MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_016944	ATGA	2	8	2240895	2240902	50 %	25 %	25 %	0 %	379741861
43003	NC_016944	AAG	2	6	2240905	2240910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741861
43004	NC_016944	AAC	2	6	2240950	2240955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741861
43005	NC_016944	CT	3	6	2241125	2241130	0 %	50 %	0 %	50 %	379741862
43006	NC_016944	CAG	2	6	2241135	2241140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741862
43007	NC_016944	TCA	3	9	2241248	2241256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741862
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43009	NC_016944	TGA	2	6	2241347	2241352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741862
43010	NC_016944	CAT	2	6	2241481	2241486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741862
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43012	NC_016944	CGA	2	6	2241561	2241566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741862
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43015	NC_016944	GAC	2	6	2241792	2241797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741862
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43020	NC_016944	GCG	2	6	2242112	2242117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741862
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43023	NC_016944	CT	3	6	2242292	2242297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43024	NC_016944	ACCT	2	8	2242318	2242325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43025	NC_016944	TCG	2	6	2242339	2242344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43042	NC_016944	CTGA	2	8	2243485	2243492	25 %	25 %	25 %	25 %	379741864
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43055	NC_016944	ACTT	2	8	2243914	2243921	25 %	50 %	0 %	25 %	379741865
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43090	NC_016944	TTTA	2	8	2245674	2245681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43091	NC_016944	GA	3	6	2245798	2245803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43092	NC_016944	TC	3	6	2245877	2245882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43100	NC_016944	TGCCG	2	10	2246358	2246367	0 %	20 %	40 %	40 %	379741866
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43102	NC_016944	AG	3	6	2246421	2246426	50 %	0 %	50 %	0 %	379741866
43103	NC_016944	ACAG	2	8	2246459	2246466	50 %	0 %	25 %	25 %	379741866
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43106	NC_016944	AATA	2	8	2246840	2246847	75 %	25 %	0 %	0 %	379741866
43107	NC_016944	TGCTC	2	10	2246873	2246882	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43108	NC_016944	TTA	2	6	2246888	2246893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741867
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43111	NC_016944	TGGCG	2	10	2247351	2247360	0 %	20 %	60 %	20 %	379741867
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43119	NC_016944	TTC	2	6	2247651	2247656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741867
43120	NC_016944	ATG	2	6	2247666	2247671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741867
43121	NC_016944	GTG	2	6	2247674	2247679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741867
43122	NC_016944	CAT	2	6	2247730	2247735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741867
43123	NC_016944	TTG	2	6	2247762	2247767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741867
43124	NC_016944	TTG	2	6	2247890	2247895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741867
43125	NC_016944	GCTT	2	8	2247963	2247970	0 %	50 %	25 %	25 %	379741867
43126	NC_016944	CCA	2	6	2248036	2248041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741867
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43130	NC_016944	T	6	6	2248274	2248279	0 %	100 %	0 %	0 %	379741867
43131	NC_016944	CATAC	2	10	2248310	2248319	40 %	20 %	0 %	40 %	379741867
43132	NC_016944	AG	3	6	2248355	2248360	50 %	0 %	50 %	0 %	379741867
43133	NC_016944	T	6	6	2248454	2248459	0 %	100 %	0 %	0 %	379741867
43134	NC_016944	AAT	2	6	2248477	2248482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741867
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43138	NC_016944	GAG	2	6	2248587	2248592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741867
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43141	NC_016944	TCGC	2	8	2248789	2248796	0 %	25 %	25 %	50 %	379741867
43142	NC_016944	AATA	2	8	2248817	2248824	75 %	25 %	0 %	0 %	379741867
43143	NC_016944	GAGC	2	8	2248935	2248942	25 %	0 %	50 %	25 %	379741868
43144	NC_016944	CTT	2	6	2248948	2248953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741868
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43148	NC_016944	TAA	2	6	2249383	2249388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43149	NC_016944	AGTC	2	8	2249416	2249423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43150	NC_016944	ACG	2	6	2249427	2249432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43151	NC_016944	ATA	2	6	2249439	2249444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43152	NC_016944	CA	3	6	2249552	2249557	50 %	0 %	0 %	50 %	379741869
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43172	NC_016944	CGT	2	6	2250286	2250291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741870
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43183	NC_016944	AAG	2	6	2250872	2250877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43184	NC_016944	T	6	6	2250922	2250927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43185	NC_016944	TAAGG	2	10	2251065	2251074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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43187	NC_016944	ATTA	2	8	2251106	2251113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43188	NC_016944	GCGATC	2	12	2251186	2251197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379741871
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43194	NC_016944	ACA	2	6	2251516	2251521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741871
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43201	NC_016944	CCCAG	2	10	2251971	2251980	20 %	0 %	20 %	60 %	379741872
