MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_016944	ATA	2	6	2215762	2215767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741840
42502	NC_016944	TGC	2	6	2215772	2215777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741840
42503	NC_016944	T	6	6	2215791	2215796	0 %	100 %	0 %	0 %	379741840
42504	NC_016944	AC	3	6	2215811	2215816	50 %	0 %	0 %	50 %	379741840
42505	NC_016944	TCA	2	6	2215902	2215907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741840
42506	NC_016944	CGT	2	6	2216008	2216013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741840
42507	NC_016944	ACC	2	6	2216039	2216044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741840
42508	NC_016944	TCG	2	6	2216094	2216099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741840
42509	NC_016944	AAAT	2	8	2216130	2216137	75 %	25 %	0 %	0 %	379741840
42510	NC_016944	ATTC	2	8	2216190	2216197	25 %	50 %	0 %	25 %	379741840
42511	NC_016944	CAATCA	2	12	2216214	2216225	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379741840
42512	NC_016944	GAC	2	6	2216246	2216251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741840
42513	NC_016944	AAC	2	6	2216320	2216325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741840
42514	NC_016944	GAT	2	6	2216337	2216342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741840
42515	NC_016944	ACG	2	6	2216597	2216602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741841
42516	NC_016944	TGC	2	6	2216633	2216638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741841
42517	NC_016944	ATCA	2	8	2216639	2216646	50 %	25 %	0 %	25 %	379741841
42518	NC_016944	ATC	2	6	2216657	2216662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741841
42519	NC_016944	A	6	6	2216702	2216707	100 %	0 %	0 %	0 %	379741841
42520	NC_016944	T	6	6	2216719	2216724	0 %	100 %	0 %	0 %	379741841
42521	NC_016944	CAC	2	6	2216740	2216745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741841
42522	NC_016944	CCA	2	6	2216868	2216873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741841
42523	NC_016944	ACC	2	6	2216913	2216918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741841
42524	NC_016944	TAA	2	6	2216944	2216949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741841
42525	NC_016944	CCA	2	6	2216956	2216961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741841
42526	NC_016944	CG	3	6	2216970	2216975	0 %	0 %	50 %	50 %	379741841
42527	NC_016944	CTT	2	6	2217028	2217033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741841
42528	NC_016944	CG	3	6	2217041	2217046	0 %	0 %	50 %	50 %	379741841
42529	NC_016944	CAGC	2	8	2217055	2217062	25 %	0 %	25 %	50 %	379741841
42530	NC_016944	CCG	2	6	2217069	2217074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741841
42531	NC_016944	CGAGTG	2	12	2217081	2217092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379741841
42532	NC_016944	ACC	2	6	2217126	2217131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741841
42533	NC_016944	GCCC	2	8	2217152	2217159	0 %	0 %	25 %	75 %	379741841
42534	NC_016944	TTGTT	2	10	2217196	2217205	0 %	80 %	20 %	0 %	379741841
42535	NC_016944	T	6	6	2217211	2217216	0 %	100 %	0 %	0 %	379741842
42536	NC_016944	GCAC	2	8	2217224	2217231	25 %	0 %	25 %	50 %	379741842
42537	NC_016944	TCTT	2	8	2217419	2217426	0 %	75 %	0 %	25 %	379741842
42538	NC_016944	TC	3	6	2217447	2217452	0 %	50 %	0 %	50 %	379741842
42539	NC_016944	GCGTTC	2	12	2217529	2217540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741842
42540	NC_016944	AAAC	2	8	2217727	2217734	75 %	0 %	0 %	25 %	379741842
42541	NC_016944	TCAG	2	8	2217782	2217789	25 %	25 %	25 %	25 %	379741842
42542	NC_016944	TTGC	2	8	2217818	2217825	0 %	50 %	25 %	25 %	379741842
42543	NC_016944	ACG	2	6	2217985	2217990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741842
42544	NC_016944	CAA	2	6	2218002	2218007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741842
42545	NC_016944	ATC	2	6	2218100	2218105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741842
42546	NC_016944	AAC	2	6	2218138	2218143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741842
42547	NC_016944	CTGC	2	8	2218154	2218161	0 %	25 %	25 %	50 %	379741842
42548	NC_016944	CAAC	2	8	2218179	2218186	50 %	0 %	0 %	50 %	379741842
42549	NC_016944	TAC	2	6	2218214	2218219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741843
42550	NC_016944	TCG	2	6	2218230	2218235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741843
42551	NC_016944	GTT	2	6	2218259	2218264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741843
42552	NC_016944	TG	3	6	2218273	2218278	0 %	50 %	50 %	0 %	379741843
42553	NC_016944	TAA	2	6	2218307	2218312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741843
42554	NC_016944	TCA	2	6	2218351	2218356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741843
42555	NC_016944	TTG	2	6	2218374	2218379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741843
42556	NC_016944	AT	3	6	2218472	2218477	50 %	50 %	0 %	0 %	379741843
42557	NC_016944	GGT	2	6	2218485	2218490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741843
