MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016945	ATCG	2	8	25826	25833	25 %	25 %	25 %	25 %	379743476
502	NC_016945	TGG	2	6	25837	25842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743476
503	NC_016945	CAG	2	6	25904	25909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743476
504	NC_016945	ATT	2	6	25971	25976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743476
505	NC_016945	T	6	6	25975	25980	0 %	100 %	0 %	0 %	379743476
506	NC_016945	TGG	2	6	26015	26020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743476
507	NC_016945	AG	3	6	26165	26170	50 %	0 %	50 %	0 %	379743476
508	NC_016945	AGC	2	6	26261	26266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743476
509	NC_016945	ATGG	2	8	26270	26277	25 %	25 %	50 %	0 %	379743476
510	NC_016945	TCA	2	6	26416	26421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743476
511	NC_016945	AAC	2	6	26425	26430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743476
512	NC_016945	CG	3	6	26574	26579	0 %	0 %	50 %	50 %	379743476
513	NC_016945	CAG	2	6	26699	26704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743477
514	NC_016945	TTAT	2	8	26710	26717	25 %	75 %	0 %	0 %	379743477
515	NC_016945	GA	4	8	26740	26747	50 %	0 %	50 %	0 %	379743477
516	NC_016945	CTG	2	6	26782	26787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743477
517	NC_016945	ATTT	2	8	26807	26814	25 %	75 %	0 %	0 %	379743477
518	NC_016945	T	8	8	26812	26819	0 %	100 %	0 %	0 %	379743477
519	NC_016945	GCT	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743477
520	NC_016945	ACC	2	6	26911	26916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743477
521	NC_016945	TAT	2	6	26949	26954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743477
522	NC_016945	AAG	2	6	26962	26967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743477
523	NC_016945	TGGG	2	8	27009	27016	0 %	25 %	75 %	0 %	379743477
524	NC_016945	TGTT	2	8	27027	27034	0 %	75 %	25 %	0 %	379743477
525	NC_016945	CGT	2	6	27044	27049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743477
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528	NC_016945	CCACC	2	10	27113	27122	20 %	0 %	0 %	80 %	379743477
529	NC_016945	AAGA	2	8	27129	27136	75 %	0 %	25 %	0 %	379743477
530	NC_016945	ATTG	2	8	27155	27162	25 %	50 %	25 %	0 %	379743477
531	NC_016945	AAAGA	2	10	27177	27186	80 %	0 %	20 %	0 %	379743477
532	NC_016945	TGG	2	6	27187	27192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743477
533	NC_016945	T	6	6	27240	27245	0 %	100 %	0 %	0 %	379743477
534	NC_016945	TGA	2	6	27254	27259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743477
535	NC_016945	ATA	2	6	27295	27300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743477
536	NC_016945	ACT	2	6	27387	27392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016945	GCG	2	6	27411	27416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016945	CGT	2	6	27503	27508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743478
539	NC_016945	ATTT	2	8	27525	27532	25 %	75 %	0 %	0 %	379743478
540	NC_016945	GCG	2	6	27554	27559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743478
541	NC_016945	TGG	2	6	27584	27589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743478
542	NC_016945	GC	3	6	27609	27614	0 %	0 %	50 %	50 %	379743478
543	NC_016945	AATG	2	8	27677	27684	50 %	25 %	25 %	0 %	379743478
544	NC_016945	TG	3	6	27692	27697	0 %	50 %	50 %	0 %	379743478
545	NC_016945	CCA	2	6	27766	27771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743478
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547	NC_016945	TTC	2	6	27861	27866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743478
548	NC_016945	GCC	2	6	27960	27965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_016945	GTT	2	6	27981	27986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016945	GTG	2	6	28080	28085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743479
551	NC_016945	GTG	2	6	28115	28120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743479
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553	NC_016945	TCA	3	9	28188	28196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743479
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557	NC_016945	CGA	2	6	28386	28391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743479
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559	NC_016945	ACAA	2	8	28481	28488	75 %	0 %	0 %	25 %	379743479
560	NC_016945	GC	3	6	28524	28529	0 %	0 %	50 %	50 %	379743479
561	NC_016945	GAC	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743479
562	NC_016945	GCT	2	6	28549	28554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743479
563	NC_016945	GT	3	6	28606	28611	0 %	50 %	50 %	0 %	379743479
564	NC_016945	T	6	6	28611	28616	0 %	100 %	0 %	0 %	379743479
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572	NC_016945	CTT	2	6	29153	29158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_016945	A	6	6	29918	29923	100 %	0 %	0 %	0 %	379743480
585	NC_016945	A	7	7	30000	30006	100 %	0 %	0 %	0 %	379743480
586	NC_016945	CGCGA	2	10	30039	30048	20 %	0 %	40 %	40 %	379743480
587	NC_016945	TGG	2	6	30130	30135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743480
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600	NC_016945	GCA	2	6	31006	31011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743481
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603	NC_016945	GCG	2	6	31098	31103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743481
604	NC_016945	ACTG	2	8	31125	31132	25 %	25 %	25 %	25 %	379743481
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611	NC_016945	GTG	2	6	31572	31577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743481
612	NC_016945	CTG	2	6	31632	31637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743481
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630	NC_016945	CAC	2	6	32348	32353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743482
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