MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48503	NC_016445	CACG	2	8	2545716	2545723	25 %	0 %	25 %	50 %	360036764
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48505	NC_016445	GTTGGC	2	12	2545753	2545764	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	360036764
48506	NC_016445	CACG	2	8	2545794	2545801	25 %	0 %	25 %	50 %	360036764
48507	NC_016445	AAAG	2	8	2545825	2545832	75 %	0 %	25 %	0 %	360036764
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48541	NC_016445	TAA	2	6	2547032	2547037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48542	NC_016445	CA	3	6	2547102	2547107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48543	NC_016445	TCT	2	6	2547150	2547155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036766
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48592	NC_016445	GTAC	2	8	2549733	2549740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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48600	NC_016445	TTA	2	6	2550116	2550121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48601	NC_016445	CCA	2	6	2550221	2550226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48602	NC_016445	CCA	2	6	2550277	2550282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48603	NC_016445	ATAA	2	8	2550302	2550309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48619	NC_016445	GTG	3	9	2550961	2550969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036771
48620	NC_016445	AAG	2	6	2550996	2551001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036771
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48646	NC_016445	AAGT	2	8	2551932	2551939	50 %	25 %	25 %	0 %	360036771
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48687	NC_016445	TTGA	2	8	2553917	2553924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48688	NC_016445	TCAA	2	8	2553932	2553939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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48693	NC_016445	TA	4	8	2554188	2554195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48733	NC_016445	A	6	6	2556168	2556173	100 %	0 %	0 %	0 %	360036774
48734	NC_016445	GCG	2	6	2556198	2556203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036774
48735	NC_016445	AGC	2	6	2556267	2556272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036775
48736	NC_016445	AGC	2	6	2556279	2556284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036775
48737	NC_016445	GCT	2	6	2556301	2556306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036775
48738	NC_016445	TGG	2	6	2556387	2556392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036775
48739	NC_016445	CAA	2	6	2556556	2556561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036775
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48742	NC_016445	ACA	2	6	2556901	2556906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036776
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48744	NC_016445	TGG	2	6	2556956	2556961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036776
48745	NC_016445	GCC	2	6	2557108	2557113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036776
48746	NC_016445	ATTG	2	8	2557222	2557229	25 %	50 %	25 %	0 %	360036776
48747	NC_016445	CTT	2	6	2557235	2557240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036776
48748	NC_016445	CTT	2	6	2557246	2557251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036776
48749	NC_016445	GCC	2	6	2557270	2557275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036776
48750	NC_016445	GCC	2	6	2557357	2557362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036776
48751	NC_016445	GTA	2	6	2557466	2557471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036776
48752	NC_016445	ACA	2	6	2557628	2557633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48753	NC_016445	ACT	2	6	2557688	2557693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036777
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48755	NC_016445	TCAG	2	8	2557738	2557745	25 %	25 %	25 %	25 %	360036777
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48757	NC_016445	GGC	2	6	2557850	2557855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036777
48758	NC_016445	TAT	2	6	2557874	2557879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036777
48759	NC_016445	GGA	2	6	2557911	2557916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360036777
48760	NC_016445	CGT	2	6	2557938	2557943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036777
48761	NC_016445	GCC	2	6	2557950	2557955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036777
48762	NC_016445	CAAG	2	8	2557991	2557998	50 %	0 %	25 %	25 %	360036777
48763	NC_016445	GTG	2	6	2558008	2558013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036777
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48765	NC_016445	CACG	2	8	2558146	2558153	25 %	0 %	25 %	50 %	360036777
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48769	NC_016445	A	7	7	2558336	2558342	100 %	0 %	0 %	0 %	360036777
48770	NC_016445	A	6	6	2558366	2558371	100 %	0 %	0 %	0 %	360036777
48771	NC_016445	AGA	2	6	2558378	2558383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036777
48772	NC_016445	ACA	2	6	2558393	2558398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036777
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48775	NC_016445	GGT	2	6	2558859	2558864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036778
48776	NC_016445	GC	4	8	2558922	2558929	0 %	0 %	50 %	50 %	360036778
48777	NC_016445	TCA	2	6	2558980	2558985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036778
48778	NC_016445	AAC	2	6	2559099	2559104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036778
48779	NC_016445	A	6	6	2559105	2559110	100 %	0 %	0 %	0 %	360036778
48780	NC_016445	TCAC	2	8	2559162	2559169	25 %	25 %	0 %	50 %	360036779
48781	NC_016445	TTC	2	6	2559251	2559256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036779
48782	NC_016445	TGG	2	6	2559354	2559359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036779
48783	NC_016445	CACT	2	8	2559426	2559433	25 %	25 %	0 %	50 %	360036779
48784	NC_016445	TTG	2	6	2559439	2559444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036779
48785	NC_016445	CTTAC	2	10	2559487	2559496	20 %	40 %	0 %	40 %	360036779
48786	NC_016445	CAGCA	2	10	2559498	2559507	40 %	0 %	20 %	40 %	360036779
48787	NC_016445	GTG	2	6	2559533	2559538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036779
