MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017269	CAC	2	6	527424	527429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422999
10002	NC_017269	AAG	2	6	527438	527443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422999
10003	NC_017269	TTCA	2	8	527502	527509	25 %	50 %	0 %	25 %	384422999
10004	NC_017269	AAC	2	6	527534	527539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422999
10005	NC_017269	TTG	2	6	527573	527578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422999
10006	NC_017269	TCAG	2	8	527603	527610	25 %	25 %	25 %	25 %	384422999
10007	NC_017269	ACG	2	6	527638	527643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422999
10008	NC_017269	CAG	2	6	527675	527680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422999
10009	NC_017269	TGC	2	6	527696	527701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422999
10010	NC_017269	TC	3	6	527779	527784	0 %	50 %	0 %	50 %	384422999
10011	NC_017269	TC	3	6	527793	527798	0 %	50 %	0 %	50 %	384422999
10012	NC_017269	TTTA	2	8	527800	527807	25 %	75 %	0 %	0 %	384422999
10013	NC_017269	A	6	6	527933	527938	100 %	0 %	0 %	0 %	384422999
10014	NC_017269	CAAC	2	8	527946	527953	50 %	0 %	0 %	50 %	384422999
10015	NC_017269	TTGGTA	2	12	528034	528045	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384422999
10016	NC_017269	GC	3	6	528088	528093	0 %	0 %	50 %	50 %	384422999
10017	NC_017269	TGA	2	6	528101	528106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422999
10018	NC_017269	CT	3	6	528133	528138	0 %	50 %	0 %	50 %	384422999
10019	NC_017269	AGC	2	6	528210	528215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422999
10020	NC_017269	GATG	2	8	528216	528223	25 %	25 %	50 %	0 %	384422999
10021	NC_017269	GGT	2	6	528234	528239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422999
10022	NC_017269	ACCG	2	8	528244	528251	25 %	0 %	25 %	50 %	384422999
10023	NC_017269	CAT	2	6	528261	528266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422999
10024	NC_017269	AAC	2	6	528274	528279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422999
10025	NC_017269	AGC	2	6	528326	528331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422999
10026	NC_017269	CAA	2	6	528426	528431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422999
10027	NC_017269	TGAGC	2	10	528564	528573	20 %	20 %	40 %	20 %	384422999
10028	NC_017269	ATT	2	6	528832	528837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422999
10029	NC_017269	GAA	2	6	528856	528861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422999
10030	NC_017269	GTG	3	9	528929	528937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422999
10031	NC_017269	GCA	2	6	529082	529087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017269	ATT	2	6	529091	529096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017269	TAC	2	6	529180	529185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_017269	GGTT	2	8	529194	529201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_017269	TAC	2	6	529203	529208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_017269	AC	3	6	529211	529216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_017269	GGC	2	6	529241	529246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_017269	TGAA	2	8	529292	529299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_017269	AGG	2	6	529325	529330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017269	AGG	2	6	529397	529402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423000
10041	NC_017269	AGCCA	2	10	529439	529448	40 %	0 %	20 %	40 %	384423000
10042	NC_017269	TGG	2	6	529460	529465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423000
10043	NC_017269	CGC	2	6	529518	529523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423000
10044	NC_017269	TCA	2	6	529612	529617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423000
10045	NC_017269	GTG	2	6	529620	529625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423000
10046	NC_017269	GGA	2	6	529644	529649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423000
10047	NC_017269	CCG	2	6	529666	529671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423000
10048	NC_017269	GTG	2	6	529725	529730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423000
10049	NC_017269	TGC	2	6	529763	529768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423000
10050	NC_017269	GAA	2	6	529776	529781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423000
10051	NC_017269	TGA	2	6	529865	529870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423000
10052	NC_017269	TTG	2	6	529891	529896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423000
10053	NC_017269	A	6	6	529986	529991	100 %	0 %	0 %	0 %	384423000
10054	NC_017269	ATG	2	6	530161	530166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423000
10055	NC_017269	TTG	2	6	530178	530183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423000
10056	NC_017269	A	7	7	530212	530218	100 %	0 %	0 %	0 %	384423000
10057	NC_017269	AGC	2	6	530239	530244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423000
10058	NC_017269	TCAAT	2	10	530299	530308	40 %	40 %	0 %	20 %	384423000
10059	NC_017269	TCA	2	6	530323	530328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423000
10060	NC_017269	GGC	2	6	530334	530339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423000
10061	NC_017269	ATC	2	6	530355	530360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423000
10062	NC_017269	TCG	2	6	530395	530400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423000
10063	NC_017269	TGA	2	6	530414	530419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423000
