MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016945	GCT	2	6	686207	686212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744151
13002	NC_016945	CGA	2	6	686229	686234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744151
13003	NC_016945	T	6	6	686302	686307	0 %	100 %	0 %	0 %	379744151
13004	NC_016945	GGT	2	6	686318	686323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744151
13005	NC_016945	GTG	2	6	686358	686363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744151
13006	NC_016945	CTT	2	6	686365	686370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744151
13007	NC_016945	CTG	2	6	686438	686443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_016945	TCA	2	6	686510	686515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744152
13009	NC_016945	GCT	2	6	686562	686567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744152
13010	NC_016945	GCG	2	6	686628	686633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744152
13011	NC_016945	TCA	2	6	686671	686676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_016945	ATT	2	6	686709	686714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016945	TTG	2	6	686802	686807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_016945	TCG	2	6	686884	686889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744153
13015	NC_016945	GAT	2	6	686915	686920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744153
13016	NC_016945	A	6	6	686927	686932	100 %	0 %	0 %	0 %	379744153
13017	NC_016945	CTG	2	6	686960	686965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744153
13018	NC_016945	CAT	2	6	687019	687024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744153
13019	NC_016945	CAT	2	6	687067	687072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744153
13020	NC_016945	CGT	2	6	687113	687118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744153
13021	NC_016945	A	6	6	687161	687166	100 %	0 %	0 %	0 %	379744153
13022	NC_016945	GC	3	6	687208	687213	0 %	0 %	50 %	50 %	379744154
13023	NC_016945	TC	3	6	687223	687228	0 %	50 %	0 %	50 %	379744154
13024	NC_016945	ACT	2	6	687518	687523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_016945	GACACT	2	12	687546	687557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_016945	AAT	2	6	687581	687586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744155
13027	NC_016945	TGG	2	6	687631	687636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744155
13028	NC_016945	TGA	2	6	687718	687723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744155
13029	NC_016945	GTC	2	6	687738	687743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744155
13030	NC_016945	A	7	7	687802	687808	100 %	0 %	0 %	0 %	379744155
13031	NC_016945	A	6	6	687846	687851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016945	ATT	2	6	687874	687879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016945	GAAA	2	8	687888	687895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016945	GA	4	8	687905	687912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_016945	CTT	2	6	687922	687927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744156
13036	NC_016945	TCA	2	6	688005	688010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744156
13037	NC_016945	CGAT	2	8	688029	688036	25 %	25 %	25 %	25 %	379744156
13038	NC_016945	GCG	2	6	688101	688106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744156
13039	NC_016945	GTT	2	6	688184	688189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744156
13040	NC_016945	CAC	2	6	688198	688203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744156
13041	NC_016945	CGCAG	2	10	688212	688221	20 %	0 %	40 %	40 %	379744156
13042	NC_016945	GCATC	2	10	688246	688255	20 %	20 %	20 %	40 %	379744156
13043	NC_016945	AAT	2	6	688301	688306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744156
13044	NC_016945	CAC	2	6	688321	688326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744156
13045	NC_016945	CAC	2	6	688397	688402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744156
13046	NC_016945	TGG	2	6	688429	688434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744156
13047	NC_016945	TCA	2	6	688476	688481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744156
13048	NC_016945	TCA	2	6	688612	688617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744156
13049	NC_016945	AAG	2	6	688620	688625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744156
13050	NC_016945	CCGTA	2	10	688630	688639	20 %	20 %	20 %	40 %	379744156
13051	NC_016945	CA	4	8	688664	688671	50 %	0 %	0 %	50 %	379744156
13052	NC_016945	TTG	2	6	688691	688696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744156
13053	NC_016945	ACC	2	6	688739	688744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744156
13054	NC_016945	T	6	6	688775	688780	0 %	100 %	0 %	0 %	379744156
13055	NC_016945	CAT	2	6	688790	688795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744156
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13057	NC_016945	GCA	2	6	689103	689108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744156
13058	NC_016945	CAC	2	6	689168	689173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744156
13059	NC_016945	GTTG	2	8	689185	689192	0 %	50 %	50 %	0 %	379744156
13060	NC_016945	TCA	2	6	689214	689219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744156
13061	NC_016945	GCGTA	2	10	689266	689275	20 %	20 %	40 %	20 %	379744156
13062	NC_016945	CCAC	2	8	689296	689303	25 %	0 %	0 %	75 %	379744156
13063	NC_016945	CAT	2	6	689359	689364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744156
13064	NC_016945	GTA	2	6	689391	689396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744156
13065	NC_016945	CGA	2	6	689410	689415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744156
13066	NC_016945	T	6	6	689545	689550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_016945	GC	4	8	689568	689575	0 %	0 %	50 %	50 %	379744157
