MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_016446	GCC	2	6	903748	903753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038122
17003	NC_016446	TGC	2	6	903770	903775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038122
17004	NC_016446	TGGT	2	8	903858	903865	0 %	50 %	50 %	0 %	360038122
17005	NC_016446	GT	3	6	903900	903905	0 %	50 %	50 %	0 %	360038123
17006	NC_016446	CAG	2	6	903918	903923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17007	NC_016446	GAT	2	6	903984	903989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038123
17008	NC_016446	CT	5	10	903999	904008	0 %	50 %	0 %	50 %	360038123
17009	NC_016446	CAGTG	2	10	904016	904025	20 %	20 %	40 %	20 %	360038123
17010	NC_016446	AGCAC	2	10	904037	904046	40 %	0 %	20 %	40 %	360038123
17011	NC_016446	CTG	2	6	904096	904101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17012	NC_016446	TTA	2	6	904136	904141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038123
17013	NC_016446	TGA	2	6	904154	904159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038123
17014	NC_016446	TCAA	2	8	904169	904176	50 %	25 %	0 %	25 %	360038123
17015	NC_016446	TCA	2	6	904287	904292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038123
17016	NC_016446	GCG	2	6	904324	904329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038123
17017	NC_016446	CAA	2	6	904342	904347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038123
17018	NC_016446	CT	3	6	904366	904371	0 %	50 %	0 %	50 %	360038123
17019	NC_016446	TGG	2	6	904379	904384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038123
17020	NC_016446	TGG	2	6	904391	904396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038123
17021	NC_016446	AGC	2	6	904427	904432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17022	NC_016446	AGC	2	6	904453	904458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17023	NC_016446	TGC	2	6	904479	904484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17024	NC_016446	GCG	2	6	904498	904503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038123
17025	NC_016446	TGG	3	9	904508	904516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038123
17026	NC_016446	AGC	2	6	904533	904538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17027	NC_016446	AAAC	2	8	904540	904547	75 %	0 %	0 %	25 %	360038123
17028	NC_016446	GCA	2	6	904631	904636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17029	NC_016446	CTG	2	6	904675	904680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17030	NC_016446	GAA	2	6	904861	904866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038123
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17032	NC_016446	CGT	2	6	904882	904887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17033	NC_016446	GCT	2	6	904896	904901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17034	NC_016446	TGGC	2	8	904954	904961	0 %	25 %	50 %	25 %	360038123
17035	NC_016446	TGC	2	6	904983	904988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17036	NC_016446	TCGG	2	8	904996	905003	0 %	25 %	50 %	25 %	360038123
17037	NC_016446	AAG	2	6	905048	905053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038123
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17039	NC_016446	CTG	2	6	905149	905154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17040	NC_016446	ATC	2	6	905162	905167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038123
17041	NC_016446	CGATG	2	10	905169	905178	20 %	20 %	40 %	20 %	360038123
17042	NC_016446	ACG	2	6	905215	905220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038123
17043	NC_016446	CTGT	2	8	905221	905228	0 %	50 %	25 %	25 %	360038123
17044	NC_016446	TTG	2	6	905315	905320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038124
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17047	NC_016446	GCA	2	6	905353	905358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038124
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17049	NC_016446	TGGC	2	8	905432	905439	0 %	25 %	50 %	25 %	360038124
17050	NC_016446	AGC	2	6	905603	905608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038124
17051	NC_016446	TAAA	2	8	905657	905664	75 %	25 %	0 %	0 %	360038124
17052	NC_016446	ACT	2	6	905669	905674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038124
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17054	NC_016446	A	6	6	905789	905794	100 %	0 %	0 %	0 %	360038124
17055	NC_016446	TGG	2	6	905818	905823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038124
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17057	NC_016446	TGAT	2	8	905843	905850	25 %	50 %	25 %	0 %	360038124
17058	NC_016446	GAA	2	6	905887	905892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038124
17059	NC_016446	ATG	2	6	905894	905899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038124
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17068	NC_016446	GTG	2	6	906440	906445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038124
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17093	NC_016446	GC	3	6	907641	907646	0 %	0 %	50 %	50 %	360038124
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17103	NC_016446	GGA	2	6	908172	908177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038124
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17211	NC_016446	ATA	2	6	913821	913826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360038127
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17228	NC_016446	T	6	6	914460	914465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17229	NC_016446	A	7	7	914526	914532	100 %	0 %	0 %	0 %	360038130
17230	NC_016446	CTA	2	6	914538	914543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038130
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17232	NC_016446	TGG	2	6	914563	914568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038130
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17235	NC_016446	T	6	6	914672	914677	0 %	100 %	0 %	0 %	360038130
17236	NC_016446	AGA	2	6	914792	914797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038130
17237	NC_016446	ACGC	2	8	914855	914862	25 %	0 %	25 %	50 %	360038130
17238	NC_016446	CG	3	6	914871	914876	0 %	0 %	50 %	50 %	360038130
17239	NC_016446	GGA	2	6	914957	914962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17240	NC_016446	TGA	2	6	915108	915113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038131
17241	NC_016446	GCA	2	6	915147	915152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038131
17242	NC_016446	ATT	2	6	915218	915223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038131
17243	NC_016446	GAGCT	2	10	915392	915401	20 %	20 %	40 %	20 %	360038131
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17248	NC_016446	ACCGAA	2	12	915494	915505	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360038131
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17250	NC_016446	GAC	2	6	915596	915601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038131
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17271	NC_016446	T	6	6	916620	916625	0 %	100 %	0 %	0 %	360038132
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17275	NC_016446	GCTG	2	8	916818	916825	0 %	25 %	50 %	25 %	360038132
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17351	NC_016446	GA	3	6	920594	920599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17352	NC_016446	TGA	2	6	920615	920620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038136
17353	NC_016446	T	7	7	920622	920628	0 %	100 %	0 %	0 %	360038136
17354	NC_016446	GTTTG	2	10	920706	920715	0 %	60 %	40 %	0 %	360038136
17355	NC_016446	A	6	6	920741	920746	100 %	0 %	0 %	0 %	360038136
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