10064	NC_017269	TCAT	2	8	530446	530453	25 %	50 %	0 %	25 %	384423000
10065	NC_017269	GTT	2	6	530550	530555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423000
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10067	NC_017269	AT	3	6	530654	530659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_017269	AAG	2	6	530713	530718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_017269	TGA	2	6	530742	530747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_017269	CTT	2	6	530782	530787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423001
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10072	NC_017269	ACC	3	9	530945	530953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423001
10073	NC_017269	CCG	2	6	530961	530966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423001
10074	NC_017269	TTG	2	6	531036	531041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423001
10075	NC_017269	GTA	2	6	531080	531085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423001
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10080	NC_017269	GATT	2	8	531334	531341	25 %	50 %	25 %	0 %	384423001
10081	NC_017269	CAG	2	6	531400	531405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423001
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10091	NC_017269	TAA	2	6	532292	532297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423001
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10093	NC_017269	AAG	2	6	532399	532404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423001
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10100	NC_017269	TTTG	2	8	532696	532703	0 %	75 %	25 %	0 %	384423001
10101	NC_017269	TG	3	6	532858	532863	0 %	50 %	50 %	0 %	384423001
10102	NC_017269	ATC	2	6	532910	532915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423001
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10105	NC_017269	CG	3	6	533133	533138	0 %	0 %	50 %	50 %	384423001
10106	NC_017269	CAC	2	6	533215	533220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423001
10107	NC_017269	CCG	2	6	533260	533265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423001
10108	NC_017269	AG	4	8	533312	533319	50 %	0 %	50 %	0 %	384423001
10109	NC_017269	CACC	2	8	533359	533366	25 %	0 %	0 %	75 %	384423001
10110	NC_017269	ATC	2	6	533405	533410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423001
10111	NC_017269	ACCA	2	8	533486	533493	50 %	0 %	0 %	50 %	384423001
10112	NC_017269	CG	3	6	533520	533525	0 %	0 %	50 %	50 %	384423001
10113	NC_017269	TGC	2	6	533552	533557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423001
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10115	NC_017269	C	7	7	533636	533642	0 %	0 %	0 %	100 %	384423001
10116	NC_017269	TGC	2	6	533647	533652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423001
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10119	NC_017269	TGC	2	6	533748	533753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423001
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10121	NC_017269	GCA	2	6	533817	533822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423001
10122	NC_017269	GCT	2	6	533825	533830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423001
10123	NC_017269	TTG	2	6	533908	533913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423001
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10125	NC_017269	TTA	2	6	533927	533932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_017269	TAAA	2	8	533943	533950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_017269	AAC	2	6	533987	533992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10129	NC_017269	TAA	2	6	534037	534042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_017269	CAA	2	6	534096	534101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_017269	A	7	7	534128	534134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_017269	CAA	2	6	534165	534170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_017269	TG	3	6	534175	534180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_017269	AAT	2	6	534247	534252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_017269	AAC	2	6	534288	534293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_017269	GCA	2	6	534310	534315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10162	NC_017269	CCAAT	2	10	535761	535770	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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10241	NC_017269	AGT	2	6	539453	539458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423005
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10243	NC_017269	GGCTG	2	10	539543	539552	0 %	20 %	60 %	20 %	384423005
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10364	NC_017269	GC	3	6	546294	546299	0 %	0 %	50 %	50 %	384423010
10365	NC_017269	TTGA	2	8	546321	546328	25 %	50 %	25 %	0 %	384423010
10366	NC_017269	GCT	2	6	546362	546367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423010
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10382	NC_017269	GGC	2	6	546942	546947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423010
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10393	NC_017269	CTT	2	6	547694	547699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10394	NC_017269	TGC	2	6	547807	547812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423011
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10483	NC_017269	CG	3	6	553011	553016	0 %	0 %	50 %	50 %	384423018
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