MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio furnissii NCTC 11218 chromosome 1

Total Repeats: 67652

< Previous12...124125126127128129130131132133134135136Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
67501	NC_016602	TGC	2	6	3286428	3286433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132156
67502	NC_016602	GCA	2	6	3286452	3286457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132156
67503	NC_016602	TTC	2	6	3286561	3286566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132156
67504	NC_016602	T	6	6	3286577	3286582	0 %	100 %	0 %	0 %	375132156
67505	NC_016602	AGT	2	6	3286584	3286589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132156
67506	NC_016602	CGA	2	6	3286590	3286595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132156
67507	NC_016602	TATC	2	8	3286749	3286756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67508	NC_016602	TAA	2	6	3286873	3286878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67509	NC_016602	GA	4	8	3287021	3287028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67510	NC_016602	CAG	2	6	3287041	3287046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132157
67511	NC_016602	TGA	2	6	3287091	3287096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132157
67512	NC_016602	AAC	2	6	3287102	3287107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375132157
67513	NC_016602	AC	3	6	3287160	3287165	50 %	0 %	0 %	50 %	375132157
67514	NC_016602	CAGC	2	8	3287168	3287175	25 %	0 %	25 %	50 %	375132157
67515	NC_016602	TAT	2	6	3287260	3287265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375132157
67516	NC_016602	GAT	2	6	3287284	3287289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132157
67517	NC_016602	GCCC	2	8	3287295	3287302	0 %	0 %	25 %	75 %	375132157
67518	NC_016602	ACT	2	6	3287316	3287321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132157
67519	NC_016602	CGC	2	6	3287419	3287424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375132157
67520	NC_016602	A	6	6	3287450	3287455	100 %	0 %	0 %	0 %	375132157
67521	NC_016602	CTT	2	6	3287551	3287556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132158
67522	NC_016602	ACC	2	6	3287682	3287687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132158
67523	NC_016602	CGCT	2	8	3287763	3287770	0 %	25 %	25 %	50 %	375132158
67524	NC_016602	TCA	2	6	3287845	3287850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132158
67525	NC_016602	TGC	2	6	3287868	3287873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132158
67526	NC_016602	AC	3	6	3287896	3287901	50 %	0 %	0 %	50 %	375132158
67527	NC_016602	ATG	3	9	3287907	3287915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132158
67528	NC_016602	TGC	2	6	3287969	3287974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132158
67529	NC_016602	GTG	2	6	3288033	3288038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375132158
67530	NC_016602	TCA	2	6	3288054	3288059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132158
67531	NC_016602	GTT	2	6	3288101	3288106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132158
67532	NC_016602	ACGC	2	8	3288149	3288156	25 %	0 %	25 %	50 %	375132158
67533	NC_016602	CAC	3	9	3288191	3288199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132158
67534	NC_016602	GCA	2	6	3288250	3288255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132158
67535	NC_016602	TTG	2	6	3288267	3288272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132158
67536	NC_016602	CAG	2	6	3288317	3288322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132158
67537	NC_016602	CAC	2	6	3288332	3288337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132158
67538	NC_016602	GC	3	6	3288345	3288350	0 %	0 %	50 %	50 %	375132158
67539	NC_016602	CTT	2	6	3288361	3288366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132158
67540	NC_016602	ACC	2	6	3288450	3288455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132158
67541	NC_016602	TGC	2	6	3288480	3288485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132158
67542	NC_016602	CTG	2	6	3288491	3288496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132158
67543	NC_016602	TCG	2	6	3288568	3288573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132159
67544	NC_016602	GAT	3	9	3288666	3288674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132159
67545	NC_016602	CGG	2	6	3288677	3288682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375132159
67546	NC_016602	GTT	2	6	3288806	3288811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132159
67547	NC_016602	AGCG	2	8	3288814	3288821	25 %	0 %	50 %	25 %	375132159
67548	NC_016602	CCA	2	6	3288839	3288844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132159
67549	NC_016602	CGAG	2	8	3288879	3288886	25 %	0 %	50 %	25 %	375132159
