MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_016445	A	7	7	2229853	2229859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42502	NC_016445	TCGGG	2	10	2229871	2229880	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42503	NC_016445	ACC	2	6	2229908	2229913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42504	NC_016445	T	8	8	2229915	2229922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42505	NC_016445	A	6	6	2229935	2229940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42506	NC_016445	AAT	2	6	2229955	2229960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42507	NC_016445	GCC	2	6	2229965	2229970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42508	NC_016445	AG	3	6	2229984	2229989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42509	NC_016445	GAC	2	6	2230053	2230058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036457
42510	NC_016445	GTT	2	6	2230096	2230101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036457
42511	NC_016445	CAA	2	6	2230179	2230184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036457
42512	NC_016445	AAC	2	6	2230210	2230215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036457
42513	NC_016445	GCCT	2	8	2230254	2230261	0 %	25 %	25 %	50 %	360036458
42514	NC_016445	CTG	2	6	2230323	2230328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036458
42515	NC_016445	T	6	6	2230412	2230417	0 %	100 %	0 %	0 %	360036458
42516	NC_016445	TCA	2	6	2230436	2230441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036458
42517	NC_016445	TTC	2	6	2230517	2230522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036459
42518	NC_016445	AC	3	6	2230648	2230653	50 %	0 %	0 %	50 %	360036459
42519	NC_016445	ACG	2	6	2230697	2230702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036459
42520	NC_016445	GAC	2	6	2230729	2230734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036459
42521	NC_016445	CTTA	2	8	2230860	2230867	25 %	50 %	0 %	25 %	360036460
42522	NC_016445	GCT	2	6	2230878	2230883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036460
42523	NC_016445	TGC	2	6	2230921	2230926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036460
42524	NC_016445	GGT	2	6	2230987	2230992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036460
42525	NC_016445	GAA	2	6	2231000	2231005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036460
42526	NC_016445	GT	3	6	2231033	2231038	0 %	50 %	50 %	0 %	360036460
42527	NC_016445	GCC	2	6	2231086	2231091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036460
42528	NC_016445	GC	3	6	2231153	2231158	0 %	0 %	50 %	50 %	360036460
42529	NC_016445	ACG	2	6	2231167	2231172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036460
42530	NC_016445	CTG	2	6	2231292	2231297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036460
42531	NC_016445	AAC	2	6	2231335	2231340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036460
42532	NC_016445	ATA	2	6	2231658	2231663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036461
42533	NC_016445	TCG	2	6	2231712	2231717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036461
42534	NC_016445	T	6	6	2231789	2231794	0 %	100 %	0 %	0 %	360036461
42535	NC_016445	GAG	2	6	2231872	2231877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360036461
42536	NC_016445	ATT	2	6	2231913	2231918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036461
42537	NC_016445	TCT	2	6	2231930	2231935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036462
42538	NC_016445	ATC	2	6	2232004	2232009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036462
42539	NC_016445	GAC	2	6	2232038	2232043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036462
42540	NC_016445	TTG	2	6	2232074	2232079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036462
42541	NC_016445	ACG	2	6	2232093	2232098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036462
42542	NC_016445	CTT	2	6	2232150	2232155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036462
42543	NC_016445	GA	3	6	2232189	2232194	50 %	0 %	50 %	0 %	360036462
42544	NC_016445	TTA	2	6	2232228	2232233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036463
42545	NC_016445	CGA	2	6	2232234	2232239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42546	NC_016445	TAC	2	6	2232268	2232273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036463
42547	NC_016445	TTGG	2	8	2232288	2232295	0 %	50 %	50 %	0 %	360036463
42548	NC_016445	GAC	2	6	2232319	2232324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42549	NC_016445	CAC	3	9	2232343	2232351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036463
42550	NC_016445	GTGG	2	8	2232355	2232362	0 %	25 %	75 %	0 %	360036463
42551	NC_016445	TGC	2	6	2232416	2232421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42552	NC_016445	GCA	2	6	2232442	2232447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42553	NC_016445	ACGTAG	2	12	2232518	2232529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360036463
42554	NC_016445	CAA	2	6	2232553	2232558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036463
42555	NC_016445	CAG	2	6	2232574	2232579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42556	NC_016445	TTG	2	6	2232628	2232633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036463
42557	NC_016445	GCATTG	2	12	2232652	2232663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360036463
42558	NC_016445	ATG	2	6	2232735	2232740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036463
42559	NC_016445	ACG	2	6	2232743	2232748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42560	NC_016445	CCA	2	6	2232879	2232884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036463
42561	NC_016445	GTT	3	9	2232911	2232919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036463
42562	NC_016445	ACC	2	6	2232923	2232928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036463
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42564	NC_016445	AAC	2	6	2232989	2232994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036463
42565	NC_016445	AAC	2	6	2232998	2233003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036463
42566	NC_016445	GAC	3	9	2233006	2233014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036463
