MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_016445	GTT	3	9	2521469	2521477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036742
48002	NC_016445	AAC	2	6	2521478	2521483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036742
48003	NC_016445	CGA	2	6	2521519	2521524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036742
48004	NC_016445	CTG	2	6	2521547	2521552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036742
48005	NC_016445	A	6	6	2521590	2521595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48006	NC_016445	CAC	2	6	2521786	2521791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036743
48007	NC_016445	AAT	2	6	2521867	2521872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036743
48008	NC_016445	ACC	2	6	2521915	2521920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036743
48009	NC_016445	CGC	2	6	2521953	2521958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036743
48010	NC_016445	TGC	2	6	2521964	2521969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48011	NC_016445	CGT	2	6	2522050	2522055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48012	NC_016445	GCA	2	6	2522088	2522093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48013	NC_016445	GCG	2	6	2522110	2522115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036743
48014	NC_016445	CAG	2	6	2522167	2522172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48015	NC_016445	TGC	2	6	2522174	2522179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48016	NC_016445	CAC	2	6	2522230	2522235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036743
48017	NC_016445	CAG	2	6	2522266	2522271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48018	NC_016445	CGC	2	6	2522383	2522388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036743
48019	NC_016445	GCA	2	6	2522421	2522426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48020	NC_016445	CAG	2	6	2522455	2522460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036743
48021	NC_016445	ACC	2	6	2522483	2522488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036743
48022	NC_016445	A	7	7	2522549	2522555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48023	NC_016445	ATG	2	6	2522743	2522748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036744
48024	NC_016445	GC	3	6	2522786	2522791	0 %	0 %	50 %	50 %	360036744
48025	NC_016445	GCA	2	6	2522852	2522857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036744
48026	NC_016445	GCC	2	6	2522923	2522928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036744
48027	NC_016445	CAC	2	6	2522936	2522941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036744
48028	NC_016445	CAA	2	6	2523009	2523014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036744
48029	NC_016445	GTA	2	6	2523081	2523086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036744
48030	NC_016445	GC	4	8	2523152	2523159	0 %	0 %	50 %	50 %	360036744
48031	NC_016445	AGT	2	6	2523244	2523249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036744
48032	NC_016445	GA	3	6	2523261	2523266	50 %	0 %	50 %	0 %	360036744
48033	NC_016445	GCC	2	6	2523291	2523296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036744
48034	NC_016445	GCC	2	6	2523307	2523312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036744
48035	NC_016445	GGTGC	2	10	2523326	2523335	0 %	20 %	60 %	20 %	360036744
48036	NC_016445	TGC	2	6	2523376	2523381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036744
48037	NC_016445	AG	3	6	2523385	2523390	50 %	0 %	50 %	0 %	360036744
48038	NC_016445	TCA	2	6	2523418	2523423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036744
48039	NC_016445	CTG	3	9	2523543	2523551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036744
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48041	NC_016445	ACTT	2	8	2523582	2523589	25 %	50 %	0 %	25 %	360036744
48042	NC_016445	CA	3	6	2523635	2523640	50 %	0 %	0 %	50 %	360036744
48043	NC_016445	GCC	2	6	2523700	2523705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036744
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48045	NC_016445	GGCA	2	8	2523765	2523772	25 %	0 %	50 %	25 %	360036744
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48047	NC_016445	C	6	6	2523904	2523909	0 %	0 %	0 %	100 %	360036744
48048	NC_016445	TGA	2	6	2523977	2523982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036744
48049	NC_016445	CG	3	6	2524001	2524006	0 %	0 %	50 %	50 %	360036744
48050	NC_016445	ATGA	2	8	2524119	2524126	50 %	25 %	25 %	0 %	360036744
48051	NC_016445	TA	3	6	2524211	2524216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48052	NC_016445	GTG	2	6	2524219	2524224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48053	NC_016445	A	6	6	2524243	2524248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48054	NC_016445	TG	3	6	2524280	2524285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48055	NC_016445	A	6	6	2524333	2524338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48056	NC_016445	GAC	2	6	2524408	2524413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48057	NC_016445	A	7	7	2524451	2524457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48058	NC_016445	T	7	7	2524482	2524488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48059	NC_016445	CAGA	2	8	2524495	2524502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48060	NC_016445	A	7	7	2524505	2524511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48061	NC_016445	GATA	2	8	2524543	2524550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48062	NC_016445	GAA	2	6	2524593	2524598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48063	NC_016445	ACACA	2	10	2524622	2524631	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48064	NC_016445	TTG	2	6	2524652	2524657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48065	NC_016445	AGG	2	6	2524663	2524668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48066	NC_016445	ACA	2	6	2524708	2524713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036745
