MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016446	CCT	2	6	240758	240763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_016446	TGA	2	6	240765	240770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016446	GCA	2	6	240823	240828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037501
4504	NC_016446	CTTG	2	8	240904	240911	0 %	50 %	25 %	25 %	360037501
4505	NC_016446	GATAG	2	10	240932	240941	40 %	20 %	40 %	0 %	360037501
4506	NC_016446	CTTT	2	8	241008	241015	0 %	75 %	0 %	25 %	360037501
4507	NC_016446	TG	3	6	241173	241178	0 %	50 %	50 %	0 %	360037501
4508	NC_016446	A	7	7	241400	241406	100 %	0 %	0 %	0 %	360037501
4509	NC_016446	GT	3	6	241480	241485	0 %	50 %	50 %	0 %	360037501
4510	NC_016446	GAG	2	6	241511	241516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037501
4511	NC_016446	CAC	2	6	241544	241549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037501
4512	NC_016446	CAGC	2	8	241573	241580	25 %	0 %	25 %	50 %	360037501
4513	NC_016446	CAG	2	6	241670	241675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037501
4514	NC_016446	CTT	2	6	241705	241710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037501
4515	NC_016446	TGC	2	6	241739	241744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037501
4516	NC_016446	TCA	2	6	241780	241785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037501
4517	NC_016446	ATTG	2	8	241795	241802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016446	TACCC	2	10	241830	241839	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4519	NC_016446	GAA	2	6	241860	241865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_016446	ACG	2	6	241880	241885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_016446	GTT	2	6	241979	241984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016446	GAA	2	6	242029	242034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037502
4523	NC_016446	CTG	2	6	242045	242050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037502
4524	NC_016446	CGTG	2	8	242080	242087	0 %	25 %	50 %	25 %	360037502
4525	NC_016446	GAT	3	9	242117	242125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037502
4526	NC_016446	TTG	2	6	242139	242144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037502
4527	NC_016446	CCG	2	6	242152	242157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037502
4528	NC_016446	CCA	2	6	242175	242180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037502
4529	NC_016446	CA	3	6	242179	242184	50 %	0 %	0 %	50 %	360037502
4530	NC_016446	CCA	2	6	242238	242243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037502
4531	NC_016446	GCT	2	6	242272	242277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037502
4532	NC_016446	TGAT	2	8	242280	242287	25 %	50 %	25 %	0 %	360037502
4533	NC_016446	TGA	2	6	242383	242388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037502
4534	NC_016446	ACC	3	9	242450	242458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037502
4535	NC_016446	CGATG	2	10	242524	242533	20 %	20 %	40 %	20 %	360037502
4536	NC_016446	TCAGC	2	10	242589	242598	20 %	20 %	20 %	40 %	360037502
4537	NC_016446	CAA	2	6	242599	242604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037502
4538	NC_016446	CTCA	2	8	242683	242690	25 %	25 %	0 %	50 %	360037502
4539	NC_016446	GC	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	360037502
4540	NC_016446	CAT	2	6	242920	242925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037502
4541	NC_016446	AGTC	2	8	243019	243026	25 %	25 %	25 %	25 %	360037502
4542	NC_016446	GCA	2	6	243100	243105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037502
4543	NC_016446	AT	3	6	243110	243115	50 %	50 %	0 %	0 %	360037502
4544	NC_016446	CAA	2	6	243119	243124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037502
4545	NC_016446	ACC	2	6	243214	243219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037503
4546	NC_016446	ATG	2	6	243251	243256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037503
4547	NC_016446	ACT	2	6	243259	243264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037503
4548	NC_016446	TTA	2	6	243271	243276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037503
4549	NC_016446	GCT	2	6	243350	243355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037503
4550	NC_016446	ATG	2	6	243362	243367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037503
4551	NC_016446	AAT	2	6	243400	243405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037503
4552	NC_016446	GGTCAT	2	12	243418	243429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360037503
4553	NC_016446	A	6	6	243443	243448	100 %	0 %	0 %	0 %	360037503
4554	NC_016446	ACCTT	2	10	243466	243475	20 %	40 %	0 %	40 %	360037503
4555	NC_016446	CGG	2	6	243573	243578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037503
4556	NC_016446	GGC	2	6	243691	243696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037503
4557	NC_016446	TCC	2	6	243750	243755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037503
4558	NC_016446	GGC	2	6	243844	243849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037503
4559	NC_016446	TGA	2	6	243963	243968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037503
4560	NC_016446	GGGCT	2	10	244061	244070	0 %	20 %	60 %	20 %	360037503
4561	NC_016446	GCC	2	6	244081	244086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037503
4562	NC_016446	ACA	2	6	244106	244111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037503
4563	NC_016446	A	6	6	244148	244153	100 %	0 %	0 %	0 %	360037503
4564	NC_016446	GCTGC	2	10	244163	244172	0 %	20 %	40 %	40 %	360037503
4565	NC_016446	AGC	2	6	244199	244204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037503
