MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016446	TGC	2	6	823896	823901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038050
15502	NC_016446	TGA	2	6	823956	823961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038050
15503	NC_016446	GT	3	6	823968	823973	0 %	50 %	50 %	0 %	360038050
15504	NC_016446	GCA	2	6	824056	824061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038050
15505	NC_016446	AAC	2	6	824103	824108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_016446	GGC	2	6	824124	824129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_016446	AGTG	2	8	824131	824138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_016446	TTG	2	6	824279	824284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_016446	TG	3	6	824359	824364	0 %	50 %	50 %	0 %	360038051
15510	NC_016446	GT	3	6	824545	824550	0 %	50 %	50 %	0 %	360038051
15511	NC_016446	ATCG	2	8	824585	824592	25 %	25 %	25 %	25 %	360038051
15512	NC_016446	TC	3	6	824633	824638	0 %	50 %	0 %	50 %	360038051
15513	NC_016446	GGT	2	6	824646	824651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038051
15514	NC_016446	CAG	2	6	824715	824720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15515	NC_016446	TCT	2	6	824730	824735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038051
15516	NC_016446	GAT	2	6	824748	824753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15517	NC_016446	GGA	2	6	824817	824822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038051
15518	NC_016446	TGA	2	6	824909	824914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15519	NC_016446	CAC	2	6	824999	825004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038051
15520	NC_016446	TG	3	6	825029	825034	0 %	50 %	50 %	0 %	360038051
15521	NC_016446	CTC	2	6	825047	825052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360038051
15522	NC_016446	TCTG	2	8	825062	825069	0 %	50 %	25 %	25 %	360038051
15523	NC_016446	GCA	2	6	825095	825100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15524	NC_016446	ACC	2	6	825136	825141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038051
15525	NC_016446	AAGC	2	8	825234	825241	50 %	0 %	25 %	25 %	360038051
15526	NC_016446	TCG	2	6	825263	825268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15527	NC_016446	TGG	2	6	825325	825330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038051
15528	NC_016446	ATG	2	6	825526	825531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15529	NC_016446	TCC	2	6	825546	825551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360038051
15530	NC_016446	GAC	2	6	825581	825586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15531	NC_016446	TGA	2	6	825947	825952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15532	NC_016446	TGG	2	6	825955	825960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038051
15533	NC_016446	ATG	2	6	825967	825972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15534	NC_016446	TTCAAT	2	12	826005	826016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	360038051
15535	NC_016446	CAG	2	6	826090	826095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15536	NC_016446	GGT	2	6	826103	826108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038051
15537	NC_016446	AGC	2	6	826126	826131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15538	NC_016446	CTCA	2	8	826154	826161	25 %	25 %	0 %	50 %	360038051
15539	NC_016446	ATT	2	6	826164	826169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038051
15540	NC_016446	ATC	2	6	826203	826208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038051
15541	NC_016446	AATC	2	8	826244	826251	50 %	25 %	0 %	25 %	360038051
15542	NC_016446	TGA	2	6	826322	826327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15543	NC_016446	CTT	2	6	826631	826636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038051
15544	NC_016446	GAG	2	6	826659	826664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038051
15545	NC_016446	ATG	2	6	826687	826692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038051
15546	NC_016446	GCGT	2	8	826711	826718	0 %	25 %	50 %	25 %	360038051
15547	NC_016446	ATT	2	6	826782	826787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038051
15548	NC_016446	GAAA	2	8	826802	826809	75 %	0 %	25 %	0 %	360038051
15549	NC_016446	GAG	2	6	826890	826895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038051
15550	NC_016446	GCT	2	6	826946	826951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15551	NC_016446	GATG	2	8	827033	827040	25 %	25 %	50 %	0 %	360038051
15552	NC_016446	AAG	2	6	827308	827313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038051
15553	NC_016446	AGC	2	6	827371	827376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15554	NC_016446	GATT	2	8	827389	827396	25 %	50 %	25 %	0 %	360038051
15555	NC_016446	ATC	2	6	827457	827462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038051
15556	NC_016446	GCC	2	6	827526	827531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038051
15557	NC_016446	CTG	2	6	827541	827546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038051
15558	NC_016446	CAA	2	6	827586	827591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038052
15559	NC_016446	A	6	6	827590	827595	100 %	0 %	0 %	0 %	360038052
15560	NC_016446	CGTT	2	8	827666	827673	0 %	50 %	25 %	25 %	360038052
15561	NC_016446	C	6	6	827674	827679	0 %	0 %	0 %	100 %	360038052
15562	NC_016446	GT	3	6	827687	827692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_016446	GCC	2	6	827720	827725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15564	NC_016446	GAGGTA	2	12	827771	827782	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	360038053
15565	NC_016446	ATC	2	6	827900	827905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038053
15566	NC_016446	CAC	2	6	827968	827973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038053
15567	NC_016446	TACCT	2	10	828032	828041	20 %	40 %	0 %	40 %	360038053
15568	NC_016446	AG	3	6	828093	828098	50 %	0 %	50 %	0 %	360038053
15569	NC_016446	GACA	2	8	828173	828180	50 %	0 %	25 %	25 %	360038053
15570	NC_016446	GCAC	2	8	828228	828235	25 %	0 %	25 %	50 %	360038053
15571	NC_016446	CAC	2	6	828304	828309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038053
15572	NC_016446	GGC	2	6	828368	828373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038053
15573	NC_016446	CTT	2	6	828556	828561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038053
15574	NC_016446	GAACA	2	10	828617	828626	60 %	0 %	20 %	20 %	360038053
15575	NC_016446	TGGTT	2	10	828645	828654	0 %	60 %	40 %	0 %	360038053
15576	NC_016446	CCA	2	6	828667	828672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038053
