MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016944	TCC	2	6	625856	625861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740462
12003	NC_016944	CTGG	2	8	625873	625880	0 %	25 %	50 %	25 %	379740462
12004	NC_016944	TATC	2	8	625945	625952	25 %	50 %	0 %	25 %	379740462
12005	NC_016944	TCGAT	2	10	625953	625962	20 %	40 %	20 %	20 %	379740462
12006	NC_016944	TCT	2	6	626132	626137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740462
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12013	NC_016944	ATC	2	6	626579	626584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740462
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12015	NC_016944	TTG	2	6	626738	626743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740462
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12017	NC_016944	GC	3	6	626794	626799	0 %	0 %	50 %	50 %	379740462
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12123	NC_016944	TCA	2	6	632309	632314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740464
12124	NC_016944	TGG	2	6	632403	632408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740464
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12143	NC_016944	TCA	2	6	633601	633606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12245	NC_016944	GGC	2	6	638601	638606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740469
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12344	NC_016944	TAGT	2	8	643708	643715	25 %	50 %	25 %	0 %	379740472
12345	NC_016944	TGA	2	6	643742	643747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740472
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12357	NC_016944	CA	3	6	644504	644509	50 %	0 %	0 %	50 %	379740473
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12363	NC_016944	TTGA	2	8	644971	644978	25 %	50 %	25 %	0 %	379740473
12364	NC_016944	GGCG	2	8	645012	645019	0 %	0 %	75 %	25 %	379740473
12365	NC_016944	CAT	2	6	645028	645033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740473
12366	NC_016944	GCA	2	6	645114	645119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740473
12367	NC_016944	GCAT	2	8	645131	645138	25 %	25 %	25 %	25 %	379740473
12368	NC_016944	CTGC	2	8	645152	645159	0 %	25 %	25 %	50 %	379740473
12369	NC_016944	TGCA	2	8	645277	645284	25 %	25 %	25 %	25 %	379740473
12370	NC_016944	GCA	2	6	645305	645310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740473
12371	NC_016944	CG	3	6	645311	645316	0 %	0 %	50 %	50 %	379740473
12372	NC_016944	CTGG	2	8	645340	645347	0 %	25 %	50 %	25 %	379740473
12373	NC_016944	TGA	3	9	645573	645581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740473
12374	NC_016944	ATCA	2	8	645697	645704	50 %	25 %	0 %	25 %	379740473
12375	NC_016944	AATTC	2	10	645800	645809	40 %	40 %	0 %	20 %	379740473
12376	NC_016944	CTG	2	6	645906	645911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740474
12377	NC_016944	TGC	2	6	645950	645955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740474
12378	NC_016944	GCG	2	6	646018	646023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740474
12379	NC_016944	CGC	2	6	646055	646060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740474
12380	NC_016944	CAA	2	6	646130	646135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740474
12381	NC_016944	TCA	2	6	646163	646168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740474
12382	NC_016944	CA	3	6	646175	646180	50 %	0 %	0 %	50 %	379740474
12383	NC_016944	AGC	2	6	646213	646218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740474
12384	NC_016944	TTG	2	6	646221	646226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740474
12385	NC_016944	GC	3	6	646373	646378	0 %	0 %	50 %	50 %	379740474
12386	NC_016944	TGC	2	6	646435	646440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740474
12387	NC_016944	GTC	2	6	646509	646514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740474
12388	NC_016944	AACGC	2	10	646565	646574	40 %	0 %	20 %	40 %	379740474
12389	NC_016944	ATG	2	6	646591	646596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740474
12390	NC_016944	CCG	2	6	646669	646674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740474
12391	NC_016944	GTA	2	6	646689	646694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740474
12392	NC_016944	TCC	2	6	646707	646712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740475
12393	NC_016944	TGA	2	6	646741	646746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740475
12394	NC_016944	GCA	2	6	646804	646809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740475
12395	NC_016944	CTG	2	6	646825	646830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740475
12396	NC_016944	TCA	2	6	646854	646859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740475
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12398	NC_016944	GTAA	2	8	646918	646925	50 %	25 %	25 %	0 %	379740475
