MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017269	TCA	2	6	580128	580133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423046
11002	NC_017269	GGC	3	9	580136	580144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423046
11003	NC_017269	CAC	2	6	580228	580233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423046
11004	NC_017269	TGC	2	6	580251	580256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423046
11005	NC_017269	CG	3	6	580336	580341	0 %	0 %	50 %	50 %	384423046
11006	NC_017269	GTTT	2	8	580365	580372	0 %	75 %	25 %	0 %	384423046
11007	NC_017269	AGA	2	6	580384	580389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423046
11008	NC_017269	AAG	2	6	580464	580469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423046
11009	NC_017269	TG	3	6	580551	580556	0 %	50 %	50 %	0 %	384423046
11010	NC_017269	GC	3	6	580587	580592	0 %	0 %	50 %	50 %	384423046
11011	NC_017269	GCGT	2	8	580650	580657	0 %	25 %	50 %	25 %	384423046
11012	NC_017269	GCT	2	6	580789	580794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423046
11013	NC_017269	TAA	2	6	580813	580818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423046
11014	NC_017269	CAC	2	6	580894	580899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423046
11015	NC_017269	GC	3	6	581017	581022	0 %	0 %	50 %	50 %	384423046
11016	NC_017269	GAT	3	9	581054	581062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423046
11017	NC_017269	AGC	2	6	581109	581114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423046
11018	NC_017269	CAC	2	6	581134	581139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423046
11019	NC_017269	TGA	2	6	581157	581162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423046
11020	NC_017269	AGCA	2	8	581262	581269	50 %	0 %	25 %	25 %	384423046
11021	NC_017269	GAT	2	6	581363	581368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423046
11022	NC_017269	CCG	2	6	581409	581414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423046
11023	NC_017269	AAT	2	6	581450	581455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423046
11024	NC_017269	ACG	2	6	581467	581472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423046
11025	NC_017269	CCTT	2	8	581702	581709	0 %	50 %	0 %	50 %	384423046
11026	NC_017269	ACA	2	6	581728	581733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423046
11027	NC_017269	ATG	2	6	581734	581739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423046
11028	NC_017269	ATG	2	6	581744	581749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423047
11029	NC_017269	GCC	2	6	581785	581790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423047
11030	NC_017269	GC	3	6	581793	581798	0 %	0 %	50 %	50 %	384423047
11031	NC_017269	GAAA	2	8	581810	581817	75 %	0 %	25 %	0 %	384423047
11032	NC_017269	GTG	2	6	581818	581823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423047
11033	NC_017269	TTC	2	6	581856	581861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423047
11034	NC_017269	ACA	2	6	581937	581942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423047
11035	NC_017269	A	6	6	582096	582101	100 %	0 %	0 %	0 %	384423047
11036	NC_017269	TTG	2	6	582167	582172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423047
11037	NC_017269	TGC	2	6	582206	582211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423047
11038	NC_017269	TGC	2	6	582338	582343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423047
11039	NC_017269	TGA	2	6	582399	582404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423047
11040	NC_017269	TGCC	2	8	582416	582423	0 %	25 %	25 %	50 %	384423047
11041	NC_017269	TGA	2	6	582452	582457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423047
11042	NC_017269	GAA	2	6	582535	582540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423047
11043	NC_017269	GGC	2	6	582568	582573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423047
11044	NC_017269	TGG	2	6	582600	582605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423047
11045	NC_017269	GCG	2	6	582908	582913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423047
11046	NC_017269	CAAAC	2	10	583015	583024	60 %	0 %	0 %	40 %	384423047
11047	NC_017269	TGC	2	6	583034	583039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423047
11048	NC_017269	ACC	2	6	583077	583082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423048
11049	NC_017269	GT	3	6	583107	583112	0 %	50 %	50 %	0 %	384423048
11050	NC_017269	ATG	2	6	583213	583218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423048
11051	NC_017269	CGC	2	6	583415	583420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423048
11052	NC_017269	CCG	2	6	583511	583516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423048
11053	NC_017269	CCAG	2	8	583537	583544	25 %	0 %	25 %	50 %	384423048
11054	NC_017269	TGA	2	6	583630	583635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423048
11055	NC_017269	GCGT	2	8	583651	583658	0 %	25 %	50 %	25 %	384423048
11056	NC_017269	CAA	2	6	583712	583717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423048
11057	NC_017269	GCA	2	6	583820	583825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423048
11058	NC_017269	GTG	2	6	583863	583868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423048
11059	NC_017269	A	6	6	583947	583952	100 %	0 %	0 %	0 %	384423048
11060	NC_017269	GTG	2	6	583953	583958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423048
11061	NC_017269	TGG	2	6	584041	584046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423048
11062	NC_017269	AGTG	2	8	584055	584062	25 %	25 %	50 %	0 %	384423048
11063	NC_017269	AGA	2	6	584093	584098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423048
11064	NC_017269	GAA	2	6	584114	584119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423048
11065	NC_017269	GAA	2	6	584205	584210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423048
11066	NC_017269	CAC	2	6	584338	584343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_017269	AGGG	2	8	584362	584369	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_017269	TGAT	2	8	584429	584436	25 %	50 %	25 %	0 %	384423049
11069	NC_017269	AAG	2	6	584491	584496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423049
11070	NC_017269	GCG	2	6	584583	584588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423049