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43208	NC_016944	AG	3	6	2252335	2252340	50 %	0 %	50 %	0 %	379741872
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43210	NC_016944	GAG	2	6	2252437	2252442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741872
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43215	NC_016944	TAT	2	6	2252562	2252567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43216	NC_016944	TCG	2	6	2252667	2252672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741873
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43220	NC_016944	TTG	2	6	2253004	2253009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741873
43221	NC_016944	GCA	2	6	2253032	2253037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741873
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43223	NC_016944	CTT	2	6	2253135	2253140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741873
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43226	NC_016944	CAT	2	6	2253303	2253308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741873
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43228	NC_016944	T	7	7	2253394	2253400	0 %	100 %	0 %	0 %	379741873
43229	NC_016944	TGC	2	6	2253428	2253433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741873
43230	NC_016944	CAA	2	6	2253496	2253501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741873
43231	NC_016944	CTG	2	6	2253544	2253549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741873
43232	NC_016944	GTC	2	6	2253571	2253576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741873
43233	NC_016944	TTG	2	6	2253610	2253615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741873
43234	NC_016944	CAA	2	6	2253621	2253626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741873
43235	NC_016944	CTT	2	6	2253630	2253635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741873
43236	NC_016944	ATG	2	6	2253737	2253742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741873
43237	NC_016944	ACC	2	6	2253749	2253754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741873
43238	NC_016944	CCA	2	6	2253762	2253767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741873
43239	NC_016944	TC	3	6	2253806	2253811	0 %	50 %	0 %	50 %	379741874
43240	NC_016944	CTT	2	6	2253821	2253826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741874
43241	NC_016944	CTT	2	6	2253848	2253853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741874
43242	NC_016944	ATT	2	6	2253873	2253878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741874
43243	NC_016944	GCA	2	6	2253880	2253885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741874
43244	NC_016944	ACG	2	6	2253897	2253902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741874
43245	NC_016944	CGA	2	6	2254031	2254036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741874
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43247	NC_016944	GTT	2	6	2254125	2254130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741874
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43249	NC_016944	GGC	2	6	2254245	2254250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741874
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43255	NC_016944	TTGG	2	8	2254725	2254732	0 %	50 %	50 %	0 %	379741875
43256	NC_016944	AC	3	6	2254771	2254776	50 %	0 %	0 %	50 %	379741875
43257	NC_016944	ATAA	2	8	2254806	2254813	75 %	25 %	0 %	0 %	379741875
43258	NC_016944	TCT	2	6	2254816	2254821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741875
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43264	NC_016944	ATC	2	6	2254973	2254978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741876
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43267	NC_016944	ATG	2	6	2255268	2255273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741876
43268	NC_016944	CAT	2	6	2255300	2255305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741876
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43273	NC_016944	CAT	2	6	2255462	2255467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741876
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43292	NC_016944	GTA	2	6	2256089	2256094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741876
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43302	NC_016944	TCA	2	6	2256676	2256681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741876
43303	NC_016944	GT	3	6	2256685	2256690	0 %	50 %	50 %	0 %	379741876
43304	NC_016944	GCA	2	6	2256715	2256720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741876
43305	NC_016944	TGG	2	6	2256859	2256864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741877
43306	NC_016944	TCA	2	6	2256875	2256880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741877
43307	NC_016944	CCA	3	9	2257068	2257076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741877
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43315	NC_016944	CTCA	2	8	2257499	2257506	25 %	25 %	0 %	50 %	379741879
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43325	NC_016944	CACC	2	8	2257847	2257854	25 %	0 %	0 %	75 %	379741879
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43327	NC_016944	GAT	2	6	2258048	2258053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741879
43328	NC_016944	TTG	2	6	2258069	2258074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741879
43329	NC_016944	CAA	2	6	2258153	2258158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741879
43330	NC_016944	CA	3	6	2258164	2258169	50 %	0 %	0 %	50 %	379741879
43331	NC_016944	ATT	2	6	2258241	2258246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43332	NC_016944	GTT	2	6	2258260	2258265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43333	NC_016944	CAAT	2	8	2258306	2258313	50 %	25 %	0 %	25 %	379741880
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43337	NC_016944	AGT	2	6	2258628	2258633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741880
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43342	NC_016944	GAT	2	6	2258882	2258887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741880