42558	NC_016944	CAT	2	6	2218526	2218531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741843
42559	NC_016944	ATT	2	6	2218581	2218586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741843
42560	NC_016944	GCT	2	6	2218625	2218630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741843
42561	NC_016944	TCAC	2	8	2218714	2218721	25 %	25 %	0 %	50 %	379741843
42562	NC_016944	TGC	2	6	2218897	2218902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741843
42563	NC_016944	CTT	2	6	2218910	2218915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741843
42564	NC_016944	GATC	2	8	2218957	2218964	25 %	25 %	25 %	25 %	379741843
42565	NC_016944	TGA	2	6	2219076	2219081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42566	NC_016944	ACC	2	6	2219120	2219125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741844
42567	NC_016944	CTT	2	6	2219206	2219211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741844
42568	NC_016944	CCA	2	6	2219251	2219256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741844
42569	NC_016944	TGA	2	6	2219269	2219274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741844
42570	NC_016944	GCA	2	6	2219292	2219297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741844
42571	NC_016944	TAA	2	6	2219300	2219305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741844
42572	NC_016944	AGA	2	6	2219327	2219332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741844
42573	NC_016944	ATG	2	6	2219616	2219621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741844
42574	NC_016944	TCA	2	6	2219688	2219693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741844
42575	NC_016944	CGC	2	6	2219714	2219719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741844
42576	NC_016944	CAC	2	6	2219761	2219766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741844
42577	NC_016944	CGCATC	2	12	2219777	2219788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379741844
42578	NC_016944	TGC	2	6	2219807	2219812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741844
42579	NC_016944	GAA	2	6	2219930	2219935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741844
42580	NC_016944	GCC	2	6	2219999	2220004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741844
42581	NC_016944	GCA	2	6	2220036	2220041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741844
42582	NC_016944	TTC	2	6	2220044	2220049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741844
42583	NC_016944	T	7	7	2220134	2220140	0 %	100 %	0 %	0 %	379741844
42584	NC_016944	GGCC	2	8	2220238	2220245	0 %	0 %	50 %	50 %	379741844
42585	NC_016944	ACA	2	6	2220289	2220294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741844
42586	NC_016944	ACA	2	6	2220309	2220314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741844
42587	NC_016944	ATA	2	6	2220333	2220338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42588	NC_016944	AATTGA	2	12	2220347	2220358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42589	NC_016944	GA	3	6	2220362	2220367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42590	NC_016944	GGC	2	6	2220392	2220397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42591	NC_016944	GCC	2	6	2220404	2220409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42592	NC_016944	GAG	2	6	2220411	2220416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42593	NC_016944	ATCG	2	8	2220444	2220451	25 %	25 %	25 %	25 %	379741845
42594	NC_016944	AGT	2	6	2220462	2220467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741845
42595	NC_016944	TCT	2	6	2220470	2220475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741845
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42597	NC_016944	AGA	2	6	2220573	2220578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741845
42598	NC_016944	CAA	2	6	2220617	2220622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741845
42599	NC_016944	TTC	2	6	2220639	2220644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741845
42600	NC_016944	T	6	6	2220656	2220661	0 %	100 %	0 %	0 %	379741845
42601	NC_016944	GAT	2	6	2220690	2220695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42602	NC_016944	TTAC	2	8	2220820	2220827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42603	NC_016944	CA	3	6	2220834	2220839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42604	NC_016944	CCG	2	6	2220908	2220913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741846
42605	NC_016944	CTG	2	6	2221008	2221013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741846
42606	NC_016944	CG	3	6	2221110	2221115	0 %	0 %	50 %	50 %	379741846
42607	NC_016944	TGC	2	6	2221165	2221170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741846
42608	NC_016944	CAA	2	6	2221206	2221211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741846
42609	NC_016944	TGA	2	6	2221224	2221229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741846
42610	NC_016944	T	6	6	2221243	2221248	0 %	100 %	0 %	0 %	379741846
