MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52119	NC_016944	TG	3	6	2717711	2717716	0 %	50 %	50 %	0 %	379742275
52120	NC_016944	GAA	2	6	2717722	2717727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742275
52121	NC_016944	TATC	2	8	2717778	2717785	25 %	50 %	0 %	25 %	379742275
52122	NC_016944	ATC	2	6	2717869	2717874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742275
52123	NC_016944	TTG	2	6	2717947	2717952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742275
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52152	NC_016944	CT	3	6	2719264	2719269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52153	NC_016944	GAA	2	6	2719279	2719284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52222	NC_016944	ACC	2	6	2724065	2724070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52223	NC_016944	GTA	2	6	2724153	2724158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52226	NC_016944	C	6	6	2724265	2724270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52227	NC_016944	GAG	2	6	2724396	2724401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52228	NC_016944	CGACT	2	10	2724573	2724582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52229	NC_016944	CTTT	2	8	2724597	2724604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52230	NC_016944	ATG	2	6	2724607	2724612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52231	NC_016944	GCT	2	6	2724613	2724618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52232	NC_016944	GTT	2	6	2724702	2724707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52233	NC_016944	ACG	2	6	2724717	2724722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52234	NC_016944	GT	3	6	2724739	2724744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52235	NC_016944	TACT	2	8	2724756	2724763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52236	NC_016944	AGT	2	6	2724832	2724837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52237	NC_016944	TCGGT	2	10	2724947	2724956	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52238	NC_016944	CAC	2	6	2725133	2725138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52239	NC_016944	GTAC	2	8	2725158	2725165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52240	NC_016944	GTCA	2	8	2725241	2725248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52241	NC_016944	GGA	2	6	2725264	2725269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52243	NC_016944	TCGC	2	8	2725421	2725428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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52364	NC_016944	GCC	2	6	2731354	2731359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742282
52365	NC_016944	ACA	2	6	2731406	2731411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742282
52366	NC_016944	GCT	2	6	2731454	2731459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742282
52367	NC_016944	TGA	2	6	2731469	2731474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742282
52368	NC_016944	AG	3	6	2731479	2731484	50 %	0 %	50 %	0 %	379742282
52369	NC_016944	CAA	2	6	2731487	2731492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742282
52370	NC_016944	CAA	2	6	2731520	2731525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742282
52371	NC_016944	CAG	2	6	2731650	2731655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742283
52372	NC_016944	ACC	2	6	2731816	2731821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742283
52373	NC_016944	AC	3	6	2731842	2731847	50 %	0 %	0 %	50 %	379742283
52374	NC_016944	GA	4	8	2731851	2731858	50 %	0 %	50 %	0 %	379742283
52375	NC_016944	CGA	2	6	2731885	2731890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742283
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52378	NC_016944	TTCAC	2	10	2731948	2731957	20 %	40 %	0 %	40 %	379742283
52379	NC_016944	CGT	2	6	2731973	2731978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742283
52380	NC_016944	GGTA	2	8	2732013	2732020	25 %	25 %	50 %	0 %	379742283
52381	NC_016944	AG	3	6	2732045	2732050	50 %	0 %	50 %	0 %	379742283
52382	NC_016944	TAA	2	6	2732051	2732056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742283
52383	NC_016944	GTG	2	6	2732129	2732134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742283
52384	NC_016944	GAG	2	6	2732197	2732202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379742283
52385	NC_016944	GCA	2	6	2732234	2732239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742283
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52388	NC_016944	GGC	2	6	2732361	2732366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742283
52389	NC_016944	GCA	2	6	2732474	2732479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742283
52390	NC_016944	TAA	2	6	2732481	2732486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742283
52391	NC_016944	GAA	2	6	2732607	2732612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742283
52392	NC_016944	AAT	2	6	2732658	2732663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742283
52393	NC_016944	T	7	7	2732692	2732698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52394	NC_016944	T	6	6	2732734	2732739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52395	NC_016944	AAT	2	6	2732741	2732746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52396	NC_016944	CAGCG	2	10	2732896	2732905	20 %	0 %	40 %	40 %	379742284
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52398	NC_016944	CTG	2	6	2733040	2733045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742284
52399	NC_016944	GT	3	6	2733059	2733064	0 %	50 %	50 %	0 %	379742284
52400	NC_016944	TCG	2	6	2733083	2733088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742284
52401	NC_016944	CTT	2	6	2733189	2733194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742284
52402	NC_016944	CCA	2	6	2733254	2733259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742284
52403	NC_016944	CCG	2	6	2733309	2733314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742284
52404	NC_016944	TGAAT	2	10	2733354	2733363	40 %	40 %	20 %	0 %	379742284
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52412	NC_016944	CGGT	2	8	2733569	2733576	0 %	25 %	50 %	25 %	379742284
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52414	NC_016944	GATGA	2	10	2733718	2733727	40 %	20 %	40 %	0 %	379742284
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52416	NC_016944	GCA	2	6	2733745	2733750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742284
52417	NC_016944	GCA	2	6	2733839	2733844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742284
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52420	NC_016944	GT	3	6	2734005	2734010	0 %	50 %	50 %	0 %	379742284
52421	NC_016944	CATCA	2	10	2734024	2734033	40 %	20 %	0 %	40 %	379742284
52422	NC_016944	TGA	2	6	2734125	2734130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742284
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52425	NC_016944	GTC	2	6	2734304	2734309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742284
52426	NC_016944	CTA	2	6	2734318	2734323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742284
52427	NC_016944	GTG	2	6	2734429	2734434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52428	NC_016944	AGC	2	6	2734603	2734608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742285
52429	NC_016944	GGT	2	6	2734790	2734795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742285
52430	NC_016944	AGC	2	6	2734825	2734830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742285
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52432	NC_016944	CT	3	6	2734926	2734931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52433	NC_016944	CAT	2	6	2735105	2735110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742286
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52452	NC_016944	CTGA	2	8	2736129	2736136	25 %	25 %	25 %	25 %	379742286
52453	NC_016944	TC	3	6	2736271	2736276	0 %	50 %	0 %	50 %	379742286
52454	NC_016944	TGG	2	6	2736285	2736290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742286
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52461	NC_016944	TGGC	2	8	2736458	2736465	0 %	25 %	50 %	25 %	379742286
52462	NC_016944	A	6	6	2736469	2736474	100 %	0 %	0 %	0 %	379742286
52463	NC_016944	CAT	2	6	2736527	2736532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742286
52464	NC_016944	CTT	2	6	2736533	2736538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742286
52465	NC_016944	GC	3	6	2736546	2736551	0 %	0 %	50 %	50 %	379742286
52466	NC_016944	ATG	2	6	2736558	2736563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742286
52467	NC_016944	AAGATG	2	12	2736580	2736591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379742286
52468	NC_016944	GTCGAA	2	12	2736662	2736673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379742286
52469	NC_016944	ATG	2	6	2736750	2736755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742286
52470	NC_016944	TGA	2	6	2736955	2736960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742286
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52472	NC_016944	CG	3	6	2737197	2737202	0 %	0 %	50 %	50 %	379742286
52473	NC_016944	TGG	2	6	2737303	2737308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742286
52474	NC_016944	CAT	2	6	2737328	2737333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742286
52475	NC_016944	AAG	2	6	2737375	2737380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742286
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52477	NC_016944	GC	3	6	2737433	2737438	0 %	0 %	50 %	50 %	379742286
52478	NC_016944	GCG	2	6	2737485	2737490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742286
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