MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016945	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016945	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016945	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016945	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016945	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016945	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016945	AGC	3	9	309	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016945	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016945	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016945	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016945	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016945	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016945	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016945	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016945	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016945	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016945	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016945	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016945	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016945	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016945	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016945	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016945	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016945	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743461
26	NC_016945	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743461
27	NC_016945	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	379743461
28	NC_016945	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
29	NC_016945	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
30	NC_016945	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
31	NC_016945	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	379743461
32	NC_016945	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	379743461
33	NC_016945	AAAAGC	2	12	1546	1557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379743461
34	NC_016945	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	379743461
35	NC_016945	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	379743461
36	NC_016945	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
37	NC_016945	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
38	NC_016945	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
39	NC_016945	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	379743461
40	NC_016945	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
41	NC_016945	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
42	NC_016945	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
43	NC_016945	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743461
44	NC_016945	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	379743461
45	NC_016945	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	379743461
46	NC_016945	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	379743461
47	NC_016945	T	6	6	2190	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	379743461
48	NC_016945	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743461
49	NC_016945	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743461
50	NC_016945	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
51	NC_016945	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
52	NC_016945	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
53	NC_016945	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	379743461
54	NC_016945	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	379743461
55	NC_016945	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743461
56	NC_016945	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	379743461
57	NC_016945	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743461
58	NC_016945	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
59	NC_016945	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
60	NC_016945	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
61	NC_016945	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743461
62	NC_016945	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	379743461
63	NC_016945	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
64	NC_016945	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743461
65	NC_016945	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	379743461
66	NC_016945	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	379743461
67	NC_016945	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016945	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016945	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016945	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016945	T	7	7	3279	3285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016945	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743462
73	NC_016945	TGAGAT	2	12	3415	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743462
74	NC_016945	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	379743462
75	NC_016945	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743462
76	NC_016945	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743462
77	NC_016945	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	379743462
78	NC_016945	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743462
79	NC_016945	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743462
80	NC_016945	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	379743462
81	NC_016945	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	379743462
82	NC_016945	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743462
83	NC_016945	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	379743462
84	NC_016945	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016945	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743463
86	NC_016945	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743463
87	NC_016945	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743463
88	NC_016945	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743463
89	NC_016945	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743463
90	NC_016945	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016945	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	379743464
92	NC_016945	A	7	7	4548	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	379743464
93	NC_016945	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743464
94	NC_016945	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	379743464
95	NC_016945	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016945	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016945	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743465
98	NC_016945	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743465
99	NC_016945	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	379743465
100	NC_016945	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	379743465
101	NC_016945	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743465
102	NC_016945	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	379743465
103	NC_016945	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	379743465
104	NC_016945	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743465
105	NC_016945	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743465
106	NC_016945	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743465
107	NC_016945	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	379743465
108	NC_016945	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743465
109	NC_016945	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743465
110	NC_016945	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743465
111	NC_016945	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743465
112	NC_016945	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743466
113	NC_016945	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743466
114	NC_016945	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	379743466
115	NC_016945	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743466
116	NC_016945	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
117	NC_016945	CAT	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743466
118	NC_016945	GTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
119	NC_016945	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	379743466
120	NC_016945	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	379743466
121	NC_016945	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	379743466
122	NC_016945	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
123	NC_016945	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	379743466
124	NC_016945	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	379743466
125	NC_016945	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	379743466
126	NC_016945	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743466
127	NC_016945	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743466
128	NC_016945	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016945	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	379743467
130	NC_016945	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743467
131	NC_016945	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	379743467
132	NC_016945	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
133	NC_016945	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	379743467
134	NC_016945	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
135	NC_016945	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	379743467
136	NC_016945	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	379743467
137	NC_016945	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743467
138	NC_016945	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
139	NC_016945	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743467
140	NC_016945	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	379743467
141	NC_016945	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
142	NC_016945	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743467
143	NC_016945	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743467
144	NC_016945	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	379743467
145	NC_016945	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
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149	NC_016945	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
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164	NC_016945	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016945	CGGTAT	2	12	8331	8342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_016945	CTTG	2	8	8396	8403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_016945	TAA	2	6	8449	8454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016945	AGTG	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016945	AG	3	6	8514	8519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016945	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743468
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172	NC_016945	CAA	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743468
173	NC_016945	GCC	2	6	8612	8617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743468
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242	NC_016945	ATT	2	6	11986	11991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_016945	GGC	2	6	13182	13187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743470
266	NC_016945	GCG	2	6	13309	13314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743470
267	NC_016945	ACCA	2	8	13345	13352	50 %	0 %	0 %	50 %	379743470
268	NC_016945	CTG	2	6	13357	13362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743470
269	NC_016945	GAGT	2	8	13383	13390	25 %	25 %	50 %	0 %	379743470
270	NC_016945	CTG	2	6	13405	13410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743470
271	NC_016945	ACC	2	6	13442	13447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743470
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292	NC_016945	GAA	2	6	14323	14328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743470
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383	NC_016945	T	6	6	19628	19633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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