MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017269	TAAGCG	2	12	260811	260822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384422752
5002	NC_017269	CAT	2	6	260863	260868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422752
5003	NC_017269	GCG	2	6	261015	261020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422752
5004	NC_017269	TG	3	6	261021	261026	0 %	50 %	50 %	0 %	384422752
5005	NC_017269	CAT	2	6	261055	261060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422752
5006	NC_017269	CATG	2	8	261106	261113	25 %	25 %	25 %	25 %	384422752
5007	NC_017269	AAT	2	6	261119	261124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422752
5008	NC_017269	TTGA	2	8	261233	261240	25 %	50 %	25 %	0 %	384422752
5009	NC_017269	TGT	2	6	261405	261410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422752
5010	NC_017269	TAA	2	6	261417	261422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422752
5011	NC_017269	TTG	2	6	261576	261581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422752
5012	NC_017269	CATT	2	8	261633	261640	25 %	50 %	0 %	25 %	384422752
5013	NC_017269	T	6	6	261674	261679	0 %	100 %	0 %	0 %	384422752
5014	NC_017269	GCG	3	9	261687	261695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422752
5015	NC_017269	TGC	2	6	261701	261706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422752
5016	NC_017269	GCT	2	6	261767	261772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422752
5017	NC_017269	TGC	2	6	261782	261787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422752
5018	NC_017269	GAT	2	6	261816	261821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422752
5019	NC_017269	CT	3	6	261834	261839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_017269	CAT	2	6	261858	261863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017269	GAA	2	6	261897	261902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017269	A	6	6	261940	261945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017269	TTG	2	6	261974	261979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017269	GT	3	6	262026	262031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017269	GCC	2	6	262053	262058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_017269	TTA	2	6	262093	262098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017269	T	6	6	262138	262143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017269	CAC	2	6	262184	262189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_017269	CTG	2	6	262236	262241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422753
5030	NC_017269	AGT	2	6	262247	262252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422753
5031	NC_017269	ATT	2	6	262266	262271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422753
5032	NC_017269	GC	3	6	262565	262570	0 %	0 %	50 %	50 %	384422753
5033	NC_017269	GGC	2	6	262613	262618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422753
5034	NC_017269	GCT	2	6	262718	262723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422753
5035	NC_017269	GCC	2	6	262745	262750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422753
5036	NC_017269	GGC	2	6	262796	262801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422753
5037	NC_017269	CAAG	2	8	262805	262812	50 %	0 %	25 %	25 %	384422753
5038	NC_017269	ATG	2	6	262825	262830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422753
5039	NC_017269	AGCT	2	8	262851	262858	25 %	25 %	25 %	25 %	384422753
5040	NC_017269	TCA	2	6	262869	262874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017269	TTGA	2	8	262904	262911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017269	CG	3	6	262922	262927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_017269	TCGC	2	8	262932	262939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_017269	TG	3	6	263028	263033	0 %	50 %	50 %	0 %	384422754
5045	NC_017269	TCC	2	6	263047	263052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422754
5046	NC_017269	GC	3	6	263070	263075	0 %	0 %	50 %	50 %	384422754
5047	NC_017269	TGC	2	6	263117	263122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422754
5048	NC_017269	CCAG	2	8	263139	263146	25 %	0 %	25 %	50 %	384422754
5049	NC_017269	TTG	2	6	263200	263205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422754
5050	NC_017269	GCT	2	6	263217	263222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422754
5051	NC_017269	CG	3	6	263228	263233	0 %	0 %	50 %	50 %	384422754
5052	NC_017269	CACG	2	8	263304	263311	25 %	0 %	25 %	50 %	384422754
5053	NC_017269	GTG	2	6	263350	263355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422754
5054	NC_017269	TCA	2	6	263369	263374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422754
5055	NC_017269	A	6	6	263462	263467	100 %	0 %	0 %	0 %	384422754
5056	NC_017269	ATA	2	6	263500	263505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422754
5057	NC_017269	GGC	2	6	263668	263673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422754
5058	NC_017269	TGC	2	6	263691	263696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422754
5059	NC_017269	AGG	2	6	263811	263816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422754
5060	NC_017269	TGCT	2	8	264070	264077	0 %	50 %	25 %	25 %	384422754
5061	NC_017269	TCAG	2	8	264152	264159	25 %	25 %	25 %	25 %	384422754
5062	NC_017269	GCT	2	6	264171	264176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422754
