MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_016944	CTG	2	6	2322488	2322493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741938
44502	NC_016944	CTT	2	6	2322511	2322516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741938
44503	NC_016944	CCT	2	6	2322553	2322558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379741939
44504	NC_016944	AATA	2	8	2322607	2322614	75 %	25 %	0 %	0 %	379741939
44505	NC_016944	CCA	2	6	2322664	2322669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741939
44506	NC_016944	CGAG	2	8	2322688	2322695	25 %	0 %	50 %	25 %	379741939
44507	NC_016944	AAT	2	6	2322761	2322766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741939
44508	NC_016944	ATG	2	6	2322787	2322792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741939
44509	NC_016944	CGT	2	6	2322839	2322844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741939
44510	NC_016944	ACC	2	6	2322885	2322890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741939
44511	NC_016944	AGC	2	6	2322963	2322968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741939
44512	NC_016944	GGAA	2	8	2323154	2323161	50 %	0 %	50 %	0 %	379741939
44513	NC_016944	GC	4	8	2323235	2323242	0 %	0 %	50 %	50 %	379741939
44514	NC_016944	TCA	2	6	2323252	2323257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741939
44515	NC_016944	GAC	2	6	2323316	2323321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741939
44516	NC_016944	A	6	6	2323423	2323428	100 %	0 %	0 %	0 %	379741940
44517	NC_016944	TAA	2	6	2323438	2323443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741940
44518	NC_016944	GCC	2	6	2323496	2323501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741940
44519	NC_016944	CGA	2	6	2323512	2323517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741940
44520	NC_016944	CCA	2	6	2323524	2323529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741940
44521	NC_016944	ATG	3	9	2323541	2323549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741940
44522	NC_016944	CA	3	6	2323551	2323556	50 %	0 %	0 %	50 %	379741940
44523	NC_016944	CCAG	2	8	2323569	2323576	25 %	0 %	25 %	50 %	379741940
44524	NC_016944	CAA	2	6	2323596	2323601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741940
44525	NC_016944	CCA	2	6	2323680	2323685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741941
44526	NC_016944	AAC	2	6	2323691	2323696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741941
44527	NC_016944	CAT	3	9	2323735	2323743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741941
44528	NC_016944	A	6	6	2323787	2323792	100 %	0 %	0 %	0 %	379741941
44529	NC_016944	TAA	2	6	2323842	2323847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741941
44530	NC_016944	TTG	2	6	2324119	2324124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741941
44531	NC_016944	CAC	3	9	2324155	2324163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741941
44532	NC_016944	GGCA	2	8	2324197	2324204	25 %	0 %	50 %	25 %	379741941
44533	NC_016944	TCA	2	6	2324220	2324225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741941
44534	NC_016944	TGG	2	6	2324274	2324279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741941
44535	NC_016944	CCA	2	6	2324306	2324311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741941
44536	NC_016944	TGGA	2	8	2324397	2324404	25 %	25 %	50 %	0 %	379741941
44537	NC_016944	AGCG	2	8	2324434	2324441	25 %	0 %	50 %	25 %	379741941
44538	NC_016944	AGC	2	6	2324465	2324470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741941
44539	NC_016944	GTC	2	6	2324486	2324491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741941
44540	NC_016944	T	6	6	2324531	2324536	0 %	100 %	0 %	0 %	379741942
44541	NC_016944	CTC	2	6	2324579	2324584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379741942
44542	NC_016944	CAG	2	6	2324612	2324617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741942
44543	NC_016944	GAT	2	6	2324669	2324674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741942
44544	NC_016944	TGA	2	6	2324710	2324715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741942
44545	NC_016944	GGT	2	6	2324816	2324821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741942
44546	NC_016944	GCT	2	6	2324837	2324842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741942
44547	NC_016944	AGC	2	6	2324846	2324851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741942
44548	NC_016944	GCC	2	6	2324880	2324885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741942
44549	NC_016944	CAC	4	12	2324969	2324980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741943
44550	NC_016944	CCA	2	6	2325049	2325054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741943
44551	NC_016944	GCA	2	6	2325073	2325078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741943
44552	NC_016944	GTG	2	6	2325205	2325210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741943
44553	NC_016944	TTC	2	6	2325275	2325280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741943
44554	NC_016944	CCG	2	6	2325341	2325346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44555	NC_016944	ATC	2	6	2325357	2325362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44556	NC_016944	CGT	2	6	2325367	2325372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44557	NC_016944	ATT	2	6	2325380	2325385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741944
