MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_016945	ACC	2	6	580380	580385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744066
11003	NC_016945	GGAA	2	8	580443	580450	50 %	0 %	50 %	0 %	379744066
11004	NC_016945	TTC	2	6	580491	580496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744066
11005	NC_016945	AACC	2	8	580564	580571	50 %	0 %	0 %	50 %	379744066
11006	NC_016945	ATT	2	6	580578	580583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379744066
11007	NC_016945	ATG	2	6	580588	580593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744066
11008	NC_016945	TGC	2	6	580727	580732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744067
11009	NC_016945	CAC	2	6	580789	580794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744067
11010	NC_016945	GCA	2	6	580875	580880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744067
11011	NC_016945	ACT	2	6	580916	580921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744067
11012	NC_016945	GATG	2	8	581040	581047	25 %	25 %	50 %	0 %	379744067
11013	NC_016945	GCT	2	6	581075	581080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744067
11014	NC_016945	TGCTGA	2	12	581094	581105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379744067
11015	NC_016945	CAAA	2	8	581112	581119	75 %	0 %	0 %	25 %	379744067
11016	NC_016945	CCA	2	6	581208	581213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744067
11017	NC_016945	ACCA	2	8	581347	581354	50 %	0 %	0 %	50 %	379744067
11018	NC_016945	GCTC	2	8	581355	581362	0 %	25 %	25 %	50 %	379744067
11019	NC_016945	CAAA	2	8	581375	581382	75 %	0 %	0 %	25 %	379744067
11020	NC_016945	AAT	2	6	581391	581396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744067
11021	NC_016945	CG	3	6	581446	581451	0 %	0 %	50 %	50 %	379744067
11022	NC_016945	CAT	2	6	581485	581490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744067
11023	NC_016945	GCTT	2	8	581552	581559	0 %	50 %	25 %	25 %	379744067
11024	NC_016945	GCT	2	6	581588	581593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744067
11025	NC_016945	TCA	2	6	581661	581666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744067
11026	NC_016945	CATCTT	2	12	581697	581708	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379744067
11027	NC_016945	GCAC	2	8	581877	581884	25 %	0 %	25 %	50 %	379744067
11028	NC_016945	TGAA	2	8	581900	581907	50 %	25 %	25 %	0 %	379744067
11029	NC_016945	CGG	2	6	581979	581984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744067
11030	NC_016945	GC	3	6	582063	582068	0 %	0 %	50 %	50 %	379744067
11031	NC_016945	CCAA	2	8	582164	582171	50 %	0 %	0 %	50 %	379744067
11032	NC_016945	GAT	2	6	582207	582212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744067
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11034	NC_016945	TTG	2	6	582340	582345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744067
11035	NC_016945	CAT	2	6	582445	582450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744067
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11039	NC_016945	CCA	2	6	582637	582642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744068
11040	NC_016945	GCG	2	6	582647	582652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744068
11041	NC_016945	TTG	2	6	582690	582695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744068
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11052	NC_016945	CAT	2	6	583522	583527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744069
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11056	NC_016945	TGAA	2	8	583800	583807	50 %	25 %	25 %	0 %	379744070
11057	NC_016945	CAC	2	6	583845	583850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744070
11058	NC_016945	GTA	2	6	583874	583879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744070
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11060	NC_016945	CTG	2	6	584044	584049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744070
11061	NC_016945	A	6	6	584101	584106	100 %	0 %	0 %	0 %	379744070
11062	NC_016945	GGC	2	6	584145	584150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744070
11063	NC_016945	AGCA	2	8	584184	584191	50 %	0 %	25 %	25 %	379744070
11064	NC_016945	TGGTTA	2	12	584239	584250	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11068	NC_016945	AT	3	6	584460	584465	50 %	50 %	0 %	0 %	379744071
11069	NC_016945	TCGCT	2	10	584469	584478	0 %	40 %	20 %	40 %	379744071
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11093	NC_016945	TCT	2	6	585901	585906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744072
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11095	NC_016945	GCT	2	6	585954	585959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744072
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11100	NC_016945	GAAAA	2	10	586093	586102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_016945	AAG	2	6	586146	586151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_016945	TGT	2	6	586203	586208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_016945	T	6	6	586242	586247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_016945	CAAAC	2	10	586277	586286	60 %	0 %	0 %	40 %	379744073
11105	NC_016945	TC	3	6	586316	586321	0 %	50 %	0 %	50 %	379744073
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11107	NC_016945	AGCG	2	8	586437	586444	25 %	0 %	50 %	25 %	379744073
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11109	NC_016945	TG	3	6	586618	586623	0 %	50 %	50 %	0 %	379744073
11110	NC_016945	A	6	6	586645	586650	100 %	0 %	0 %	0 %	379744073
11111	NC_016945	CGC	2	6	586654	586659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744073
11112	NC_016945	TAAG	2	8	586698	586705	50 %	25 %	25 %	0 %	379744073
11113	NC_016945	A	6	6	586820	586825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_016945	T	6	6	586899	586904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11116	NC_016945	ATG	2	6	586964	586969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11118	NC_016945	CAC	2	6	587079	587084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11119	NC_016945	GCA	2	6	587090	587095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11123	NC_016945	CAA	2	6	587788	587793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11233	NC_016945	GGT	2	6	593956	593961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744077
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11235	NC_016945	TGG	2	6	593996	594001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744077
11236	NC_016945	CCTTT	2	10	594005	594014	0 %	60 %	0 %	40 %	379744077
11237	NC_016945	CAC	2	6	594063	594068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744077
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11239	NC_016945	CAG	2	6	594259	594264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744077
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11241	NC_016945	TCTTTT	2	12	594361	594372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11242	NC_016945	CATCGC	2	12	594459	594470	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379744078
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11358	NC_016945	CATA	2	8	600212	600219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11359	NC_016945	CTT	2	6	600245	600250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11362	NC_016945	AATT	2	8	600475	600482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_016945	ACAT	2	8	600498	600505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11364	NC_016945	TGC	2	6	600747	600752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744083
11365	NC_016945	GGC	3	9	600761	600769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744083
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11489	NC_016945	CAAC	2	8	606545	606552	50 %	0 %	0 %	50 %	379744086
11490	NC_016945	AG	3	6	606650	606655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11497	NC_016945	CGT	2	6	606876	606881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744087
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