MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_016445	CGC	2	6	2255145	2255150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036486
43002	NC_016445	CACG	2	8	2255153	2255160	25 %	0 %	25 %	50 %	360036486
43003	NC_016445	CGC	2	6	2255220	2255225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036486
43004	NC_016445	T	6	6	2255352	2255357	0 %	100 %	0 %	0 %	360036486
43005	NC_016445	GCG	2	6	2255373	2255378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036486
43006	NC_016445	CCG	2	6	2255390	2255395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036486
43007	NC_016445	AAT	2	6	2255546	2255551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036487
43008	NC_016445	CGC	2	6	2255571	2255576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036487
43009	NC_016445	GAT	2	6	2255592	2255597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036487
43010	NC_016445	TCT	2	6	2255608	2255613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036487
43011	NC_016445	GCC	2	6	2255632	2255637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036487
43012	NC_016445	CAA	2	6	2255708	2255713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036487
43013	NC_016445	CTT	2	6	2255879	2255884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036487
43014	NC_016445	T	6	6	2255940	2255945	0 %	100 %	0 %	0 %	360036487
43015	NC_016445	AATC	2	8	2255978	2255985	50 %	25 %	0 %	25 %	360036487
43016	NC_016445	CATCGG	2	12	2256029	2256040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360036487
43017	NC_016445	CGC	2	6	2256044	2256049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036487
43018	NC_016445	CAT	2	6	2256096	2256101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036487
43019	NC_016445	A	6	6	2256103	2256108	100 %	0 %	0 %	0 %	360036487
43020	NC_016445	GTT	2	6	2256195	2256200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036487
43021	NC_016445	ATT	2	6	2256225	2256230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036487
43022	NC_016445	CACC	2	8	2256353	2256360	25 %	0 %	0 %	75 %	360036487
43023	NC_016445	TCA	2	6	2256373	2256378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036487
43024	NC_016445	ATG	2	6	2256461	2256466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036487
43025	NC_016445	AAC	2	6	2256534	2256539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036487
43026	NC_016445	CTCC	2	8	2256551	2256558	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43027	NC_016445	CTT	2	6	2256726	2256731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036488
43028	NC_016445	TTG	2	6	2256739	2256744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036488
43029	NC_016445	TGA	3	9	2256747	2256755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036488
43030	NC_016445	GA	3	6	2256754	2256759	50 %	0 %	50 %	0 %	360036488
43031	NC_016445	CCA	2	6	2256789	2256794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036488
43032	NC_016445	TGAT	2	8	2256920	2256927	25 %	50 %	25 %	0 %	360036488
43033	NC_016445	GC	3	6	2256941	2256946	0 %	0 %	50 %	50 %	360036488
43034	NC_016445	CCAG	2	8	2256971	2256978	25 %	0 %	25 %	50 %	360036488
43035	NC_016445	CGA	2	6	2256993	2256998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036488
43036	NC_016445	GA	3	6	2257129	2257134	50 %	0 %	50 %	0 %	360036488
43037	NC_016445	AGT	2	6	2257232	2257237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036488
43038	NC_016445	CA	3	6	2257251	2257256	50 %	0 %	0 %	50 %	360036488
43039	NC_016445	CACCTT	2	12	2257302	2257313	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	360036488
43040	NC_016445	CAT	2	6	2257324	2257329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036488
43041	NC_016445	TGCAG	2	10	2257361	2257370	20 %	20 %	40 %	20 %	360036488
43042	NC_016445	ACC	2	6	2257441	2257446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036488
43043	NC_016445	AAAG	2	8	2257459	2257466	75 %	0 %	25 %	0 %	360036488
43044	NC_016445	AAT	2	6	2257495	2257500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036488
43045	NC_016445	ACG	2	6	2257537	2257542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036488
43046	NC_016445	A	6	6	2257588	2257593	100 %	0 %	0 %	0 %	360036488
43047	NC_016445	T	6	6	2257624	2257629	0 %	100 %	0 %	0 %	360036488
43048	NC_016445	GGT	2	6	2257693	2257698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036488
43049	NC_016445	CTG	2	6	2257780	2257785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036488
43050	NC_016445	TCA	2	6	2257856	2257861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036488
