MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_016446	GTG	2	6	797602	797607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038026
15004	NC_016446	ATG	2	6	797624	797629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038026
15005	NC_016446	A	7	7	797649	797655	100 %	0 %	0 %	0 %	360038026
15006	NC_016446	AAC	2	6	797734	797739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038026
15007	NC_016446	TC	3	6	797766	797771	0 %	50 %	0 %	50 %	360038026
15008	NC_016446	TGG	2	6	797792	797797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038026
15009	NC_016446	AG	3	6	797937	797942	50 %	0 %	50 %	0 %	360038026
15010	NC_016446	AGG	2	6	797991	797996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038026
15011	NC_016446	TTG	2	6	798007	798012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038026
15012	NC_016446	TGG	2	6	798032	798037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038026
15013	NC_016446	TGC	2	6	798062	798067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038026
15014	NC_016446	ATGA	2	8	798136	798143	50 %	25 %	25 %	0 %	360038026
15015	NC_016446	AGT	2	6	798235	798240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038026
15016	NC_016446	GAT	2	6	798249	798254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038026
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15018	NC_016446	GC	3	6	798317	798322	0 %	0 %	50 %	50 %	360038026
15019	NC_016446	GTT	2	6	798579	798584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038026
15020	NC_016446	ATCG	2	8	798660	798667	25 %	25 %	25 %	25 %	360038026
15021	NC_016446	TGG	2	6	798671	798676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038026
15022	NC_016446	CAG	2	6	798738	798743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038026
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15024	NC_016446	T	6	6	798809	798814	0 %	100 %	0 %	0 %	360038026
15025	NC_016446	TGG	2	6	798849	798854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038026
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15028	NC_016446	ATGG	2	8	799104	799111	25 %	25 %	50 %	0 %	360038026
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15032	NC_016446	CAG	2	6	799533	799538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038027
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15034	NC_016446	GA	4	8	799574	799581	50 %	0 %	50 %	0 %	360038027
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15037	NC_016446	T	8	8	799646	799653	0 %	100 %	0 %	0 %	360038027
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15043	NC_016446	TGTT	2	8	799861	799868	0 %	75 %	25 %	0 %	360038027
15044	NC_016446	CGT	2	6	799878	799883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038027
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15047	NC_016446	CCACC	2	10	799947	799956	20 %	0 %	0 %	80 %	360038027
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15049	NC_016446	ATTG	2	8	799989	799996	25 %	50 %	25 %	0 %	360038027
15050	NC_016446	AAAGA	2	10	800011	800020	80 %	0 %	20 %	0 %	360038027
15051	NC_016446	TGG	2	6	800021	800026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038027
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15053	NC_016446	TGA	2	6	800088	800093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038027
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15057	NC_016446	CGT	2	6	800337	800342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038028
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15062	NC_016446	AATG	2	8	800511	800518	50 %	25 %	25 %	0 %	360038028
15063	NC_016446	TG	3	6	800526	800531	0 %	50 %	50 %	0 %	360038028
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15088	NC_016446	TAAA	2	8	801781	801788	75 %	25 %	0 %	0 %	360038029
15089	NC_016446	TCA	2	6	801804	801809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038029
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15103	NC_016446	A	6	6	802752	802757	100 %	0 %	0 %	0 %	360038030
15104	NC_016446	A	7	7	802834	802840	100 %	0 %	0 %	0 %	360038030
15105	NC_016446	CGCGA	2	10	802873	802882	20 %	0 %	40 %	40 %	360038030
15106	NC_016446	TGG	2	6	802964	802969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038030
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15110	NC_016446	ATA	2	6	803311	803316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_016446	CCA	2	6	803345	803350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038031
15112	NC_016446	T	7	7	803549	803555	0 %	100 %	0 %	0 %	360038031
15113	NC_016446	GCG	2	6	803575	803580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038031
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15121	NC_016446	TCC	2	6	803916	803921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360038031
15122	NC_016446	GCG	2	6	803932	803937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038031
15123	NC_016446	ACTG	2	8	803959	803966	25 %	25 %	25 %	25 %	360038031
15124	NC_016446	GAT	3	9	803991	803999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038031
15125	NC_016446	GGT	2	6	804172	804177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038031
15126	NC_016446	TGG	2	6	804197	804202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038031
15127	NC_016446	TGC	2	6	804284	804289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038031