12399	NC_016944	ATT	2	6	646931	646936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740475
12400	NC_016944	TGT	2	6	646963	646968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740475
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12402	NC_016944	TTG	2	6	647210	647215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740475
12403	NC_016944	TGG	2	6	647368	647373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740475
12404	NC_016944	AGT	2	6	647380	647385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740475
12405	NC_016944	TCA	2	6	647511	647516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740475
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12407	NC_016944	CAT	2	6	647533	647538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740475
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12409	NC_016944	CG	3	6	647634	647639	0 %	0 %	50 %	50 %	379740475
12410	NC_016944	ATC	2	6	647696	647701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740475
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12413	NC_016944	A	7	7	647785	647791	100 %	0 %	0 %	0 %	379740475
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12424	NC_016944	GCA	2	6	648109	648114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740475
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12426	NC_016944	ATA	2	6	648191	648196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740475
12427	NC_016944	CGT	2	6	648206	648211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740475
12428	NC_016944	CA	3	6	648326	648331	50 %	0 %	0 %	50 %	379740475
12429	NC_016944	CA	3	6	648355	648360	50 %	0 %	0 %	50 %	379740475
12430	NC_016944	TGGT	2	8	648402	648409	0 %	50 %	50 %	0 %	379740475
12431	NC_016944	CATT	2	8	648419	648426	25 %	50 %	0 %	25 %	379740475
12432	NC_016944	GCT	2	6	648468	648473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12437	NC_016944	CGTG	2	8	648807	648814	0 %	25 %	50 %	25 %	379740476
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12444	NC_016944	CAG	2	6	649102	649107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740476
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12451	NC_016944	CGT	2	6	649365	649370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740476
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12454	NC_016944	T	6	6	649433	649438	0 %	100 %	0 %	0 %	379740476
12455	NC_016944	CGGT	2	8	649593	649600	0 %	25 %	50 %	25 %	379740477
12456	NC_016944	GTTTT	2	10	649701	649710	0 %	80 %	20 %	0 %	379740477
12457	NC_016944	TGG	2	6	649723	649728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740477
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12460	NC_016944	ATG	2	6	649820	649825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740477
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12462	NC_016944	TCT	2	6	649914	649919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740477
12463	NC_016944	ACA	2	6	649940	649945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740477
12464	NC_016944	GAGCGC	2	12	649990	650001	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379740477
12465	NC_016944	ACC	2	6	650029	650034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740477
12466	NC_016944	ACG	2	6	650104	650109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740477
12467	NC_016944	TTTC	2	8	650223	650230	0 %	75 %	0 %	25 %	379740477
12468	NC_016944	TCA	2	6	650252	650257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740477
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12473	NC_016944	TGG	2	6	650532	650537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740478
12474	NC_016944	CTTG	2	8	650564	650571	0 %	50 %	25 %	25 %	379740478
12475	NC_016944	CAG	2	6	650667	650672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740478
12476	NC_016944	CAG	2	6	650694	650699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740478
12477	NC_016944	CCA	2	6	650703	650708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740478
12478	NC_016944	ATG	2	6	650752	650757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740478
12479	NC_016944	AGGA	2	8	650791	650798	50 %	0 %	50 %	0 %	379740478
12480	NC_016944	TCG	2	6	650801	650806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740478
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12482	NC_016944	ACCGA	2	10	650830	650839	40 %	0 %	20 %	40 %	379740478
12483	NC_016944	GAT	2	6	650889	650894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740478
12484	NC_016944	GCGA	2	8	650963	650970	25 %	0 %	50 %	25 %	379740478
12485	NC_016944	ACC	2	6	650971	650976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740478
12486	NC_016944	AGG	2	6	650993	650998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379740478
12487	NC_016944	AAT	2	6	651006	651011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740478
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