MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017269	CCA	2	6	610060	610065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423076
11502	NC_017269	TGA	2	6	610067	610072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423076
11503	NC_017269	AGTG	2	8	610083	610090	25 %	25 %	50 %	0 %	384423076
11504	NC_017269	CGC	2	6	610096	610101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423076
11505	NC_017269	CCA	2	6	610110	610115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423076
11506	NC_017269	CTGT	2	8	610120	610127	0 %	50 %	25 %	25 %	384423076
11507	NC_017269	CCA	2	6	610263	610268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423076
11508	NC_017269	AC	3	6	610341	610346	50 %	0 %	0 %	50 %	384423076
11509	NC_017269	TCA	2	6	610427	610432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423076
11510	NC_017269	TTG	2	6	610453	610458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423076
11511	NC_017269	CTG	2	6	610459	610464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423076
11512	NC_017269	CCA	2	6	610548	610553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423076
11513	NC_017269	TTC	2	6	610597	610602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423076
11514	NC_017269	CGGAT	2	10	610612	610621	20 %	20 %	40 %	20 %	384423076
11515	NC_017269	GT	3	6	610658	610663	0 %	50 %	50 %	0 %	384423076
11516	NC_017269	CTG	2	6	610711	610716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423076
11517	NC_017269	T	6	6	610791	610796	0 %	100 %	0 %	0 %	384423076
11518	NC_017269	ACA	2	6	610805	610810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423076
11519	NC_017269	GCC	2	6	610838	610843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423076
11520	NC_017269	TAA	2	6	610969	610974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_017269	T	6	6	610982	610987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_017269	T	6	6	611046	611051	0 %	100 %	0 %	0 %	384423077
11523	NC_017269	TCC	2	6	611060	611065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423077
11524	NC_017269	TTCA	2	8	611158	611165	25 %	50 %	0 %	25 %	384423077
11525	NC_017269	CAC	2	6	611182	611187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423077
11526	NC_017269	ATG	2	6	611216	611221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423077
11527	NC_017269	GATG	2	8	611227	611234	25 %	25 %	50 %	0 %	384423077
11528	NC_017269	ACCA	2	8	611281	611288	50 %	0 %	0 %	50 %	384423077
11529	NC_017269	TTA	2	6	611369	611374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423077
11530	NC_017269	TTG	2	6	611450	611455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423077
11531	NC_017269	GAT	2	6	611494	611499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423077
11532	NC_017269	CGTA	2	8	611529	611536	25 %	25 %	25 %	25 %	384423077
11533	NC_017269	A	6	6	611548	611553	100 %	0 %	0 %	0 %	384423077
11534	NC_017269	GAGT	2	8	611612	611619	25 %	25 %	50 %	0 %	384423077
11535	NC_017269	CAA	2	6	611620	611625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423077
11536	NC_017269	CAA	2	6	611659	611664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423077
11537	NC_017269	CAA	2	6	611700	611705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423077
11538	NC_017269	GTT	2	6	611776	611781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423077
11539	NC_017269	CAG	2	6	611783	611788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423077
11540	NC_017269	GTT	2	6	611793	611798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423077
11541	NC_017269	ATG	2	6	611843	611848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423077
11542	NC_017269	CAT	2	6	611871	611876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423077
11543	NC_017269	GCT	2	6	612069	612074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423077
11544	NC_017269	AGCA	2	8	612121	612128	50 %	0 %	25 %	25 %	384423077
11545	NC_017269	GA	3	6	612232	612237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_017269	AAC	2	6	612317	612322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_017269	T	6	6	612336	612341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_017269	A	6	6	612383	612388	100 %	0 %	0 %	0 %	384423078
11549	NC_017269	A	7	7	612392	612398	100 %	0 %	0 %	0 %	384423078
11550	NC_017269	CAC	2	6	612431	612436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423078
11551	NC_017269	CAACC	2	10	612483	612492	40 %	0 %	0 %	60 %	384423078
11552	NC_017269	TAAC	2	8	612545	612552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_017269	CAA	2	6	612611	612616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423079
11554	NC_017269	GCA	2	6	612630	612635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11555	NC_017269	CGA	2	6	612724	612729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11556	NC_017269	CGG	2	6	612810	612815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423079
11557	NC_017269	CTG	2	6	612851	612856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11558	NC_017269	CTGA	2	8	612860	612867	25 %	25 %	25 %	25 %	384423079
