MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42004	NC_016944	T	6	6	2190132	2190137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42005	NC_016944	A	6	6	2190144	2190149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42006	NC_016944	A	6	6	2190179	2190184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42007	NC_016944	ATTTTT	2	12	2190213	2190224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42119	NC_016944	AGCTC	2	10	2196111	2196120	20 %	20 %	20 %	40 %	379741820
42120	NC_016944	GGC	2	6	2196190	2196195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741820
42121	NC_016944	ATGAC	2	10	2196242	2196251	40 %	20 %	20 %	20 %	379741820
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42126	NC_016944	AGA	2	6	2196371	2196376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42127	NC_016944	ATT	2	6	2196438	2196443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42137	NC_016944	GAT	2	6	2196978	2196983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741822
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42156	NC_016944	T	6	6	2198345	2198350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42157	NC_016944	GT	3	6	2198352	2198357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42158	NC_016944	A	7	7	2198449	2198455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42159	NC_016944	T	8	8	2198463	2198470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42226	NC_016944	TTGA	2	8	2202189	2202196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42227	NC_016944	ACC	2	6	2202198	2202203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42228	NC_016944	TG	3	6	2202223	2202228	0 %	50 %	50 %	0 %	379741827
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42232	NC_016944	AC	3	6	2202389	2202394	50 %	0 %	0 %	50 %	379741827
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42235	NC_016944	T	7	7	2202506	2202512	0 %	100 %	0 %	0 %	379741827
42236	NC_016944	TACGC	2	10	2202580	2202589	20 %	20 %	20 %	40 %	379741827
42237	NC_016944	GGC	2	6	2202726	2202731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741827
42238	NC_016944	TGC	2	6	2202904	2202909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741827
42239	NC_016944	ATTG	2	8	2203038	2203045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42240	NC_016944	AGTC	2	8	2203050	2203057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42241	NC_016944	CTTT	2	8	2203124	2203131	0 %	75 %	0 %	25 %	379741828
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42253	NC_016944	TTGC	2	8	2204064	2204071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42254	NC_016944	CA	3	6	2204080	2204085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42255	NC_016944	T	6	6	2204108	2204113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42258	NC_016944	CTA	2	6	2204227	2204232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741829
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42313	NC_016944	TGC	2	6	2206994	2206999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42317	NC_016944	ATA	2	6	2207076	2207081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42318	NC_016944	ACT	2	6	2207112	2207117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42321	NC_016944	TTC	2	6	2207185	2207190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42337	NC_016944	TGA	2	6	2207996	2208001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741832
42338	NC_016944	TGA	2	6	2208008	2208013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741832
42339	NC_016944	TCA	2	6	2208034	2208039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741832
42340	NC_016944	CG	3	6	2208114	2208119	0 %	0 %	50 %	50 %	379741832
42341	NC_016944	A	6	6	2208120	2208125	100 %	0 %	0 %	0 %	379741832
42342	NC_016944	GTG	2	6	2208135	2208140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741832
42343	NC_016944	CGCAA	2	10	2208146	2208155	40 %	0 %	20 %	40 %	379741832
42344	NC_016944	ATG	2	6	2208156	2208161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741832
42345	NC_016944	GAT	2	6	2208167	2208172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741832
42346	NC_016944	GAT	2	6	2208329	2208334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741832
42347	NC_016944	GT	3	6	2208367	2208372	0 %	50 %	50 %	0 %	379741832
42348	NC_016944	GAA	3	9	2208381	2208389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741832
42349	NC_016944	CTAT	2	8	2208406	2208413	25 %	50 %	0 %	25 %	379741832
42350	NC_016944	CCAA	2	8	2208526	2208533	50 %	0 %	0 %	50 %	379741832
42351	NC_016944	AGC	2	6	2208611	2208616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741832
42352	NC_016944	GCA	2	6	2208621	2208626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741832
42353	NC_016944	GAA	2	6	2208657	2208662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741832
42354	NC_016944	CCA	2	6	2208712	2208717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741832
42355	NC_016944	AAG	3	9	2208754	2208762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42356	NC_016944	CTT	2	6	2208773	2208778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42357	NC_016944	ATG	2	6	2208968	2208973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741833
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42394	NC_016944	AGAC	2	8	2210853	2210860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42395	NC_016944	CTTT	2	8	2210864	2210871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42397	NC_016944	TA	3	6	2211007	2211012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42472	NC_016944	AT	3	6	2214508	2214513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42473	NC_016944	CGA	2	6	2214542	2214547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42475	NC_016944	TAAA	2	8	2214667	2214674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42476	NC_016944	CAA	2	6	2214736	2214741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42477	NC_016944	TTAT	2	8	2214773	2214780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42478	NC_016944	A	6	6	2214790	2214795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42479	NC_016944	CGCT	2	8	2214805	2214812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42480	NC_016944	T	6	6	2214812	2214817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42481	NC_016944	A	7	7	2214840	2214846	100 %	0 %	0 %	0 %	379741839
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