MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_016445	AAC	2	6	2414024	2414029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036629
46002	NC_016445	GCA	2	6	2414061	2414066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036629
46003	NC_016445	TGTAA	2	10	2414080	2414089	40 %	40 %	20 %	0 %	360036629
46004	NC_016445	TCA	2	6	2414112	2414117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036629
46005	NC_016445	TCA	2	6	2414218	2414223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46006	NC_016445	CAA	2	6	2414253	2414258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46007	NC_016445	TCAAG	2	10	2414323	2414332	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46008	NC_016445	ACC	2	6	2414368	2414373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46009	NC_016445	CGC	2	6	2414424	2414429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036630
46010	NC_016445	AAACGG	2	12	2414494	2414505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	360036630
46011	NC_016445	GAGC	2	8	2414519	2414526	25 %	0 %	50 %	25 %	360036630
46012	NC_016445	TCA	2	6	2414555	2414560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036630
46013	NC_016445	AAACC	2	10	2414596	2414605	60 %	0 %	0 %	40 %	360036630
46014	NC_016445	TCT	2	6	2414677	2414682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036630
46015	NC_016445	TTG	2	6	2414683	2414688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036630
46016	NC_016445	A	7	7	2414725	2414731	100 %	0 %	0 %	0 %	360036630
46017	NC_016445	ACATCA	2	12	2414735	2414746	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	360036630
46018	NC_016445	CAC	2	6	2414763	2414768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036630
46019	NC_016445	CAC	2	6	2414904	2414909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036630
46020	NC_016445	ATC	2	6	2414979	2414984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036630
46021	NC_016445	TGC	2	6	2414992	2414997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036630
46022	NC_016445	TCA	2	6	2415025	2415030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036630
46023	NC_016445	CGC	2	6	2415031	2415036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036630
46024	NC_016445	ATC	2	6	2415042	2415047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036630
46025	NC_016445	GAT	2	6	2415057	2415062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036630
46026	NC_016445	CTGAG	2	10	2415097	2415106	20 %	20 %	40 %	20 %	360036630
46027	NC_016445	GGC	2	6	2415234	2415239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036630
46028	NC_016445	AATG	2	8	2415263	2415270	50 %	25 %	25 %	0 %	360036630
46029	NC_016445	TGG	2	6	2415329	2415334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036630
46030	NC_016445	T	6	6	2415344	2415349	0 %	100 %	0 %	0 %	360036630
46031	NC_016445	A	6	6	2415389	2415394	100 %	0 %	0 %	0 %	360036631
46032	NC_016445	CAG	2	6	2415460	2415465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036631
46033	NC_016445	TCA	2	6	2415548	2415553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036631
46034	NC_016445	CAG	2	6	2415556	2415561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036631
46035	NC_016445	CAC	2	6	2415577	2415582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036631
46036	NC_016445	CG	3	6	2415583	2415588	0 %	0 %	50 %	50 %	360036631
46037	NC_016445	GCT	2	6	2415603	2415608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036631
46038	NC_016445	AG	3	6	2415619	2415624	50 %	0 %	50 %	0 %	360036631
46039	NC_016445	AGC	2	6	2415636	2415641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036631
46040	NC_016445	GCC	2	6	2415674	2415679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036631
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46042	NC_016445	TGC	2	6	2415750	2415755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036631
46043	NC_016445	GCG	2	6	2415799	2415804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036631
46044	NC_016445	GCC	2	6	2415931	2415936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036631
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46048	NC_016445	GTC	2	6	2416141	2416146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036632
46049	NC_016445	CTGA	2	8	2416288	2416295	25 %	25 %	25 %	25 %	360036632
46050	NC_016445	TCA	2	6	2416352	2416357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036632
46051	NC_016445	TCT	2	6	2416359	2416364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036632
46052	NC_016445	TCA	2	6	2416365	2416370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036632
46053	NC_016445	TTTTG	2	10	2416407	2416416	0 %	80 %	20 %	0 %	360036632
46054	NC_016445	CAC	2	6	2416441	2416446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036632
46055	NC_016445	CG	3	6	2416455	2416460	0 %	0 %	50 %	50 %	360036632
46056	NC_016445	CGC	2	6	2416465	2416470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036632
