MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_016445	AG	3	6	2494320	2494325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47502	NC_016445	TCT	2	6	2494326	2494331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47503	NC_016445	GCA	2	6	2494505	2494510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036716
47504	NC_016445	A	7	7	2494555	2494561	100 %	0 %	0 %	0 %	360036716
47505	NC_016445	CTG	2	6	2494567	2494572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036716
47506	NC_016445	ATA	2	6	2494703	2494708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036716
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47510	NC_016445	ATA	2	6	2494925	2494930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47511	NC_016445	ATTA	2	8	2495028	2495035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47512	NC_016445	CTG	2	6	2495066	2495071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47513	NC_016445	AT	3	6	2495079	2495084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47514	NC_016445	GA	3	6	2495095	2495100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47515	NC_016445	GCT	2	6	2495132	2495137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47517	NC_016445	GCGGA	2	10	2495192	2495201	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47518	NC_016445	CCGCT	2	10	2495260	2495269	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47519	NC_016445	GTTTC	2	10	2495345	2495354	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47520	NC_016445	CAA	2	6	2495451	2495456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47534	NC_016445	ATTTCA	2	12	2496419	2496430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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47537	NC_016445	TAA	2	6	2496658	2496663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47538	NC_016445	TC	3	6	2496785	2496790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47539	NC_016445	ACC	2	6	2496815	2496820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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47541	NC_016445	CGT	2	6	2496915	2496920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47542	NC_016445	AG	4	8	2496932	2496939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47543	NC_016445	C	6	6	2497015	2497020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47544	NC_016445	GAG	2	6	2497146	2497151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47545	NC_016445	CGACT	2	10	2497323	2497332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47546	NC_016445	CTTT	2	8	2497347	2497354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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47552	NC_016445	TACT	2	8	2497506	2497513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47553	NC_016445	AGT	2	6	2497582	2497587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47554	NC_016445	TCGGT	2	10	2497697	2497706	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47555	NC_016445	CAC	2	6	2497883	2497888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47556	NC_016445	GTAC	2	8	2497908	2497915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47557	NC_016445	GTCA	2	8	2497991	2497998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47558	NC_016445	GGA	2	6	2498014	2498019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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47560	NC_016445	TCGC	2	8	2498171	2498178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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47591	NC_016445	TTAAC	2	10	2499926	2499935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47592	NC_016445	TCC	2	6	2499941	2499946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47593	NC_016445	CTT	2	6	2499976	2499981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47603	NC_016445	ATC	2	6	2500538	2500543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47605	NC_016445	GATT	2	8	2500560	2500567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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47611	NC_016445	T	6	6	2500793	2500798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47614	NC_016445	ATG	2	6	2500897	2500902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036718
47615	NC_016445	GTGCT	2	10	2500967	2500976	0 %	40 %	40 %	20 %	360036718
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47624	NC_016445	AG	3	6	2501466	2501471	50 %	0 %	50 %	0 %	360036719
47625	NC_016445	CACT	2	8	2501526	2501533	25 %	25 %	0 %	50 %	360036719
47626	NC_016445	TCA	2	6	2501542	2501547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036719
47627	NC_016445	A	6	6	2501639	2501644	100 %	0 %	0 %	0 %	360036719
47628	NC_016445	ACA	2	6	2501646	2501651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036719
47629	NC_016445	ATCG	2	8	2501821	2501828	25 %	25 %	25 %	25 %	360036720
47630	NC_016445	GC	3	6	2501832	2501837	0 %	0 %	50 %	50 %	360036720
47631	NC_016445	TGT	2	6	2501843	2501848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036720
47632	NC_016445	CAT	2	6	2501887	2501892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036720
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47634	NC_016445	CAT	2	6	2501982	2501987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036720
47635	NC_016445	GCT	2	6	2502102	2502107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036720
47636	NC_016445	TAA	2	6	2502112	2502117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036720
47637	NC_016445	CACGC	2	10	2502127	2502136	20 %	0 %	20 %	60 %	360036720
47638	NC_016445	CAC	2	6	2502141	2502146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036720
47639	NC_016445	CAA	2	6	2502157	2502162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036720
47640	NC_016445	TCG	2	6	2502165	2502170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036720
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47642	NC_016445	CAT	2	6	2502249	2502254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036720
