MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_016445	ATT	2	6	2092171	2092176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40003	NC_016445	CTT	2	6	2092211	2092216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40004	NC_016445	ATCT	2	8	2092279	2092286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40005	NC_016445	A	6	6	2092309	2092314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40006	NC_016445	TTAC	2	8	2092391	2092398	25 %	50 %	0 %	25 %	360036318
40007	NC_016445	GCA	2	6	2092436	2092441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036318
40008	NC_016445	AG	3	6	2092482	2092487	50 %	0 %	50 %	0 %	360036318
40009	NC_016445	TGA	2	6	2092506	2092511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036318
40010	NC_016445	GGTTG	2	10	2092525	2092534	0 %	40 %	60 %	0 %	360036318
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40012	NC_016445	AGCA	2	8	2092726	2092733	50 %	0 %	25 %	25 %	360036318
40013	NC_016445	GC	3	6	2092767	2092772	0 %	0 %	50 %	50 %	360036318
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40015	NC_016445	GGT	3	9	2092822	2092830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036318
40016	NC_016445	GCTTG	2	10	2092851	2092860	0 %	40 %	40 %	20 %	360036318
40017	NC_016445	ATT	2	6	2092873	2092878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036318
40018	NC_016445	GTTTT	2	10	2092955	2092964	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40019	NC_016445	CT	3	6	2092967	2092972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40020	NC_016445	TCG	2	6	2092977	2092982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40021	NC_016445	CT	3	6	2093085	2093090	0 %	50 %	0 %	50 %	360036319
40022	NC_016445	TACTC	2	10	2093127	2093136	20 %	40 %	0 %	40 %	360036319
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40025	NC_016445	TGT	2	6	2093419	2093424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036319
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40033	NC_016445	TGC	2	6	2093804	2093809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036320
40034	NC_016445	GGC	2	6	2093826	2093831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036320
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40037	NC_016445	CAT	2	6	2094166	2094171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036320
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40039	NC_016445	CT	3	6	2094378	2094383	0 %	50 %	0 %	50 %	360036320
40040	NC_016445	TCGG	2	8	2094386	2094393	0 %	25 %	50 %	25 %	360036320
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40042	NC_016445	TGCCA	2	10	2094455	2094464	20 %	20 %	20 %	40 %	360036320
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40044	NC_016445	C	7	7	2094484	2094490	0 %	0 %	0 %	100 %	360036320
40045	NC_016445	GA	3	6	2094500	2094505	50 %	0 %	50 %	0 %	360036320
40046	NC_016445	AG	3	6	2094508	2094513	50 %	0 %	50 %	0 %	360036320
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40050	NC_016445	GCTT	2	8	2094632	2094639	0 %	50 %	25 %	25 %	360036320
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40052	NC_016445	CA	3	6	2094651	2094656	50 %	0 %	0 %	50 %	360036320
40053	NC_016445	GATT	2	8	2094660	2094667	25 %	50 %	25 %	0 %	360036320
40054	NC_016445	TTCA	2	8	2094784	2094791	25 %	50 %	0 %	25 %	360036320
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40057	NC_016445	GCT	2	6	2094939	2094944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036320
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40063	NC_016445	TCA	2	6	2095088	2095093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036320
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40073	NC_016445	T	6	6	2095441	2095446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40105	NC_016445	CTT	2	6	2096788	2096793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036322
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40108	NC_016445	GCA	2	6	2096904	2096909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036322
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40110	NC_016445	GA	3	6	2096962	2096967	50 %	0 %	50 %	0 %	360036322
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40113	NC_016445	TTCT	2	8	2097296	2097303	0 %	75 %	0 %	25 %	360036322
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40117	NC_016445	CTT	2	6	2097529	2097534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036322
40118	NC_016445	GTT	2	6	2097584	2097589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036322
40119	NC_016445	CAC	2	6	2097601	2097606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036322