46057	NC_016445	CAT	2	6	2416479	2416484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036632
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46059	NC_016445	CTTGC	2	10	2416612	2416621	0 %	40 %	20 %	40 %	360036632
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46061	NC_016445	CCA	2	6	2416680	2416685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036632
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46065	NC_016445	TCT	2	6	2416760	2416765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036632
46066	NC_016445	CAG	2	6	2416768	2416773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036632
46067	NC_016445	GAT	2	6	2416834	2416839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036632
46068	NC_016445	CAG	2	6	2416873	2416878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036632
46069	NC_016445	TTC	2	6	2416882	2416887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036632
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46072	NC_016445	GC	3	6	2416987	2416992	0 %	0 %	50 %	50 %	360036632
46073	NC_016445	AAG	2	6	2416994	2416999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036632
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46082	NC_016445	GAAAA	2	10	2417316	2417325	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46083	NC_016445	A	6	6	2417322	2417327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46084	NC_016445	T	6	6	2417376	2417381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46085	NC_016445	A	6	6	2417448	2417453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46091	NC_016445	AAG	2	6	2417623	2417628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036633
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46101	NC_016445	CAT	2	6	2418160	2418165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036634
46102	NC_016445	CATG	2	8	2418184	2418191	25 %	25 %	25 %	25 %	360036634
46103	NC_016445	ATG	2	6	2418311	2418316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036634
46104	NC_016445	A	7	7	2418318	2418324	100 %	0 %	0 %	0 %	360036634
46105	NC_016445	CCG	2	6	2418325	2418330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46106	NC_016445	T	7	7	2418339	2418345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46107	NC_016445	CAT	2	6	2418347	2418352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46108	NC_016445	TAA	2	6	2418470	2418475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036635
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46110	NC_016445	GCC	2	6	2418657	2418662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036635
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46115	NC_016445	TGC	2	6	2418858	2418863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036635
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46117	NC_016445	AGG	2	6	2418888	2418893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360036635
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46126	NC_016445	CAAAA	2	10	2419198	2419207	80 %	0 %	0 %	20 %	360036636
46127	NC_016445	A	7	7	2419209	2419215	100 %	0 %	0 %	0 %	360036636
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46132	NC_016445	A	6	6	2419285	2419290	100 %	0 %	0 %	0 %	360036636
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46138	NC_016445	CAA	2	6	2419496	2419501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46139	NC_016445	A	6	6	2419507	2419512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46140	NC_016445	AATAA	2	10	2419525	2419534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46142	NC_016445	T	7	7	2419692	2419698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46146	NC_016445	A	6	6	2419830	2419835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46147	NC_016445	T	6	6	2419851	2419856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46150	NC_016445	CA	3	6	2419968	2419973	50 %	0 %	0 %	50 %	360036637
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46235	NC_016445	GAT	2	6	2425451	2425456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036645
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46237	NC_016445	TCGC	2	8	2425803	2425810	0 %	25 %	25 %	50 %	360036647
46238	NC_016445	ACC	2	6	2425836	2425841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036647
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46253	NC_016445	GCA	2	6	2426621	2426626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036647
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46265	NC_016445	CAT	2	6	2427126	2427131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036647
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46267	NC_016445	GCG	3	9	2427163	2427171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036647
46268	NC_016445	TACAA	2	10	2427193	2427202	60 %	20 %	0 %	20 %	360036647
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46273	NC_016445	GCTG	2	8	2427450	2427457	0 %	25 %	50 %	25 %	360036648