42611	NC_016944	CAT	2	6	2221249	2221254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741846
42612	NC_016944	AGAC	2	8	2221273	2221280	50 %	0 %	25 %	25 %	379741846
42613	NC_016944	CTT	3	9	2221323	2221331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741846
42614	NC_016944	CAG	2	6	2221342	2221347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741846
42615	NC_016944	CGC	2	6	2221389	2221394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741846
42616	NC_016944	TCG	2	6	2221400	2221405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741846
42617	NC_016944	CAC	2	6	2221539	2221544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741846
42618	NC_016944	TGT	2	6	2221649	2221654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741847
42619	NC_016944	AAG	2	6	2221671	2221676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741847
42620	NC_016944	TGA	2	6	2221890	2221895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741847
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42624	NC_016944	TCT	2	6	2222159	2222164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741847
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42629	NC_016944	TGC	2	6	2222342	2222347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741847
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42643	NC_016944	CAC	2	6	2223100	2223105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741848
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42653	NC_016944	TCT	2	6	2224066	2224071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741849
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42680	NC_016944	T	8	8	2225427	2225434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42681	NC_016944	AG	3	6	2225445	2225450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42682	NC_016944	TGC	2	6	2225480	2225485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42709	NC_016944	A	7	7	2227193	2227199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42710	NC_016944	ATC	2	6	2227305	2227310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741854
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42719	NC_016944	TCG	2	6	2227556	2227561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741854
42720	NC_016944	CAA	2	6	2227710	2227715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42721	NC_016944	TA	3	6	2227732	2227737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42722	NC_016944	TTAA	2	8	2227768	2227775	50 %	50 %	0 %	0 %	379741855
42723	NC_016944	AGA	2	6	2227788	2227793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741855
42724	NC_016944	A	6	6	2227864	2227869	100 %	0 %	0 %	0 %	379741855
42725	NC_016944	TCC	2	6	2227955	2227960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379741855
42726	NC_016944	GTC	2	6	2228012	2228017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741855
42727	NC_016944	ACC	2	6	2228104	2228109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741855
42728	NC_016944	TC	3	6	2228114	2228119	0 %	50 %	0 %	50 %	379741855
42729	NC_016944	TCG	2	6	2228175	2228180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741855
42730	NC_016944	ACTGA	2	10	2228200	2228209	40 %	20 %	20 %	20 %	379741855
42731	NC_016944	CCA	2	6	2228376	2228381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741855
42732	NC_016944	CGT	2	6	2228422	2228427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741855
42733	NC_016944	ACAGCA	2	12	2228450	2228461	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379741855
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42849	NC_016944	A	7	7	2233863	2233869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42852	NC_016944	CTTT	2	8	2233971	2233978	0 %	75 %	0 %	25 %	379741858
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42971	NC_016944	CTA	2	6	2239063	2239068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741860
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42973	NC_016944	T	6	6	2239211	2239216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42974	NC_016944	A	6	6	2239281	2239286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42975	NC_016944	A	6	6	2239304	2239309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42976	NC_016944	CTCAC	2	10	2239310	2239319	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42977	NC_016944	TTA	2	6	2239337	2239342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42979	NC_016944	CAA	2	6	2239397	2239402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42980	NC_016944	AT	3	6	2239418	2239423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42981	NC_016944	CAA	2	6	2239518	2239523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741861
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42992	NC_016944	CTT	2	6	2240275	2240280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741861
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42998	NC_016944	GT	3	6	2240823	2240828	0 %	50 %	50 %	0 %	379741861
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