MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_016944	TCG	2	6	2979306	2979311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57002	NC_016944	CCG	2	6	2979480	2979485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57003	NC_016944	TGC	2	6	2979514	2979519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57004	NC_016944	GCC	2	6	2979545	2979550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57005	NC_016944	T	6	6	2979592	2979597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57006	NC_016944	TAA	2	6	2979643	2979648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57007	NC_016944	T	6	6	2979723	2979728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57008	NC_016944	ATC	2	6	2979733	2979738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57009	NC_016944	CA	3	6	2979749	2979754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57010	NC_016944	GATT	2	8	2979755	2979762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57011	NC_016944	AAAT	2	8	2979935	2979942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57012	NC_016944	GTTTC	2	10	2980000	2980009	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57013	NC_016944	CAA	2	6	2980106	2980111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57014	NC_016944	CA	4	8	2980135	2980142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57015	NC_016944	AC	3	6	2980247	2980252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57016	NC_016944	AAC	2	6	2980278	2980283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57017	NC_016944	AGC	2	6	2980446	2980451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57018	NC_016944	ACG	2	6	2980500	2980505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57019	NC_016944	TGA	2	6	2980580	2980585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57020	NC_016944	CCG	2	6	2980608	2980613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57021	NC_016944	ACC	2	6	2980695	2980700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57022	NC_016944	CTC	2	6	2980814	2980819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57023	NC_016944	GAG	2	6	2980833	2980838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57024	NC_016944	CCA	2	6	2980858	2980863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57025	NC_016944	GGT	2	6	2980918	2980923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57026	NC_016944	GTA	2	6	2981015	2981020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57027	NC_016944	ATTTCA	2	12	2981074	2981085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57028	NC_016944	CAT	2	6	2981113	2981118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57029	NC_016944	GCC	2	6	2981188	2981193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57030	NC_016944	TAA	2	6	2981313	2981318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57031	NC_016944	TC	3	6	2981440	2981445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57032	NC_016944	ACC	2	6	2981470	2981475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57033	NC_016944	GTA	2	6	2981558	2981563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57034	NC_016944	CGT	2	6	2981570	2981575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57035	NC_016944	AG	4	8	2981587	2981594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57036	NC_016944	C	6	6	2981670	2981675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57037	NC_016944	GAG	2	6	2981801	2981806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57038	NC_016944	TCGAC	2	10	2981977	2981986	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57039	NC_016944	CTTT	2	8	2982002	2982009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57040	NC_016944	ATG	2	6	2982012	2982017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57041	NC_016944	GCT	2	6	2982018	2982023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57042	NC_016944	TG	3	6	2982043	2982048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57043	NC_016944	GTT	2	6	2982107	2982112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57044	NC_016944	ACG	2	6	2982122	2982127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57045	NC_016944	GT	3	6	2982144	2982149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57046	NC_016944	TACT	2	8	2982161	2982168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57047	NC_016944	AGT	2	6	2982237	2982242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57048	NC_016944	TCG	2	6	2982245	2982250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57049	NC_016944	TCGGT	2	10	2982352	2982361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57050	NC_016944	CAC	2	6	2982539	2982544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57051	NC_016944	GTAC	2	8	2982564	2982571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57052	NC_016944	GTCA	2	8	2982647	2982654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57053	NC_016944	GGA	2	6	2982670	2982675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57054	NC_016944	C	6	6	2982680	2982685	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57055	NC_016944	TCGC	2	8	2982827	2982834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57056	NC_016944	CTA	2	6	2982837	2982842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57057	NC_016944	TCT	2	6	2982861	2982866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57058	NC_016944	AAC	2	6	2983113	2983118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57059	NC_016944	TGT	2	6	2983222	2983227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57060	NC_016944	ACAA	2	8	2983262	2983269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57061	NC_016944	TTG	2	6	2983277	2983282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57062	NC_016944	CTT	2	6	2983319	2983324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57063	NC_016944	CGG	2	6	2983354	2983359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57064	NC_016944	GGT	2	6	2983385	2983390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57065	NC_016944	GTG	2	6	2983421	2983426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57066	NC_016944	GGA	2	6	2983516	2983521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57067	