MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017269	CTGC	2	8	234667	234674	0 %	25 %	25 %	50 %	384422728
4502	NC_017269	ACT	2	6	234765	234770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422728
4503	NC_017269	AG	3	6	234789	234794	50 %	0 %	50 %	0 %	384422728
4504	NC_017269	GTG	2	6	234841	234846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422728
4505	NC_017269	AAC	2	6	234861	234866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422728
4506	NC_017269	GCG	2	6	235043	235048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422728
4507	NC_017269	GACCA	2	10	235117	235126	40 %	0 %	20 %	40 %	384422728
4508	NC_017269	AGCC	2	8	235156	235163	25 %	0 %	25 %	50 %	384422728
4509	NC_017269	GCA	2	6	235307	235312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4510	NC_017269	GCCC	2	8	235503	235510	0 %	0 %	25 %	75 %	384422728
4511	NC_017269	AG	3	6	235515	235520	50 %	0 %	50 %	0 %	384422728
4512	NC_017269	ATC	2	6	235590	235595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422728
4513	NC_017269	TCG	2	6	235598	235603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4514	NC_017269	CG	3	6	235642	235647	0 %	0 %	50 %	50 %	384422728
4515	NC_017269	TGGCT	2	10	235694	235703	0 %	40 %	40 %	20 %	384422728
4516	NC_017269	CTG	2	6	235706	235711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4517	NC_017269	ATC	2	6	235746	235751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422728
4518	NC_017269	CG	3	6	235877	235882	0 %	0 %	50 %	50 %	384422728
4519	NC_017269	GCT	2	6	235910	235915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4520	NC_017269	GCCC	2	8	236004	236011	0 %	0 %	25 %	75 %	384422728
4521	NC_017269	CA	3	6	236117	236122	50 %	0 %	0 %	50 %	384422728
4522	NC_017269	AC	3	6	236270	236275	50 %	0 %	0 %	50 %	384422728
4523	NC_017269	CTT	2	6	236285	236290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422728
4524	NC_017269	ATC	2	6	236311	236316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422728
4525	NC_017269	TTACCG	2	12	236350	236361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384422728
4526	NC_017269	CG	3	6	236414	236419	0 %	0 %	50 %	50 %	384422728
4527	NC_017269	ATT	2	6	236466	236471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422728
4528	NC_017269	TAA	2	6	236494	236499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422728
4529	NC_017269	CTG	2	6	236528	236533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4530	NC_017269	ATC	2	6	236709	236714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422728
4531	NC_017269	GCT	2	6	236846	236851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4532	NC_017269	TCC	2	6	236905	236910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422728
4533	NC_017269	AATT	2	8	236988	236995	50 %	50 %	0 %	0 %	384422728
4534	NC_017269	CAC	2	6	237006	237011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422728
4535	NC_017269	CTG	2	6	237046	237051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422728
4536	NC_017269	A	6	6	237052	237057	100 %	0 %	0 %	0 %	384422728
4537	NC_017269	CGG	2	6	237065	237070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422728
4538	NC_017269	T	7	7	237083	237089	0 %	100 %	0 %	0 %	384422728
4539	NC_017269	GAA	2	6	237238	237243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422729
4540	NC_017269	TTA	3	9	237277	237285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422729
4541	NC_017269	TGC	2	6	237322	237327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422729
4542	NC_017269	TCAA	2	8	237361	237368	50 %	25 %	0 %	25 %	384422729
4543	NC_017269	ATTA	2	8	237372	237379	50 %	50 %	0 %	0 %	384422729
4544	NC_017269	TCA	2	6	237385	237390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422729
4545	NC_017269	ATA	2	6	237410	237415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422729
4546	NC_017269	TGGC	2	8	237496	237503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_017269	ATT	2	6	237525	237530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017269	ATC	2	6	237576	237581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_017269	TAA	2	6	237597	237602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017269	GTTA	2	8	237670	237677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017269	TAAA	2	8	237685	237692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017269	AATA	2	8	237706	237713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017269	AT	3	6	237739	237744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017269	ATAAA	2	10	237770	237779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017269	AAT	2	6	237784	237789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017269	GTG	2	6	237831	237836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017269	T	6	6	238029	238034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017269	GCTG	2	8	238055	238062	0 %	25 %	50 %	25 %	384422730
4559	NC_017269	GCA	2	6	238202	238207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422730
4560	NC_017269	CGTT	2	8	238302	238309	0 %	50 %	25 %	25 %	384422730
4561	NC_017269	ACG	2	6	238465	238470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422730
4562	NC_017269	CGT	2	6	238581	238586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422730
4563	NC_017269	TC	3	6	238611	238616	0 %	50 %	0 %	50 %	384422730
4564	NC_017269	TGGT	2	8	238633	238640	0 %	50 %	50 %	0 %	384422730
4565	NC_017269	CCG	2	6	238663	238668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422730
4566	NC_017269	ATC	2	6	238699	238704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422730
4567	NC_017269	GTCA	2	8	238787	238794	25 %	25 %	25 %	25 %	384422730
4568	NC_017269	TC	3	6	238834	238839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_017269	CA	3	6	238969	238974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_017269	GGAA	2	8	239068	239075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017269	ATT	2	6	239111	239116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422731
4572	NC_017269	TGC	2	6	239126	239131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422731
4573	NC_017269	ACC	2	6	239172	239177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422731
4574	NC_017269	GTT	2	6	239333	239338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422731
4575	NC_017269	TGATTG	2	12	239380	239391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384422731
4576	NC_017269	ACG	2	6	239413	239418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422731
4577	NC_017269	TGC	2	6	239450	239455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422731
4578	NC_017269	CAG	2	6	239490	239495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422731
