MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016446	T	6	6	850262	850267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_016446	GCT	2	6	850312	850317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16003	NC_016446	TGC	2	6	850323	850328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16004	NC_016446	TGC	3	9	850355	850363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16005	NC_016446	TTC	2	6	850451	850456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038073
16006	NC_016446	TGAT	2	8	850506	850513	25 %	50 %	25 %	0 %	360038073
16007	NC_016446	GA	3	6	850520	850525	50 %	0 %	50 %	0 %	360038073
16008	NC_016446	GCT	2	6	850539	850544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16009	NC_016446	CTG	2	6	850587	850592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16010	NC_016446	ATTGG	2	10	850601	850610	20 %	40 %	40 %	0 %	360038073
16011	NC_016446	AAT	2	6	850625	850630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360038073
16012	NC_016446	CG	3	6	850662	850667	0 %	0 %	50 %	50 %	360038073
16013	NC_016446	CTA	2	6	850690	850695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16014	NC_016446	CG	3	6	850721	850726	0 %	0 %	50 %	50 %	360038073
16015	NC_016446	TAC	2	6	850777	850782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16016	NC_016446	TTGA	2	8	850829	850836	25 %	50 %	25 %	0 %	360038073
16017	NC_016446	CT	3	6	850890	850895	0 %	50 %	0 %	50 %	360038073
16018	NC_016446	GTTG	2	8	850924	850931	0 %	50 %	50 %	0 %	360038073
16019	NC_016446	TTG	2	6	850934	850939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038073
16020	NC_016446	TGC	2	6	850940	850945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16021	NC_016446	TG	3	6	850957	850962	0 %	50 %	50 %	0 %	360038073
16022	NC_016446	TCA	2	6	851065	851070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16023	NC_016446	CT	3	6	851124	851129	0 %	50 %	0 %	50 %	360038073
16024	NC_016446	CTT	2	6	851200	851205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038073
16025	NC_016446	TTG	2	6	851249	851254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038073
16026	NC_016446	ATG	2	6	851277	851282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038073
16027	NC_016446	ACT	2	6	851297	851302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16028	NC_016446	TGCTCA	2	12	851364	851375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	360038073
16029	NC_016446	TCA	2	6	851379	851384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16030	NC_016446	GTC	2	6	851388	851393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038073
16031	NC_016446	ATC	2	6	851439	851444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16032	NC_016446	GTTT	2	8	851658	851665	0 %	75 %	25 %	0 %	360038073
16033	NC_016446	ATCA	2	8	851750	851757	50 %	25 %	0 %	25 %	360038073
16034	NC_016446	GTG	2	6	851760	851765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038073
16035	NC_016446	TGA	2	6	851782	851787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038073
16036	NC_016446	GTT	2	6	851788	851793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038073
16037	NC_016446	TGG	2	6	851811	851816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038073
16038	NC_016446	AAC	2	6	851865	851870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038073
16039	NC_016446	TAC	2	6	851888	851893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038073
16040	NC_016446	TTA	2	6	851955	851960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_016446	AAT	2	6	851963	851968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_016446	AAAT	2	8	851981	851988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_016446	ATA	2	6	851997	852002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_016446	ATG	2	6	852010	852015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_016446	TGA	2	6	852043	852048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_016446	GAA	2	6	852094	852099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_016446	T	6	6	852121	852126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_016446	TGA	2	6	852304	852309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038074
16049	NC_016446	CAG	2	6	852385	852390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038074
16050	NC_016446	AAG	2	6	852565	852570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038074
16051	NC_016446	GAA	2	6	852582	852587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038074
16052	NC_016446	CAG	2	6	852649	852654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038074
16053	NC_016446	TGG	2	6	852704	852709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038074
16054	NC_016446	GTG	2	6	852760	852765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038074
16055	NC_016446	CAT	2	6	852776	852781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038074
16056	NC_016446	AAAG	2	8	852791	852798	75 %	0 %	25 %	0 %	360038074
16057	NC_016446	AAG	2	6	852808	852813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038074
16058	NC_016446	AGCG	2	8	852959	852966	25 %	0 %	50 %	25 %	360038074
16059	NC_016446	ACAA	2	8	853021	853028	75 %	0 %	0 %	25 %	360038074
16060	NC_016446	CTG	2	6	853039	853044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038074
16061	NC_016446	GAA	2	6	853049	853054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038074
16062	NC_016446	TAAC	2	8	853121	853128	50 %	25 %	0 %	25 %	360038074
16063	NC_016446	CAA	2	6	853215	853220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038075
16064	NC_016446	ATA	2	6	853239	853244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360038075
16065	NC_016446	ACG	2	6	853270	853275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038075
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16067	NC_016446	CAT	2	6	853348	853353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038075
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16070	NC_016446	GTC	2	6	853478	853483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038075
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16074	NC_016446	AAG	2	6	853788	853793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038075
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16087	NC_016446	TTCT	2	8	854552	854559	0 %	75 %	0 %	25 %	360038076
16088	NC_016446	ATT	2	6	854596	854601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038076
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16092	NC_016446	GAA	2	6	854884	854889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038076
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16095	NC_016446	ATGG	2	8	855227	855234	25 %	25 %	50 %	0 %	360038077
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16098	NC_016446	TGA	2	6	855382	855387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038077
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16100	NC_016446	CG	3	6	855496	855501	0 %	0 %	50 %	50 %	360038077
16101	NC_016446	GATG	2	8	855532	855539	25 %	25 %	50 %	0 %	360038077
16102	NC_016446	GAA	3	9	855601	855609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038077
16103	NC_016446	ACTC	2	8	855629	855636	25 %	25 %	0 %	50 %	360038077
16104	NC_016446	GCA	2	6	855640	855645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038077
16105	NC_016446	GC	3	6	855647	855652	0 %	0 %	50 %	50 %	360038077
16106	NC_016446	TTC	2	6	855674	855679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038077
16107	NC_016446	GTTG	2	8	855691	855698	0 %	50 %	50 %	0 %	360038077
16108	NC_016446	GAT	2	6	855737	855742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038077
16109	NC_016446	T	6	6	855839	855844	0 %	100 %	0 %	0 %	360038078
16110	NC_016446	ATTTC	2	10	855851	855860	20 %	60 %	0 %	20 %	360038078
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16112	NC_016446	CAT	3	9	856011	856019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038078
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16116	NC_016446	AC	3	6	856079	856084	50 %	0 %	0 %	50 %	360038078
16117	NC_016446	GTT	2	6	856107	856112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038078
16118	NC_016446	AG	4	8	856205	856212	50 %	0 %	50 %	0 %	360038078
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16120	NC_016446	CA	3	6	856347	856352	50 %	0 %	0 %	50 %	360038078
16121	NC_016446	CAA	2	6	856362	856367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038078
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16245	NC_016446	CGT	2	6	862605	862610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038083
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16488	NC_016446	CTG	2	6	875437	875442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038100
16489	NC_016446	TGAA	2	8	875473	875480	50 %	25 %	25 %	0 %	360038100
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16492	NC_016446	TGAT	2	8	875713	875720	25 %	50 %	25 %	0 %	360038100
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