MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016945	TGA	2	6	52075	52080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743500
1002	NC_016945	CAC	2	6	52165	52170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743500
1003	NC_016945	TG	3	6	52195	52200	0 %	50 %	50 %	0 %	379743500
1004	NC_016945	CTC	2	6	52213	52218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379743500
1005	NC_016945	TCTG	2	8	52228	52235	0 %	50 %	25 %	25 %	379743500
1006	NC_016945	GCA	2	6	52261	52266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1007	NC_016945	ACC	2	6	52302	52307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743500
1008	NC_016945	AAGC	2	8	52400	52407	50 %	0 %	25 %	25 %	379743500
1009	NC_016945	TCG	2	6	52429	52434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1010	NC_016945	TGG	2	6	52491	52496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743500
1011	NC_016945	ATG	2	6	52692	52697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743500
1012	NC_016945	TCC	2	6	52712	52717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379743500
1013	NC_016945	GAC	2	6	52747	52752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1014	NC_016945	TGA	2	6	53113	53118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743500
1015	NC_016945	TGG	2	6	53121	53126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743500
1016	NC_016945	ATG	2	6	53133	53138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743500
1017	NC_016945	TTCAAT	2	12	53171	53182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379743500
1018	NC_016945	CAG	2	6	53256	53261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1019	NC_016945	GGT	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743500
1020	NC_016945	AGC	2	6	53292	53297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1021	NC_016945	CTCA	2	8	53320	53327	25 %	25 %	0 %	50 %	379743500
1022	NC_016945	ATT	2	6	53330	53335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743500
1023	NC_016945	ATC	2	6	53369	53374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743500
1024	NC_016945	AATC	2	8	53410	53417	50 %	25 %	0 %	25 %	379743500
1025	NC_016945	TGA	2	6	53488	53493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743500
1026	NC_016945	CTT	2	6	53797	53802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743500
1027	NC_016945	GAG	2	6	53825	53830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743500
1028	NC_016945	ATG	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743500
1029	NC_016945	GCGT	2	8	53877	53884	0 %	25 %	50 %	25 %	379743500
1030	NC_016945	ATT	2	6	53948	53953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743500
1031	NC_016945	GAAA	2	8	53968	53975	75 %	0 %	25 %	0 %	379743500
1032	NC_016945	GAG	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743500
1033	NC_016945	GCT	2	6	54112	54117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1034	NC_016945	GATG	2	8	54199	54206	25 %	25 %	50 %	0 %	379743500
1035	NC_016945	AAG	2	6	54474	54479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743500
1036	NC_016945	AGC	2	6	54537	54542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1037	NC_016945	GATT	2	8	54555	54562	25 %	50 %	25 %	0 %	379743500
1038	NC_016945	ATC	2	6	54623	54628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743500
1039	NC_016945	GCC	2	6	54692	54697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743500
1040	NC_016945	CTG	2	6	54707	54712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743500
1041	NC_016945	CAA	2	6	54752	54757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016945	A	6	6	54756	54761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016945	CGTT	2	8	54832	54839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_016945	C	6	6	54840	54845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1045	NC_016945	GT	3	6	54853	54858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016945	GCC	2	6	54886	54891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_016945	GAGGTA	2	12	54937	54948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379743501
1048	NC_016945	ATC	2	6	55066	55071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743501
1049	NC_016945	CAC	2	6	55134	55139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743501
1050	NC_016945	TACCT	2	10	55198	55207	20 %	40 %	0 %	40 %	379743501
1051	NC_016945	AG	3	6	55259	55264	50 %	0 %	50 %	0 %	379743501
1052	NC_016945	GACA	2	8	55339	55346	50 %	0 %	25 %	25 %	379743501
1053	NC_016945	GCAC	2	8	55394	55401	25 %	0 %	25 %	50 %	379743501
1054	NC_016945	CAC	2	6	55470	55475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743501
1055	NC_016945	GGC	2	6	55534	55539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743501
1056	NC_016945	CTT	2	6	55722	55727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743501
1057	NC_016945	GAACA	2	10	55783	55792	60 %	0 %	20 %	20 %	379743501
1058	NC_016945	TGGTT	2	10	55811	55820	0 %	60 %	40 %	0 %	379743501
1059	NC_016945	CCA	2	6	55833	55838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743501
1060	NC_016945	AGT	2	6	55867	55872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743501
1061	NC_016945	GGT	2	6	55905	55910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743501
1062	NC_016945	TCA	2	6	55917	55922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743501
