MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016446	AG	3	6	483787	483792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_016446	CG	3	6	483917	483922	0 %	0 %	50 %	50 %	360037738
9003	NC_016446	CAC	2	6	483947	483952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037738
9004	NC_016446	GAC	2	6	483954	483959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037738
9005	NC_016446	ACG	2	6	484002	484007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037738
9006	NC_016446	CAG	2	6	484010	484015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037738
9007	NC_016446	T	6	6	484040	484045	0 %	100 %	0 %	0 %	360037738
9008	NC_016446	T	6	6	484053	484058	0 %	100 %	0 %	0 %	360037738
9009	NC_016446	CCAT	2	8	484147	484154	25 %	25 %	0 %	50 %	360037738
9010	NC_016446	A	6	6	484310	484315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_016446	CTAAGC	2	12	484326	484337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_016446	GCA	2	6	484361	484366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_016446	CTA	2	6	484373	484378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_016446	CTG	2	6	484411	484416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_016446	TTA	2	6	484536	484541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_016446	CTG	2	6	484654	484659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_016446	TTA	2	6	484712	484717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_016446	AAAT	2	8	484749	484756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_016446	ACAAA	2	10	484770	484779	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9020	NC_016446	AAG	2	6	484855	484860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_016446	AG	3	6	484952	484957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_016446	GAAT	2	8	485098	485105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_016446	AAC	2	6	485110	485115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9026	NC_016446	TTTG	2	8	485337	485344	0 %	75 %	25 %	0 %	360037739
9027	NC_016446	AAC	2	6	485623	485628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_016446	AGT	2	6	485661	485666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037740
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9031	NC_016446	CT	3	6	485768	485773	0 %	50 %	0 %	50 %	360037740
9032	NC_016446	A	6	6	485870	485875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_016446	TCA	2	6	485964	485969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_016446	ACT	2	6	485975	485980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_016446	AT	3	6	485989	485994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_016446	ATT	2	6	486001	486006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_016446	AAC	2	6	486057	486062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037741
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9041	NC_016446	TGC	3	9	486200	486208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_016446	GT	3	6	486258	486263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_016446	AAT	2	6	486269	486274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_016446	ACT	2	6	486366	486371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037742
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9049	NC_016446	GCA	2	6	486643	486648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037742
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9051	NC_016446	CTCG	2	8	486773	486780	0 %	25 %	25 %	50 %	360037742
9052	NC_016446	GCG	2	6	486798	486803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037742
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9055	NC_016446	TGG	3	9	487035	487043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037742
9056	NC_016446	GTG	2	6	487151	487156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037742
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9059	NC_016446	CGT	2	6	487346	487351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037742
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9061	NC_016446	TGG	2	6	487620	487625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037742
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9064	NC_016446	TGC	2	6	487884	487889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9084	NC_016446	ATGGA	2	10	489116	489125	40 %	20 %	40 %	0 %	360037746
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9096	NC_016446	CGT	3	9	489870	489878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037746
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9109	NC_016446	CA	3	6	490509	490514	50 %	0 %	0 %	50 %	360037747
9110	NC_016446	GGTA	2	8	490591	490598	25 %	25 %	50 %	0 %	360037747
9111	NC_016446	TGAG	2	8	490614	490621	25 %	25 %	50 %	0 %	360037747
9112	NC_016446	A	6	6	490731	490736	100 %	0 %	0 %	0 %	360037747
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9248	NC_016446	GGT	2	6	498497	498502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037748
9249	NC_016446	GGT	2	6	498521	498526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037748
9250	NC_016446	CTTTG	2	10	498532	498541	0 %	60 %	20 %	20 %	360037748
9251	NC_016446	ATC	2	6	498560	498565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037748
9252	NC_016446	TGGT	2	8	498602	498609	0 %	50 %	50 %	0 %	360037748
9253	NC_016446	GCA	2	6	498628	498633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037748
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9256	NC_016446	CGCCA	2	10	498848	498857	20 %	0 %	20 %	60 %	360037748
9257	NC_016446	GCT	2	6	498887	498892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037748
9258	NC_016446	GTAC	2	8	499003	499010	25 %	25 %	25 %	25 %	360037748
9259	NC_016446	GTC	2	6	499040	499045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037748
9260	NC_016446	CAT	2	6	499252	499257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037748
9261	NC_016446	CGCCA	2	10	499280	499289	20 %	0 %	20 %	60 %	360037748
9262	NC_016446	GCT	2	6	499319	499324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037748
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9264	NC_016446	TGCT	2	8	499501	499508	0 %	50 %	25 %	25 %	360037748
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9269	NC_016446	GTA	2	6	499794	499799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037748
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9272	NC_016446	GCT	2	6	499873	499878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037748
9273	NC_016446	ATC	2	6	499901	499906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037748
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9275	NC_016446	GCC	2	6	500078	500083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037748
9276	NC_016446	ATCA	2	8	500111	500118	50 %	25 %	0 %	25 %	360037748
9277	NC_016446	CAGT	2	8	500248	500255	25 %	25 %	25 %	25 %	360037748
9278	NC_016446	TTCA	2	8	500291	500298	25 %	50 %	0 %	25 %	360037748
9279	NC_016446	CAT	2	6	500338	500343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037748
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9282	NC_016446	GGCT	2	8	500481	500488	0 %	25 %	50 %	25 %	360037748
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9330	NC_016446	TA	3	6	502459	502464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9332	NC_016446	TTA	2	6	502576	502581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9353	NC_016446	TCG	2	6	503590	503595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037750
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9357	NC_016446	CCAGTT	2	12	503770	503781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	360037751
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9361	NC_016446	GCA	2	6	504016	504021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037751
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9365	NC_016446	CAAA	2	8	504130	504137	75 %	0 %	0 %	25 %	360037751
9366	NC_016446	GCT	2	6	504175	504180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037751
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9373	NC_016446	TCA	2	6	504669	504674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037751
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9382	NC_016446	ATC	2	6	505284	505289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037752
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9385	NC_016446	CAT	2	6	505481	505486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037752
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9387	NC_016446	CAT	2	6	505511	505516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037752
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9393	NC_016446	GATC	2	8	505618	505625	25 %	25 %	25 %	25 %	360037752
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9401	NC_016446	AAAG	2	8	506107	506114	75 %	0 %	25 %	0 %	360037753
9402	NC_016446	TGC	2	6	506120	506125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037753
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9431	NC_016446	GCA	2	6	507714	507719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037755
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9434	NC_016446	TCT	2	6	507906	507911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037755
9435	NC_016446	ACT	2	6	507947	507952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037755
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9439	NC_016446	CTT	2	6	508087	508092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037755
9440	NC_016446	AACT	2	8	508130	508137	50 %	25 %	0 %	25 %	360037755
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9452	NC_016446	ACG	2	6	508727	508732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037758
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9458	NC_016446	GATA	2	8	509167	509174	50 %	25 %	25 %	0 %	360037758
9459	NC_016446	TGC	2	6	509373	509378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037758
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9461	NC_016446	ATTCC	2	10	509411	509420	20 %	40 %	0 %	40 %	360037758
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9475	NC_016446	ATTT	2	8	510422	510429	25 %	75 %	0 %	0 %	360037759
9476	NC_016446	ATG	2	6	510468	510473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037759
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9483	NC_016446	ATCA	2	8	510788	510795	50 %	25 %	0 %	25 %	360037759
9484	NC_016446	GTG	2	6	510842	510847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037759
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9486	NC_016446	CGA	2	6	510895	510900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037759
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