MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_016445	AACTG	2	10	2174343	2174352	40 %	20 %	20 %	20 %	360036387
41503	NC_016445	CTT	2	6	2174459	2174464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036388
41504	NC_016445	GCG	2	6	2174631	2174636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036388
41505	NC_016445	CAG	2	6	2174787	2174792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036388
41506	NC_016445	TTCA	2	8	2174811	2174818	25 %	50 %	0 %	25 %	360036388
41507	NC_016445	CTT	2	6	2174834	2174839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036388
41508	NC_016445	GTT	2	6	2174882	2174887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036388
41509	NC_016445	TCA	2	6	2174927	2174932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036388
41510	NC_016445	TGG	2	6	2174957	2174962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036388
41511	NC_016445	GAG	2	6	2175000	2175005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360036388
41512	NC_016445	T	6	6	2175012	2175017	0 %	100 %	0 %	0 %	360036388
41513	NC_016445	CCAC	2	8	2175055	2175062	25 %	0 %	0 %	75 %	360036389
41514	NC_016445	ACC	2	6	2175322	2175327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036389
41515	NC_016445	ATC	2	6	2175442	2175447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036389
41516	NC_016445	TTG	2	6	2175510	2175515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036389
41517	NC_016445	TGA	2	6	2175575	2175580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036390
41518	NC_016445	CA	3	6	2175683	2175688	50 %	0 %	0 %	50 %	360036390
41519	NC_016445	CCAA	2	8	2175783	2175790	50 %	0 %	0 %	50 %	360036390
41520	NC_016445	GCC	2	6	2175794	2175799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036390
41521	NC_016445	ATC	2	6	2175822	2175827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036390
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41523	NC_016445	CAT	2	6	2175899	2175904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036390
41524	NC_016445	GCT	2	6	2175919	2175924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036390
41525	NC_016445	TCA	2	6	2175934	2175939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036390
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41527	NC_016445	CAG	2	6	2175983	2175988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036390
41528	NC_016445	GCA	2	6	2176015	2176020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036390
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41530	NC_016445	GAG	2	6	2176172	2176177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360036390
41531	NC_016445	GCGT	2	8	2176264	2176271	0 %	25 %	50 %	25 %	360036390
41532	NC_016445	CATCA	2	10	2176295	2176304	40 %	20 %	0 %	40 %	360036390
41533	NC_016445	CGC	2	6	2176373	2176378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036391
41534	NC_016445	TTG	2	6	2176386	2176391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036391
41535	NC_016445	TCA	2	6	2176484	2176489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036391
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41538	NC_016445	ATG	2	6	2176612	2176617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036391
41539	NC_016445	GCG	2	6	2176651	2176656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036391
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41544	NC_016445	GC	3	6	2176826	2176831	0 %	0 %	50 %	50 %	360036391
41545	NC_016445	TCT	2	6	2176853	2176858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036391
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41556	NC_016445	AGTG	2	8	2177550	2177557	25 %	25 %	50 %	0 %	360036393
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41558	NC_016445	GAAC	2	8	2177595	2177602	50 %	0 %	25 %	25 %	360036393
41559	NC_016445	TTA	2	6	2177679	2177684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41565	NC_016445	GAT	3	9	2178018	2178026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036394
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41586	NC_016445	CAT	2	6	2179327	2179332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036395
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41601	NC_016445	TGA	2	6	2180052	2180057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036396
41602	NC_016445	GT	5	10	2180096	2180105	0 %	50 %	50 %	0 %	360036396
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41604	NC_016445	TTACG	2	10	2180142	2180151	20 %	40 %	20 %	20 %	360036396
41605	NC_016445	GATTT	2	10	2180191	2180200	20 %	60 %	20 %	0 %	360036396
41606	NC_016445	CTG	2	6	2180271	2180276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036397
41607	NC_016445	CTT	2	6	2180287	2180292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036397
41608	NC_016445	GAC	2	6	2180580	2180585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036397
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41610	NC_016445	AC	3	6	2180715	2180720	50 %	0 %	0 %	50 %	360036397
41611	NC_016445	CT	3	6	2180848	2180853	0 %	50 %	0 %	50 %	360036398
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41614	NC_016445	CTT	2	6	2180925	2180930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036398
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41616	NC_016445	GCA	2	6	2180954	2180959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036398
41617	NC_016445	GAA	2	6	2181016	2181021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036398
41618	NC_016445	ACTG	2	8	2181057	2181064	25 %	25 %	25 %	25 %	360036398
41619	NC_016445	CTA	2	6	2181102	2181107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036398
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41621	NC_016445	TGA	2	6	2181131	2181136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036398
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41623	NC_016445	GCA	2	6	2181179	2181184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036398
41624	NC_016445	TTC	2	6	2181254	2181259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036398