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47644	NC_016445	CG	4	8	2502290	2502297	0 %	0 %	50 %	50 %	360036720
47645	NC_016445	CCT	2	6	2502327	2502332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036720
47646	NC_016445	A	7	7	2502376	2502382	100 %	0 %	0 %	0 %	360036720
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47650	NC_016445	GATT	2	8	2502707	2502714	25 %	50 %	25 %	0 %	360036721
47651	NC_016445	CGA	2	6	2502789	2502794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036721
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47653	NC_016445	CATT	2	8	2502921	2502928	25 %	50 %	0 %	25 %	360036721
47654	NC_016445	ATC	2	6	2502932	2502937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036721
47655	NC_016445	A	6	6	2502938	2502943	100 %	0 %	0 %	0 %	360036721
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47661	NC_016445	GCG	2	6	2503244	2503249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036721
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47666	NC_016445	TC	3	6	2503522	2503527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47667	NC_016445	CTA	2	6	2503615	2503620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036722
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47672	NC_016445	TAGC	2	8	2503920	2503927	25 %	25 %	25 %	25 %	360036722
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47677	NC_016445	TGT	2	6	2504079	2504084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036722
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47680	NC_016445	TTC	2	6	2504153	2504158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036723
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47682	NC_016445	A	7	7	2504192	2504198	100 %	0 %	0 %	0 %	360036723
47683	NC_016445	GCTT	2	8	2504224	2504231	0 %	50 %	25 %	25 %	360036723
47684	NC_016445	ATAA	2	8	2504237	2504244	75 %	25 %	0 %	0 %	360036723
47685	NC_016445	TAT	2	6	2504273	2504278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036724
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47688	NC_016445	ATC	2	6	2504436	2504441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036724
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47690	NC_016445	CCG	2	6	2504479	2504484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036724
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47696	NC_016445	GC	3	6	2504784	2504789	0 %	0 %	50 %	50 %	360036725
47697	NC_016445	ATG	2	6	2504790	2504795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036725
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47706	NC_016445	GT	3	6	2505376	2505381	0 %	50 %	50 %	0 %	360036725
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47714	NC_016445	ATG	2	6	2505948	2505953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47715	NC_016445	CTG	2	6	2506010	2506015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036726
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47718	NC_016445	TGG	2	6	2506234	2506239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036726
47719	NC_016445	GCA	2	6	2506289	2506294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036726
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47722	NC_016445	A	6	6	2506405	2506410	100 %	0 %	0 %	0 %	360036726
47723	NC_016445	TGC	2	6	2506440	2506445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036726
47724	NC_016445	CAG	2	6	2506569	2506574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036727
47725	NC_016445	GAT	2	6	2506632	2506637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036727
47726	NC_016445	TCA	2	6	2506648	2506653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036727
47727	NC_016445	CAG	2	6	2506743	2506748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036727
47728	NC_016445	TTG	2	6	2506848	2506853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036727
47729	NC_016445	GCC	2	6	2506858	2506863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036727
47730	NC_016445	GCA	2	6	2506919	2506924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036727
47731	NC_016445	CAT	3	9	2507007	2507015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036727
47732	NC_016445	CCA	2	6	2507043	2507048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036728
47733	NC_016445	CAT	2	6	2507093	2507098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036728
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47735	NC_016445	CAG	2	6	2507209	2507214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036728
47736	NC_016445	A	6	6	2507215	2507220	100 %	0 %	0 %	0 %	360036728
47737	NC_016445	AG	3	6	2507246	2507251	50 %	0 %	50 %	0 %	360036728
47738	NC_016445	TGA	2	6	2507280	2507285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036728
47739	NC_016445	TTG	2	6	2507288	2507293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036728
47740	NC_016445	TGGC	2	8	2507343	2507350	0 %	25 %	50 %	25 %	360036728
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47742	NC_016445	ACC	2	6	2507448	2507453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036728
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47745	NC_016445	GAT	2	6	2507558	2507563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036728
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47859	NC_016445	ACTC	2	8	2513345	2513352	25 %	25 %	0 %	50 %	360036733
47860	NC_016445	GCGCC	2	10	2513357	2513366	0 %	0 %	40 %	60 %	360036733
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47967	NC_016445	CTT	2	6	2519054	2519059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036740
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47978	NC_016445	CAA	2	6	2519660	2519665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036740
47979	NC_016445	CAG	2	6	2519670	2519675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036740
47980	NC_016445	CAAA	2	8	2519729	2519736	75 %	0 %	0 %	25 %	360036740
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