MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_016944	TTA	2	6	2847894	2847899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379742408
54502	NC_016944	GAT	2	6	2847923	2847928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742408
54503	NC_016944	CAA	2	6	2847971	2847976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742408
54504	NC_016944	TCA	2	6	2848074	2848079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742408
54505	NC_016944	CT	3	6	2848110	2848115	0 %	50 %	0 %	50 %	379742408
54506	NC_016944	TCC	2	6	2848121	2848126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379742408
54507	NC_016944	CTC	2	6	2848175	2848180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379742408
54508	NC_016944	CTT	2	6	2848189	2848194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742408
54509	NC_016944	AGTT	2	8	2848306	2848313	25 %	50 %	25 %	0 %	379742408
54510	NC_016944	TCG	2	6	2848317	2848322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742408
54511	NC_016944	ACA	2	6	2848345	2848350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742408
54512	NC_016944	CCG	2	6	2848368	2848373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742408
54513	NC_016944	ATC	2	6	2848374	2848379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742408
54514	NC_016944	TGA	2	6	2848414	2848419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742408
54515	NC_016944	AAT	2	6	2848559	2848564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742408
54516	NC_016944	TGC	2	6	2848575	2848580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742408
54517	NC_016944	CAC	2	6	2848616	2848621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742408
54518	NC_016944	CTT	2	6	2848720	2848725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742408
54519	NC_016944	TG	3	6	2848848	2848853	0 %	50 %	50 %	0 %	379742408
54520	NC_016944	CTT	2	6	2848969	2848974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742408
54521	NC_016944	CCG	2	6	2848996	2849001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742408
54522	NC_016944	CCG	2	6	2849029	2849034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742408
54523	NC_016944	TTG	2	6	2849043	2849048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742408
54524	NC_016944	GAA	2	6	2849109	2849114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742408
54525	NC_016944	AACC	2	8	2849128	2849135	50 %	0 %	0 %	50 %	379742408
54526	NC_016944	ATT	2	6	2849210	2849215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379742409
54527	NC_016944	ATTA	2	8	2849274	2849281	50 %	50 %	0 %	0 %	379742409
54528	NC_016944	GTC	2	6	2849292	2849297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742409
54529	NC_016944	ATT	2	6	2849316	2849321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379742409
54530	NC_016944	GCT	2	6	2849400	2849405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742409
54531	NC_016944	GGTT	2	8	2849503	2849510	0 %	50 %	50 %	0 %	379742409
54532	NC_016944	CTT	2	6	2849522	2849527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742409
54533	NC_016944	TGC	2	6	2849557	2849562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742409
54534	NC_016944	CTT	2	6	2849609	2849614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742409
54535	NC_016944	GC	3	6	2849616	2849621	0 %	0 %	50 %	50 %	379742409
54536	NC_016944	ATC	2	6	2849655	2849660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742409
54537	NC_016944	TCA	2	6	2849696	2849701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742409
54538	NC_016944	TCA	2	6	2849726	2849731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742409
54539	NC_016944	CCT	2	6	2849736	2849741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379742410
54540	NC_016944	CT	3	6	2849789	2849794	0 %	50 %	0 %	50 %	379742410
54541	NC_016944	TCG	2	6	2849819	2849824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742410
54542	NC_016944	TGA	2	6	2849829	2849834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742410
54543	NC_016944	C	6	6	2849943	2849948	0 %	0 %	0 %	100 %	379742410
54544	NC_016944	AATC	2	8	2849949	2849956	50 %	25 %	0 %	25 %	379742410
54545	NC_016944	TGAC	2	8	2849994	2850001	25 %	25 %	25 %	25 %	379742410
54546	NC_016944	A	6	6	2850047	2850052	100 %	0 %	0 %	0 %	379742410
54547	NC_016944	CAC	2	6	2850241	2850246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742410
54548	NC_016944	GCA	2	6	2850255	2850260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742410
54549	NC_016944	TG	3	6	2850310	2850315	0 %	50 %	50 %	0 %	379742411
54550	NC_016944	AGCG	2	8	2850475	2850482	25 %	0 %	50 %	25 %	379742411
54551	NC_016944	ATCTTG	2	12	2850525	2850536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379742411
54552	NC_016944	TGC	2	6	2850606	2850611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742411
54553	NC_016944	CCA	2	6	2850619	2850624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742411
54554	NC_016944	TTC	3	9	2850653	2850661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742411
54555	NC_016944	CTG	2	6	2850683	2850688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742411
54556	NC_016944	TGT	2	6	2850705	2850710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742411
54557	NC_016944	TTG	2	6	2850731	2850736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742411
54558	NC_016944	CTG	2	6	2850766	2850771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742411
54559	NC_016944	CCAA	2	8	2850896	2850903	50 %	0 %	0 %	50 %	379742412
54560	NC_016944	CGG	3	9	2850926	2850934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742412
54561	NC_016944	GCGTTT	2	12	2850963	2850974	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379742412
54562	NC_016944	GAT	2	6	2851199	2851204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742412
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54564	NC_016944	CCA	2	6	2851325	2851330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742412
54565	NC_016944	CAA	2	6	2851380	2851385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742412
54566	NC_016944	CATC	2	8	2851400	2851407	25 %	25 %	0 %	50 %	379742412
54567	NC_016944	T	6	6	2851428	2851433	0 %	100 %	0 %	0 %	379742412
54568	NC_016944	T	6	6	2851464	2851469	0 %	100 %	0 %	0 %	379742412
54569	NC_016944	GTC	2	6	2851489	2851494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742412
54570	NC_016944	TGC	3	9	2851496	2851504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742412
54571	NC_016944	T	6	6	2851514	2851519	0 %	100 %	0 %	0 %	379742412
