MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_016445	GAA	2	6	2334362	2334367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036566
44503	NC_016445	AG	3	6	2334429	2334434	50 %	0 %	50 %	0 %	360036566
44504	NC_016445	CA	3	6	2334538	2334543	50 %	0 %	0 %	50 %	360036566
44505	NC_016445	TTA	2	6	2334720	2334725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036566
44506	NC_016445	AGA	2	6	2334761	2334766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036566
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44510	NC_016445	TA	3	6	2334905	2334910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44511	NC_016445	TAT	2	6	2334994	2334999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44512	NC_016445	T	6	6	2335082	2335087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44513	NC_016445	AAT	2	6	2335093	2335098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44514	NC_016445	GAA	2	6	2335167	2335172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036567
44515	NC_016445	CTG	2	6	2335198	2335203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036567
44516	NC_016445	TAC	2	6	2335209	2335214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036567
44517	NC_016445	A	6	6	2335308	2335313	100 %	0 %	0 %	0 %	360036567
44518	NC_016445	CAAA	2	8	2335327	2335334	75 %	0 %	0 %	25 %	360036567
44519	NC_016445	TGATT	2	10	2335385	2335394	20 %	60 %	20 %	0 %	360036567
44520	NC_016445	GGT	2	6	2335443	2335448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036567
44521	NC_016445	TGAACA	2	12	2335462	2335473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	360036567
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44523	NC_016445	TCA	2	6	2335537	2335542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036567
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44525	NC_016445	ACA	2	6	2335615	2335620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036567
44526	NC_016445	TGAT	2	8	2335633	2335640	25 %	50 %	25 %	0 %	360036567
44527	NC_016445	TGAA	2	8	2335777	2335784	50 %	25 %	25 %	0 %	360036567
44528	NC_016445	CG	3	6	2335791	2335796	0 %	0 %	50 %	50 %	360036567
44529	NC_016445	CGC	2	6	2335865	2335870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036567
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44533	NC_016445	CT	3	6	2336046	2336051	0 %	50 %	0 %	50 %	360036567
44534	NC_016445	TGAA	2	8	2336071	2336078	50 %	25 %	25 %	0 %	360036567
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44546	NC_016445	TTG	2	6	2336588	2336593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44549	NC_016445	T	6	6	2336666	2336671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44550	NC_016445	CTTCAT	2	12	2336727	2336738	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	360036568
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44585	NC_016445	TGC	3	9	2338436	2338444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036569
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44600	NC_016445	ATTTT	2	10	2340016	2340025	20 %	80 %	0 %	0 %	360036570
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44737	NC_016445	TCT	2	6	2347745	2347750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036575
44738	NC_016445	GGC	2	6	2347762	2347767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036575
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44748	NC_016445	CTG	2	6	2348096	2348101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036575
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44851	NC_016445	CTG	2	6	2353471	2353476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44852	NC_016445	CAC	2	6	2353534	2353539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036580
44853	NC_016445	ACACTG	2	12	2353636	2353647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360036580
44854	NC_016445	T	7	7	2353650	2353656	0 %	100 %	0 %	0 %	360036580
44855	NC_016445	AAC	2	6	2353678	2353683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036580
44856	NC_016445	ATC	2	6	2353747	2353752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036580
44857	NC_016445	TGAC	2	8	2353862	2353869	25 %	25 %	25 %	25 %	360036580
44858	NC_016445	CAG	2	6	2353933	2353938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44859	NC_016445	TCAT	2	8	2353964	2353971	25 %	50 %	0 %	25 %	360036580
44860	NC_016445	CGG	2	6	2353979	2353984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036580
44861	NC_016445	GCT	2	6	2354049	2354054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44862	NC_016445	TC	3	6	2354064	2354069	0 %	50 %	0 %	50 %	360036580
44863	NC_016445	CCA	2	6	2354127	2354132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036580