1063	NC_016945	CGC	2	6	55950	55955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743501
1064	NC_016945	AC	3	6	56018	56023	50 %	0 %	0 %	50 %	379743501
1065	NC_016945	CAG	2	6	56044	56049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743501
1066	NC_016945	ATT	2	6	56057	56062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743501
1067	NC_016945	GA	4	8	56107	56114	50 %	0 %	50 %	0 %	379743502
1068	NC_016945	TCA	2	6	56158	56163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743502
1069	NC_016945	AATG	2	8	56312	56319	50 %	25 %	25 %	0 %	379743502
1070	NC_016945	AAT	2	6	56379	56384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743502
1071	NC_016945	CGA	2	6	56405	56410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743502
1072	NC_016945	AAT	2	6	56432	56437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743502
1073	NC_016945	ATA	2	6	56514	56519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016945	ATA	2	6	56540	56545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016945	TGC	2	6	56571	56576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016945	AC	4	8	56589	56596	50 %	0 %	0 %	50 %	379743503
1077	NC_016945	ACGT	2	8	56650	56657	25 %	25 %	25 %	25 %	379743503
1078	NC_016945	GCAT	2	8	56769	56776	25 %	25 %	25 %	25 %	379743503
1079	NC_016945	AGG	2	6	56842	56847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743503
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1081	NC_016945	TCA	2	6	56925	56930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743503
1082	NC_016945	GCA	3	9	56986	56994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743503
1083	NC_016945	CCAA	2	8	57013	57020	50 %	0 %	0 %	50 %	379743503
1084	NC_016945	CGG	2	6	57021	57026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743503
1085	NC_016945	TTC	2	6	57084	57089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743503
1086	NC_016945	GGT	2	6	57098	57103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743503
1087	NC_016945	GGC	2	6	57169	57174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743503
1088	NC_016945	TCA	2	6	57214	57219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743503
1089	NC_016945	CTTT	2	8	57241	57248	0 %	75 %	0 %	25 %	379743503
1090	NC_016945	CA	3	6	57286	57291	50 %	0 %	0 %	50 %	379743503
1091	NC_016945	GAAT	2	8	57333	57340	50 %	25 %	25 %	0 %	379743503
1092	NC_016945	CAG	2	6	57368	57373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743503
1093	NC_016945	TGG	2	6	57376	57381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743503
1094	NC_016945	AG	3	6	57404	57409	50 %	0 %	50 %	0 %	379743503
1095	NC_016945	TCA	2	6	57493	57498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743503
1096	NC_016945	TTG	2	6	57518	57523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743503
1097	NC_016945	GCTTG	2	10	57532	57541	0 %	40 %	40 %	20 %	379743503
1098	NC_016945	CAG	2	6	57563	57568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743503
1099	NC_016945	TCA	2	6	57594	57599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743503
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1101	NC_016945	GTA	2	6	57728	57733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743503
1102	NC_016945	TCA	2	6	57804	57809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743503
1103	NC_016945	CATGC	2	10	57812	57821	20 %	20 %	20 %	40 %	379743503
1104	NC_016945	CTCA	2	8	57893	57900	25 %	25 %	0 %	50 %	379743503
1105	NC_016945	GCG	2	6	57960	57965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743503
1106	NC_016945	CGG	2	6	58005	58010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743503
1107	NC_016945	TGA	2	6	58021	58026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743503
1108	NC_016945	GGT	2	6	58052	58057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743503
1109	NC_016945	CTT	2	6	58132	58137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743503
1110	NC_016945	GCA	2	6	58229	58234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743504
1111	NC_016945	GCA	2	6	58321	58326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743504
1112	NC_016945	GCT	2	6	58362	58367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743504
1113	NC_016945	AGTG	2	8	58399	58406	25 %	25 %	50 %	0 %	379743504
1114	NC_016945	CA	3	6	58420	58425	50 %	0 %	0 %	50 %	379743504
1115	NC_016945	GAC	2	6	58455	58460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743504
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1118	NC_016945	GA	3	6	58540	58545	50 %	0 %	50 %	0 %	379743504
1119	NC_016945	GC	3	6	58596	58601	0 %	0 %	50 %	50 %	379743504
1120	NC_016945	GCT	2	6	58604	58609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743504
1121	NC_016945	GCA	2	6	58667	58672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743504
1122	NC_016945	TCA	2	6	58673	58678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743504
1123	NC_016945	T	6	6	58695	58700	0 %	100 %	0 %	0 %	379743504
1124	NC_016945	GCC	2	6	58714	58719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743504
1125	NC_016945	TCT	2	6	58735	58740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743504
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1127	NC_016945	AAG	2	6	58773	58778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743504
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