54572	NC_016944	GCT	2	6	2851610	2851615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742412
54573	NC_016944	CTAT	2	8	2851624	2851631	25 %	50 %	0 %	25 %	379742412
54574	NC_016944	T	6	6	2851705	2851710	0 %	100 %	0 %	0 %	379742412
54575	NC_016944	CTC	2	6	2851788	2851793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379742412
54576	NC_016944	TGG	2	6	2851852	2851857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742412
54577	NC_016944	AATA	2	8	2851941	2851948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54578	NC_016944	GAT	2	6	2851953	2851958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54581	NC_016944	GAA	2	6	2852248	2852253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742413
54582	NC_016944	CTA	2	6	2852301	2852306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742413
54583	NC_016944	GCC	2	6	2852344	2852349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742413
54584	NC_016944	CAG	2	6	2852401	2852406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742413
54585	NC_016944	CT	3	6	2852425	2852430	0 %	50 %	0 %	50 %	379742413
54586	NC_016944	GAA	2	6	2852436	2852441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742413
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54588	NC_016944	CAA	2	6	2852526	2852531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742413
54589	NC_016944	CTAT	2	8	2852666	2852673	25 %	50 %	0 %	25 %	379742413
54590	NC_016944	CGT	2	6	2852695	2852700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742413
54591	NC_016944	TGC	2	6	2852708	2852713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742413
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54598	NC_016944	TCAA	2	8	2853014	2853021	50 %	25 %	0 %	25 %	379742413
54599	NC_016944	AGC	2	6	2853031	2853036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742413
54600	NC_016944	ACCT	2	8	2853066	2853073	25 %	25 %	0 %	50 %	379742413
54601	NC_016944	GAA	2	6	2853109	2853114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742413
54602	NC_016944	GC	3	6	2853181	2853186	0 %	0 %	50 %	50 %	379742413
54603	NC_016944	ACG	2	6	2853197	2853202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742413
54604	NC_016944	GTTG	2	8	2853375	2853382	0 %	50 %	50 %	0 %	379742413
54605	NC_016944	CAA	2	6	2853402	2853407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742413
54606	NC_016944	CAGT	2	8	2853424	2853431	25 %	25 %	25 %	25 %	379742413
54607	NC_016944	ATG	2	6	2853512	2853517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742413
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54612	NC_016944	TGA	2	6	2853912	2853917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742413
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54614	NC_016944	CGC	2	6	2854081	2854086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742413
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54616	NC_016944	ACC	2	6	2854108	2854113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742413
54617	NC_016944	TGGG	2	8	2854171	2854178	0 %	25 %	75 %	0 %	379742413
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54625	NC_016944	ATTCG	2	10	2854571	2854580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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54736	NC_016944	ACT	2	6	2861411	2861416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742419
54737	NC_016944	T	6	6	2861416	2861421	0 %	100 %	0 %	0 %	379742419
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54740	NC_016944	TCA	2	6	2861820	2861825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742420
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54744	NC_016944	GCA	2	6	2862027	2862032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742420
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54746	NC_016944	TCTT	2	8	2862104	2862111	0 %	75 %	0 %	25 %	379742420
54747	NC_016944	GTC	2	6	2862142	2862147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742420
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54749	NC_016944	CACGAT	2	12	2862169	2862180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379742420
54750	NC_016944	CGT	2	6	2862182	2862187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742420
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54763	NC_016944	GGT	2	6	2863300	2863305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742421
54764	NC_016944	GTG	2	6	2863333	2863338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54789	NC_016944	TCA	2	6	2864519	2864524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742422
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54791	NC_016944	AAT	2	6	2864655	2864660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54792	NC_016944	T	8	8	2864790	2864797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54793	NC_016944	GAC	2	6	2864859	2864864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742423
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54801	NC_016944	GCC	2	6	2865339	2865344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742423
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54834	NC_016944	T	6	6	2867507	2867512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54835	NC_016944	ATT	2	6	2867514	2867519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54849	NC_016944	CGT	2	6	2868264	2868269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742424
54850	NC_016944	AAGCC	2	10	2868340	2868349	40 %	0 %	20 %	40 %	379742424
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54852	NC_016944	GAT	2	6	2868371	2868376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54853	NC_016944	CAT	2	6	2868382	2868387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54854	NC_016944	T	6	6	2868396	2868401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54993	NC_016944	CAT	2	6	2876336	2876341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742433
54994	NC_016944	A	6	6	2876389	2876394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54995	NC_016944	GCTG	2	8	2876395	2876402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54996	NC_016944	ACA	2	6	2876403	2876408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54997	NC_016944	A	7	7	2876447	2876453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54998	NC_016944	GGTT	2	8	2876464	2876471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54999	NC_016944	T	6	6	2876470	2876475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55000	NC_016944	AG	3	6	2876560	2876565	50 %	0 %	50 %	0 %	379742434

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