46274	NC_016445	GC	3	6	2427524	2427529	0 %	0 %	50 %	50 %	360036648
46275	NC_016445	ACCCA	2	10	2427533	2427542	40 %	0 %	0 %	60 %	360036648
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46278	NC_016445	CGCT	2	8	2427602	2427609	0 %	25 %	25 %	50 %	360036648
46279	NC_016445	GC	3	6	2427662	2427667	0 %	0 %	50 %	50 %	360036648
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46288	NC_016445	ATC	2	6	2428262	2428267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036649
46289	NC_016445	CGGG	2	8	2428316	2428323	0 %	0 %	75 %	25 %	360036649
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46299	NC_016445	TTG	2	6	2428715	2428720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036649
46300	NC_016445	GCG	2	6	2428732	2428737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036649
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46302	NC_016445	CTGA	2	8	2428792	2428799	25 %	25 %	25 %	25 %	360036649
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46312	NC_016445	CATG	2	8	2429484	2429491	25 %	25 %	25 %	25 %	360036649
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46321	NC_016445	TCA	2	6	2429792	2429797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036649
46322	NC_016445	ACC	2	6	2429872	2429877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036649
46323	NC_016445	GTTT	2	8	2429972	2429979	0 %	75 %	25 %	0 %	360036649
46324	NC_016445	GGC	2	6	2429980	2429985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036649
46325	NC_016445	CCA	2	6	2429987	2429992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036649
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46328	NC_016445	ATGCA	2	10	2430471	2430480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46329	NC_016445	GA	3	6	2430570	2430575	50 %	0 %	50 %	0 %	360036650
46330	NC_016445	CGCT	2	8	2430601	2430608	0 %	25 %	25 %	50 %	360036650
46331	NC_016445	CGA	2	6	2430618	2430623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036650
46332	NC_016445	CAG	2	6	2430648	2430653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036650
46333	NC_016445	AAGCTG	2	12	2430731	2430742	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360036650
46334	NC_016445	TGC	2	6	2430746	2430751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036650
46335	NC_016445	GC	3	6	2430798	2430803	0 %	0 %	50 %	50 %	360036650
46336	NC_016445	T	6	6	2430835	2430840	0 %	100 %	0 %	0 %	360036650
46337	NC_016445	TCGC	2	8	2430966	2430973	0 %	25 %	25 %	50 %	360036650
46338	NC_016445	TGC	2	6	2431020	2431025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036650
46339	NC_016445	CAT	2	6	2431051	2431056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036650
46340	NC_016445	GCG	2	6	2431073	2431078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036650
46341	NC_016445	GCCA	2	8	2431098	2431105	25 %	0 %	25 %	50 %	360036650
46342	NC_016445	AAC	2	6	2431146	2431151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036650
46343	NC_016445	TGA	2	6	2431180	2431185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036650
46344	NC_016445	GC	3	6	2431288	2431293	0 %	0 %	50 %	50 %	360036651
46345	NC_016445	CGCA	2	8	2431396	2431403	25 %	0 %	25 %	50 %	360036651
46346	NC_016445	TTG	2	6	2431652	2431657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036651
46347	NC_016445	ATC	3	9	2431789	2431797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036651
46348	NC_016445	TCA	2	6	2431823	2431828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036651
46349	NC_016445	GCT	2	6	2431854	2431859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036651
46350	NC_016445	GCG	2	6	2431863	2431868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036651
46351	NC_016445	CTG	2	6	2431961	2431966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036651
46352	NC_016445	CTG	2	6	2432080	2432085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036651
46353	NC_016445	TCG	2	6	2432189	2432194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036651
46354	NC_016445	TTC	2	6	2432195	2432200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036651
46355	NC_016445	GCC	2	6	2432294	2432299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036652
46356	NC_016445	CAG	2	6	2432393	2432398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036652
46357	NC_016445	TCA	2	6	2432502	2432507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036652
46358	NC_016445	GCA	2	6	2432515	2432520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036652
46359	NC_016445	CGA	2	6	2432588	2432593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036652
46360	NC_016445	GA	3	6	2432687	2432692	50 %	0 %	50 %	0 %	360036652
46361	NC_016445	GAGC	2	8	2432728	2432735	25 %	0 %	50 %	25 %	360036652
46362	NC_016445	GAT	2	6	2432785	2432790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036652
46363	NC_016445	A	7	7	2432795	2432801	100 %	0 %	0 %	0 %	360036652