4566	NC_016446	GCA	3	9	244266	244274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037503
4567	NC_016446	GATC	2	8	244332	244339	25 %	25 %	25 %	25 %	360037503
4568	NC_016446	ATG	2	6	244552	244557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
4569	NC_016446	TTG	2	6	244637	244642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037504
4570	NC_016446	CAAG	2	8	244650	244657	50 %	0 %	25 %	25 %	360037504
4571	NC_016446	GCA	2	6	244716	244721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037504
4572	NC_016446	CGC	2	6	244815	244820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037504
4573	NC_016446	CTCA	2	8	244871	244878	25 %	25 %	0 %	50 %	360037504
4574	NC_016446	CG	3	6	244904	244909	0 %	0 %	50 %	50 %	360037504
4575	NC_016446	GATG	2	8	244950	244957	25 %	25 %	50 %	0 %	360037504
4576	NC_016446	GAT	2	6	245014	245019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
4577	NC_016446	GCC	2	6	245033	245038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037504
4578	NC_016446	TG	3	6	245098	245103	0 %	50 %	50 %	0 %	360037504
4579	NC_016446	GAT	2	6	245110	245115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
4580	NC_016446	GGTT	2	8	245160	245167	0 %	50 %	50 %	0 %	360037504
4581	NC_016446	CTG	2	6	245170	245175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037504
4582	NC_016446	TGA	2	6	245220	245225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
4583	NC_016446	GCG	2	6	245239	245244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037504
4584	NC_016446	CG	3	6	245243	245248	0 %	0 %	50 %	50 %	360037504
4585	NC_016446	ATT	2	6	245285	245290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037504
4586	NC_016446	TGCC	2	8	245312	245319	0 %	25 %	25 %	50 %	360037504
4587	NC_016446	ATT	2	6	245343	245348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037504
4588	NC_016446	TCT	2	6	245437	245442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_016446	TGAT	2	8	245482	245489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_016446	TATT	2	8	245511	245518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_016446	GGA	2	6	245521	245526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016446	GTG	2	6	245553	245558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037505
4593	NC_016446	GAA	3	9	245634	245642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037505
4594	NC_016446	GTC	2	6	245688	245693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037505
4595	NC_016446	A	6	6	245746	245751	100 %	0 %	0 %	0 %	360037505
4596	NC_016446	AGC	2	6	245778	245783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037505
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4598	NC_016446	ATC	2	6	245889	245894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037505
4599	NC_016446	GGT	2	6	245957	245962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016446	CAA	2	6	246006	246011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037506
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4602	NC_016446	TGA	2	6	246079	246084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037506
4603	NC_016446	GGTTG	2	10	246174	246183	0 %	40 %	60 %	0 %	360037506
4604	NC_016446	CTT	2	6	246239	246244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037506
4605	NC_016446	A	6	6	246264	246269	100 %	0 %	0 %	0 %	360037506
4606	NC_016446	GTCA	2	8	246270	246277	25 %	25 %	25 %	25 %	360037506
4607	NC_016446	AGCC	2	8	246288	246295	25 %	0 %	25 %	50 %	360037506
4608	NC_016446	GTG	2	6	246439	246444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037506
4609	NC_016446	CCAC	2	8	246521	246528	25 %	0 %	0 %	75 %	360037506
4610	NC_016446	CTT	2	6	246542	246547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037506
4611	NC_016446	GC	3	6	246588	246593	0 %	0 %	50 %	50 %	360037506
4612	NC_016446	ATG	2	6	246673	246678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037506
4613	NC_016446	AGTGT	2	10	246701	246710	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_016446	ACC	2	6	246748	246753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_016446	ATTT	2	8	246766	246773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_016446	T	6	6	246883	246888	0 %	100 %	0 %	0 %	360037507
4617	NC_016446	AGT	2	6	246895	246900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037507
4618	NC_016446	AGA	2	6	246958	246963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037507
4619	NC_016446	TCCT	2	8	246982	246989	0 %	50 %	0 %	50 %	360037507
4620	NC_016446	GGA	2	6	247042	247047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037507
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4622	NC_016446	GCA	2	6	247184	247189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037508
4623	NC_016446	ACC	2	6	247204	247209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037508
4624	NC_016446	TGG	2	6	247246	247251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037508
4625	NC_016446	GC	3	6	247266	247271	0 %	0 %	50 %	50 %	360037508
4626	NC_016446	TGAA	2	8	247303	247310	50 %	25 %	25 %	0 %	360037508
4627	NC_016446	CAT	2	6	247472	247477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037508
4628	NC_016446	GAT	2	6	247481	247486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037508
4629	NC_016446	GGT	2	6	247554	247559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037508
4630	NC_016446	TGA	2	6	247595	247600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037508
