MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_016944	TCA	2	6	2267426	2267431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741889
43502	NC_016944	AACTT	2	10	2267514	2267523	40 %	40 %	0 %	20 %	379741890
43503	NC_016944	TCA	2	6	2267618	2267623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741890
43504	NC_016944	TTC	2	6	2267698	2267703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741890
43505	NC_016944	CGT	2	6	2267757	2267762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741890
43506	NC_016944	CAA	2	6	2267787	2267792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741890
43507	NC_016944	CAC	2	6	2267961	2267966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741890
43508	NC_016944	TCG	2	6	2267975	2267980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741890
43509	NC_016944	CAT	2	6	2268039	2268044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741890
43510	NC_016944	T	7	7	2268047	2268053	0 %	100 %	0 %	0 %	379741890
43511	NC_016944	ACCA	2	8	2268067	2268074	50 %	0 %	0 %	50 %	379741890
43512	NC_016944	GAC	2	6	2268117	2268122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741890
43513	NC_016944	ATG	2	6	2268130	2268135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741890
43514	NC_016944	GCT	2	6	2268177	2268182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741890
43515	NC_016944	TAAG	2	8	2268259	2268266	50 %	25 %	25 %	0 %	379741891
43516	NC_016944	TTTG	2	8	2268326	2268333	0 %	75 %	25 %	0 %	379741891
43517	NC_016944	CCA	2	6	2268379	2268384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741891
43518	NC_016944	T	6	6	2268388	2268393	0 %	100 %	0 %	0 %	379741891
43519	NC_016944	GTC	2	6	2268419	2268424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741891
43520	NC_016944	AAT	2	6	2268495	2268500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741891
43521	NC_016944	CAA	2	6	2268535	2268540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741891
43522	NC_016944	TCA	2	6	2268615	2268620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741891
43523	NC_016944	CA	3	6	2268619	2268624	50 %	0 %	0 %	50 %	379741891
43524	NC_016944	TGCGC	2	10	2268642	2268651	0 %	20 %	40 %	40 %	379741891
43525	NC_016944	CAC	2	6	2268662	2268667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741891
43526	NC_016944	CATCT	2	10	2268710	2268719	20 %	40 %	0 %	40 %	379741891
43527	NC_016944	GA	3	6	2268763	2268768	50 %	0 %	50 %	0 %	379741891
43528	NC_016944	ATG	2	6	2268804	2268809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741891
43529	NC_016944	T	6	6	2268950	2268955	0 %	100 %	0 %	0 %	379741891
43530	NC_016944	ACC	2	6	2269010	2269015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741891
43531	NC_016944	GCTT	2	8	2269076	2269083	0 %	50 %	25 %	25 %	379741891
43532	NC_016944	AT	3	6	2269088	2269093	50 %	50 %	0 %	0 %	379741891
43533	NC_016944	TTTG	2	8	2269097	2269104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43534	NC_016944	CCG	2	6	2269115	2269120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43535	NC_016944	TC	3	6	2269128	2269133	0 %	50 %	0 %	50 %	379741892
43536	NC_016944	TCG	2	6	2269321	2269326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741892
43537	NC_016944	TGCGC	2	10	2269394	2269403	0 %	20 %	40 %	40 %	379741892
43538	NC_016944	TC	3	6	2269436	2269441	0 %	50 %	0 %	50 %	379741892
43539	NC_016944	CT	3	6	2269444	2269449	0 %	50 %	0 %	50 %	379741892
43540	NC_016944	CGA	2	6	2269525	2269530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741892
43541	NC_016944	GCC	2	6	2269699	2269704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741892
43542	NC_016944	CCA	2	6	2269762	2269767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741892
43543	NC_016944	GAC	2	6	2269788	2269793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741892
43544	NC_016944	GAG	2	6	2269841	2269846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741892
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43546	NC_016944	CTT	2	6	2269955	2269960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741892
43547	NC_016944	TCT	2	6	2270119	2270124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741892
43548	NC_016944	GCA	2	6	2270126	2270131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741892
43549	NC_016944	ACT	2	6	2270169	2270174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741892
43550	NC_016944	AGC	2	6	2270230	2270235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741892
43551	NC_016944	AG	3	6	2270238	2270243	50 %	0 %	50 %	0 %	379741892
43552	NC_016944	CT	3	6	2270376	2270381	0 %	50 %	0 %	50 %	379741892
43553	NC_016944	T	6	6	2270511	2270516	0 %	100 %	0 %	0 %	379741892
43554	NC_016944	CTT	2	6	2270549	2270554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741892
43555	NC_016944	AGC	2	6	2270563	2270568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741892
43556	NC_016944	A	6	6	2270589	2270594	100 %	0 %	0 %	0 %	379741892
43557	NC_016944	A	6	6	2270627	2270632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43558	NC_016944	ATTA	2	8	2270643	2270650	50 %	50 %	0 %	0 %	379741893
43559	NC_016944	GTGGC	2	10	2270813	2270822	0 %	20 %	60 %	20 %	379741893
43560	NC_016944	CTG	2	6	2270865	2270870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741893
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43563	NC_016944	GGATCG	2	12	2271078	2271089	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379741893
43564	NC_016944	GCA	2	6	2271096	2271101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741893
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43566	NC_016944	CAG	2	6	2271193	2271198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741893
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43568	NC_016944	TTG	2	6	2271236	2271241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741893
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43571	NC_016944	T	6	6	2271553	2271558	0 %	100 %	0 %	0 %	379741893
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43584	NC_016944	TGA	2	6	2272329	2272334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741893
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43587	NC_016944	ACCG	2	8	2272360	2272367	25 %	0 %	25 %	50 %	379741893
43588	NC_016944	CAC	2	6	2272384	2272389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741893