67550	NC_016602	GC	3	6	3288996	3289001	0 %	0 %	50 %	50 %	375132159
67551	NC_016602	GTCG	2	8	3289014	3289021	0 %	25 %	50 %	25 %	375132159
67552	NC_016602	TTC	3	9	3289054	3289062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132159
67553	NC_016602	GAA	2	6	3289084	3289089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375132159
67554	NC_016602	TCA	2	6	3289105	3289110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132159
67555	NC_016602	TTTGG	2	10	3289131	3289140	0 %	60 %	40 %	0 %	375132159
67556	NC_016602	GA	3	6	3289148	3289153	50 %	0 %	50 %	0 %	375132159
67557	NC_016602	CAT	2	6	3289170	3289175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132159
67558	NC_016602	CGG	2	6	3289184	3289189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375132159
67559	NC_016602	CGC	2	6	3289233	3289238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375132159
67560	NC_016602	CA	3	6	3289244	3289249	50 %	0 %	0 %	50 %	375132159
67561	NC_016602	CGA	2	6	3289292	3289297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132159
67562	NC_016602	TGA	2	6	3289298	3289303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132159
67563	NC_016602	TTG	2	6	3289333	3289338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132159
67564	NC_016602	GCG	2	6	3289379	3289384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375132159
67565	NC_016602	T	6	6	3289415	3289420	0 %	100 %	0 %	0 %	375132159
67566	NC_016602	TGT	2	6	3289427	3289432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132159
67567	NC_016602	GC	3	6	3289464	3289469	0 %	0 %	50 %	50 %	375132159
67568	NC_016602	TACTT	2	10	3289485	3289494	20 %	60 %	0 %	20 %	375132159
67569	NC_016602	CCAC	2	8	3289675	3289682	25 %	0 %	0 %	75 %	375132159
67570	NC_016602	GTT	2	6	3289700	3289705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132159
67571	NC_016602	CGTT	2	8	3289840	3289847	0 %	50 %	25 %	25 %	375132159
67572	NC_016602	CAA	2	6	3289854	3289859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375132159
67573	NC_016602	GCC	2	6	3289860	3289865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375132159
67574	NC_016602	GGA	2	6	3289897	3289902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375132159
67575	NC_016602	CAG	2	6	3289928	3289933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132159
67576	NC_016602	TAAT	2	8	3290027	3290034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67577	NC_016602	GT	3	6	3290141	3290146	0 %	50 %	50 %	0 %	375132160
67578	NC_016602	AT	3	6	3290328	3290333	50 %	50 %	0 %	0 %	375132160
67579	NC_016602	CA	3	6	3290548	3290553	50 %	0 %	0 %	50 %	375132160
67580	NC_016602	GTT	2	6	3290559	3290564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132160
67581	NC_016602	CGT	2	6	3290634	3290639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132160
67582	NC_016602	CTGAC	2	10	3290723	3290732	20 %	20 %	20 %	40 %	375132160
67583	NC_016602	AAC	2	6	3290785	3290790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375132160
67584	NC_016602	A	7	7	3290935	3290941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67585	NC_016602	CAA	2	6	3290993	3290998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375132161
67586	NC_016602	TAC	2	6	3291198	3291203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132161
67587	NC_016602	ACG	2	6	3291282	3291287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132161
67588	NC_016602	ACC	2	6	3291393	3291398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132161
67589	NC_016602	TAA	2	6	3291452	3291457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67590	NC_016602	AGCT	2	8	3291528	3291535	25 %	25 %	25 %	25 %	375132162
67591	NC_016602	AATC	2	8	3291629	3291636	50 %	25 %	0 %	25 %	375132162
67592	NC_016602	CTG	2	6	3291650	3291655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132162
67593	NC_016602	ACG	3	9	3291672	3291680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132162
67594	NC_016602	GAA	2	6	3291681	3291686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375132162
67595	NC_016602	TGT	2	6	3291725	3291730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132163
67596	NC_016602	ATG	2	6	3291799	3291804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132163
67597	NC_016602	ACC	2	6	3291856	3291861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132163
67598	NC_016602	TCA	2	6	3292010	3292015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67599	NC_016602	CTT	2	6	3292069	3292074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132164
67600	NC_016602	TCA	2	6	3292204	3292209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132164
67601	NC_016602	TTG	2	6	3292233	3292238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132164
