MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_016445	CGCC	2	8	2386011	2386018	0 %	0 %	25 %	75 %	360036611
45503	NC_016445	AG	3	6	2386087	2386092	50 %	0 %	50 %	0 %	360036611
45504	NC_016445	CTG	2	6	2386228	2386233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036611
45505	NC_016445	TAA	2	6	2386236	2386241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036611
45506	NC_016445	TGA	2	6	2386399	2386404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036612
45507	NC_016445	TTG	2	6	2386446	2386451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036612
45508	NC_016445	GAT	2	6	2386490	2386495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036612
45509	NC_016445	GGCA	2	8	2386521	2386528	25 %	0 %	50 %	25 %	360036612
45510	NC_016445	CG	3	6	2386572	2386577	0 %	0 %	50 %	50 %	360036612
45511	NC_016445	TCAA	2	8	2386705	2386712	50 %	25 %	0 %	25 %	360036612
45512	NC_016445	CAA	2	6	2386764	2386769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036612
45513	NC_016445	GCC	2	6	2386791	2386796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036612
45514	NC_016445	AAT	2	6	2386800	2386805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036612
45515	NC_016445	TTCCT	2	10	2386822	2386831	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45516	NC_016445	TC	3	6	2386843	2386848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45517	NC_016445	TCG	2	6	2387015	2387020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036613
45518	NC_016445	GGC	2	6	2387063	2387068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036613
45519	NC_016445	CAT	2	6	2387082	2387087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036613
45520	NC_016445	CGTT	2	8	2387244	2387251	0 %	50 %	25 %	25 %	360036613
45521	NC_016445	CGC	2	6	2387307	2387312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036613
45522	NC_016445	TG	3	6	2387316	2387321	0 %	50 %	50 %	0 %	360036613
45523	NC_016445	CAG	2	6	2387347	2387352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036613
45524	NC_016445	ACCTGA	2	12	2387353	2387364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360036613
45525	NC_016445	ATACGG	2	12	2387426	2387437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360036613
45526	NC_016445	ATG	2	6	2387495	2387500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036613
45527	NC_016445	CTT	2	6	2387514	2387519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036613
45528	NC_016445	ACG	2	6	2387617	2387622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036613
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45531	NC_016445	TCA	2	6	2387831	2387836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036613
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45533	NC_016445	TCACA	2	10	2387868	2387877	40 %	20 %	0 %	40 %	360036613
45534	NC_016445	CTT	2	6	2388004	2388009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036613
45535	NC_016445	TTG	2	6	2388034	2388039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036613
45536	NC_016445	TTTAC	2	10	2388047	2388056	20 %	60 %	0 %	20 %	360036613
45537	NC_016445	ATTTGC	2	12	2388116	2388127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	360036613
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45542	NC_016445	GGCT	2	8	2388780	2388787	0 %	25 %	50 %	25 %	360036614
45543	NC_016445	AAT	2	6	2388825	2388830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036614
45544	NC_016445	TCG	2	6	2388882	2388887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036614
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45547	NC_016445	TCA	2	6	2389062	2389067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036614
45548	NC_016445	TTA	2	6	2389136	2389141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45549	NC_016445	TTTA	2	8	2389189	2389196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45550	NC_016445	TTA	2	6	2389216	2389221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45551	NC_016445	AAGTT	2	10	2389281	2389290	40 %	40 %	20 %	0 %	360036615
45552	NC_016445	AAC	2	6	2389326	2389331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036615
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45554	NC_016445	TTC	2	6	2389396	2389401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036615
45555	NC_016445	TGGC	2	8	2389404	2389411	0 %	25 %	50 %	25 %	360036615
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45559	NC_016445	TTC	2	6	2389637	2389642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036615
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45562	NC_016445	GAC	2	6	2389697	2389702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036615
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45568	NC_016445	TC	3	6	2390060	2390065	0 %	50 %	0 %	50 %	360036615
45569	NC_016445	CGG	2	6	2390104	2390109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036615
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45574	NC_016445	CCA	2	6	2390187	2390192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036615
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45577	NC_016445	CAG	2	6	2390442	2390447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036615
45578	NC_016445	AAG	2	6	2390448	2390453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036615
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45580	NC_016445	TAC	2	6	2390636	2390641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036615
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45582	NC_016445	CTCGC	2	10	2390697	2390706	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45583	NC_016445	AT	3	6	2390824	2390829	50 %	50 %	0 %	0 %	360036616
45584	NC_016445	TCGTC	2	10	2390834	2390843	0 %	40 %	20 %	40 %	360036616
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45589	NC_016445	GCAATT	2	12	2391238	2391249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	360036616
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45598	NC_016445	CAA	2	6	2391523	2391528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036617
45599	NC_016445	CGAG	2	8	2391542	2391549	25 %	0 %	50 %	25 %	360036617
45600	NC_016445	TGAGTG	2	12	2391552	2391563	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	360036617
45601	NC_016445	CAT	2	6	2391580	2391585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036617
45602	NC_016445	TAA	2	6	2391586	2391591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036617
45603	NC_016445	TGA	2	6	2391627	2391632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036617
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45605	NC_016445	TC	3	6	2391725	2391730	0 %	50 %	0 %	50 %	360036617
45606	NC_016445	GCT	2	6	2391859	2391864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036617
45607	NC_016445	CAA	2	6	2391893	2391898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036617
45608	NC_016445	TCAA	2	8	2391918	2391925	50 %	25 %	0 %	25 %	360036617
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45611	NC_016445	ATC	3	9	2392064	2392072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036617
45612	NC_016445	A	6	6	2392136	2392141	100 %	0 %	0 %	0 %	360036617
45613	NC_016445	GCG	2	6	2392301	2392306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036617
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45615	NC_016445	CCT	2	6	2392436	2392441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036617
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45617	NC_016445	GATC	2	8	2392525	2392532	25 %	25 %	25 %	25 %	360036617
45618	NC_016445	ATTT	2	8	2392586	2392593	25 %	75 %	0 %	0 %	360036617
45619	NC_016445	GAT	3	9	2392652	2392660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036618
45620	NC_016445	CT	3	6	2392691	2392696	0 %	50 %	0 %	50 %	360036618
45621	NC_016445	CTG	2	6	2392742	2392747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036618
45622	NC_016445	GATG	2	8	2392801	2392808	25 %	25 %	50 %	0 %	360036618
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45729	NC_016445	TC	3	6	2399549	2399554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45730	NC_016445	ACC	2	6	2399579	2399584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45731	NC_016445	GTA	2	6	2399667	2399672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45732	NC_016445	CGT	2	6	2399679	2399684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45734	NC_016445	C	6	6	2399779	2399784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45735	NC_016445	GAG	2	6	2399910	2399915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45736	NC_016445	CGACT	2	10	2400087	2400096	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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45962	NC_016445	A	6	6	2412128	2412133	100 %	0 %	0 %	0 %	360036628
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45977	NC_016445	CTT	2	6	2412879	2412884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036628
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