43589	NC_016944	CGC	2	6	2272417	2272422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741893
43590	NC_016944	CAG	2	6	2272501	2272506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741893
43591	NC_016944	CGC	2	6	2272519	2272524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741893
43592	NC_016944	CAC	2	6	2272564	2272569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741893
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43594	NC_016944	GGA	2	6	2272626	2272631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741893
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43596	NC_016944	ACTC	2	8	2272857	2272864	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43597	NC_016944	A	6	6	2272995	2273000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43598	NC_016944	AAC	2	6	2273013	2273018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43599	NC_016944	GCT	2	6	2273023	2273028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43600	NC_016944	ATG	2	6	2273053	2273058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43601	NC_016944	CAA	2	6	2273219	2273224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741894
43602	NC_016944	TCAA	2	8	2273244	2273251	50 %	25 %	0 %	25 %	379741894
43603	NC_016944	GTAA	2	8	2273368	2273375	50 %	25 %	25 %	0 %	379741894
43604	NC_016944	TTGA	2	8	2273414	2273421	25 %	50 %	25 %	0 %	379741894
43605	NC_016944	GC	4	8	2273427	2273434	0 %	0 %	50 %	50 %	379741894
43606	NC_016944	TCGG	2	8	2273459	2273466	0 %	25 %	50 %	25 %	379741894
43607	NC_016944	CTG	2	6	2273498	2273503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741894
43608	NC_016944	ATA	2	6	2273520	2273525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741894
43609	NC_016944	CTAC	2	8	2273542	2273549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43610	NC_016944	GCT	2	6	2273565	2273570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43611	NC_016944	T	6	6	2273574	2273579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43612	NC_016944	CAG	2	6	2273588	2273593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43613	NC_016944	GACTTC	2	12	2273604	2273615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43614	NC_016944	AAT	3	9	2273661	2273669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43615	NC_016944	TCA	2	6	2273757	2273762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741895
43616	NC_016944	AT	3	6	2273769	2273774	50 %	50 %	0 %	0 %	379741895
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43618	NC_016944	TAA	2	6	2273985	2273990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741895
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43620	NC_016944	TCAG	2	8	2274068	2274075	25 %	25 %	25 %	25 %	379741895
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43721	NC_016944	GCATC	2	10	2279952	2279961	20 %	20 %	20 %	40 %	379741899
43722	NC_016944	CG	3	6	2279990	2279995	0 %	0 %	50 %	50 %	379741899
43723	NC_016944	T	6	6	2280017	2280022	0 %	100 %	0 %	0 %	379741899
43724	NC_016944	CGC	2	6	2280031	2280036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741899
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43733	NC_016944	CTT	2	6	2280590	2280595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741900
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43735	NC_016944	A	6	6	2280662	2280667	100 %	0 %	0 %	0 %	379741900
43736	NC_016944	GCT	2	6	2280685	2280690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741900
43737	NC_016944	CAA	4	12	2280773	2280784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741900
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43739	NC_016944	GCA	2	6	2280943	2280948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741900
43740	NC_016944	TAA	2	6	2280957	2280962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741900
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43747	NC_016944	AATA	2	8	2281252	2281259	75 %	25 %	0 %	0 %	379741900
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43764	NC_016944	TGCA	2	8	2282190	2282197	25 %	25 %	25 %	25 %	379741900
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43773	NC_016944	TATTAA	2	12	2282599	2282610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43774	NC_016944	A	6	6	2282759	2282764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43775	NC_016944	TTACAT	2	12	2282772	2282783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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43778	NC_016944	GGT	2	6	2282929	2282934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43781	NC_016944	T	7	7	2283016	2283022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43782	NC_016944	TCAC	2	8	2283047	2283054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43784	NC_016944	TATT	2	8	2283185	2283192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43800	NC_016944	TGA	2	6	2284344	2284349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741902
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43814	NC_016944	AG	3	6	2285342	2285347	50 %	0 %	50 %	0 %	379741902
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43835	NC_016944	CAGAA	2	10	2286437	2286446	60 %	0 %	20 %	20 %	379741902
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43840	NC_016944	AGCA	2	8	2286642	2286649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43841	NC_016944	ACA	2	6	2286655	2286660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43842	NC_016944	T	6	6	2286804	2286809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43843	NC_016944	A	7	7	2286823	2286829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43844	NC_016944	GTA	2	6	2286897	2286902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741903
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43847	NC_016944	ATT	2	6	2287146	2287151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741903
43848	NC_016944	CAT	2	6	2287184	2287189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741903
43849	NC_016944	TAA	2	6	2287198	2287203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741903
43850	NC_016944	CTG	4	12	2287293	2287304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741903
43851	NC_016944	CAT	2	6	2287409	2287414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741903
43852	NC_016944	TGC	2	6	2287420	2287425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741903
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