11559	NC_017269	GCA	2	6	612877	612882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11560	NC_017269	CAA	2	6	612956	612961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423079
11561	NC_017269	CAT	2	6	613042	613047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423079
11562	NC_017269	ACTG	2	8	613079	613086	25 %	25 %	25 %	25 %	384423079
11563	NC_017269	CAC	2	6	613097	613102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423079
11564	NC_017269	GC	3	6	613174	613179	0 %	0 %	50 %	50 %	384423079
11565	NC_017269	TCGC	2	8	613236	613243	0 %	25 %	25 %	50 %	384423079
11566	NC_017269	GCGCA	2	10	613346	613355	20 %	0 %	40 %	40 %	384423079
11567	NC_017269	CT	3	6	613362	613367	0 %	50 %	0 %	50 %	384423079
11568	NC_017269	ATG	2	6	613428	613433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423079
11569	NC_017269	AGC	2	6	613439	613444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11570	NC_017269	TGCT	2	8	613456	613463	0 %	50 %	25 %	25 %	384423079
11571	NC_017269	GAT	2	6	613586	613591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423079
11572	NC_017269	AG	4	8	613607	613614	50 %	0 %	50 %	0 %	384423079
11573	NC_017269	CAG	2	6	613706	613711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11574	NC_017269	ACC	2	6	613731	613736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423079
11575	NC_017269	CAC	2	6	613754	613759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423079
11576	NC_017269	CAG	2	6	613805	613810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11577	NC_017269	CAG	2	6	613835	613840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423079
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11580	NC_017269	CAAT	2	8	613942	613949	50 %	25 %	0 %	25 %	384423079
11581	NC_017269	GCT	2	6	613952	613957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423079
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11584	NC_017269	CCAAC	2	10	614044	614053	40 %	0 %	0 %	60 %	384423079
11585	NC_017269	ACC	2	6	614073	614078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423079
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11587	NC_017269	TGCG	2	8	614169	614176	0 %	25 %	50 %	25 %	384423079
11588	NC_017269	GGT	2	6	614210	614215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423079
11589	NC_017269	TTG	2	6	614339	614344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423079
11590	NC_017269	TCGAT	2	10	614350	614359	20 %	40 %	20 %	20 %	384423079
11591	NC_017269	TCA	2	6	614367	614372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423079
11592	NC_017269	GTTG	2	8	614599	614606	0 %	50 %	50 %	0 %	384423079
11593	NC_017269	CAC	2	6	614653	614658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423079
11594	NC_017269	TGC	2	6	614763	614768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423079
11595	NC_017269	GCG	2	6	614981	614986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423079
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11598	NC_017269	TCG	2	6	615052	615057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423080
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11600	NC_017269	GTTCA	2	10	615121	615130	20 %	40 %	20 %	20 %	384423080
11601	NC_017269	ATCA	2	8	615139	615146	50 %	25 %	0 %	25 %	384423080
11602	NC_017269	TCA	2	6	615185	615190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423080
11603	NC_017269	TGC	2	6	615242	615247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423080
11604	NC_017269	CAC	2	6	615249	615254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423080
11605	NC_017269	ACCG	2	8	615295	615302	25 %	0 %	25 %	50 %	384423080
11606	NC_017269	AGC	2	6	615308	615313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423080
11607	NC_017269	TCC	2	6	615332	615337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423080
11608	NC_017269	AACA	2	8	615350	615357	75 %	0 %	0 %	25 %	384423080
11609	NC_017269	GCG	2	6	615443	615448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423080
11610	NC_017269	TCA	2	6	615455	615460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423080
11611	NC_017269	TCA	2	6	615534	615539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423080
11612	NC_017269	GA	3	6	615599	615604	50 %	0 %	50 %	0 %	384423080
11613	NC_017269	ATG	2	6	615674	615679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423080
11614	NC_017269	ACT	2	6	615697	615702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423081
11615	NC_017269	TGTT	2	8	615711	615718	0 %	75 %	25 %	0 %	384423081
11616	NC_017269	CTG	2	6	615729	615734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423081
11617	NC_017269	CAGC	2	8	615735	615742	25 %	0 %	25 %	50 %	384423081
11618	NC_017269	CGA	2	6	615826	615831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423081
11619	NC_017269	CGT	2	6	615859	615864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423081
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11621	NC_017269	CT	3	6	615916	615921	0 %	50 %	0 %	50 %	384423081
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