43051	NC_016445	TTC	2	6	2257938	2257943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43052	NC_016445	GCA	2	6	2257989	2257994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43053	NC_016445	ATTT	2	8	2258005	2258012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43054	NC_016445	CAC	2	6	2258067	2258072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43055	NC_016445	A	6	6	2258092	2258097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_016445	ATT	2	6	2258099	2258104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43057	NC_016445	GCA	2	6	2258148	2258153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43058	NC_016445	A	7	7	2258239	2258245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43059	NC_016445	CAGT	2	8	2258253	2258260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43060	NC_016445	A	6	6	2258307	2258312	100 %	0 %	0 %	0 %	360036489
43061	NC_016445	CAA	2	6	2258318	2258323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036489
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43063	NC_016445	TGC	2	6	2258416	2258421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036489
43064	NC_016445	CATG	2	8	2258572	2258579	25 %	25 %	25 %	25 %	360036489
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43066	NC_016445	AAAC	2	8	2258637	2258644	75 %	0 %	0 %	25 %	360036489
43067	NC_016445	CGC	2	6	2258681	2258686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036489
43068	NC_016445	GC	3	6	2258752	2258757	0 %	0 %	50 %	50 %	360036489
43069	NC_016445	GATC	2	8	2258770	2258777	25 %	25 %	25 %	25 %	360036489
43070	NC_016445	TCA	2	6	2258778	2258783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036489
43071	NC_016445	GTAA	2	8	2258837	2258844	50 %	25 %	25 %	0 %	360036489
43072	NC_016445	ATC	2	6	2258862	2258867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036489
43073	NC_016445	GCAT	2	8	2258872	2258879	25 %	25 %	25 %	25 %	360036489
43074	NC_016445	GCA	2	6	2258916	2258921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43076	NC_016445	T	6	6	2258982	2258987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43077	NC_016445	TC	3	6	2259002	2259007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43078	NC_016445	CA	3	6	2259118	2259123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43079	NC_016445	A	7	7	2259180	2259186	100 %	0 %	0 %	0 %	360036490
43080	NC_016445	A	6	6	2259257	2259262	100 %	0 %	0 %	0 %	360036490
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43090	NC_016445	TTACCC	2	12	2259917	2259928	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	360036490
43091	NC_016445	ATC	2	6	2259942	2259947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036490
43092	NC_016445	ATTCC	2	10	2259987	2259996	20 %	40 %	0 %	40 %	360036490
43093	NC_016445	ATG	2	6	2260023	2260028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036490
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43102	NC_016445	GAA	2	6	2260377	2260382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036490
43103	NC_016445	AACC	2	8	2260448	2260455	50 %	0 %	0 %	50 %	360036490
43104	NC_016445	GCA	2	6	2260516	2260521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036490
43105	NC_016445	ACG	2	6	2260528	2260533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036490
43106	NC_016445	CAC	2	6	2260547	2260552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43107	NC_016445	GCGACG	2	12	2260618	2260629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	360036491
43108	NC_016445	ACC	2	6	2260678	2260683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036491
43109	NC_016445	GACT	2	8	2260848	2260855	25 %	25 %	25 %	25 %	360036491
43110	NC_016445	GAT	2	6	2260860	2260865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036491
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43112	NC_016445	TGCG	2	8	2261004	2261011	0 %	25 %	50 %	25 %	360036491
43113	NC_016445	GT	3	6	2261040	2261045	0 %	50 %	50 %	0 %	360036491
43114	NC_016445	CGG	2	6	2261151	2261156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036491
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43117	NC_016445	CAC	2	6	2261434	2261439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036491
43118	NC_016445	GATA	2	8	2261448	2261455	50 %	25 %	25 %	0 %	360036491
43119	NC_016445	GCA	2	6	2261492	2261497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036491
43120	NC_016445	T	6	6	2261545	2261550	0 %	100 %	0 %	0 %	360036491
43121	NC_016445	GTT	2	6	2261617	2261622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036491
43122	NC_016445	TGC	2	6	2261687	2261692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036491
43123	NC_016445	TTG	2	6	2261711	2261716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036491
43124	NC_016445	CAC	2	6	2261748	2261753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036491
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43130	NC_016445	TGC	2	6	2262110	2262115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036491
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43134	NC_016445	AGTC	2	8	2262511	2262518	25 %	25 %	25 %	25 %	360036491