44558	NC_016944	TCT	3	9	2325394	2325402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741944
44559	NC_016944	AAT	2	6	2325420	2325425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741944
44560	NC_016944	CAG	2	6	2325744	2325749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741944
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44562	NC_016944	GAC	2	6	2325834	2325839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741944
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44570	NC_016944	GCA	2	6	2326214	2326219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741944
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44573	NC_016944	CTT	2	6	2326358	2326363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741944
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44583	NC_016944	GCCA	2	8	2326852	2326859	25 %	0 %	25 %	50 %	379741945
44584	NC_016944	CGG	2	6	2326869	2326874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741945
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44606	NC_016944	CTT	2	6	2327812	2327817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741946
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44612	NC_016944	CTCA	2	8	2328020	2328027	25 %	25 %	0 %	50 %	379741946
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44616	NC_016944	CCAT	2	8	2328193	2328200	25 %	25 %	0 %	50 %	379741946
44617	NC_016944	GCA	2	6	2328246	2328251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741946
44618	NC_016944	GGC	2	6	2328324	2328329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741946
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44621	NC_016944	TGA	2	6	2328409	2328414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741946
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44623	NC_016944	CTCA	2	8	2328458	2328465	25 %	25 %	0 %	50 %	379741946
44624	NC_016944	CAC	2	6	2328493	2328498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741946
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44626	NC_016944	CTTG	2	8	2328583	2328590	0 %	50 %	25 %	25 %	379741946
44627	NC_016944	TGG	2	6	2328604	2328609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741946
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44630	NC_016944	GCC	2	6	2328687	2328692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741946
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44632	NC_016944	TGC	2	6	2328844	2328849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741946
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44638	NC_016944	AGG	2	6	2329121	2329126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44640	NC_016944	GAG	2	6	2329168	2329173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741947
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44645	NC_016944	T	6	6	2329260	2329265	0 %	100 %	0 %	0 %	379741947
44646	NC_016944	TGC	2	6	2329348	2329353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741947
44647	NC_016944	T	6	6	2329361	2329366	0 %	100 %	0 %	0 %	379741947
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44680	NC_016944	GGTT	2	8	2331232	2331239	0 %	50 %	50 %	0 %	379741949
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44715	NC_016944	ATG	2	6	2332757	2332762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741950
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44967	NC_016944	TGC	2	6	2345479	2345484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741962
44968	NC_016944	ATCA	2	8	2345649	2345656	50 %	25 %	0 %	25 %	379741962
44969	NC_016944	GC	3	6	2345665	2345670	0 %	0 %	50 %	50 %	379741962
44970	NC_016944	CTG	2	6	2345686	2345691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741962
44971	NC_016944	TTCA	2	8	2345817	2345824	25 %	50 %	0 %	25 %	379741962
44972	NC_016944	TGT	2	6	2345953	2345958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741962
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44975	NC_016944	GGT	2	6	2346144	2346149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741962
44976	NC_016944	CGATT	2	10	2346155	2346164	20 %	40 %	20 %	20 %	379741962
44977	NC_016944	AGC	2	6	2346180	2346185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741962
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44980	NC_016944	AGA	2	6	2346432	2346437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741962
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44983	NC_016944	A	6	6	2346602	2346607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44991	NC_016944	TGG	2	6	2347347	2347352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741963
44992	NC_016944	TGAT	2	8	2347429	2347436	25 %	50 %	25 %	0 %	379741963
44993	NC_016944	AGT	2	6	2347504	2347509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741963
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44995	NC_016944	TAA	2	6	2347598	2347603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44997	NC_016944	TGA	3	9	2347622	2347630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44999	NC_016944	CTG	2	6	2347751	2347756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741964
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