46364	NC_016445	CCA	2	6	2432827	2432832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036652
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46368	NC_016445	TCA	2	6	2433106	2433111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036653
46369	NC_016445	GCA	2	6	2433196	2433201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036653
46370	NC_016445	CCA	2	6	2433215	2433220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036653
46371	NC_016445	CGC	2	6	2433254	2433259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036653
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46374	NC_016445	TCTTCC	2	12	2433373	2433384	0 %	50 %	0 %	50 %	360036653
46375	NC_016445	ATGG	2	8	2433420	2433427	25 %	25 %	50 %	0 %	360036653
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46377	NC_016445	GC	4	8	2433474	2433481	0 %	0 %	50 %	50 %	360036653
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46380	NC_016445	GA	3	6	2433629	2433634	50 %	0 %	50 %	0 %	360036653
46381	NC_016445	AGA	3	9	2433632	2433640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036653
46382	NC_016445	AGA	2	6	2433714	2433719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46383	NC_016445	GCT	2	6	2433758	2433763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036654
46384	NC_016445	CGA	2	6	2433845	2433850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036654
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46387	NC_016445	CCAA	2	8	2433957	2433964	50 %	0 %	0 %	50 %	360036654
46388	NC_016445	ATG	2	6	2434005	2434010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036654
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46391	NC_016445	CG	3	6	2434142	2434147	0 %	0 %	50 %	50 %	360036654
46392	NC_016445	TCA	2	6	2434236	2434241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036654
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46395	NC_016445	AATC	2	8	2434309	2434316	50 %	25 %	0 %	25 %	360036654
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46419	NC_016445	ATA	2	6	2435553	2435558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46420	NC_016445	A	6	6	2435558	2435563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46421	NC_016445	T	6	6	2435580	2435585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46422	NC_016445	TACGG	2	10	2435670	2435679	20 %	20 %	40 %	20 %	360036657
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46454	NC_016445	TGA	2	6	2437695	2437700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036657
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46456	NC_016445	CGAT	2	8	2437839	2437846	25 %	25 %	25 %	25 %	360036657
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46463	NC_016445	GTT	2	6	2438328	2438333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46464	NC_016445	ATA	2	6	2438364	2438369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46465	NC_016445	CA	3	6	2438384	2438389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46466	NC_016445	TTC	2	6	2438409	2438414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46467	NC_016445	CAT	2	6	2438504	2438509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46469	NC_016445	GC	3	6	2438729	2438734	0 %	0 %	50 %	50 %	360036658
46470	NC_016445	TCG	2	6	2438881	2438886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036658
46471	NC_016445	TAAG	2	8	2438977	2438984	50 %	25 %	25 %	0 %	360036658
46472	NC_016445	CAT	2	6	2439008	2439013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036658
46473	NC_016445	GCA	2	6	2439021	2439026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036658
46474	NC_016445	GC	3	6	2439146	2439151	0 %	0 %	50 %	50 %	360036658
46475	NC_016445	CCG	2	6	2439181	2439186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036658
46476	NC_016445	CG	3	6	2439204	2439209	0 %	0 %	50 %	50 %	360036658
46477	NC_016445	CTG	2	6	2439261	2439266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036658
46478	NC_016445	GCG	2	6	2439328	2439333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036658
46479	NC_016445	CA	3	6	2439350	2439355	50 %	0 %	0 %	50 %	360036658
46480	NC_016445	GCTG	2	8	2439377	2439384	0 %	25 %	50 %	25 %	360036658
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46482	NC_016445	CGCA	2	8	2439462	2439469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46483	NC_016445	ATTG	2	8	2439491	2439498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46484	NC_016445	TGA	2	6	2439530	2439535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036659
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46491	NC_016445	TTG	2	6	2439725	2439730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036659
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46498	NC_016445	AAG	2	6	2439958	2439963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036659
46499	NC_016445	GCC	3	9	2439990	2439998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036659
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