NC_017269	GCGA	2	8	665130	665137	25 %	0 %	50 %	25 %	384423125
12545	NC_017269	CTGA	2	8	665222	665229	25 %	25 %	25 %	25 %	384423125
12546	NC_017269	TCGC	2	8	665304	665311	0 %	25 %	25 %	50 %	384423125
12547	NC_017269	AAGGC	2	10	665325	665334	40 %	0 %	40 %	20 %	384423125
12548	NC_017269	CCG	2	6	665361	665366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423125
12549	NC_017269	GCGCC	2	10	665452	665461	0 %	0 %	40 %	60 %	384423125
12550	NC_017269	CTC	2	6	665477	665482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423125
12551	NC_017269	ACG	2	6	665489	665494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423125
12552	NC_017269	GT	3	6	665547	665552	0 %	50 %	50 %	0 %	384423125
12553	NC_017269	TGA	2	6	665560	665565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423125
12554	NC_017269	CCTA	2	8	665606	665613	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_017269	CGC	2	6	665760	665765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423126
12556	NC_017269	GAC	2	6	665805	665810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423126
12557	NC_017269	CAT	2	6	665828	665833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423126
12558	NC_017269	CGA	3	9	665875	665883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423126
12559	NC_017269	CAC	2	6	665973	665978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423126
12560	NC_017269	TGA	2	6	665987	665992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423126
12561	NC_017269	AGG	2	6	666039	666044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423126
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12564	NC_017269	TGC	2	6	666288	666293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_017269	TTC	2	6	666374	666379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423127
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12568	NC_017269	GCA	2	6	666508	666513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423127
12569	NC_017269	CAT	2	6	666518	666523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423127
12570	NC_017269	TTG	2	6	666548	666553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423127
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12573	NC_017269	TCA	2	6	666739	666744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423127
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12576	NC_017269	ATTC	2	8	666851	666858	25 %	50 %	0 %	25 %	384423127
12577	NC_017269	TGT	2	6	666946	666951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423127
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12581	NC_017269	GTC	2	6	667142	667147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423127
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12587	NC_017269	TGG	2	6	667276	667281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423127
12588	NC_017269	CATCGC	2	12	667295	667306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384423127
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12593	NC_017269	GCCGC	2	10	667592	667601	0 %	0 %	40 %	60 %	384423128
12594	NC_017269	AGAAA	2	10	667623	667632	80 %	0 %	20 %	0 %	384423128
12595	NC_017269	GCA	2	6	667639	667644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423128
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12599	NC_017269	GA	3	6	667749	667754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_017269	AG	3	6	667805	667810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017269	CG	3	6	667935	667940	0 %	0 %	50 %	50 %	384423129
12602	NC_017269	CAC	2	6	667965	667970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423129
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12605	NC_017269	CAG	2	6	668028	668033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423129
12606	NC_017269	T	6	6	668058	668063	0 %	100 %	0 %	0 %	384423129
12607	NC_017269	T	6	6	668071	668076	0 %	100 %	0 %	0 %	384423129
12608	NC_017269	CATC	2	8	668166	668173	25 %	25 %	0 %	50 %	384423129
12609	NC_017269	A	6	6	668328	668333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017269	CTAAGC	2	12	668344	668355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_017269	GCA	2	6	668379	668384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_017269	CTA	2	6	668391	668396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12615	NC_017269	CTG	2	6	668672	668677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_017269	TTA	2	6	668730	668735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_017269	AAAT	2	8	668767	668774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_017269	ACAAA	2	10	668788	668797	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12619	NC_017269	AAG	2	6	668873	668878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_017269	AG	3	6	668970	668975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_017269	GAAT	2	8	669116	669123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12623	NC_017269	T	6	6	669160	669165	0 %	100 %	0 %	0 %	384423130
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12985	NC_017269	TGC	2	6	689607	689612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423141
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12987	NC_017269	CAC	2	6	689647	689652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423141
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12989	NC_017269	CGC	2	6	689741	689746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423142
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12991	NC_017269	CA	3	6	689917	689922	50 %	0 %	0 %	50 %	384423142
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