67602	NC_016602	CGG	2	6	3292257	3292262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375132164
67603	NC_016602	TCT	2	6	3292269	3292274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132164
67604	NC_016602	ATTT	2	8	3292389	3292396	25 %	75 %	0 %	0 %	375132164
67605	NC_016602	ATT	2	6	3292408	3292413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67606	NC_016602	CAG	2	6	3292504	3292509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67607	NC_016602	GCTG	2	8	3292572	3292579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67608	NC_016602	TCG	2	6	3292595	3292600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132165
67609	NC_016602	ATCA	2	8	3292639	3292646	50 %	25 %	0 %	25 %	375132165
67610	NC_016602	CCAG	2	8	3292662	3292669	25 %	0 %	25 %	50 %	375132165
67611	NC_016602	CTT	2	6	3292680	3292685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132165
67612	NC_016602	ATC	2	6	3292829	3292834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132165
67613	NC_016602	AGGC	2	8	3292858	3292865	25 %	0 %	50 %	25 %	375132165
67614	NC_016602	TCAA	2	8	3292886	3292893	50 %	25 %	0 %	25 %	375132165
67615	NC_016602	TCATC	2	10	3292908	3292917	20 %	40 %	0 %	40 %	375132165
67616	NC_016602	GC	3	6	3292975	3292980	0 %	0 %	50 %	50 %	375132165
67617	NC_016602	ATTG	2	8	3292992	3292999	25 %	50 %	25 %	0 %	375132165
67618	NC_016602	GAT	3	9	3293041	3293049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132165
67619	NC_016602	CTC	2	6	3293074	3293079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67620	NC_016602	TTG	2	6	3293143	3293148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132166
67621	NC_016602	ACG	2	6	3293156	3293161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132166
67622	NC_016602	TCT	2	6	3293283	3293288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375132166
67623	NC_016602	AC	3	6	3293295	3293300	50 %	0 %	0 %	50 %	375132166
67624	NC_016602	AC	3	6	3293311	3293316	50 %	0 %	0 %	50 %	375132166
67625	NC_016602	TTG	2	6	3293340	3293345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67626	NC_016602	TTA	2	6	3293372	3293377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67627	NC_016602	AGTT	2	8	3293380	3293387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67628	NC_016602	TCGTT	2	10	3293404	3293413	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67629	NC_016602	T	7	7	3293532	3293538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67630	NC_016602	T	6	6	3293575	3293580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67631	NC_016602	GAT	2	6	3293615	3293620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132167
67632	NC_016602	CAA	2	6	3293626	3293631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375132167
67633	NC_016602	CAA	2	6	3293710	3293715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375132167
67634	NC_016602	TGT	2	6	3293725	3293730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375132167
67635	NC_016602	GAA	2	6	3293822	3293827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375132167
67636	NC_016602	GAC	2	6	3293836	3293841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132167
67637	NC_016602	GT	3	6	3293886	3293891	0 %	50 %	50 %	0 %	375132167
67638	NC_016602	TCA	2	6	3293937	3293942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132167
67639	NC_016602	GTA	2	6	3293956	3293961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132167
67640	NC_016602	AGT	3	9	3294029	3294037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132167
67641	NC_016602	TCA	2	6	3294069	3294074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132167
67642	NC_016602	TAC	2	6	3294110	3294115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132167
67643	NC_016602	GCTCTG	2	12	3294181	3294192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375132167
67644	NC_016602	TCA	2	6	3294294	3294299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132167
67645	NC_016602	CAGA	2	8	3294316	3294323	50 %	0 %	25 %	25 %	375132167
67646	NC_016602	CTA	2	6	3294343	3294348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375132167
67647	NC_016602	TAG	2	6	3294353	3294358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132167
67648	NC_016602	GAT	2	6	3294398	3294403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132167
67649	NC_016602	TAG	2	6	3294428	3294433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375132167
67650	NC_016602	GCA	2	6	3294471	3294476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132167
67651	NC_016602	ACC	2	6	3294488	3294493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375132167
67652	NC_016602	GCA	2	6	3294504	3294509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375132167

< Previous12...124125126127128129130131132133134135136Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.