15128	NC_016446	TGG	3	9	804294	804302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038031
15129	NC_016446	GTG	2	6	804394	804399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038031
15130	NC_016446	GTG	2	6	804406	804411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038031
15131	NC_016446	CTG	2	6	804466	804471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038031
15132	NC_016446	ATTG	2	8	804531	804538	25 %	50 %	25 %	0 %	360038031
15133	NC_016446	CCT	2	6	804548	804553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360038031
15134	NC_016446	TGC	2	6	804563	804568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038031
15135	NC_016446	CCG	2	6	804580	804585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038031
15136	NC_016446	GAT	2	6	804627	804632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038031
15137	NC_016446	A	6	6	804726	804731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15138	NC_016446	CAG	2	6	804784	804789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15139	NC_016446	TATT	2	8	804798	804805	25 %	75 %	0 %	0 %	360038032
15140	NC_016446	GCA	2	6	804869	804874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038032
15141	NC_016446	TTC	2	6	804876	804881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038032
15142	NC_016446	GCC	2	6	804955	804960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038032
15143	NC_016446	TTA	2	6	804973	804978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038032
15144	NC_016446	CTT	2	6	805022	805027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038032
15145	NC_016446	TTG	2	6	805065	805070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038032
15146	NC_016446	AGT	2	6	805075	805080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038032
15147	NC_016446	GAG	2	6	805115	805120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038032
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15149	NC_016446	CAC	2	6	805182	805187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038032
15150	NC_016446	GAT	3	9	805197	805205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038032
15151	NC_016446	A	6	6	805293	805298	100 %	0 %	0 %	0 %	360038032
15152	NC_016446	GCC	2	6	805299	805304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038032
15153	NC_016446	AGC	2	6	805386	805391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038032
15154	NC_016446	GCAA	2	8	805402	805409	50 %	0 %	25 %	25 %	360038032
15155	NC_016446	TGC	2	6	805598	805603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15156	NC_016446	AATC	2	8	805626	805633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15157	NC_016446	TTTGT	2	10	805645	805654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15158	NC_016446	CTC	2	6	805698	805703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15159	NC_016446	T	8	8	805749	805756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15160	NC_016446	CAAA	2	8	805759	805766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15161	NC_016446	A	6	6	805764	805769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15162	NC_016446	TC	3	6	805771	805776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15163	NC_016446	AG	4	8	805853	805860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15164	NC_016446	CGC	2	6	805888	805893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038033
15165	NC_016446	GCA	2	6	805928	805933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038033
15166	NC_016446	ACC	2	6	806006	806011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038033
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15168	NC_016446	GCT	2	6	806561	806566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038033
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15170	NC_016446	A	7	7	806645	806651	100 %	0 %	0 %	0 %	360038033
15171	NC_016446	ATC	2	6	806669	806674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038033
15172	NC_016446	ATCG	2	8	806677	806684	25 %	25 %	25 %	25 %	360038033
15173	NC_016446	CT	3	6	806696	806701	0 %	50 %	0 %	50 %	360038033
15174	NC_016446	CTT	2	6	806707	806712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038033
15175	NC_016446	AAGCG	2	10	806727	806736	40 %	0 %	40 %	20 %	360038033
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15178	NC_016446	TGA	2	6	806908	806913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038033
15179	NC_016446	CGG	2	6	807049	807054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038033
15180	NC_016446	CCA	2	6	807073	807078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038033
15181	NC_016446	CTG	2	6	807194	807199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038033
15182	NC_016446	TATG	2	8	807244	807251	25 %	50 %	25 %	0 %	360038033
15183	NC_016446	TAC	2	6	807481	807486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038033
15184	NC_016446	TGA	3	9	807505	807513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038033
15185	NC_016446	TACG	2	8	807539	807546	25 %	25 %	25 %	25 %	360038033
15186	NC_016446	AATGC	2	10	807608	807617	40 %	20 %	20 %	20 %	360038033
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15189	NC_016446	GACA	2	8	807883	807890	50 %	0 %	25 %	25 %	360038033
15190	NC_016446	TGG	2	6	807918	807923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038033
