MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_016945	TCA	2	6	554325	554330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744041
10503	NC_016945	CAA	2	6	554465	554470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744042
10504	NC_016945	AGC	2	6	554504	554509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744042
10505	NC_016945	CAA	2	6	554551	554556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744042
10506	NC_016945	ATG	2	6	554624	554629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744042
10507	NC_016945	GAG	2	6	554636	554641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379744042
10508	NC_016945	CTCG	2	8	554654	554661	0 %	25 %	25 %	50 %	379744042
10509	NC_016945	ACA	2	6	554703	554708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744042
10510	NC_016945	TGG	2	6	554735	554740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744042
10511	NC_016945	TTG	2	6	554886	554891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744042
10512	NC_016945	GC	3	6	554957	554962	0 %	0 %	50 %	50 %	379744042
10513	NC_016945	TCA	2	6	555045	555050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744042
10514	NC_016945	GCT	2	6	555088	555093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744042
10515	NC_016945	TGC	2	6	555102	555107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744042
10516	NC_016945	TGC	2	6	555165	555170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744042
10517	NC_016945	TG	4	8	555181	555188	0 %	50 %	50 %	0 %	379744042
10518	NC_016945	CT	3	6	555200	555205	0 %	50 %	0 %	50 %	379744042
10519	NC_016945	CTT	2	6	555299	555304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_016945	TCAT	2	8	555546	555553	25 %	50 %	0 %	25 %	379744043
10521	NC_016945	A	6	6	555584	555589	100 %	0 %	0 %	0 %	379744043
10522	NC_016945	CAC	2	6	555638	555643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744043
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10525	NC_016945	GAC	2	6	555853	555858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744043
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10527	NC_016945	TGC	2	6	555907	555912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744043
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10529	NC_016945	ATG	2	6	555950	555955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744043
10530	NC_016945	T	6	6	556005	556010	0 %	100 %	0 %	0 %	379744043
10531	NC_016945	TTG	2	6	556049	556054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744043
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10533	NC_016945	GGCGC	2	10	556094	556103	0 %	0 %	60 %	40 %	379744043
10534	NC_016945	GCT	2	6	556126	556131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744043
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10538	NC_016945	T	6	6	556238	556243	0 %	100 %	0 %	0 %	379744043
10539	NC_016945	ATA	2	6	556274	556279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744043
10540	NC_016945	TCAG	2	8	556293	556300	25 %	25 %	25 %	25 %	379744043
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10543	NC_016945	CAA	2	6	556548	556553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_016945	A	8	8	556568	556575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_016945	GTT	2	6	556601	556606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_016945	CAT	2	6	556644	556649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_016945	CT	3	6	556721	556726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10548	NC_016945	ACT	2	6	556739	556744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10550	NC_016945	GAAC	2	8	556811	556818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10551	NC_016945	A	6	6	557007	557012	100 %	0 %	0 %	0 %	379744045
10552	NC_016945	CCAG	2	8	557015	557022	25 %	0 %	25 %	50 %	379744045
10553	NC_016945	TGAT	2	8	557086	557093	25 %	50 %	25 %	0 %	379744045
10554	NC_016945	CAA	2	6	557136	557141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744045
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10556	NC_016945	TCTT	2	8	557234	557241	0 %	75 %	0 %	25 %	379744045
10557	NC_016945	CG	3	6	557355	557360	0 %	0 %	50 %	50 %	379744045
10558	NC_016945	AAG	2	6	557377	557382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744045
10559	NC_016945	CTG	2	6	557403	557408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744045
10560	NC_016945	GCGT	2	8	557426	557433	0 %	25 %	50 %	25 %	379744045
10561	NC_016945	TC	3	6	557458	557463	0 %	50 %	0 %	50 %	379744045
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10566	NC_016945	GCTG	2	8	557813	557820	0 %	25 %	50 %	25 %	379744045
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10569	NC_016945	TTG	2	6	557934	557939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_016945	CCT	2	6	557956	557961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10605	NC_016945	GAT	2	6	560030	560035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_016945	A	6	6	560036	560041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_016945	GCG	2	6	560049	560054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_016945	CGATT	2	10	560085	560094	20 %	40 %	20 %	20 %	379744047
10609	NC_016945	GTT	2	6	560186	560191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744047
10610	NC_016945	GCC	2	6	560283	560288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744047
10611	NC_016945	TTG	2	6	560480	560485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744047
10612	NC_016945	CGC	2	6	560519	560524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744047
10613	NC_016945	AG	3	6	560576	560581	50 %	0 %	50 %	0 %	379744047
10614	NC_016945	ATC	2	6	560714	560719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744047
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10622	NC_016945	TCT	2	6	561438	561443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744047
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