MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017269	GCA	2	6	447714	447719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_017269	AGA	2	6	447768	447773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_017269	GCC	2	6	447777	447782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8504	NC_017269	TGCG	2	8	447790	447797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8505	NC_017269	GTG	2	6	447877	447882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_017269	ACA	2	6	447911	447916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_017269	TGA	2	6	447930	447935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_017269	ATG	2	6	447947	447952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_017269	GC	3	6	447970	447975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8510	NC_017269	GAT	2	6	447995	448000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_017269	TTGA	2	8	448143	448150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_017269	TGG	2	6	448246	448251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_017269	CGG	2	6	448259	448264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_017269	GC	3	6	448369	448374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_017269	A	6	6	448527	448532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_017269	GACG	2	8	448540	448547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8517	NC_017269	GTG	2	6	448590	448595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_017269	AACCC	2	10	448719	448728	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8519	NC_017269	TGG	2	6	448743	448748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422933
8520	NC_017269	GGT	2	6	448862	448867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422933
8521	NC_017269	CGG	2	6	448899	448904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422933
8522	NC_017269	TCACA	2	10	448912	448921	40 %	20 %	0 %	40 %	384422933
8523	NC_017269	TTGA	2	8	448922	448929	25 %	50 %	25 %	0 %	384422933
8524	NC_017269	TGA	3	9	448927	448935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422933
8525	NC_017269	CT	3	6	448946	448951	0 %	50 %	0 %	50 %	384422933
8526	NC_017269	ATG	2	6	448977	448982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422933
8527	NC_017269	CGG	2	6	449010	449015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422933
8528	NC_017269	AC	3	6	449142	449147	50 %	0 %	0 %	50 %	384422933
8529	NC_017269	GCG	2	6	449201	449206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422933
8530	NC_017269	ATT	2	6	449342	449347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422933
8531	NC_017269	TGG	2	6	449653	449658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_017269	CAC	2	6	449740	449745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422934
8533	NC_017269	TGC	2	6	449835	449840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422934
8534	NC_017269	ATG	2	6	449876	449881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422934
8535	NC_017269	TAG	2	6	449889	449894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422934
8536	NC_017269	TCA	2	6	449970	449975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422934
8537	NC_017269	CAA	2	6	450110	450115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422935
8538	NC_017269	AGC	2	6	450149	450154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422935
8539	NC_017269	CAA	2	6	450196	450201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422935
8540	NC_017269	ATG	2	6	450269	450274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422935
8541	NC_017269	TGA	2	6	450280	450285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422935
8542	NC_017269	CTCG	2	8	450299	450306	0 %	25 %	25 %	50 %	384422935
8543	NC_017269	ACA	2	6	450348	450353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422935
8544	NC_017269	TGG	2	6	450380	450385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422935
8545	NC_017269	TTG	2	6	450531	450536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422935
8546	NC_017269	CA	3	6	450570	450575	50 %	0 %	0 %	50 %	384422935
8547	NC_017269	GC	3	6	450602	450607	0 %	0 %	50 %	50 %	384422935
8548	NC_017269	TCA	2	6	450690	450695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422935
8549	NC_017269	TGC	2	6	450810	450815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422935
8550	NC_017269	GTAT	2	8	450823	450830	25 %	50 %	25 %	0 %	384422935
8551	NC_017269	CTT	2	6	450944	450949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_017269	TCA	2	6	451164	451169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_017269	TCAT	2	8	451191	451198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8554	NC_017269	A	6	6	451229	451234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_017269	CAC	2	6	451279	451284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8556	NC_017269	GCC	2	6	451471	451476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_017269	T	7	7	451480	451486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_017269	GCC	2	6	451523	451528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8559	NC_017269	TGC	2	6	451531	451536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_017269	GCG	2	6	451555	451560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_017269	ATG	2	6	451574	451579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_017269	T	6	6	451629	451634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_017269	TTG	2	6	451673	451678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_017269	TCA	2	6	451689	451694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_017269	GGCGC	2	10	451718	451727	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8566	NC_017269	GCT	2	6	451750	451755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_017269	GAT	2	6	451777	451782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_017269	CAA	2	6	451798	451803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_017269	TCA	2	6	451809	451814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_017269	T	6	6	451862	451867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_017269	ATA	2	6	451898	451903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_017269	TCAG	2	8	451917	451924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8573	NC_017269	GCA	2	6	452001	452006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_017269	CTT	2	6	452063	452068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_017269	GCA	2	6	452171	452176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_017269	A	8	8	452192	452199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_017269	GTT	2	6	452225	452230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_017269	CAT	2	6	452268	452273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8580	NC_017269	A	6	6	452527	452532	100 %	0 %	0 %	0 %	384422936
8581	NC_017269	CCAG	2	8	452535	452542	25 %	0 %	25 %	50 %	384422936
8582	NC_017269	TGAT	2	8	452606	452613	25 %	50 %	25 %	0 %	384422936
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8585	NC_017269	TCTT	2	8	452754	452761	0 %	75 %	0 %	25 %	384422936
8586	NC_017269	CG	3	6	452875	452880	0 %	0 %	50 %	50 %	384422936
8587	NC_017269	AAG	2	6	452897	452902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422936
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8589	NC_017269	GCGT	2	8	452946	452953	0 %	25 %	50 %	25 %	384422936
8590	NC_017269	GT	3	6	452966	452971	0 %	50 %	50 %	0 %	384422936
8591	NC_017269	TC	3	6	452978	452983	0 %	50 %	0 %	50 %	384422936
8592	NC_017269	AAG	2	6	453020	453025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422936
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8594	NC_017269	ACT	2	6	453083	453088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422936
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8597	NC_017269	TTG	2	6	453453	453458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_017269	CCT	2	6	453475	453480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8599	NC_017269	AAC	2	6	453511	453516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_017269	GCT	2	6	453716	453721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_017269	TG	3	6	453782	453787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_017269	GCA	2	6	453894	453899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_017269	CGCAG	2	10	453904	453913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8604	NC_017269	GGT	2	6	453937	453942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_017269	CTGATT	2	12	453976	453987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8606	NC_017269	CAT	2	6	454063	454068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_017269	CAAA	2	8	454083	454090	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8608	NC_017269	ATG	2	6	454128	454133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_017269	CG	3	6	454144	454149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8610	NC_017269	TTGGG	2	10	454157	454166	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_017269	TGC	2	6	454183	454188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_017269	GCAA	2	8	454211	454218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_017269	CAG	2	6	454266	454271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_017269	CGC	2	6	454289	454294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8615	NC_017269	GCCA	2	8	454309	454316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_017269	AGC	2	6	454324	454329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_017269	GCG	2	6	454408	454413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_017269	CGCTT	2	10	454444	454453	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8619	NC_017269	GTT	2	6	454545	454550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_017269	CGGA	2	8	454616	454623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8621	NC_017269	GCC	2	6	454642	454647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8622	NC_017269	CCAA	2	8	454655	454662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_017269	TTG	2	6	454839	454844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_017269	CGC	2	6	454878	454883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8625	NC_017269	AG	3	6	454935	454940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_017269	ATC	2	6	455073	455078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_017269	GCA	2	6	455081	455086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_017269	GTT	2	6	455188	455193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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