MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

< Previous12...28293031323334353637383940Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16504	NC_016446	TTATGG	2	12	876626	876637	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360038101
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16507	NC_016446	GACA	2	8	876863	876870	50 %	0 %	25 %	25 %	360038101
16508	NC_016446	GTA	2	6	876942	876947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038101
16509	NC_016446	AAGC	2	8	877056	877063	50 %	0 %	25 %	25 %	360038101
16510	NC_016446	ATG	2	6	877111	877116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038101
16511	NC_016446	CTG	3	9	877126	877134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038101
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16513	NC_016446	GCAA	2	8	877238	877245	50 %	0 %	25 %	25 %	360038102
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16519	NC_016446	T	6	6	877494	877499	0 %	100 %	0 %	0 %	360038102
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16524	NC_016446	CG	3	6	877759	877764	0 %	0 %	50 %	50 %	360038102
16525	NC_016446	TCA	2	6	877813	877818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038102
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16532	NC_016446	GCTG	2	8	878199	878206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16533	NC_016446	CAA	2	6	878299	878304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_016446	CAT	2	6	878371	878376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038103
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16553	NC_016446	TGGATG	2	12	879579	879590	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	360038103
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16614	NC_016446	TG	3	6	882814	882819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16615	NC_016446	TCAC	2	8	882833	882840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16745	NC_016446	GCA	2	6	889418	889423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16748	NC_016446	TCA	2	6	889464	889469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16868	NC_016446	CTA	2	6	896277	896282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038116
16869	NC_016446	GTT	2	6	896322	896327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038116
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16871	NC_016446	GTC	2	6	896591	896596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038117
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16986	NC_016446	GCT	2	6	902737	902742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038121
16987	NC_016446	TTGA	2	8	902867	902874	25 %	50 %	25 %	0 %	360038121
16988	NC_016446	GC	3	6	902883	902888	0 %	0 %	50 %	50 %	360038121
16989	NC_016446	ACCCT	2	10	902942	902951	20 %	20 %	0 %	60 %	360038121
16990	NC_016446	GCTG	2	8	903025	903032	0 %	25 %	50 %	25 %	360038121
16991	NC_016446	GTCA	2	8	903074	903081	25 %	25 %	25 %	25 %	360038121
16992	NC_016446	ATC	2	6	903095	903100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038121
16993	NC_016446	CG	3	6	903131	903136	0 %	0 %	50 %	50 %	360038121
16994	NC_016446	GCG	2	6	903140	903145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038121
16995	NC_016446	AGC	2	6	903273	903278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038122
16996	NC_016446	AGCTG	2	10	903309	903318	20 %	20 %	40 %	20 %	360038122
16997	NC_016446	GGC	2	6	903441	903446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038122
16998	NC_016446	GCA	2	6	903506	903511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038122
16999	NC_016446	TAA	2	6	903588	903593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360038122
17000	NC_016446	AAG	2	6	903623	903628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038122

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