42567	NC_016445	ACT	2	6	2233055	2233060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42568	NC_016445	CGC	2	6	2233073	2233078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036464
42569	NC_016445	TTCA	2	8	2233101	2233108	25 %	50 %	0 %	25 %	360036464
42570	NC_016445	T	6	6	2233122	2233127	0 %	100 %	0 %	0 %	360036464
42571	NC_016445	ACG	2	6	2233137	2233142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036464
42572	NC_016445	TGA	2	6	2233178	2233183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036464
42573	NC_016445	AACTTC	2	12	2233203	2233214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036464
42574	NC_016445	GCT	2	6	2233231	2233236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036464
42575	NC_016445	TCTT	2	8	2233243	2233250	0 %	75 %	0 %	25 %	360036464
42576	NC_016445	CAG	2	6	2233295	2233300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036464
42577	NC_016445	TAG	2	6	2233344	2233349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036464
42578	NC_016445	GCA	3	9	2233395	2233403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036465
42579	NC_016445	CACG	2	8	2233459	2233466	25 %	0 %	25 %	50 %	360036465
42580	NC_016445	TAGCT	2	10	2233556	2233565	20 %	40 %	20 %	20 %	360036465
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42582	NC_016445	CAGA	2	8	2233639	2233646	50 %	0 %	25 %	25 %	360036465
42583	NC_016445	CAC	2	6	2233660	2233665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036465
42584	NC_016445	GCA	2	6	2233710	2233715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036465
42585	NC_016445	ACC	2	6	2233724	2233729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036465
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42588	NC_016445	AGT	2	6	2233916	2233921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036465
42589	NC_016445	TTAC	2	8	2233966	2233973	25 %	50 %	0 %	25 %	360036465
42590	NC_016445	T	7	7	2234132	2234138	0 %	100 %	0 %	0 %	360036466
42591	NC_016445	T	7	7	2234295	2234301	0 %	100 %	0 %	0 %	360036466
42592	NC_016445	CAGT	2	8	2234321	2234328	25 %	25 %	25 %	25 %	360036466
42593	NC_016445	AGT	2	6	2234457	2234462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036466
42594	NC_016445	CTTCAA	2	12	2234522	2234533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036466
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42596	NC_016445	GCA	2	6	2234658	2234663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036467
42597	NC_016445	GA	3	6	2234776	2234781	50 %	0 %	50 %	0 %	360036467
42598	NC_016445	CGGATA	2	12	2234913	2234924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360036467
42599	NC_016445	A	6	6	2234958	2234963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42600	NC_016445	ACAA	2	8	2234968	2234975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42601	NC_016445	GA	3	6	2235001	2235006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42602	NC_016445	GATT	2	8	2235012	2235019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42603	NC_016445	TAG	2	6	2235093	2235098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42604	NC_016445	TTA	2	6	2235111	2235116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42605	NC_016445	CTC	2	6	2235171	2235176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42606	NC_016445	ATGC	2	8	2235306	2235313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42607	NC_016445	GAT	2	6	2235351	2235356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42608	NC_016445	GAT	2	6	2235390	2235395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42609	NC_016445	CTGC	2	8	2235488	2235495	0 %	25 %	25 %	50 %	360036468
42610	NC_016445	AATCA	2	10	2235508	2235517	60 %	20 %	0 %	20 %	360036468
42611	NC_016445	ACG	2	6	2235538	2235543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036468
42612	NC_016445	GATA	2	8	2235600	2235607	50 %	25 %	25 %	0 %	360036468
42613	NC_016445	GC	3	6	2235662	2235667	0 %	0 %	50 %	50 %	360036468
42614	NC_016445	CCG	2	6	2235711	2235716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036468
42615	NC_016445	GTG	2	6	2235750	2235755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036468
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42617	NC_016445	AAC	2	6	2235857	2235862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036468
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42732	NC_016445	ACC	2	6	2241442	2241447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42852	NC_016445	CAT	2	6	2247388	2247393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42853	NC_016445	CTA	2	6	2247435	2247440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036478
42854	NC_016445	T	7	7	2247473	2247479	0 %	100 %	0 %	0 %	360036478
42855	NC_016445	GGC	2	6	2247513	2247518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036478
42856	NC_016445	CCA	2	6	2247544	2247549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036478
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42858	NC_016445	CTG	2	6	2247615	2247620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036478
42859	NC_016445	GGT	2	6	2247840	2247845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036478
42860	NC_016445	TCGCGC	2	12	2247854	2247865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	360036478
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42862	NC_016445	CTG	2	6	2247990	2247995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036478
42863	NC_016445	CGA	2	6	2247998	2248003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036478
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42865	NC_016445	TTGGAT	2	12	2248017	2248028	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360036478
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42867	NC_016445	ACT	2	6	2248168	2248173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036478
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42869	NC_016445	GC	4	8	2248190	2248197	0 %	0 %	50 %	50 %	360036478
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42871	NC_016445	CAA	2	6	2248233	2248238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036478
42872	NC_016445	TGC	2	6	2248345	2248350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036478
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42874	NC_016445	GCA	2	6	2248622	2248627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036478
