MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016446	CAT	2	6	536262	536267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037779
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10011	NC_016446	AGC	2	6	536808	536813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037779
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10023	NC_016446	ATC	2	6	537461	537466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037780
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10030	NC_016446	CAA	2	6	537982	537987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_016446	AGCAC	2	10	538031	538040	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10032	NC_016446	TAAAC	2	10	538144	538153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10033	NC_016446	AAT	2	6	538171	538176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_016446	ATT	2	6	538215	538220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10036	NC_016446	GAT	2	6	538251	538256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10056	NC_016446	GC	3	6	539554	539559	0 %	0 %	50 %	50 %	360037782
10057	NC_016446	ATG	2	6	539660	539665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037782
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10096	NC_016446	CT	3	6	541045	541050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10106	NC_016446	TA	3	6	541331	541336	50 %	50 %	0 %	0 %	360037783
10107	NC_016446	TCT	2	6	541348	541353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037783
10108	NC_016446	GTGAT	2	10	541376	541385	20 %	40 %	40 %	0 %	360037783
10109	NC_016446	GT	3	6	541421	541426	0 %	50 %	50 %	0 %	360037783
10110	NC_016446	TAT	2	6	541518	541523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037783
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10120	NC_016446	A	6	6	542129	542134	100 %	0 %	0 %	0 %	360037784
10121	NC_016446	ATAG	2	8	542261	542268	50 %	25 %	25 %	0 %	360037784
10122	NC_016446	T	6	6	542315	542320	0 %	100 %	0 %	0 %	360037784
10123	NC_016446	CGT	2	6	542327	542332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037784
10124	NC_016446	CT	3	6	542369	542374	0 %	50 %	0 %	50 %	360037784
10125	NC_016446	AAG	2	6	542385	542390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037784
10126	NC_016446	TGG	2	6	542497	542502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037784
10127	NC_016446	TAC	2	6	542595	542600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_016446	GAT	2	6	542620	542625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_016446	ATTG	2	8	542683	542690	25 %	50 %	25 %	0 %	360037785
10130	NC_016446	TGG	2	6	542721	542726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037785
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10134	NC_016446	CTG	2	6	542955	542960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037785
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10224	NC_016446	TCAA	2	8	547984	547991	50 %	25 %	0 %	25 %	360037791
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10232	NC_016446	C	6	6	548401	548406	0 %	0 %	0 %	100 %	360037791
10233	NC_016446	GTCAAG	2	12	548410	548421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360037791
10234	NC_016446	CAG	2	6	548457	548462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037791
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10237	NC_016446	TTCTG	2	10	548560	548569	0 %	60 %	20 %	20 %	360037791
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10241	NC_016446	A	7	7	548661	548667	100 %	0 %	0 %	0 %	360037791
10242	NC_016446	GCG	2	6	548697	548702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037791
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10245	NC_016446	AAT	2	6	548874	548879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037791
10246	NC_016446	GCC	2	6	548892	548897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037791
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10350	NC_016446	GCTA	2	8	554479	554486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10351	NC_016446	CTT	2	6	554487	554492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10352	NC_016446	GGA	2	6	554522	554527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10353	NC_016446	T	7	7	554552	554558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10354	NC_016446	CGA	2	6	554584	554589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037795
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10358	NC_016446	A	6	6	554743	554748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10359	NC_016446	T	7	7	554763	554769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10360	NC_016446	AG	4	8	554796	554803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10361	NC_016446	ATTC	2	8	554825	554832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10362	NC_016446	ATC	2	6	554915	554920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10363	NC_016446	TA	3	6	554974	554979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10364	NC_016446	TGCTT	2	10	554990	554999	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10366	NC_016446	CAA	2	6	555027	555032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10488	NC_016446	TTG	2	6	561308	561313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037801
10489	NC_016446	GAC	2	6	561338	561343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10490	NC_016446	CAT	2	6	561395	561400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10491	NC_016446	CACT	2	8	561401	561408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10492	NC_016446	AAAAG	2	10	561425	561434	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_016446	GCAG	2	8	561441	561448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10494	NC_016446	CGTTG	2	10	561519	561528	0 %	40 %	40 %	20 %	360037802
10495	NC_016446	CCA	2	6	561534	561539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037802
10496	NC_016446	GTT	2	6	561552	561557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037802
10497	NC_016446	TCA	2	6	561617	561622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037802
10498	NC_016446	CTC	2	6	561637	561642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037802
10499	NC_016446	GCA	2	6	561650	561655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037802
10500	NC_016446	CCA	2	6	561702	561707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037802

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