48788	NC_016445	ATGGCT	2	12	2559563	2559574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360036779
48789	NC_016445	TGA	2	6	2559591	2559596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036779
48790	NC_016445	TAC	2	6	2559599	2559604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036779
48791	NC_016445	ATTG	2	8	2559691	2559698	25 %	50 %	25 %	0 %	360036779
48792	NC_016445	GTT	2	6	2559701	2559706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036779
48793	NC_016445	GCT	2	6	2559709	2559714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036779
48794	NC_016445	AGT	2	6	2559769	2559774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036779
48795	NC_016445	TGC	2	6	2559795	2559800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036779
48796	NC_016445	ATGG	2	8	2559814	2559821	25 %	25 %	50 %	0 %	360036779
48797	NC_016445	ATG	2	6	2559881	2559886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036779
48798	NC_016445	TAA	2	6	2559932	2559937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036779
48799	NC_016445	TAT	2	6	2560016	2560021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036780
48800	NC_016445	TGC	2	6	2560117	2560122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036780
48801	NC_016445	TCA	2	6	2560135	2560140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036780
48802	NC_016445	CTG	2	6	2560149	2560154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036780
48803	NC_016445	AGCT	2	8	2560222	2560229	25 %	25 %	25 %	25 %	360036780
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48805	NC_016445	TG	3	6	2560359	2560364	0 %	50 %	50 %	0 %	360036781
48806	NC_016445	TG	3	6	2560380	2560385	0 %	50 %	50 %	0 %	360036781
48807	NC_016445	GCC	2	6	2560386	2560391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036781
48808	NC_016445	AGA	2	6	2560418	2560423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036781
48809	NC_016445	AAAG	2	8	2560458	2560465	75 %	0 %	25 %	0 %	360036781
48810	NC_016445	AAG	2	6	2560505	2560510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036781
48811	NC_016445	ATC	2	6	2560564	2560569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036781
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48814	NC_016445	TGCT	2	8	2560885	2560892	0 %	50 %	25 %	25 %	360036782
48815	NC_016445	A	6	6	2560910	2560915	100 %	0 %	0 %	0 %	360036782
48816	NC_016445	TAA	2	6	2560955	2560960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036782
48817	NC_016445	GTC	2	6	2561044	2561049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036782
48818	NC_016445	GAA	2	6	2561105	2561110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036782
48819	NC_016445	AAC	2	6	2561149	2561154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036782
48820	NC_016445	GCA	2	6	2561170	2561175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036782
48821	NC_016445	AGC	2	6	2561182	2561187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036782
48822	NC_016445	TTA	2	6	2561245	2561250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036782
48823	NC_016445	AAC	2	6	2561378	2561383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036783
48824	NC_016445	GTT	2	6	2561401	2561406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036783
48825	NC_016445	TATCG	2	10	2561430	2561439	20 %	40 %	20 %	20 %	360036783
48826	NC_016445	GCACTG	2	12	2561521	2561532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48827	NC_016445	TCGG	2	8	2561548	2561555	0 %	25 %	50 %	25 %	360036783
48828	NC_016445	GTA	2	6	2561560	2561565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036783
48829	NC_016445	GCT	2	6	2561646	2561651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48830	NC_016445	ATCG	2	8	2561749	2561756	25 %	25 %	25 %	25 %	360036783
48831	NC_016445	GAT	2	6	2561805	2561810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036783
48832	NC_016445	ATC	2	6	2561839	2561844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036783
48833	NC_016445	ATC	2	6	2561887	2561892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036783
48834	NC_016445	CTAT	2	8	2561918	2561925	25 %	50 %	0 %	25 %	360036783
48835	NC_016445	TTG	2	6	2562005	2562010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036783
48836	NC_016445	TGG	2	6	2562011	2562016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036783
48837	NC_016445	CTG	2	6	2562032	2562037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48838	NC_016445	CGT	2	6	2562172	2562177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48839	NC_016445	CCA	2	6	2562178	2562183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036783
48840	NC_016445	CTA	2	6	2562229	2562234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036783
48841	NC_016445	GTGAA	2	10	2562284	2562293	40 %	20 %	40 %	0 %	360036783
48842	NC_016445	ATC	2	6	2562325	2562330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036783
48843	NC_016445	AACTG	2	10	2562408	2562417	40 %	20 %	20 %	20 %	360036783
48844	NC_016445	GGT	2	6	2562472	2562477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036783
48845	NC_016445	AAG	2	6	2562499	2562504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036783
48846	NC_016445	CT	3	6	2562505	2562510	0 %	50 %	0 %	50 %	360036783
48847	NC_016445	GGT	2	6	2562511	2562516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036783
48848	NC_016445	GCT	2	6	2562532	2562537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48849	NC_016445	GGC	2	6	2562549	2562554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036783
48850	NC_016445	ACTGA	2	10	2562622	2562631	40 %	20 %	20 %	20 %	360036783
48851	NC_016445	TGTC	2	8	2562656	2562663	0 %	50 %	25 %	25 %	360036783
48852	NC_016445	TGC	2	6	2562687	2562692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48853	NC_016445	GCT	2	6	2562745	2562750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036783
48854	NC_016445	CTA	2	6	2562751	2562756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036783
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48920	NC_016445	TAA	2	6	2565795	2565800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48955	NC_016445	GCTG	2	8	2567248	2567255	0 %	25 %	50 %	25 %	360036787
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48958	NC_016445	TCA	2	6	2567346	2567351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036788
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48966	NC_016445	CCAC	2	8	2567781	2567788	25 %	0 %	0 %	75 %	360036788
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