15191	NC_016446	CCA	2	6	807942	807947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038033
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15194	NC_016446	GGT	2	6	808238	808243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038033
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15197	NC_016446	GTT	2	6	808401	808406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038033
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15199	NC_016446	TCG	2	6	808520	808525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038034
15200	NC_016446	TGG	2	6	808547	808552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038034
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15203	NC_016446	TC	4	8	808674	808681	0 %	50 %	0 %	50 %	360038034
15204	NC_016446	TTC	2	6	808713	808718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15205	NC_016446	CCA	2	6	808757	808762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15206	NC_016446	CA	3	6	808778	808783	50 %	0 %	0 %	50 %	360038035
15207	NC_016446	AAC	2	6	808889	808894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038035
15208	NC_016446	GCT	2	6	808932	808937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038035
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15210	NC_016446	AG	3	6	808959	808964	50 %	0 %	50 %	0 %	360038035
15211	NC_016446	ATC	2	6	808984	808989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038035
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15213	NC_016446	TGA	2	6	809009	809014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038035
15214	NC_016446	GTC	2	6	809066	809071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038035
15215	NC_016446	CTG	2	6	809240	809245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038035
15216	NC_016446	A	6	6	809315	809320	100 %	0 %	0 %	0 %	360038035
15217	NC_016446	CGT	2	6	809323	809328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038035
15218	NC_016446	TGA	2	6	809390	809395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038035
15219	NC_016446	CAA	2	6	809454	809459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038035
15220	NC_016446	CCA	2	6	809503	809508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038035
15221	NC_016446	GCTTA	2	10	809526	809535	20 %	40 %	20 %	20 %	360038036
15222	NC_016446	GT	3	6	809599	809604	0 %	50 %	50 %	0 %	360038036
15223	NC_016446	AGTTTG	2	12	809633	809644	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360038036
15224	NC_016446	GCA	2	6	809646	809651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038036
15225	NC_016446	CAG	2	6	809683	809688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038036
15226	NC_016446	CAA	2	6	809755	809760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038036
15227	NC_016446	AATC	2	8	809767	809774	50 %	25 %	0 %	25 %	360038036
15228	NC_016446	AAGCT	2	10	809963	809972	40 %	20 %	20 %	20 %	360038036
15229	NC_016446	GTCA	2	8	810049	810056	25 %	25 %	25 %	25 %	360038036
15230	NC_016446	T	6	6	810069	810074	0 %	100 %	0 %	0 %	360038036
15231	NC_016446	ACTCA	2	10	810082	810091	40 %	20 %	0 %	40 %	360038036
15232	NC_016446	CTT	2	6	810152	810157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038036
15233	NC_016446	GTTG	2	8	810261	810268	0 %	50 %	50 %	0 %	360038036
15234	NC_016446	TGA	2	6	810323	810328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038036
15235	NC_016446	TGCA	2	8	810347	810354	25 %	25 %	25 %	25 %	360038036
15236	NC_016446	TCT	2	6	810366	810371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15237	NC_016446	TGAT	2	8	810377	810384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_016446	GCGGA	2	10	810521	810530	20 %	0 %	60 %	20 %	360038037
15239	NC_016446	CAA	2	6	810595	810600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038037
15240	NC_016446	GTT	2	6	810618	810623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038037
15241	NC_016446	CTG	2	6	810637	810642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038037
15242	NC_016446	TGGT	2	8	810665	810672	0 %	50 %	50 %	0 %	360038037
15243	NC_016446	CGC	2	6	810733	810738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038037
15244	NC_016446	CGC	2	6	810751	810756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038037
15245	NC_016446	CT	3	6	810764	810769	0 %	50 %	0 %	50 %	360038037
15246	NC_016446	T	6	6	810849	810854	0 %	100 %	0 %	0 %	360038037
15247	NC_016446	ACG	2	6	810881	810886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038037
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15250	NC_016446	GTT	2	6	811059	811064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038037
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15255	NC_016446	TGA	2	6	811187	811192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038037
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15264	NC_016446	ACA	2	6	811980	811985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360038037
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15271	NC_016446	A	6	6	812755	812760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15272	NC_016446	ACATG	2	10	812775	812784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15273	NC_016446	TCG	2	6	812809	812814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15274	NC_016446	AGT	2	6	812922	812927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15276	NC_016446	TGA	2	6	813124	813129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038039