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43345	NC_016944	GTC	2	6	2259038	2259043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741881
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43347	NC_016944	TGC	2	6	2259062	2259067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741881
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43349	NC_016944	TGA	2	6	2259290	2259295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741881
43350	NC_016944	TGA	2	6	2259353	2259358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741881
43351	NC_016944	TGA	2	6	2259377	2259382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741881
43352	NC_016944	CACACT	2	12	2259432	2259443	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379741881
43353	NC_016944	AAT	2	6	2259457	2259462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741881
43354	NC_016944	AG	3	6	2259535	2259540	50 %	0 %	50 %	0 %	379741881
43355	NC_016944	TCA	2	6	2259560	2259565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741881
43356	NC_016944	CTA	2	6	2259604	2259609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43357	NC_016944	TAAG	2	8	2259684	2259691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43358	NC_016944	ATCC	2	8	2259750	2259757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43359	NC_016944	GAA	2	6	2259836	2259841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43360	NC_016944	A	7	7	2259843	2259849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43361	NC_016944	CTTC	2	8	2259861	2259868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43362	NC_016944	TTG	2	6	2259984	2259989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741882
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43366	NC_016944	GTT	2	6	2260276	2260281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741882
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43368	NC_016944	ATG	2	6	2260380	2260385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741882
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43382	NC_016944	CT	3	6	2260953	2260958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43383	NC_016944	T	6	6	2261060	2261065	0 %	100 %	0 %	0 %	379741884
43384	NC_016944	TGAGT	2	10	2261150	2261159	20 %	40 %	40 %	0 %	379741884
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43386	NC_016944	TCA	2	6	2261224	2261229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741884
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43390	NC_016944	CAA	2	6	2261672	2261677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741884
43391	NC_016944	AAC	2	6	2261691	2261696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741884
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43453	NC_016944	T	6	6	2264910	2264915	0 %	100 %	0 %	0 %	379741887
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43465	NC_016944	CGG	2	6	2265287	2265292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741887
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43468	NC_016944	AGC	2	6	2265504	2265509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741887
43469	NC_016944	GCT	2	6	2265514	2265519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741887
43470	NC_016944	GCCTTT	2	12	2265534	2265545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379741887
43471	NC_016944	GCCTT	2	10	2265673	2265682	0 %	40 %	20 %	40 %	379741887
43472	NC_016944	TCA	2	6	2265694	2265699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741887
43473	NC_016944	ATCA	2	8	2265747	2265754	50 %	25 %	0 %	25 %	379741887
43474	NC_016944	CAC	2	6	2265755	2265760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741887
43475	NC_016944	CAA	2	6	2265809	2265814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741887
43476	NC_016944	CTT	2	6	2265827	2265832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741887
43477	NC_016944	TTC	3	9	2265852	2265860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741887
43478	NC_016944	TCT	2	6	2265898	2265903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741887
43479	NC_016944	GGCT	2	8	2265906	2265913	0 %	25 %	50 %	25 %	379741887
43480	NC_016944	TCT	2	6	2266186	2266191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741887
43481	NC_016944	GCT	2	6	2266214	2266219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741887
43482	NC_016944	TGAGA	2	10	2266345	2266354	40 %	20 %	40 %	0 %	379741888
43483	NC_016944	TGCGC	2	10	2266441	2266450	0 %	20 %	40 %	40 %	379741888
43484	NC_016944	TGA	2	6	2266514	2266519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741888
43485	NC_016944	CAC	2	6	2266571	2266576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741888
43486	NC_016944	CTG	2	6	2266585	2266590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741888
43487	NC_016944	TCA	2	6	2266615	2266620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741888
43488	NC_016944	TCA	2	6	2266667	2266672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741888
43489	NC_016944	CCATT	2	10	2266675	2266684	20 %	40 %	0 %	40 %	379741888
43490	NC_016944	CAG	2	6	2266695	2266700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741888
43491	NC_016944	TCA	2	6	2266849	2266854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741888
43492	NC_016944	CGT	2	6	2266961	2266966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741888
43493	NC_016944	ATC	2	6	2267020	2267025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741888
43494	NC_016944	GCA	2	6	2267068	2267073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43495	NC_016944	AGC	2	6	2267122	2267127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741889
43496	NC_016944	GAT	2	6	2267176	2267181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741889
43497	NC_016944	CTG	2	6	2267199	2267204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741889
43498	NC_016944	CAGG	2	8	2267217	2267224	25 %	0 %	50 %	25 %	379741889
43499	NC_016944	TTC	2	6	2267233	2267238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741889
43500	NC_016944	TTG	2	6	2267415	2267420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741889

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