MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_016445	CAG	2	6	2440049	2440054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036659
46502	NC_016445	T	7	7	2440067	2440073	0 %	100 %	0 %	0 %	360036659
46503	NC_016445	GCA	2	6	2440109	2440114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036659
46504	NC_016445	CCA	2	6	2440157	2440162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036659
46505	NC_016445	CATCG	2	10	2440173	2440182	20 %	20 %	20 %	40 %	360036659
46506	NC_016445	TGC	2	6	2440196	2440201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036659
46507	NC_016445	CAA	3	9	2440263	2440271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036659
46508	NC_016445	CAA	2	6	2440279	2440284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036660
46509	NC_016445	ACAA	2	8	2440343	2440350	75 %	0 %	0 %	25 %	360036660
46510	NC_016445	CGG	2	6	2440373	2440378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036660
46511	NC_016445	GCC	2	6	2440416	2440421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036660
46512	NC_016445	CAG	2	6	2440507	2440512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036660
46513	NC_016445	A	6	6	2440514	2440519	100 %	0 %	0 %	0 %	360036660
46514	NC_016445	AAC	2	6	2440528	2440533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036660
46515	NC_016445	CAA	2	6	2440666	2440671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036660
46516	NC_016445	A	6	6	2440670	2440675	100 %	0 %	0 %	0 %	360036660
46517	NC_016445	TGC	2	6	2440943	2440948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036660
46518	NC_016445	TCA	2	6	2440952	2440957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036660
46519	NC_016445	CAG	2	6	2440966	2440971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036660
46520	NC_016445	TGCC	2	8	2441003	2441010	0 %	25 %	25 %	50 %	360036660
46521	NC_016445	CAAGC	2	10	2441024	2441033	40 %	0 %	20 %	40 %	360036660
46522	NC_016445	AACC	2	8	2441061	2441068	50 %	0 %	0 %	50 %	360036660
46523	NC_016445	TCA	2	6	2441102	2441107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036660
46524	NC_016445	TC	4	8	2441142	2441149	0 %	50 %	0 %	50 %	360036660
46525	NC_016445	GA	3	6	2441171	2441176	50 %	0 %	50 %	0 %	360036660
46526	NC_016445	AAC	2	6	2441222	2441227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036660
46527	NC_016445	ATCGC	2	10	2441237	2441246	20 %	20 %	20 %	40 %	360036660
46528	NC_016445	GCC	2	6	2441257	2441262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036660
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46531	NC_016445	AACG	2	8	2441404	2441411	50 %	0 %	25 %	25 %	360036660
46532	NC_016445	CAC	2	6	2441429	2441434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036660
46533	NC_016445	TGT	2	6	2441477	2441482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036661
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46535	NC_016445	CAC	2	6	2441576	2441581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036661
46536	NC_016445	A	7	7	2441640	2441646	100 %	0 %	0 %	0 %	360036661
46537	NC_016445	GCGT	2	8	2441683	2441690	0 %	25 %	50 %	25 %	360036661
46538	NC_016445	AGC	2	6	2441692	2441697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036661
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46542	NC_016445	CAC	2	6	2441790	2441795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036661
46543	NC_016445	GCT	2	6	2441804	2441809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036661
46544	NC_016445	GCC	2	6	2441832	2441837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036661
46545	NC_016445	ACA	2	6	2441933	2441938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036661
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46547	NC_016445	TGC	2	6	2442076	2442081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036661
46548	NC_016445	GCA	2	6	2442122	2442127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036661
46549	NC_016445	AG	3	6	2442311	2442316	50 %	0 %	50 %	0 %	360036661
46550	NC_016445	GAA	2	6	2442320	2442325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036661
46551	NC_016445	TGC	2	6	2442397	2442402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036661
46552	NC_016445	AAG	2	6	2442403	2442408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036661
46553	NC_016445	AAT	2	6	2442426	2442431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036661
46554	NC_016445	CT	3	6	2442612	2442617	0 %	50 %	0 %	50 %	360036661
46555	NC_016445	ACA	2	6	2442669	2442674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46556	NC_016445	TTG	2	6	2442696	2442701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46557	NC_016445	CTG	3	9	2442732	2442740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036662
46558	NC_016445	TCG	2	6	2442850	2442855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036662
46559	NC_016445	AGT	2	6	2442890	2442895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036662
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46567	NC_016445	GTG	2	6	2443261	2443266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036662
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46571	NC_016445	TGCGC	2	10	2443328	2443337	0 %	20 %	40 %	40 %	360036662
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46576	NC_016445	GCA	2	6	2443697	2443702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036662
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46584	NC_016445	CAA	2	6	2444189	2444194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46585	NC_016445	ATT	2	6	2444265	2444270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036663
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46599	NC_016445	TCG	2	6	2444851	2444856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036664
46600	NC_016445	GTCG	2	8	2444951	2444958	0 %	25 %	50 %	25 %	360036664
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46604	NC_016445	CAAT	2	8	2445056	2445063	50 %	25 %	0 %	25 %	360036664
46605	NC_016445	GGC	2	6	2445143	2445148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036664
46606	NC_016445	T	6	6	2445180	2445185	0 %	100 %	0 %	0 %	360036664
46607	NC_016445	GGC	2	6	2445191	2445196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036664
46608	NC_016445	GTAC	2	8	2445220	2445227	25 %	25 %	25 %	25 %	360036664
46609	NC_016445	T	7	7	2445270	2445276	0 %	100 %	0 %	0 %	360036664
46610	NC_016445	CAT	2	6	2445313	2445318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036665
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46612	NC_016445	TCA	2	6	2445454	2445459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036665
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46616	NC_016445	GA	3	6	2445641	2445646	50 %	0 %	50 %	0 %	360036665
46617	NC_016445	CT	3	6	2445700	2445705	0 %	50 %	0 %	50 %	360036665
46618	NC_016445	TCA	2	6	2445750	2445755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036665