4631	NC_016446	GTC	2	6	247780	247785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_016446	TTG	2	6	247788	247793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_016446	AAT	2	6	247815	247820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_016446	TA	3	6	247827	247832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_016446	TTCAA	2	10	247936	247945	40 %	40 %	0 %	20 %	360037509
4636	NC_016446	ATTT	2	8	247948	247955	25 %	75 %	0 %	0 %	360037509
4637	NC_016446	CTTA	2	8	247982	247989	25 %	50 %	0 %	25 %	360037510
4638	NC_016446	ATC	2	6	248043	248048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037510
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4643	NC_016446	GGT	2	6	248124	248129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037510
4644	NC_016446	CTG	2	6	248182	248187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037510
4645	NC_016446	GAA	3	9	248292	248300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037510
4646	NC_016446	CCAA	2	8	248322	248329	50 %	0 %	0 %	50 %	360037510
4647	NC_016446	ATAA	2	8	248380	248387	75 %	25 %	0 %	0 %	360037510
4648	NC_016446	GAT	2	6	248393	248398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4649	NC_016446	GC	3	6	248442	248447	0 %	0 %	50 %	50 %	360037511
4650	NC_016446	TCGC	2	8	248510	248517	0 %	25 %	25 %	50 %	360037511
4651	NC_016446	GC	3	6	248569	248574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4652	NC_016446	TGC	2	6	248619	248624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037512
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4654	NC_016446	ATTC	2	8	248782	248789	25 %	50 %	0 %	25 %	360037512
4655	NC_016446	GTG	2	6	248946	248951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037512
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4659	NC_016446	A	6	6	249214	249219	100 %	0 %	0 %	0 %	360037512
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4672	NC_016446	TGA	2	6	250281	250286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037512
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4674	NC_016446	TCG	2	6	250350	250355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037512
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4700	NC_016446	TTC	2	6	252245	252250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037514
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4703	NC_016446	CTG	2	6	252328	252333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037514
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4734	NC_016446	ACT	2	6	254688	254693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4735	NC_016446	CAG	2	6	254723	254728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4739	NC_016446	TAG	2	6	254964	254969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037517
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4743	NC_016446	AGC	2	6	255224	255229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037518
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4745	NC_016446	ATG	2	6	255344	255349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037518
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4747	NC_016446	CTCG	2	8	255374	255381	0 %	25 %	25 %	50 %	360037518
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4751	NC_016446	GC	3	6	255677	255682	0 %	0 %	50 %	50 %	360037518
4752	NC_016446	TCA	2	6	255765	255770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037518
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4846	NC_016446	GCG	2	6	260769	260774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4868	NC_016446	TCA	2	6	262479	262484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037522
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4870	NC_016446	TAC	2	6	262562	262567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037522
4871	NC_016446	ATC	2	6	262580	262585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037522
4872	NC_016446	TGA	2	6	262588	262593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037522
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4876	NC_016446	CAC	2	6	262810	262815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037522
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4882	NC_016446	AAT	2	6	263123	263128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4883	NC_016446	ATCA	2	8	263175	263182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4884	NC_016446	TC	3	6	263303	263308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4885	NC_016446	ACC	2	6	263372	263377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4898	NC_016446	TAA	2	6	264151	264156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4899	NC_016446	T	6	6	264157	264162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4925	NC_016446	AT	3	6	265309	265314	50 %	50 %	0 %	0 %	360037524
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4948	NC_016446	A	8	8	266394	266401	100 %	0 %	0 %	0 %	360037524
4949	NC_016446	TC	3	6	266402	266407	0 %	50 %	0 %	50 %	360037524
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4953	NC_016446	AGA	2	6	266644	266649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4961	NC_016446	CCAT	2	8	267120	267127	25 %	25 %	0 %	50 %	360037525
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4983	NC_016446	CGG	3	9	268221	268229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037526
4984	NC_016446	AG	3	6	268366	268371	50 %	0 %	50 %	0 %	360037526
4985	NC_016446	TTG	2	6	268399	268404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037526
4986	NC_016446	CA	3	6	268536	268541	50 %	0 %	0 %	50 %	360037526
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4992	NC_016446	ATC	2	6	268777	268782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037526
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