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43147	NC_016445	TCATC	2	10	2263370	2263379	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43148	NC_016445	GCG	2	6	2263438	2263443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43149	NC_016445	GAG	2	6	2263459	2263464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43150	NC_016445	AAG	2	6	2263466	2263471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43151	NC_016445	AAG	2	6	2263516	2263521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036492
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43157	NC_016445	TAGC	2	8	2263969	2263976	25 %	25 %	25 %	25 %	360036492
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43160	NC_016445	CA	3	6	2264326	2264331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43161	NC_016445	A	6	6	2264363	2264368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43179	NC_016445	ACAAA	2	10	2265476	2265485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43180	NC_016445	CAC	2	6	2265583	2265588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036494
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43182	NC_016445	ATC	2	6	2265607	2265612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036494
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43189	NC_016445	GC	4	8	2266076	2266083	0 %	0 %	50 %	50 %	360036494
43190	NC_016445	CCG	2	6	2266137	2266142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036494
43191	NC_016445	CGC	2	6	2266159	2266164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036494
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43197	NC_016445	AAATC	2	10	2266534	2266543	60 %	20 %	0 %	20 %	360036495
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43200	NC_016445	TGA	2	6	2266624	2266629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036495
43201	NC_016445	ATG	2	6	2266710	2266715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036495
43202	NC_016445	GC	3	6	2266792	2266797	0 %	0 %	50 %	50 %	360036495
43203	NC_016445	CAC	2	6	2266844	2266849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036495
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43206	NC_016445	ATGG	2	8	2266914	2266921	25 %	25 %	50 %	0 %	360036495
43207	NC_016445	GCC	2	6	2266985	2266990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43208	NC_016445	CCA	2	6	2267049	2267054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43209	NC_016445	GTG	2	6	2267208	2267213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036496
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43213	NC_016445	T	6	6	2267519	2267524	0 %	100 %	0 %	0 %	360036496
43214	NC_016445	CATCG	2	10	2267588	2267597	20 %	20 %	20 %	40 %	360036496
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43218	NC_016445	AG	3	6	2268047	2268052	50 %	0 %	50 %	0 %	360036497
43219	NC_016445	TGG	2	6	2268082	2268087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036497
43220	NC_016445	TCG	2	6	2268171	2268176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036497
43221	NC_016445	CGC	2	6	2268209	2268214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036497
43222	NC_016445	GTG	2	6	2268235	2268240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036497
43223	NC_016445	TCA	2	6	2268255	2268260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036497
43224	NC_016445	CGC	2	6	2268341	2268346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036497
43225	NC_016445	CTA	2	6	2268358	2268363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036497
43226	NC_016445	GTT	2	6	2268365	2268370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036497
43227	NC_016445	GCA	2	6	2268406	2268411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036497
43228	NC_016445	CCA	2	6	2268418	2268423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036497
43229	NC_016445	ACG	2	6	2268438	2268443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036497
43230	NC_016445	CCA	2	6	2268484	2268489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036497
43231	NC_016445	ATC	2	6	2268512	2268517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036497
43232	NC_016445	CAG	2	6	2268683	2268688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036497
43233	NC_016445	CCA	2	6	2268689	2268694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036497
43234	NC_016445	CAA	3	9	2268710	2268718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036497
43235	NC_016445	CAA	2	6	2268757	2268762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036497
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43237	NC_016445	TCT	2	6	2268835	2268840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036497
43238	NC_016445	TAA	2	6	2268986	2268991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036497
43239	NC_016445	CAC	2	6	2269022	2269027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036497
43240	NC_016445	AG	3	6	2269097	2269102	50 %	0 %	50 %	0 %	360036497
43241	NC_016445	CAT	2	6	2269111	2269116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036497