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48068	NC_016445	ATG	2	6	2524764	2524769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036745
48069	NC_016445	GCC	2	6	2524803	2524808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036745
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48071	NC_016445	GC	3	6	2524844	2524849	0 %	0 %	50 %	50 %	360036745
48072	NC_016445	CCA	2	6	2524896	2524901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036745
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48074	NC_016445	GATG	2	8	2525005	2525012	25 %	25 %	50 %	0 %	360036745
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48079	NC_016445	GTGG	2	8	2525282	2525289	0 %	25 %	75 %	0 %	360036745
48080	NC_016445	TGA	2	6	2525494	2525499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036745
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48092	NC_016445	CAC	2	6	2525844	2525849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036745
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48102	NC_016445	TTA	2	6	2526376	2526381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036746
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48106	NC_016445	AAGG	2	8	2526614	2526621	50 %	0 %	50 %	0 %	360036746
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48118	NC_016445	TGA	2	6	2526985	2526990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036747
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48120	NC_016445	GAA	2	6	2527023	2527028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036747
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48133	NC_016445	GC	4	8	2527626	2527633	0 %	0 %	50 %	50 %	360036748
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48200	NC_016445	CTC	2	6	2531116	2531121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48201	NC_016445	CCAT	2	8	2531139	2531146	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48202	NC_016445	ACT	2	6	2531152	2531157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48223	NC_016445	CTA	2	6	2532075	2532080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036750
48224	NC_016445	GAAA	2	8	2532204	2532211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48225	NC_016445	A	7	7	2532268	2532274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48226	NC_016445	AGTC	2	8	2532337	2532344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48227	NC_016445	GTG	2	6	2532371	2532376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036751
48228	NC_016445	GCA	2	6	2532419	2532424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036751
48229	NC_016445	TG	3	6	2532452	2532457	0 %	50 %	50 %	0 %	360036751
48230	NC_016445	TC	3	6	2532459	2532464	0 %	50 %	0 %	50 %	360036751
48231	NC_016445	CA	3	6	2532477	2532482	50 %	0 %	0 %	50 %	360036751
48232	NC_016445	CAT	2	6	2532535	2532540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036751
48233	NC_016445	ATT	2	6	2532606	2532611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48234	NC_016445	AAT	2	6	2532613	2532618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48235	NC_016445	CCA	2	6	2532625	2532630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48236	NC_016445	ATC	2	6	2532633	2532638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48237	NC_016445	TGA	2	6	2532740	2532745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036752
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48239	NC_016445	A	6	6	2532904	2532909	100 %	0 %	0 %	0 %	360036752
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48241	NC_016445	GGT	2	6	2532946	2532951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48242	NC_016445	A	6	6	2532966	2532971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48243	NC_016445	T	6	6	2532988	2532993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48244	NC_016445	CTT	2	6	2533013	2533018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036753
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48251	NC_016445	A	7	7	2533373	2533379	100 %	0 %	0 %	0 %	360036754
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48269	NC_016445	ACC	2	6	2534135	2534140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48344	NC_016445	CAA	2	6	2537361	2537366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48345	NC_016445	GAAC	2	8	2537492	2537499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48346	NC_016445	GCC	2	6	2537500	2537505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48347	NC_016445	CGG	2	6	2537596	2537601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48348	NC_016445	AC	3	6	2537629	2537634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48349	NC_016445	GAT	2	6	2537718	2537723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036757
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48351	NC_016445	CTG	2	6	2537776	2537781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036757
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48353	NC_016445	TCGC	2	8	2537901	2537908	0 %	25 %	25 %	50 %	360036757
48354	NC_016445	CTG	2	6	2537913	2537918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036757
48355	NC_016445	CA	3	6	2538031	2538036	50 %	0 %	0 %	50 %	360036757
48356	NC_016445	A	7	7	2538036	2538042	100 %	0 %	0 %	0 %	360036757