44864	NC_016445	ACA	2	6	2354139	2354144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036580
44865	NC_016445	GCA	2	6	2354181	2354186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44866	NC_016445	ATG	2	6	2354233	2354238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036580
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44868	NC_016445	GGCT	2	8	2354410	2354417	0 %	25 %	50 %	25 %	360036580
44869	NC_016445	TGG	2	6	2354486	2354491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036580
44870	NC_016445	ATT	2	6	2354548	2354553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036580
44871	NC_016445	AGC	2	6	2354558	2354563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44872	NC_016445	TGAT	2	8	2354705	2354712	25 %	50 %	25 %	0 %	360036580
44873	NC_016445	C	6	6	2354719	2354724	0 %	0 %	0 %	100 %	360036580
44874	NC_016445	GCCT	2	8	2354797	2354804	0 %	25 %	25 %	50 %	360036580
44875	NC_016445	GCAA	2	8	2354813	2354820	50 %	0 %	25 %	25 %	360036580
44876	NC_016445	GT	3	6	2354830	2354835	0 %	50 %	50 %	0 %	360036580
44877	NC_016445	TGAT	2	8	2354840	2354847	25 %	50 %	25 %	0 %	360036580
44878	NC_016445	CCG	2	6	2354951	2354956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036580
44879	NC_016445	TCG	2	6	2355005	2355010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44880	NC_016445	CCA	2	6	2355011	2355016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036580
44881	NC_016445	TGA	2	6	2355056	2355061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036580
44882	NC_016445	AGCC	2	8	2355135	2355142	25 %	0 %	25 %	50 %	360036580
44883	NC_016445	TG	3	6	2355145	2355150	0 %	50 %	50 %	0 %	360036580
44884	NC_016445	CTG	2	6	2355151	2355156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036580
44885	NC_016445	CAC	2	6	2355164	2355169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036580
44886	NC_016445	CAAA	2	8	2355279	2355286	75 %	0 %	0 %	25 %	360036580
44887	NC_016445	CG	3	6	2355357	2355362	0 %	0 %	50 %	50 %	360036580
44888	NC_016445	CAT	2	6	2355399	2355404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036580
44889	NC_016445	TCA	2	6	2355458	2355463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44890	NC_016445	CGC	2	6	2355521	2355526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44891	NC_016445	CT	3	6	2355554	2355559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44892	NC_016445	CAGAG	2	10	2355563	2355572	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44893	NC_016445	ACT	2	6	2355588	2355593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44894	NC_016445	GGC	2	6	2355608	2355613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44895	NC_016445	GAAC	2	8	2355660	2355667	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44896	NC_016445	ACC	2	6	2355742	2355747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44897	NC_016445	CT	3	6	2355862	2355867	0 %	50 %	0 %	50 %	360036581
44898	NC_016445	CTG	2	6	2355885	2355890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036581
44899	NC_016445	CAT	2	6	2355968	2355973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036581
44900	NC_016445	TTCA	2	8	2356008	2356015	25 %	50 %	0 %	25 %	360036581
44901	NC_016445	ATT	2	6	2356089	2356094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036581
44902	NC_016445	ATG	2	6	2356140	2356145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036581
44903	NC_016445	TGC	2	6	2356204	2356209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036581
44904	NC_016445	GATT	2	8	2356288	2356295	25 %	50 %	25 %	0 %	360036581
44905	NC_016445	GTG	2	6	2356303	2356308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036581
44906	NC_016445	TGC	2	6	2356387	2356392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036581
44907	NC_016445	TACG	2	8	2356413	2356420	25 %	25 %	25 %	25 %	360036581
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44909	NC_016445	CTG	2	6	2356779	2356784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036581
44910	NC_016445	TAC	2	6	2356834	2356839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036581
44911	NC_016445	GGC	2	6	2356896	2356901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036581
44912	NC_016445	TGC	2	6	2356928	2356933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036581
44913	NC_016445	TC	3	6	2356951	2356956	0 %	50 %	0 %	50 %	360036581
44914	NC_016445	CGC	2	6	2356971	2356976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036581
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44917	NC_016445	CTG	2	6	2357121	2357126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036581
44918	NC_016445	CGC	2	6	2357153	2357158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036581
