MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_016944	CTT	2	6	3003355	3003360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742540
57502	NC_016944	TGC	2	6	3003368	3003373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742540
57503	NC_016944	AGA	2	6	3003407	3003412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742540
57504	NC_016944	GCA	2	6	3003486	3003491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742540
57505	NC_016944	CGTG	2	8	3003505	3003512	0 %	25 %	50 %	25 %	379742540
57506	NC_016944	CTG	2	6	3003535	3003540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742540
57507	NC_016944	CAC	2	6	3003645	3003650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742540
57508	NC_016944	CTTG	2	8	3003660	3003667	0 %	50 %	25 %	25 %	379742540
57509	NC_016944	GGC	2	6	3003703	3003708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742540
57510	NC_016944	ACG	2	6	3003715	3003720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742540
57511	NC_016944	TCC	2	6	3003742	3003747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379742540
57512	NC_016944	ATA	2	6	3003779	3003784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742540
57513	NC_016944	GCC	2	6	3003803	3003808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742540
57514	NC_016944	CCG	2	6	3003900	3003905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742540
57515	NC_016944	GACT	2	8	3003911	3003918	25 %	25 %	25 %	25 %	379742540
57516	NC_016944	TGC	2	6	3003932	3003937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742540
57517	NC_016944	AGT	2	6	3003965	3003970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742540
57518	NC_016944	GTT	3	9	3004023	3004031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57519	NC_016944	TAC	2	6	3004187	3004192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742541
57520	NC_016944	CGG	2	6	3004295	3004300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742541
57521	NC_016944	CGG	2	6	3004382	3004387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742541
57522	NC_016944	AAG	2	6	3004407	3004412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742541
57523	NC_016944	AAG	2	6	3004418	3004423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742541
57524	NC_016944	CAAT	2	8	3004429	3004436	50 %	25 %	0 %	25 %	379742541
57525	NC_016944	GGC	2	6	3004545	3004550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742541
57526	NC_016944	ACC	2	6	3004696	3004701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742541
57527	NC_016944	GGC	2	6	3004731	3004736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742541
57528	NC_016944	GTT	3	9	3004750	3004758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742541
57529	NC_016944	TCA	3	9	3004926	3004934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742542
57530	NC_016944	TTG	2	6	3005097	3005102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742542
57531	NC_016944	ACC	2	6	3005265	3005270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742542
57532	NC_016944	AGC	2	6	3005352	3005357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742542
57533	NC_016944	GCT	2	6	3005374	3005379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742542
57534	NC_016944	TGC	2	6	3005385	3005390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742542
57535	NC_016944	CGC	2	6	3005455	3005460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742543
57536	NC_016944	T	6	6	3005485	3005490	0 %	100 %	0 %	0 %	379742543
57537	NC_016944	CGC	2	6	3005515	3005520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742543
57538	NC_016944	ACC	2	6	3005588	3005593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742543
57539	NC_016944	CGG	2	6	3005730	3005735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742543
57540	NC_016944	CAG	2	6	3005779	3005784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742543
57541	NC_016944	CAC	2	6	3005820	3005825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742543
57542	NC_016944	CAG	2	6	3005851	3005856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742543
57543	NC_016944	TGT	2	6	3005931	3005936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742543
57544	NC_016944	T	6	6	3005940	3005945	0 %	100 %	0 %	0 %	379742543
57545	NC_016944	CAT	2	6	3005967	3005972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742543
57546	NC_016944	GCA	3	9	3006030	3006038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742543
57547	NC_016944	TCG	2	6	3006101	3006106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742543
57548	NC_016944	CTT	2	6	3006150	3006155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742543
57549	NC_016944	CTT	2	6	3006210	3006215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742543
57550	NC_016944	GTA	2	6	3006224	3006229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742543
57551	NC_016944	AT	3	6	3006263	3006268	50 %	50 %	0 %	0 %	379742543
57552	NC_016944	GAA	2	6	3006304	3006309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742543
57553	NC_016944	ACGA	2	8	3006334	3006341	50 %	0 %	25 %	25 %	379742543
57554	NC_016944	TGG	2	6	3006405	3006410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742543
57555	NC_016944	GTG	2	6	3006434	3006439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742543
57556	NC_016944	TCGA	2	8	3006506	3006513	25 %	25 %	25 %	25 %	379742543
57557	NC_016944	GAT	2	6	3006541	3006546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742543
57558	NC_016944	CATA	2	8	3006552	3006559	50 %	25 %	0 %	25 %	379742543
57559	NC_016944	CAT	2	6	3006588	3006593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742543
57560	NC_016944	A	6	6	3006666	3006671	100 %	0 %	0 %	0 %	379742543
57561	NC_016944	TGC	2	6	3006692	3006697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742543
57562	NC_016944	GTG	3	9	3006738	3006746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742543
57563	NC_016944	CGAT	2	8	3006804	3006811	25 %	25 %	25 %	25 %	379742543
57564	NC_016944	CGA	2	6	3006957	3006962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742543
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57572	NC_016944	CCA	2	6	3007307	3007312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742543
57573	NC_016944	T	6	6	3007436	3007441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.