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15278	NC_016446	AGTG	2	8	813202	813209	25 %	25 %	50 %	0 %	360038039
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15336	NC_016446	TA	3	6	815971	815976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15337	NC_016446	TAA	2	6	815982	815987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15338	NC_016446	T	7	7	816020	816026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15339	NC_016446	CAT	2	6	816118	816123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038041
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15349	NC_016446	TTTC	2	8	816585	816592	0 %	75 %	0 %	25 %	360038041
15350	NC_016446	TTA	2	6	816644	816649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038041
15351	NC_016446	A	7	7	816654	816660	100 %	0 %	0 %	0 %	360038041
15352	NC_016446	GCT	2	6	816682	816687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038041
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15356	NC_016446	GC	3	6	816917	816922	0 %	0 %	50 %	50 %	360038042
15357	NC_016446	GTCG	2	8	816964	816971	0 %	25 %	50 %	25 %	360038042
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15360	NC_016446	CCGC	2	8	817100	817107	0 %	0 %	25 %	75 %	360038042
15361	NC_016446	CAC	2	6	817119	817124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038042
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15363	NC_016446	TCA	2	6	817164	817169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038042
15364	NC_016446	GT	3	6	817190	817195	0 %	50 %	50 %	0 %	360038042
15365	NC_016446	GCA	2	6	817199	817204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038042
15366	NC_016446	TGC	2	6	817228	817233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038042
15367	NC_016446	AGTA	2	8	817275	817282	50 %	25 %	25 %	0 %	360038042
15368	NC_016446	GAGTTT	2	12	817291	817302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360038042
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15370	NC_016446	GCA	2	6	817334	817339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038042
15371	NC_016446	GTA	2	6	817420	817425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038042
15372	NC_016446	GAC	2	6	817441	817446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038042
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15374	NC_016446	TGG	2	6	817629	817634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038042
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15381	NC_016446	TCT	2	6	817917	817922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038042
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15385	NC_016446	ATT	2	6	818161	818166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15386	NC_016446	AAGT	2	8	818271	818278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15387	NC_016446	TTG	2	6	818282	818287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_016446	GTC	2	6	818325	818330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15390	NC_016446	TGT	2	6	818440	818445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15402	NC_016446	CTTT	2	8	818948	818955	0 %	75 %	0 %	25 %	360038044
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15420	NC_016446	GGT	2	6	820108	820113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15445	NC_016446	CAA	2	6	821190	821195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15479	NC_016446	GAT	2	6	822871	822876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15480	NC_016446	A	6	6	823094	823099	100 %	0 %	0 %	0 %	360038049
15481	NC_016446	GGC	2	6	823144	823149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038049
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15484	NC_016446	GA	3	6	823265	823270	50 %	0 %	50 %	0 %	360038049
15485	NC_016446	GA	3	6	823291	823296	50 %	0 %	50 %	0 %	360038049
15486	NC_016446	GTG	2	6	823370	823375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038049
15487	NC_016446	CG	3	6	823380	823385	0 %	0 %	50 %	50 %	360038049
15488	NC_016446	CTT	2	6	823403	823408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038049
15489	NC_016446	GAA	2	6	823410	823415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038049
15490	NC_016446	ATC	2	6	823425	823430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038049
15491	NC_016446	CCA	2	6	823451	823456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038049
15492	NC_016446	ACT	2	6	823545	823550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038049
15493	NC_016446	CAT	2	6	823625	823630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038049
15494	NC_016446	TAT	2	6	823631	823636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360038049
15495	NC_016446	T	6	6	823640	823645	0 %	100 %	0 %	0 %	360038049
15496	NC_016446	ACG	2	6	823686	823691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15497	NC_016446	ATTCA	2	10	823740	823749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15498	NC_016446	ATCT	2	8	823770	823777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15499	NC_016446	ATG	2	6	823815	823820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038050
15500	NC_016446	CAG	3	9	823880	823888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038050

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