MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_016445	AGA	2	6	2119333	2119338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036342
40502	NC_016445	TCT	2	6	2119349	2119354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036342
40503	NC_016445	ATC	2	6	2119476	2119481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036342
40504	NC_016445	TCT	2	6	2119511	2119516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036342
40505	NC_016445	CAC	2	6	2119571	2119576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036342
40506	NC_016445	CTT	2	6	2119592	2119597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036342
40507	NC_016445	CAA	2	6	2119637	2119642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036342
40508	NC_016445	TAA	2	6	2119733	2119738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036342
40509	NC_016445	TGCT	2	8	2119839	2119846	0 %	50 %	25 %	25 %	360036342
40510	NC_016445	TCAA	2	8	2119867	2119874	50 %	25 %	0 %	25 %	360036342
40511	NC_016445	ACT	2	6	2119980	2119985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40512	NC_016445	ATT	2	6	2120028	2120033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40513	NC_016445	GCA	2	6	2120066	2120071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40514	NC_016445	TA	3	6	2120134	2120139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40515	NC_016445	GTG	2	6	2120140	2120145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40516	NC_016445	GAT	2	6	2120215	2120220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40517	NC_016445	T	6	6	2120318	2120323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40518	NC_016445	AAC	2	6	2120335	2120340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40519	NC_016445	GCA	2	6	2120457	2120462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036343
40520	NC_016445	GCTT	2	8	2120471	2120478	0 %	50 %	25 %	25 %	360036343
40521	NC_016445	GCA	2	6	2120565	2120570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036343
40522	NC_016445	TGA	2	6	2120576	2120581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036343
40523	NC_016445	TGA	2	6	2120639	2120644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036343
40524	NC_016445	GTGC	2	8	2120681	2120688	0 %	25 %	50 %	25 %	360036343
40525	NC_016445	TGAT	2	8	2120695	2120702	25 %	50 %	25 %	0 %	360036343
40526	NC_016445	AGA	2	6	2120723	2120728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036343
40527	NC_016445	ACC	2	6	2120743	2120748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036343
40528	NC_016445	TGC	2	6	2120801	2120806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036343
40529	NC_016445	CGG	2	6	2120921	2120926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036343
40530	NC_016445	CAA	2	6	2120933	2120938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036343
40531	NC_016445	TATG	2	8	2120952	2120959	25 %	50 %	25 %	0 %	360036343
40532	NC_016445	TCT	2	6	2121063	2121068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036343
40533	NC_016445	TGGCG	2	10	2121085	2121094	0 %	20 %	60 %	20 %	360036343
40534	NC_016445	TCCA	2	8	2121133	2121140	25 %	25 %	0 %	50 %	360036343
40535	NC_016445	GTG	2	6	2121193	2121198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036343
40536	NC_016445	GCC	2	6	2121214	2121219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036343
40537	NC_016445	GAGCT	2	10	2121256	2121265	20 %	20 %	40 %	20 %	360036343
40538	NC_016445	CG	3	6	2121288	2121293	0 %	0 %	50 %	50 %	360036343
40539	NC_016445	TGTA	2	8	2121327	2121334	25 %	50 %	25 %	0 %	360036343
40540	NC_016445	CTG	2	6	2121355	2121360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036343
40541	NC_016445	CCA	2	6	2121382	2121387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036343
40542	NC_016445	GCG	2	6	2121450	2121455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036343
40543	NC_016445	GTG	2	6	2121466	2121471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036343
40544	NC_016445	CT	3	6	2121575	2121580	0 %	50 %	0 %	50 %	360036343
40545	NC_016445	CAT	2	6	2121620	2121625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036343
40546	NC_016445	TGA	2	6	2121695	2121700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036343
40547	NC_016445	GGT	2	6	2121704	2121709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036343
40548	NC_016445	GCA	2	6	2121713	2121718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036343
40549	NC_016445	CAA	2	6	2121773	2121778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036343
40550	NC_016445	GT	3	6	2121850	2121855	0 %	50 %	50 %	0 %	360036343
40551	NC_016445	CCT	2	6	2121863	2121868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036343
40552	NC_016445	AAAG	2	8	2121927	2121934	75 %	0 %	25 %	0 %	360036343
40553	NC_016445	TACAC	2	10	2121943	2121952	40 %	20 %	0 %	40 %	360036343
40554	NC_016445	AG	3	6	2121977	2121982	50 %	0 %	50 %	0 %	360036343
40555	NC_016445	CGA	2	6	2121988	2121993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036343
40556	NC_016445	CT	3	6	2122016	2122021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40557	NC_016445	TGCCC	2	10	2122148	2122157	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40558	NC_016445	CACCAA	2	12	2122329	2122340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40559	NC_016445	AGA	2	6	2122347	2122352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40560	NC_016445	ATC	2	6	2122396	2122401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40561	NC_016445	AAGG	2	8	2122411	2122418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40562	NC_016445	CCA	2	6	2122470	2122475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036344
40563	NC_016445	GCA	2	6	2122478	2122483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036344
40564	NC_016445	GTC	2	6	2122537	2122542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036344
40565	NC_016445	GTC	2	6	2122564	2122569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036344
40566	NC_016445	ATG	2	6	2122616	2122621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036344
40567	NC_016445	ACG	2	6	2122645	2122650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036344