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42876	NC_016445	CGC	2	6	2248657	2248662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036478
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42878	NC_016445	ACT	2	6	2248714	2248719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036478
42879	NC_016445	GTG	2	6	2248777	2248782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036478
42880	NC_016445	TG	3	6	2248811	2248816	0 %	50 %	50 %	0 %	360036478
42881	NC_016445	CTG	2	6	2248833	2248838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036478
42882	NC_016445	ACCA	2	8	2248851	2248858	50 %	0 %	0 %	50 %	360036478
42883	NC_016445	TTTGGA	2	12	2248859	2248870	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360036478
42884	NC_016445	TGC	2	6	2248945	2248950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036478
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42887	NC_016445	ACT	2	6	2249020	2249025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036478
42888	NC_016445	A	6	6	2249112	2249117	100 %	0 %	0 %	0 %	360036478
42889	NC_016445	AGA	2	6	2249186	2249191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036478
42890	NC_016445	ACTG	2	8	2249279	2249286	25 %	25 %	25 %	25 %	360036478
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42893	NC_016445	AGA	2	6	2249366	2249371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036478
42894	NC_016445	TGA	2	6	2249402	2249407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036479
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42903	NC_016445	CTG	2	6	2249930	2249935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036480
42904	NC_016445	TGC	2	6	2249943	2249948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036480
42905	NC_016445	CACAC	2	10	2250037	2250046	40 %	0 %	0 %	60 %	360036480
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42920	NC_016445	CAG	2	6	2250611	2250616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036480
42921	NC_016445	ATC	2	6	2250662	2250667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036480
42922	NC_016445	GTTT	2	8	2250741	2250748	0 %	75 %	25 %	0 %	360036480
42923	NC_016445	GGC	2	6	2250755	2250760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036480
42924	NC_016445	GAT	2	6	2250845	2250850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036480
42925	NC_016445	ATTC	2	8	2250875	2250882	25 %	50 %	0 %	25 %	360036481
42926	NC_016445	TCG	2	6	2250927	2250932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036481
42927	NC_016445	TTTC	2	8	2250933	2250940	0 %	75 %	0 %	25 %	360036481
42928	NC_016445	CAT	2	6	2250973	2250978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036481
42929	NC_016445	TGC	2	6	2251057	2251062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036482
42930	NC_016445	GTAC	2	8	2251119	2251126	25 %	25 %	25 %	25 %	360036482
42931	NC_016445	GAC	2	6	2251215	2251220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42932	NC_016445	TGTCA	2	10	2251298	2251307	20 %	40 %	20 %	20 %	360036483
42933	NC_016445	ATT	2	6	2251320	2251325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036483
42934	NC_016445	TTC	2	6	2251337	2251342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036483
42935	NC_016445	TAC	2	6	2251352	2251357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036483
42936	NC_016445	ACC	2	6	2251359	2251364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036483
42937	NC_016445	ATG	2	6	2251392	2251397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036483
42938	NC_016445	GC	3	6	2251476	2251481	0 %	0 %	50 %	50 %	360036483
42939	NC_016445	GAA	2	6	2251539	2251544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036483
42940	NC_016445	TTC	2	6	2251545	2251550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036483
42941	NC_016445	AC	3	6	2251595	2251600	50 %	0 %	0 %	50 %	360036483
42942	NC_016445	TGA	2	6	2251604	2251609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036483
42943	NC_016445	CGG	2	6	2251700	2251705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036483
42944	NC_016445	TACG	2	8	2251794	2251801	25 %	25 %	25 %	25 %	360036483
42945	NC_016445	GAC	2	6	2251863	2251868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036483
42946	NC_016445	TCA	2	6	2251879	2251884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036483
42947	NC_016445	TACT	2	8	2252031	2252038	25 %	50 %	0 %	25 %	360036483
42948	NC_016445	GAT	2	6	2252042	2252047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036483
42949	NC_016445	TCAT	2	8	2252055	2252062	25 %	50 %	0 %	25 %	360036483
42950	NC_016445	GTG	2	6	2252082	2252087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036483
42951	NC_016445	CAA	2	6	2252139	2252144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036483
42952	NC_016445	TGA	2	6	2252182	2252187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42953	NC_016445	ACT	2	6	2252240	2252245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42954	NC_016445	ATT	2	6	2252408	2252413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42955	NC_016445	TTTC	2	8	2252456	2252463	0 %	75 %	0 %	25 %	360036484
42956	NC_016445	TAC	2	6	2252534	2252539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036484
42957	NC_016445	GAA	2	6	2252576	2252581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036484
42958	NC_016445	GAT	2	6	2252590	2252595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036484
42959	NC_016445	TC	3	6	2252596	2252601	0 %	50 %	0 %	50 %	360036484
42960	NC_016445	GCTTG	2	10	2252632	2252641	0 %	40 %	40 %	20 %	360036484
42961	NC_016445	GAA	2	6	2252645	2252650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036484
42962	NC_016445	TCG	2	6	2252779	2252784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036484
42963	NC_016445	CCAG	2	8	2252796	2252803	25 %	0 %	25 %	50 %	360036484
42964	NC_016445	CTG	2	6	2252855	2252860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036484
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42966	NC_016445	A	6	6	2253074	2253079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42967	NC_016445	ATG	2	6	2253111	2253116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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