4579	NC_017269	CAT	2	6	239576	239581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422731
4580	NC_017269	CAAC	2	8	239588	239595	50 %	0 %	0 %	50 %	384422731
4581	NC_017269	GGC	2	6	239631	239636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422731
4582	NC_017269	GAC	2	6	239642	239647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422731
4583	NC_017269	AG	3	6	239720	239725	50 %	0 %	50 %	0 %	384422731
4584	NC_017269	TGATC	2	10	239735	239744	20 %	40 %	20 %	20 %	384422731
4585	NC_017269	TGG	2	6	239785	239790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422731
4586	NC_017269	GTG	2	6	239805	239810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422731
4587	NC_017269	CCA	2	6	239863	239868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422731
4588	NC_017269	GGA	2	6	239999	240004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017269	CTC	2	6	240014	240019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_017269	GTT	2	6	240067	240072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422732
4591	NC_017269	TGTT	2	8	240089	240096	0 %	75 %	25 %	0 %	384422732
4592	NC_017269	TGA	2	6	240135	240140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422732
4593	NC_017269	CTG	2	6	240157	240162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422732
4594	NC_017269	ATT	2	6	240180	240185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422732
4595	NC_017269	GCA	2	6	240234	240239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422732
4596	NC_017269	TTCA	2	8	240394	240401	25 %	50 %	0 %	25 %	384422732
4597	NC_017269	CAT	2	6	240444	240449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422732
4598	NC_017269	ATG	2	6	240497	240502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422732
4599	NC_017269	TC	3	6	240513	240518	0 %	50 %	0 %	50 %	384422732
4600	NC_017269	CGCA	2	8	240615	240622	25 %	0 %	25 %	50 %	384422732
4601	NC_017269	ATC	2	6	240688	240693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422732
4602	NC_017269	CAT	2	6	240711	240716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422732
4603	NC_017269	GTT	2	6	240852	240857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422732
4604	NC_017269	TCA	2	6	240878	240883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422732
4605	NC_017269	ATC	2	6	240913	240918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422732
4606	NC_017269	GGT	2	6	240928	240933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422732
4607	NC_017269	CTG	3	9	240992	241000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422733
4608	NC_017269	CTG	2	6	241013	241018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422733
4609	NC_017269	GCG	2	6	241022	241027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422733
4610	NC_017269	T	6	6	241069	241074	0 %	100 %	0 %	0 %	384422733
4611	NC_017269	TCGCG	2	10	241076	241085	0 %	20 %	40 %	40 %	384422733
4612	NC_017269	ATTGCG	2	12	241118	241129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384422733
4613	NC_017269	GTC	2	6	241132	241137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422733
4614	NC_017269	GTG	2	6	241229	241234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422733
4615	NC_017269	AGT	2	6	241250	241255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422733
4616	NC_017269	GGC	2	6	241294	241299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422733
4617	NC_017269	GCT	2	6	241318	241323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422733
4618	NC_017269	T	6	6	241398	241403	0 %	100 %	0 %	0 %	384422733
4619	NC_017269	CTTT	2	8	241416	241423	0 %	75 %	0 %	25 %	384422733
4620	NC_017269	TAA	2	6	241483	241488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422733
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4622	NC_017269	TGT	2	6	241545	241550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422733
4623	NC_017269	AGATAA	2	12	241585	241596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384422733
4624	NC_017269	GC	3	6	241653	241658	0 %	0 %	50 %	50 %	384422733
4625	NC_017269	T	6	6	241700	241705	0 %	100 %	0 %	0 %	384422733
4626	NC_017269	GCT	2	6	241708	241713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422733
4627	NC_017269	TGC	2	6	241764	241769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422733
4628	NC_017269	ATC	2	6	241817	241822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422733
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4631	NC_017269	CGG	2	6	241873	241878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422733
4632	NC_017269	GCT	2	6	242049	242054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422734
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4638	NC_017269	GTG	2	6	242333	242338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422734
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4643	NC_017269	CGTGA	2	10	242584	242593	20 %	20 %	40 %	20 %	384422734
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4649	NC_017269	GCT	2	6	243379	243384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422735
4650	NC_017269	CA	3	6	243421	243426	50 %	0 %	0 %	50 %	384422735
4651	NC_017269	ATC	2	6	243440	243445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422735
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4654	NC_017269	TGG	2	6	243502	243507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422735
4655	NC_017269	TCA	2	6	243508	243513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422735
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4657	NC_017269	AT	3	6	243791	243796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4658	NC_017269	AAG	2	6	243850	243855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422736
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4702	NC_017269	A	7	7	246335	246341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4741	NC_017269	AGTG	2	8	248291	248298	25 %	25 %	50 %	0 %	384422740
4742	NC_017269	TTCC	2	8	248342	248349	0 %	50 %	0 %	50 %	384422740
4743	NC_017269	TTG	2	6	248391	248396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422740
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4996	NC_017269	AGC	2	6	260625	260630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422752
4997	NC_017269	GCA	2	6	260689	260694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422752
4998	NC_017269	TTATCT	2	12	260739	260750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384422752
4999	NC_017269	ATC	2	6	260765	260770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422752
5000	NC_017269	CCA	2	6	260790	260795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422752

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