40568	NC_016445	TTTG	2	8	2122715	2122722	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40569	NC_016445	CAGA	2	8	2122744	2122751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40570	NC_016445	A	6	6	2122790	2122795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40571	NC_016445	T	6	6	2122822	2122827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40572	NC_016445	GTG	2	6	2122833	2122838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40573	NC_016445	AAC	2	6	2122839	2122844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40574	NC_016445	TCTT	2	8	2122877	2122884	0 %	75 %	0 %	25 %	360036345
40575	NC_016445	A	6	6	2122959	2122964	100 %	0 %	0 %	0 %	360036345
40576	NC_016445	AGC	2	6	2123011	2123016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036345
40577	NC_016445	AGGTA	2	10	2123048	2123057	40 %	20 %	40 %	0 %	360036345
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40580	NC_016445	TCT	2	6	2123158	2123163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036345
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40582	NC_016445	GTGA	2	8	2123241	2123248	25 %	25 %	50 %	0 %	360036345
40583	NC_016445	GCTG	2	8	2123308	2123315	0 %	25 %	50 %	25 %	360036345
40584	NC_016445	GTT	2	6	2123503	2123508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036345
40585	NC_016445	GC	3	6	2123558	2123563	0 %	0 %	50 %	50 %	360036345
40586	NC_016445	ACT	2	6	2123663	2123668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036345
40587	NC_016445	GCT	2	6	2123754	2123759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036345
40588	NC_016445	TGA	2	6	2123807	2123812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036345
40589	NC_016445	TCAT	2	8	2123820	2123827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40590	NC_016445	TCA	2	6	2123872	2123877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40591	NC_016445	AC	3	6	2123902	2123907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40592	NC_016445	CAAA	2	8	2123940	2123947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40593	NC_016445	TTAT	2	8	2123955	2123962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40594	NC_016445	ATTAA	2	10	2123972	2123981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40595	NC_016445	GAG	2	6	2124030	2124035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40596	NC_016445	CT	3	6	2124061	2124066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40597	NC_016445	CGCC	2	8	2124136	2124143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40598	NC_016445	T	7	7	2124156	2124162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40599	NC_016445	ATT	2	6	2124166	2124171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40600	NC_016445	GGCT	2	8	2124229	2124236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40601	NC_016445	TCA	2	6	2124250	2124255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40602	NC_016445	AGA	2	6	2124274	2124279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40603	NC_016445	ATTC	2	8	2124327	2124334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40604	NC_016445	AGTA	2	8	2124357	2124364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40605	NC_016445	CCA	2	6	2124374	2124379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40606	NC_016445	AAC	2	6	2124430	2124435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40607	NC_016445	TCAA	2	8	2124616	2124623	50 %	25 %	0 %	25 %	360036346
40608	NC_016445	TTG	2	6	2124737	2124742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40609	NC_016445	ACCA	2	8	2124859	2124866	50 %	0 %	0 %	50 %	360036347
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40611	NC_016445	TCA	2	6	2125001	2125006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036347
40612	NC_016445	TGC	2	6	2125022	2125027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036347
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40615	NC_016445	CAGC	2	8	2125092	2125099	25 %	0 %	25 %	50 %	360036347
40616	NC_016445	CGA	2	6	2125125	2125130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036347
40617	NC_016445	CAA	2	6	2125146	2125151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036347
40618	NC_016445	ACT	2	6	2125199	2125204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036347
40619	NC_016445	CAT	2	6	2125260	2125265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036347
40620	NC_016445	CA	3	6	2125307	2125312	50 %	0 %	0 %	50 %	360036347
40621	NC_016445	GC	3	6	2125378	2125383	0 %	0 %	50 %	50 %	360036347
40622	NC_016445	CCA	2	6	2125419	2125424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036347
40623	NC_016445	TGC	2	6	2125616	2125621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036347
40624	NC_016445	CAA	2	6	2125662	2125667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036347
40625	NC_016445	GCGCG	2	10	2125763	2125772	0 %	0 %	60 %	40 %	360036347
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40627	NC_016445	GCA	2	6	2125803	2125808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036347
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40713	NC_016445	TGA	2	6	2130997	2131002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036353
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40723	NC_016445	TGG	2	6	2131391	2131396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40724	NC_016445	AAC	2	6	2131431	2131436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40725	NC_016445	T	6	6	2131452	2131457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40726	NC_016445	TGCTT	2	10	2131463	2131472	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40727	NC_016445	GGC	2	6	2131516	2131521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40728	NC_016445	GAAC	2	8	2131568	2131575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40729	NC_016445	CAC	2	6	2131637	2131642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036354
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40731	NC_016445	CAA	2	6	2131772	2131777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036354
40732	NC_016445	CCG	2	6	2131796	2131801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036354
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40734	NC_016445	GCT	2	6	2131922	2131927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036354
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40737	NC_016445	TGT	2	6	2132024	2132029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036354
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