5063	NC_017269	TC	3	6	264246	264251	0 %	50 %	0 %	50 %	384422754
5064	NC_017269	T	6	6	264262	264267	0 %	100 %	0 %	0 %	384422754
5065	NC_017269	T	7	7	264295	264301	0 %	100 %	0 %	0 %	384422754
5066	NC_017269	CCA	2	6	264381	264386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422754
5067	NC_017269	T	6	6	264444	264449	0 %	100 %	0 %	0 %	384422754
5068	NC_017269	TGC	2	6	264632	264637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422754
5069	NC_017269	TGG	2	6	264660	264665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422754
5070	NC_017269	TGA	2	6	264684	264689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422754
5071	NC_017269	GC	3	6	264705	264710	0 %	0 %	50 %	50 %	384422754
5072	NC_017269	AAT	2	6	264768	264773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422754
5073	NC_017269	TTG	2	6	264934	264939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422754
5074	NC_017269	TGT	2	6	265019	265024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422754
5075	NC_017269	CTTG	2	8	265077	265084	0 %	50 %	25 %	25 %	384422754
5076	NC_017269	GT	3	6	265098	265103	0 %	50 %	50 %	0 %	384422754
5077	NC_017269	GC	3	6	265158	265163	0 %	0 %	50 %	50 %	384422754
5078	NC_017269	CAG	3	9	265168	265176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422754
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5080	NC_017269	TGGG	2	8	265402	265409	0 %	25 %	75 %	0 %	384422755
5081	NC_017269	AGG	2	6	265412	265417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422755
5082	NC_017269	GTA	2	6	265444	265449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422755
5083	NC_017269	A	6	6	265466	265471	100 %	0 %	0 %	0 %	384422755
5084	NC_017269	CAG	2	6	265583	265588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422755
5085	NC_017269	GCT	2	6	265597	265602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422755
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5087	NC_017269	GT	3	6	265933	265938	0 %	50 %	50 %	0 %	384422755
5088	NC_017269	GTG	2	6	266002	266007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422755
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5090	NC_017269	GGC	2	6	266037	266042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422755
5091	NC_017269	GCG	2	6	266055	266060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422755
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5094	NC_017269	AGC	2	6	266264	266269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422756
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5096	NC_017269	TGG	2	6	266462	266467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422756
5097	NC_017269	GCAT	2	8	266689	266696	25 %	25 %	25 %	25 %	384422756
5098	NC_017269	GAC	2	6	266804	266809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422757
5099	NC_017269	GCC	2	6	266823	266828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422757
5100	NC_017269	TGA	2	6	266837	266842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422757
5101	NC_017269	GA	3	6	266891	266896	50 %	0 %	50 %	0 %	384422757
5102	NC_017269	GGC	2	6	267016	267021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422757
5103	NC_017269	TGC	2	6	267028	267033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422757
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5105	NC_017269	TAA	2	6	267076	267081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422757
5106	NC_017269	GC	3	6	267174	267179	0 %	0 %	50 %	50 %	384422757
5107	NC_017269	AGT	2	6	267203	267208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422757
5108	NC_017269	TGA	2	6	267241	267246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422757
5109	NC_017269	CT	3	6	267268	267273	0 %	50 %	0 %	50 %	384422757
5110	NC_017269	TCA	2	6	267292	267297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422757
5111	NC_017269	CAG	2	6	267363	267368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422757
5112	NC_017269	CTT	2	6	267395	267400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422757
5113	NC_017269	CGCAG	2	10	267421	267430	20 %	0 %	40 %	40 %	384422757
5114	NC_017269	GCAA	2	8	267439	267446	50 %	0 %	25 %	25 %	384422757
5115	NC_017269	CTG	2	6	267484	267489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422757
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5118	NC_017269	GCT	2	6	267624	267629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422757
5119	NC_017269	TCA	2	6	267640	267645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422757
5120	NC_017269	GAT	2	6	267728	267733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422757
5121	NC_017269	CCG	2	6	267833	267838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422757
5122	NC_017269	GCG	2	6	267878	267883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422757
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5124	NC_017269	TGACTG	2	12	268021	268032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384422757
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5245	NC_017269	GC	3	6	273312	273317	0 %	0 %	50 %	50 %	384422767
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5498	NC_017269	ATG	2	6	286520	286525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_017269	ATA	2	6	286616	286621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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