48357	NC_016445	TCC	2	6	2538043	2538048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036757
48358	NC_016445	TGA	2	6	2538092	2538097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036757
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48360	NC_016445	TG	3	6	2538207	2538212	0 %	50 %	50 %	0 %	360036757
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48373	NC_016445	GCA	2	6	2539088	2539093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036758
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48380	NC_016445	T	7	7	2539650	2539656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48381	NC_016445	A	7	7	2539658	2539664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48382	NC_016445	TTAA	2	8	2539711	2539718	50 %	50 %	0 %	0 %	360036759
48383	NC_016445	CT	3	6	2539752	2539757	0 %	50 %	0 %	50 %	360036759
48384	NC_016445	T	6	6	2539808	2539813	0 %	100 %	0 %	0 %	360036759
48385	NC_016445	TTGG	2	8	2539872	2539879	0 %	50 %	50 %	0 %	360036760
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48392	NC_016445	A	7	7	2540422	2540428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48393	NC_016445	A	6	6	2540455	2540460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48394	NC_016445	TAA	2	6	2540469	2540474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48395	NC_016445	CAA	2	6	2540530	2540535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48397	NC_016445	A	7	7	2540630	2540636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48420	NC_016445	ATG	4	12	2541616	2541627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036761
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48428	NC_016445	CGC	2	6	2541948	2541953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036761
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48433	NC_016445	GAA	2	6	2542075	2542080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036761
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48452	NC_016445	CCG	2	6	2542801	2542806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036761
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48455	NC_016445	CTGA	2	8	2542891	2542898	25 %	25 %	25 %	25 %	360036761
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48460	NC_016445	ATC	2	6	2543294	2543299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036762
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48465	NC_016445	CTG	2	6	2543474	2543479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036762
48466	NC_016445	T	7	7	2543493	2543499	0 %	100 %	0 %	0 %	360036762
48467	NC_016445	ATA	2	6	2543540	2543545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036762
48468	NC_016445	ATTG	2	8	2543608	2543615	25 %	50 %	25 %	0 %	360036762
48469	NC_016445	GC	3	6	2543698	2543703	0 %	0 %	50 %	50 %	360036762
48470	NC_016445	GCT	2	6	2543722	2543727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036762
48471	NC_016445	A	6	6	2543760	2543765	100 %	0 %	0 %	0 %	360036762
48472	NC_016445	CAG	2	6	2543828	2543833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036762
48473	NC_016445	GCC	2	6	2543906	2543911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036762
48474	NC_016445	GCT	2	6	2543938	2543943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036762
48475	NC_016445	TCCG	2	8	2544040	2544047	0 %	25 %	25 %	50 %	360036762
48476	NC_016445	CTG	2	6	2544148	2544153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036762
48477	NC_016445	TCA	2	6	2544272	2544277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036763
48478	NC_016445	CCA	2	6	2544288	2544293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036763
48479	NC_016445	CGCAG	2	10	2544336	2544345	20 %	0 %	40 %	40 %	360036763
48480	NC_016445	CTT	3	9	2544432	2544440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036763
48481	NC_016445	GCA	2	6	2544687	2544692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036763
48482	NC_016445	GAGCT	2	10	2544784	2544793	20 %	20 %	40 %	20 %	360036763
48483	NC_016445	GGT	2	6	2544838	2544843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036763
48484	NC_016445	AGT	2	6	2544873	2544878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036763
48485	NC_016445	TTGG	2	8	2544889	2544896	0 %	50 %	50 %	0 %	360036763
48486	NC_016445	TGAG	2	8	2544941	2544948	25 %	25 %	50 %	0 %	360036763
48487	NC_016445	CACTT	2	10	2544958	2544967	20 %	40 %	0 %	40 %	360036763
48488	NC_016445	AGC	2	6	2545061	2545066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036763
48489	NC_016445	CTGC	2	8	2545136	2545143	0 %	25 %	25 %	50 %	360036763
48490	NC_016445	CAA	2	6	2545234	2545239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036763
48491	NC_016445	ACC	2	6	2545267	2545272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036763
48492	NC_016445	CTG	2	6	2545288	2545293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036763
48493	NC_016445	TCT	2	6	2545338	2545343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48494	NC_016445	AAT	2	6	2545422	2545427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036764
48495	NC_016445	CTT	2	6	2545428	2545433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036764
48496	NC_016445	CT	3	6	2545445	2545450	0 %	50 %	0 %	50 %	360036764
48497	NC_016445	GCC	2	6	2545504	2545509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036764
48498	NC_016445	TGGT	2	8	2545538	2545545	0 %	50 %	50 %	0 %	360036764
48499	NC_016445	GACGAG	2	12	2545575	2545586	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	360036764
48500	NC_016445	GTA	2	6	2545636	2545641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036764

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