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41627	NC_016445	ACCATT	2	12	2181459	2181470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036399
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41632	NC_016445	GGC	2	6	2181740	2181745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036399
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41634	NC_016445	TCA	2	6	2181856	2181861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036399
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41637	NC_016445	GGAA	2	8	2181935	2181942	50 %	0 %	50 %	0 %	360036399
41638	NC_016445	AAT	2	6	2181960	2181965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036399
41639	NC_016445	AGAGT	2	10	2182018	2182027	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41640	NC_016445	TAACAA	2	12	2182039	2182050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41641	NC_016445	CAG	2	6	2182123	2182128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036400
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41643	NC_016445	CGTA	2	8	2182248	2182255	25 %	25 %	25 %	25 %	360036400
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41645	NC_016445	CG	3	6	2182271	2182276	0 %	0 %	50 %	50 %	360036400
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41682	NC_016445	AAGC	2	8	2184629	2184636	50 %	0 %	25 %	25 %	360036403
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41701	NC_016445	TTA	2	6	2185542	2185547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41702	NC_016445	ATT	2	6	2185581	2185586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41703	NC_016445	CTCAC	2	10	2185639	2185648	20 %	20 %	0 %	60 %	360036405
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41710	NC_016445	GAT	2	6	2185905	2185910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036405
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41716	NC_016445	AGTGA	2	10	2186220	2186229	40 %	20 %	40 %	0 %	360036405
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41718	NC_016445	GAT	2	6	2186402	2186407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036405
41719	NC_016445	GAT	3	9	2186424	2186432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036405
41720	NC_016445	GTC	2	6	2186451	2186456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036405
41721	NC_016445	GC	3	6	2186463	2186468	0 %	0 %	50 %	50 %	360036405
41722	NC_016445	GCC	2	6	2186502	2186507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036405
41723	NC_016445	TGC	2	6	2186510	2186515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036405
41724	NC_016445	GGC	2	6	2186558	2186563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036405
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41726	NC_016445	CCAT	2	8	2186589	2186596	25 %	25 %	0 %	50 %	360036405
41727	NC_016445	GCG	2	6	2186599	2186604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036405
41728	NC_016445	TGA	2	6	2186686	2186691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036405
41729	NC_016445	AAG	2	6	2186692	2186697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036405
41730	NC_016445	ATC	2	6	2186736	2186741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036405
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41732	NC_016445	GAT	2	6	2186801	2186806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036405
41733	NC_016445	GGT	2	6	2186889	2186894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036405
41734	NC_016445	TGC	2	6	2186956	2186961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036405
41735	NC_016445	AGTT	2	8	2186967	2186974	25 %	50 %	25 %	0 %	360036405
41736	NC_016445	TTCA	2	8	2187024	2187031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41737	NC_016445	TCAA	2	8	2187069	2187076	50 %	25 %	0 %	25 %	360036406
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41752	NC_016445	TTA	2	6	2188415	2188420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41830	NC_016445	GAGG	2	8	2192525	2192532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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41833	NC_016445	C	6	6	2192677	2192682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41834	NC_016445	CGC	2	6	2192759	2192764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036411
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41837	NC_016445	TGA	2	6	2192872	2192877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036411
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41840	NC_016445	CAG	2	6	2192979	2192984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036411
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41843	NC_016445	CTGC	2	8	2193064	2193071	0 %	25 %	25 %	50 %	360036411
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41845	NC_016445	TCT	2	6	2193136	2193141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036411
41846	NC_016445	CAC	2	6	2193150	2193155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036411
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41872	NC_016445	AC	3	6	2194334	2194339	50 %	0 %	0 %	50 %	360036413
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41956	NC_016445	CGT	2	6	2200181	2200186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036417
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41958	NC_016445	GAT	2	6	2200224	2200229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036417
41959	NC_016445	ATC	2	6	2200294	2200299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036417
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41964	NC_016445	CT	3	6	2200594	2200599	0 %	50 %	0 %	50 %	360036417
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41995	NC_016445	GA	3	6	2202534	2202539	50 %	0 %	50 %	0 %	360036418
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41997	NC_016445	TGC	2	6	2202787	2202792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41999	NC_016445	CAT	2	6	2202836	2202841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036419
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