11071	NC_017269	ATC	2	6	584597	584602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423049
11072	NC_017269	CA	3	6	584725	584730	50 %	0 %	0 %	50 %	384423049
11073	NC_017269	AAT	2	6	584738	584743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423049
11074	NC_017269	CAC	2	6	584768	584773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423049
11075	NC_017269	TTC	2	6	584780	584785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423049
11076	NC_017269	TGC	2	6	584814	584819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423049
11077	NC_017269	GCA	2	6	584823	584828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423049
11078	NC_017269	CGCAC	2	10	584838	584847	20 %	0 %	20 %	60 %	384423049
11079	NC_017269	ACAGC	2	10	585040	585049	40 %	0 %	20 %	40 %	384423049
11080	NC_017269	GTCCA	2	10	585063	585072	20 %	20 %	20 %	40 %	384423049
11081	NC_017269	AG	3	6	585080	585085	50 %	0 %	50 %	0 %	384423049
11082	NC_017269	GGC	2	6	585176	585181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423049
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11084	NC_017269	TGC	2	6	585222	585227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423049
11085	NC_017269	AAT	2	6	585278	585283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423049
11086	NC_017269	CCCA	2	8	585478	585485	25 %	0 %	0 %	75 %	384423049
11087	NC_017269	TGC	2	6	585526	585531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_017269	AG	3	6	585668	585673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_017269	AGA	2	6	585733	585738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423050
11090	NC_017269	ACT	2	6	585781	585786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423050
11091	NC_017269	GC	3	6	585792	585797	0 %	0 %	50 %	50 %	384423050
11092	NC_017269	GCT	2	6	585829	585834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423050
11093	NC_017269	GTC	3	9	585851	585859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423050
11094	NC_017269	GCC	2	6	585920	585925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423050
11095	NC_017269	GCA	2	6	585970	585975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423050
11096	NC_017269	TGC	2	6	585982	585987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423050
11097	NC_017269	CCA	2	6	586011	586016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423050
11098	NC_017269	AAT	2	6	586110	586115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423050
11099	NC_017269	CAA	2	6	586197	586202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_017269	T	8	8	586225	586232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_017269	CTG	2	6	586282	586287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_017269	CTG	2	6	586298	586303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423051
11103	NC_017269	TTC	2	6	586314	586319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423051
11104	NC_017269	TGC	2	6	586406	586411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423051
11105	NC_017269	TGGC	2	8	586444	586451	0 %	25 %	50 %	25 %	384423051
11106	NC_017269	T	6	6	586457	586462	0 %	100 %	0 %	0 %	384423051
11107	NC_017269	TGG	2	6	586464	586469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423051
11108	NC_017269	ATT	2	6	586470	586475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423051
11109	NC_017269	GC	3	6	586481	586486	0 %	0 %	50 %	50 %	384423051
11110	NC_017269	TGG	3	9	586649	586657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423051
11111	NC_017269	GTGCC	2	10	586778	586787	0 %	20 %	40 %	40 %	384423051
11112	NC_017269	CAC	2	6	586800	586805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423051
11113	NC_017269	ACT	2	6	586806	586811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423051
11114	NC_017269	CA	3	6	586860	586865	50 %	0 %	0 %	50 %	384423051
11115	NC_017269	AGCT	2	8	586869	586876	25 %	25 %	25 %	25 %	384423051
11116	NC_017269	GCG	2	6	586912	586917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423051
11117	NC_017269	CAG	2	6	587129	587134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423051
11118	NC_017269	GAT	2	6	587155	587160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423051
11119	NC_017269	GCT	2	6	587163	587168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423051
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11121	NC_017269	TTGT	2	8	587397	587404	0 %	75 %	25 %	0 %	384423051
11122	NC_017269	CTT	2	6	587459	587464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11225	NC_017269	TGGC	2	8	593544	593551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11227	NC_017269	CAAA	2	8	593717	593724	75 %	0 %	0 %	25 %	384423059
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11295	NC_017269	ATTG	2	8	597195	597202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11358	NC_017269	AG	3	6	600782	600787	50 %	0 %	50 %	0 %	384423066
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11363	NC_017269	GCC	2	6	601157	601162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423066
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11486	NC_017269	CCG	2	6	609223	609228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423075
11487	NC_017269	ATT	2	6	609241	609246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423075
11488	NC_017269	CAAGC	2	10	609325	609334	40 %	0 %	20 %	40 %	384423075
11489	NC_017269	GGTGT	2	10	609384	609393	0 %	40 %	60 %	0 %	384423075
11490	NC_017269	T	6	6	609430	609435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11491	NC_017269	CGG	2	6	609498	609503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423076
11492	NC_017269	CG	3	6	609512	609517	0 %	0 %	50 %	50 %	384423076
11493	NC_017269	CTG	2	6	609535	609540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423076
11494	NC_017269	CTG	2	6	609547	609552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423076
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11496	NC_017269	CTG	2	6	609748	609753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423076
11497	NC_017269	CGCA	2	8	609826	609833	25 %	0 %	25 %	50 %	384423076
11498	NC_017269	GCCA	2	8	609861	609868	25 %	0 %	25 %	50 %	384423076
11499	NC_017269	CATGC	2	10	609967	609976	20 %	20 %	20 %	40 %	384423076
11500	NC_017269	TGCCA	2	10	610012	610021	20 %	20 %	20 %	40 %	384423076

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