44919	NC_016445	GCG	2	6	2357178	2357183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036581
44920	NC_016445	TTCA	2	8	2357202	2357209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44921	NC_016445	TGC	2	6	2357233	2357238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036582
44922	NC_016445	ATG	2	6	2357304	2357309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036582
44923	NC_016445	CG	3	6	2357365	2357370	0 %	0 %	50 %	50 %	360036582
44924	NC_016445	TTTA	2	8	2357400	2357407	25 %	75 %	0 %	0 %	360036582
44925	NC_016445	CTTGG	2	10	2357408	2357417	0 %	40 %	40 %	20 %	360036582
44926	NC_016445	CTT	2	6	2357460	2357465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036582
44927	NC_016445	AGCGC	2	10	2357510	2357519	20 %	0 %	40 %	40 %	360036582
44928	NC_016445	GGGC	2	8	2357570	2357577	0 %	0 %	75 %	25 %	360036582
44929	NC_016445	TGA	2	6	2357717	2357722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036582
44930	NC_016445	TGA	2	6	2357747	2357752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036582
44931	NC_016445	TCT	2	6	2357773	2357778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036582
44932	NC_016445	CAT	2	6	2357784	2357789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036582
44933	NC_016445	GC	3	6	2357855	2357860	0 %	0 %	50 %	50 %	360036582
44934	NC_016445	TCT	2	6	2357863	2357868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036582
44935	NC_016445	CG	4	8	2357904	2357911	0 %	0 %	50 %	50 %	360036582
44936	NC_016445	TGG	2	6	2357952	2357957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036582
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44940	NC_016445	GCG	2	6	2358083	2358088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036582
44941	NC_016445	TCT	2	6	2358094	2358099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036582
44942	NC_016445	GCA	2	6	2358125	2358130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036582
44943	NC_016445	CT	3	6	2358172	2358177	0 %	50 %	0 %	50 %	360036582
44944	NC_016445	ACT	2	6	2358219	2358224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036582
44945	NC_016445	TCA	2	6	2358236	2358241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036582
44946	NC_016445	CTG	2	6	2358420	2358425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036582
44947	NC_016445	GCA	2	6	2358434	2358439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036582
44948	NC_016445	GTA	2	6	2358459	2358464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036582
44949	NC_016445	AG	3	6	2358490	2358495	50 %	0 %	50 %	0 %	360036582
44950	NC_016445	CG	3	6	2358565	2358570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44951	NC_016445	AGTT	2	8	2358606	2358613	25 %	50 %	25 %	0 %	360036583
44952	NC_016445	GGC	2	6	2358614	2358619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036583
44953	NC_016445	AACA	2	8	2358632	2358639	75 %	0 %	0 %	25 %	360036583
44954	NC_016445	ACG	2	6	2358701	2358706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036583
44955	NC_016445	TCA	2	6	2358772	2358777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036583
44956	NC_016445	CG	3	6	2358784	2358789	0 %	0 %	50 %	50 %	360036583
44957	NC_016445	AGTG	2	8	2358845	2358852	25 %	25 %	50 %	0 %	360036583
44958	NC_016445	CAC	2	6	2358865	2358870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036583
44959	NC_016445	ATG	2	6	2358918	2358923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036583
44960	NC_016445	TCT	2	6	2358927	2358932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036583
44961	NC_016445	GGC	2	6	2358964	2358969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036583
44962	NC_016445	ATC	2	6	2359028	2359033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036583
44963	NC_016445	TGT	2	6	2359105	2359110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036583
44964	NC_016445	GAC	3	9	2359123	2359131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036583
44965	NC_016445	CG	3	6	2359192	2359197	0 %	0 %	50 %	50 %	360036583
44966	NC_016445	CAG	2	6	2359199	2359204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036583
44967	NC_016445	AGC	2	6	2359272	2359277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036583
44968	NC_016445	GC	3	6	2359286	2359291	0 %	0 %	50 %	50 %	360036583
44969	NC_016445	ATC	3	9	2359292	2359300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036583
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44972	NC_016445	GC	5	10	2359569	2359578	0 %	0 %	50 %	50 %	360036584
44973	NC_016445	AATC	2	8	2359587	2359594	50 %	25 %	0 %	25 %	360036584
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44999	NC_016445	CG	3	6	2360769	2360774	0 %	0 %	50 %	50 %	360036585
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