13068	NC_016945	TTC	2	6	689576	689581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744157
13069	NC_016945	CT	3	6	689583	689588	0 %	50 %	0 %	50 %	379744157
13070	NC_016945	ATCCC	2	10	689753	689762	20 %	20 %	0 %	60 %	379744157
13071	NC_016945	CCA	2	6	689838	689843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744157
13072	NC_016945	GC	3	6	689893	689898	0 %	0 %	50 %	50 %	379744157
13073	NC_016945	TCA	2	6	689907	689912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744157
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13079	NC_016945	GAA	2	6	690341	690346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744157
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13081	NC_016945	CGC	2	6	690542	690547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_016945	CAT	2	6	690570	690575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13085	NC_016945	T	6	6	690701	690706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_016945	AAC	2	6	690711	690716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_016945	T	6	6	690722	690727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016945	CT	4	8	690728	690735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_016945	TTA	2	6	690842	690847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_016945	ATC	2	6	690910	690915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_016945	TCCA	2	8	690953	690960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_016945	AAC	2	6	691004	691009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_016945	ATGAA	2	10	691014	691023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016945	AAT	2	6	691024	691029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_016945	TCA	2	6	691107	691112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744158
13096	NC_016945	GGC	3	9	691115	691123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744158
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13098	NC_016945	TGC	2	6	691230	691235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744158
13099	NC_016945	CG	3	6	691315	691320	0 %	0 %	50 %	50 %	379744158
13100	NC_016945	GTTT	2	8	691344	691351	0 %	75 %	25 %	0 %	379744158
13101	NC_016945	AGA	2	6	691363	691368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744158
13102	NC_016945	AAG	2	6	691443	691448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744158
13103	NC_016945	GC	3	6	691566	691571	0 %	0 %	50 %	50 %	379744158
13104	NC_016945	GCGT	2	8	691629	691636	0 %	25 %	50 %	25 %	379744158
13105	NC_016945	GCT	2	6	691768	691773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744158
13106	NC_016945	TAA	2	6	691792	691797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744158
13107	NC_016945	GC	3	6	691996	692001	0 %	0 %	50 %	50 %	379744158
13108	NC_016945	GAT	2	6	692036	692041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744158
13109	NC_016945	AGC	2	6	692088	692093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744158
13110	NC_016945	CAC	2	6	692113	692118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744158
13111	NC_016945	TGA	2	6	692136	692141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744158
13112	NC_016945	AGCA	2	8	692241	692248	50 %	0 %	25 %	25 %	379744158
13113	NC_016945	CGA	2	6	692341	692346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744158
13114	NC_016945	CCG	2	6	692388	692393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744158
13115	NC_016945	AAT	2	6	692429	692434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744158
13116	NC_016945	ACG	2	6	692446	692451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744158
13117	NC_016945	TTG	2	6	692558	692563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744158
13118	NC_016945	CCTT	2	8	692681	692688	0 %	50 %	0 %	50 %	379744158
13119	NC_016945	ACA	2	6	692707	692712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744158
13120	NC_016945	ATG	2	6	692713	692718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744158
13121	NC_016945	ATG	2	6	692723	692728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744159
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13123	NC_016945	GC	3	6	692772	692777	0 %	0 %	50 %	50 %	379744159
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13232	NC_016945	GGCT	2	8	699111	699118	0 %	25 %	50 %	25 %	379744164
13233	NC_016945	TGC	2	6	699137	699142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744164
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13238	NC_016945	T	7	7	699334	699340	0 %	100 %	0 %	0 %	379744164
13239	NC_016945	CAA	2	6	699367	699372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13240	NC_016945	GA	3	6	699373	699378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13241	NC_016945	AAT	2	6	699380	699385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_016945	GAT	2	6	699478	699483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_016945	CAC	2	6	699558	699563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13245	NC_016945	A	6	6	699777	699782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13489	NC_016945	GGC	3	9	713981	713989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744180
13490	NC_016945	GTC	2	6	714080	714085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744180
13491	NC_016945	TAT	2	6	714123	714128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379744180
13492	NC_016945	GAT	2	6	714139	714144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744180
13493	NC_016945	CAG	2	6	714215	714220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744180
13494	NC_016945	CTGCG	2	10	714315	714324	0 %	20 %	40 %	40 %	379744180
13495	NC_016945	AGT	2	6	714394	714399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744180
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13497	NC_016945	GTTT	2	8	714546	714553	0 %	75 %	25 %	0 %	379744180
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