43242	NC_016445	CG	3	6	2269158	2269163	0 %	0 %	50 %	50 %	360036497
43243	NC_016445	ACA	2	6	2269219	2269224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036497
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43247	NC_016445	T	6	6	2269619	2269624	0 %	100 %	0 %	0 %	360036498
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43273	NC_016445	ACATT	2	10	2270612	2270621	40 %	40 %	0 %	20 %	360036499
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43336	NC_016445	TGAC	2	8	2273850	2273857	25 %	25 %	25 %	25 %	360036502
43337	NC_016445	A	6	6	2273903	2273908	100 %	0 %	0 %	0 %	360036502
43338	NC_016445	CAC	2	6	2274097	2274102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036502
43339	NC_016445	GCA	2	6	2274111	2274116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036502
43340	NC_016445	TG	3	6	2274166	2274171	0 %	50 %	50 %	0 %	360036503
43341	NC_016445	AGCG	2	8	2274331	2274338	25 %	0 %	50 %	25 %	360036503
43342	NC_016445	ATCTTG	2	12	2274381	2274392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	360036503
43343	NC_016445	TGC	2	6	2274462	2274467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036503
43344	NC_016445	CCA	2	6	2274475	2274480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036503
43345	NC_016445	TTC	3	9	2274509	2274517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036503
43346	NC_016445	CTG	2	6	2274539	2274544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036503
43347	NC_016445	TGT	2	6	2274561	2274566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036503
43348	NC_016445	TTG	2	6	2274587	2274592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036503
43349	NC_016445	CTG	2	6	2274622	2274627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036503
43350	NC_016445	CCAA	2	8	2274752	2274759	50 %	0 %	0 %	50 %	360036504
43351	NC_016445	CGG	3	9	2274782	2274790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036504
43352	NC_016445	GCGTTT	2	12	2274819	2274830	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	360036504
43353	NC_016445	GAT	2	6	2275055	2275060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036504
43354	NC_016445	T	6	6	2275133	2275138	0 %	100 %	0 %	0 %	360036504
43355	NC_016445	CCA	2	6	2275181	2275186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036504
43356	NC_016445	CAA	2	6	2275236	2275241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036504
43357	NC_016445	CATC	2	8	2275256	2275263	25 %	25 %	0 %	50 %	360036504
43358	NC_016445	T	6	6	2275284	2275289	0 %	100 %	0 %	0 %	360036504
43359	NC_016445	T	6	6	2275320	2275325	0 %	100 %	0 %	0 %	360036504
43360	NC_016445	GTC	2	6	2275345	2275350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036504
43361	NC_016445	TGC	3	9	2275352	2275360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036504
43362	NC_016445	T	6	6	2275370	2275375	0 %	100 %	0 %	0 %	360036504
43363	NC_016445	GCT	2	6	2275466	2275471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036504
43364	NC_016445	CTAT	2	8	2275480	2275487	25 %	50 %	0 %	25 %	360036504
43365	NC_016445	T	6	6	2275561	2275566	0 %	100 %	0 %	0 %	360036504
43366	NC_016445	CTC	2	6	2275644	2275649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036504
43367	NC_016445	TGG	2	6	2275708	2275713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036504
43368	NC_016445	AATA	2	8	2275797	2275804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43369	NC_016445	GAT	2	6	2275809	2275814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43370	NC_016445	TTA	2	6	2275909	2275914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036505
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43384	NC_016445	TGC	2	6	2276633	2276638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036505
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43416	NC_016445	ATTCG	2	10	2278427	2278436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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43462	NC_016445	TGC	2	6	2281476	2281481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036508
43463	NC_016445	GAT	2	6	2281525	2281530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036508
43464	NC_016445	GAT	2	6	2281693	2281698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036508
43465	NC_016445	TTCT	2	8	2281755	2281762	0 %	75 %	0 %	25 %	360036509
43466	NC_016445	T	6	6	2281797	2281802	0 %	100 %	0 %	0 %	360036509
43467	NC_016445	CAT	2	6	2281872	2281877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43468	NC_016445	GTT	2	6	2281920	2281925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43469	NC_016445	A	7	7	2282003	2282009	100 %	0 %	0 %	0 %	360036510
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43471	NC_016445	A	6	6	2282255	2282260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43475	NC_016445	T	6	6	2282367	2282372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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