15577	NC_016446	AGT	2	6	828701	828706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038053
15578	NC_016446	GGT	2	6	828739	828744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038053
15579	NC_016446	TCA	2	6	828751	828756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038053
15580	NC_016446	CGC	2	6	828784	828789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038053
15581	NC_016446	AC	3	6	828852	828857	50 %	0 %	0 %	50 %	360038053
15582	NC_016446	CAG	2	6	828878	828883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038053
15583	NC_016446	ATT	2	6	828891	828896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038053
15584	NC_016446	GA	4	8	828941	828948	50 %	0 %	50 %	0 %	360038054
15585	NC_016446	TCA	2	6	828992	828997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038054
15586	NC_016446	AATG	2	8	829146	829153	50 %	25 %	25 %	0 %	360038054
15587	NC_016446	AAT	2	6	829213	829218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360038054
15588	NC_016446	CGA	2	6	829239	829244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038054
15589	NC_016446	AAT	2	6	829266	829271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360038054
15590	NC_016446	ATA	2	6	829348	829353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_016446	ATA	2	6	829374	829379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_016446	TGC	2	6	829405	829410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_016446	AC	4	8	829423	829430	50 %	0 %	0 %	50 %	360038055
15594	NC_016446	ACGT	2	8	829484	829491	25 %	25 %	25 %	25 %	360038055
15595	NC_016446	GCAT	2	8	829603	829610	25 %	25 %	25 %	25 %	360038055
15596	NC_016446	AGG	2	6	829676	829681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038055
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15598	NC_016446	TCA	2	6	829759	829764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038055
15599	NC_016446	GCA	3	9	829820	829828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038055
15600	NC_016446	CCAA	2	8	829847	829854	50 %	0 %	0 %	50 %	360038055
15601	NC_016446	CGG	2	6	829855	829860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038055
15602	NC_016446	TTC	2	6	829918	829923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038055
15603	NC_016446	GGT	2	6	829932	829937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038055
15604	NC_016446	GGC	2	6	830003	830008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038055
15605	NC_016446	TCA	2	6	830048	830053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038055
15606	NC_016446	CTTT	2	8	830075	830082	0 %	75 %	0 %	25 %	360038055
15607	NC_016446	CA	3	6	830120	830125	50 %	0 %	0 %	50 %	360038055
15608	NC_016446	GAAT	2	8	830167	830174	50 %	25 %	25 %	0 %	360038055
15609	NC_016446	CAG	2	6	830202	830207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038055
15610	NC_016446	TGG	2	6	830210	830215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038055
15611	NC_016446	AG	3	6	830238	830243	50 %	0 %	50 %	0 %	360038055
15612	NC_016446	TCA	2	6	830327	830332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038055
15613	NC_016446	TTG	2	6	830352	830357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038055
15614	NC_016446	GCTTG	2	10	830366	830375	0 %	40 %	40 %	20 %	360038055
15615	NC_016446	CAG	2	6	830397	830402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038055
15616	NC_016446	TCA	2	6	830428	830433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038055
15617	NC_016446	T	6	6	830555	830560	0 %	100 %	0 %	0 %	360038055
15618	NC_016446	GTA	2	6	830562	830567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038055
15619	NC_016446	TCA	2	6	830638	830643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038055
15620	NC_016446	CATGC	2	10	830646	830655	20 %	20 %	20 %	40 %	360038055
15621	NC_016446	CTCA	2	8	830727	830734	25 %	25 %	0 %	50 %	360038055
15622	NC_016446	GCG	2	6	830794	830799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038055
15623	NC_016446	CGG	2	6	830839	830844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038055
15624	NC_016446	TGA	2	6	830855	830860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038055
15625	NC_016446	GGT	2	6	830886	830891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038055
15626	NC_016446	CTT	2	6	830966	830971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038055
15627	NC_016446	GCA	2	6	831063	831068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038056
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15631	NC_016446	CA	3	6	831254	831259	50 %	0 %	0 %	50 %	360038056
15632	NC_016446	GAC	2	6	831289	831294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038056
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15634	NC_016446	CCA	2	6	831346	831351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038056
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15636	NC_016446	GC	3	6	831430	831435	0 %	0 %	50 %	50 %	360038056
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15641	NC_016446	GCC	2	6	831548	831553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038056
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15653	NC_016446	GTGG	2	8	832015	832022	0 %	25 %	75 %	0 %	360038056
15654	NC_016446	CTCAAT	2	12	832081	832092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038056
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15659	NC_016446	GCT	2	6	832422	832427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038056
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15663	NC_016446	ATA	2	6	832579	832584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15664	NC_016446	TGC	2	6	832650	832655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038057
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15706	NC_016446	CAATT	2	10	834874	834883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15707	NC_016446	TGT	2	6	834936	834941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15714	NC_016446	AATGGG	2	12	835325	835336	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	360038060
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15720	NC_016446	A	6	6	835600	835605	100 %	0 %	0 %	0 %	360038060
15721	NC_016446	GAA	2	6	835623	835628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038060
15722	NC_016446	A	7	7	835728	835734	100 %	0 %	0 %	0 %	360038060
15723	NC_016446	TCG	2	6	835735	835740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038060
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15730	NC_016446	TAC	2	6	836345	836350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038061
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