46619	NC_016445	TACA	2	8	2445824	2445831	50 %	25 %	0 %	25 %	360036665
46620	NC_016445	CTG	2	6	2445842	2445847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036665
46621	NC_016445	GCT	2	6	2445865	2445870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036665
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46623	NC_016445	CCT	2	6	2445931	2445936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46624	NC_016445	GAGTG	2	10	2445973	2445982	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46625	NC_016445	TCA	2	6	2445998	2446003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46626	NC_016445	A	6	6	2446012	2446017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46627	NC_016445	GGATA	2	10	2446151	2446160	40 %	20 %	40 %	0 %	360036666
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46630	NC_016445	CG	3	6	2446318	2446323	0 %	0 %	50 %	50 %	360036666
46631	NC_016445	TGC	2	6	2446448	2446453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036666
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46640	NC_016445	AATC	2	8	2446857	2446864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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46645	NC_016445	GC	3	6	2447465	2447470	0 %	0 %	50 %	50 %	360036667
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46649	NC_016445	CAA	2	6	2447649	2447654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46650	NC_016445	CAA	2	6	2447668	2447673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46652	NC_016445	TGG	2	6	2447688	2447693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46653	NC_016445	GA	3	6	2447702	2447707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46654	NC_016445	TGC	2	6	2447810	2447815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46655	NC_016445	ATA	2	6	2447882	2447887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46661	NC_016445	T	6	6	2448168	2448173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46662	NC_016445	T	8	8	2448178	2448185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46663	NC_016445	ACA	2	6	2448203	2448208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46665	NC_016445	A	7	7	2448244	2448250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46666	NC_016445	TTC	2	6	2448279	2448284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46672	NC_016445	GAT	2	6	2448527	2448532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036669
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46684	NC_016445	TGA	2	6	2449113	2449118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036669
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46703	NC_016445	GCTTT	2	10	2449851	2449860	0 %	60 %	20 %	20 %	360036669
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46714	NC_016445	CACC	2	8	2450518	2450525	25 %	0 %	0 %	75 %	360036669
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46722	NC_016445	GTTG	2	8	2450999	2451006	0 %	50 %	50 %	0 %	360036669
46723	NC_016445	GTAA	2	8	2451127	2451134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46724	NC_016445	TGT	2	6	2451172	2451177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036670
46725	NC_016445	ATTT	2	8	2451254	2451261	25 %	75 %	0 %	0 %	360036670
46726	NC_016445	A	8	8	2451326	2451333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46727	NC_016445	AAAAT	2	10	2451344	2451353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46728	NC_016445	ATA	2	6	2451478	2451483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46729	NC_016445	GAGCGA	2	12	2451508	2451519	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46730	NC_016445	CATAA	2	10	2451524	2451533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46731	NC_016445	T	6	6	2451586	2451591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46732	NC_016445	TAA	3	9	2451757	2451765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46733	NC_016445	A	6	6	2451799	2451804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46734	NC_016445	ATTT	2	8	2451809	2451816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46735	NC_016445	T	6	6	2451814	2451819	0 %	100 %	0 %	0 %	360036671
46736	NC_016445	GAT	2	6	2451851	2451856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036671
46737	NC_016445	T	6	6	2451894	2451899	0 %	100 %	0 %	0 %	360036671
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46741	NC_016445	T	6	6	2452195	2452200	0 %	100 %	0 %	0 %	360036671
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46973	NC_016445	GGC	2	6	2465324	2465329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036687
46974	NC_016445	GCA	2	6	2465340	2465345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036687
46975	NC_016445	GCT	2	6	2465368	2465373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036687
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46977	NC_016445	CAG	2	6	2465435	2465440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036687
46978	NC_016445	CAG	2	6	2465548	2465553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036687
46979	NC_016445	GCC	2	6	2465609	2465614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036687
46980	NC_016445	ATC	2	6	2465684	2465689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036687
46981	NC_016445	CTG	2	6	2465717	2465722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036687
46982	NC_016445	GCC	2	6	2465756	2465761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036687
46983	NC_016445	GGC	2	6	2465826	2465831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036687
46984	NC_016445	CT	3	6	2465866	2465871	0 %	50 %	0 %	50 %	360036687
46985	NC_016445	TCG	2	6	2465988	2465993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036687
46986	NC_016445	TGA	2	6	2466009	2466014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036687
46987	NC_016445	TGA	3	9	2466021	2466029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036687
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46989	NC_016445	TGGT	2	8	2466072	2466079	0 %	50 %	50 %	0 %	360036687
46990	NC_016445	GAT	2	6	2466098	2466103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036687
46991	NC_016445	TCT	2	6	2466174	2466179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036687
46992	NC_016445	GGATC	2	10	2466188	2466197	20 %	20 %	40 %	20 %	360036687
46993	NC_016445	CGG	2	6	2466237	2466242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036687
46994	NC_016445	GCCAT	2	10	2466266	2466275	20 %	20 %	20 %	40 %	360036687
46995	NC_016445	GTG	2	6	2466286	2466291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036687
46996	NC_016445	GT	3	6	2466306	2466311	0 %	50 %	50 %	0 %	360036687
46997	NC_016445	AC	3	6	2466395	2466400	50 %	0 %	0 %	50 %	360036687
46998	NC_016445	GC	3	6	2466487	2466492	0 %	0 %	50 %	50 %	360036687
46999	NC_016445	T	6	6	2466499	2466504	0 %	100 %	0 %	0 %	360036687
47000	NC_016445	ACC	2	6	2466527	2466532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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