NC_016944	TGG	2	6	2983528	2983533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57068	NC_016944	CCG	2	6	2983654	2983659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57069	NC_016944	TCTAA	2	10	2983713	2983722	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57070	NC_016944	AATC	2	8	2983727	2983734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57071	NC_016944	TG	3	6	2983735	2983740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57072	NC_016944	TCA	2	6	2983746	2983751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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57075	NC_016944	CTT	2	6	2983873	2983878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57076	NC_016944	GT	3	6	2983909	2983914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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57078	NC_016944	GT	3	6	2984078	2984083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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57082	NC_016944	CCA	2	6	2984165	2984170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57085	NC_016944	TTC	2	6	2984331	2984336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57086	NC_016944	GCC	2	6	2984575	2984580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57087	NC_016944	C	6	6	2984639	2984644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57088	NC_016944	ACC	2	6	2984721	2984726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57089	NC_016944	GCT	2	6	2984785	2984790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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57091	NC_016944	TTAAC	2	10	2984844	2984853	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57092	NC_016944	TCC	2	6	2984859	2984864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57093	NC_016944	CTT	2	6	2984894	2984899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57094	NC_016944	CTG	2	6	2984953	2984958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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57096	NC_016944	TCG	2	6	2985028	2985033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57097	NC_016944	CCG	2	6	2985202	2985207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57098	NC_016944	TGC	2	6	2985236	2985241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57099	NC_016944	GCC	2	6	2985267	2985272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57100	NC_016944	T	6	6	2985425	2985430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57101	NC_016944	ATC	2	6	2985435	2985440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57102	NC_016944	CA	3	6	2985451	2985456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57103	NC_016944	GATT	2	8	2985457	2985464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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57108	NC_016944	T	6	6	2985552	2985557	0 %	100 %	0 %	0 %	379742522
57109	NC_016944	ACT	2	6	2985607	2985612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742522
57110	NC_016944	T	7	7	2985679	2985685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57111	NC_016944	T	8	8	2985688	2985695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57112	NC_016944	A	6	6	2985718	2985723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57113	NC_016944	GA	3	6	2985785	2985790	50 %	0 %	50 %	0 %	379742523
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57116	NC_016944	ATC	2	6	2985865	2985870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742523
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57122	NC_016944	CTG	2	6	2986209	2986214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742523
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57125	NC_016944	CT	3	6	2986283	2986288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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57476	NC_016944	CAG	2	6	3001943	3001948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742538
57477	NC_016944	TCAA	2	8	3001959	3001966	50 %	25 %	0 %	25 %	379742538
57478	NC_016944	GTA	2	6	3002054	3002059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742538
57479	NC_016944	ATC	2	6	3002061	3002066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742538
57480	NC_016944	AGCCAT	2	12	3002084	3002095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379742538
57481	NC_016944	CAC	2	6	3002120	3002125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742538
57482	NC_016944	TGCTG	2	10	3002151	3002160	0 %	40 %	40 %	20 %	379742538
57483	NC_016944	GGTAA	2	10	3002161	3002170	40 %	20 %	40 %	0 %	379742538
57484	NC_016944	CAA	2	6	3002214	3002219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742538
57485	NC_016944	AGTG	2	8	3002225	3002232	25 %	25 %	50 %	0 %	379742538
57486	NC_016944	ACC	2	6	3002298	3002303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742538
57487	NC_016944	AGA	2	6	3002401	3002406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742538
57488	NC_016944	GGT	2	6	3002485	3002490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742538
57489	NC_016944	T	6	6	3002548	3002553	0 %	100 %	0 %	0 %	379742539
57490	NC_016944	GTT	2	6	3002554	3002559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742539
57491	NC_016944	TGA	2	6	3002673	3002678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742539
57492	NC_016944	CG	4	8	3002728	3002735	0 %	0 %	50 %	50 %	379742539
57493	NC_016944	CCA	2	6	3002792	3002797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742539
57494	NC_016944	CAC	2	6	3002955	3002960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57495	NC_016944	TCA	2	6	3003167	3003172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742540
57496	NC_016944	TGC	2	6	3003226	3003231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742540
57497	NC_016944	TTG	2	6	3003259	3003264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742540
57498	NC_016944	TCT	2	6	3003275	3003280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742540
57499	NC_016944	T	6	6	3003287	3003292	0 %	100 %	0 %	0 %	379742540
57500	NC_016944	T	7	7	3003316	3003322	0 %	100 %	0 %	0 %	379742540

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