40120	NC_016445	TGA	2	6	2097610	2097615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036322
40121	NC_016445	TCA	2	6	2097619	2097624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036322
40122	NC_016445	TCAGC	2	10	2097661	2097670	20 %	20 %	20 %	40 %	360036322
40123	NC_016445	TGC	2	6	2097698	2097703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036322
40124	NC_016445	GCT	3	9	2097705	2097713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036322
40125	NC_016445	CAGC	2	8	2097865	2097872	25 %	0 %	25 %	50 %	360036322
40126	NC_016445	GCT	2	6	2097963	2097968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036322
40127	NC_016445	ACC	2	6	2097983	2097988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036322
40128	NC_016445	GAT	2	6	2098034	2098039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036322
40129	NC_016445	GCT	2	6	2098182	2098187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036323
40130	NC_016445	CTT	2	6	2098301	2098306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036323
40131	NC_016445	CTG	2	6	2098309	2098314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036323
40132	NC_016445	GCA	2	6	2098357	2098362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036323
40133	NC_016445	GTT	2	6	2098364	2098369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036323
40134	NC_016445	ACCA	2	8	2098547	2098554	50 %	0 %	0 %	50 %	360036323
40135	NC_016445	GC	3	6	2098616	2098621	0 %	0 %	50 %	50 %	360036323
40136	NC_016445	ACC	2	6	2098733	2098738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036323
40137	NC_016445	TTC	2	6	2098833	2098838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036323
40138	NC_016445	ACCA	2	8	2098901	2098908	50 %	0 %	0 %	50 %	360036323
40139	NC_016445	CTT	2	6	2098939	2098944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036323
40140	NC_016445	AG	3	6	2098967	2098972	50 %	0 %	50 %	0 %	360036323
40141	NC_016445	CA	3	6	2099005	2099010	50 %	0 %	0 %	50 %	360036323
40142	NC_016445	ATC	2	6	2099015	2099020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036323
40143	NC_016445	TAGA	2	8	2099055	2099062	50 %	25 %	25 %	0 %	360036323
40144	NC_016445	ACAGA	2	10	2099105	2099114	60 %	0 %	20 %	20 %	360036323
40145	NC_016445	AGC	2	6	2099193	2099198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036323
40146	NC_016445	AGT	2	6	2099464	2099469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036323
40147	NC_016445	GTT	2	6	2099522	2099527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036323
40148	NC_016445	TCA	2	6	2099671	2099676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036323
40149	NC_016445	TGC	3	9	2099720	2099728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036323
40150	NC_016445	AG	3	6	2099742	2099747	50 %	0 %	50 %	0 %	360036323
40151	NC_016445	GTC	2	6	2099781	2099786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036323
40152	NC_016445	TCT	2	6	2099826	2099831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40153	NC_016445	GGACG	2	10	2099832	2099841	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40154	NC_016445	T	6	6	2099894	2099899	0 %	100 %	0 %	0 %	360036324
40155	NC_016445	T	6	6	2099901	2099906	0 %	100 %	0 %	0 %	360036324
40156	NC_016445	TCAAA	2	10	2099910	2099919	60 %	20 %	0 %	20 %	360036324
40157	NC_016445	GC	3	6	2099976	2099981	0 %	0 %	50 %	50 %	360036324
40158	NC_016445	T	6	6	2099984	2099989	0 %	100 %	0 %	0 %	360036324
40159	NC_016445	TGC	2	6	2100005	2100010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036324
40160	NC_016445	GATT	2	8	2100037	2100044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40161	NC_016445	TTC	2	6	2100090	2100095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036325
40162	NC_016445	ATCCAC	2	12	2100312	2100323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	360036325
40163	NC_016445	CTT	2	6	2100332	2100337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036325
40164	NC_016445	CTT	2	6	2100353	2100358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036325
40165	NC_016445	AACG	2	8	2100454	2100461	50 %	0 %	25 %	25 %	360036325
40166	NC_016445	GGC	2	6	2100590	2100595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036325
40167	NC_016445	CCA	2	6	2100620	2100625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036325
40168	NC_016445	CCA	2	6	2100743	2100748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036325
40169	NC_016445	TTC	2	6	2100759	2100764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036325
40170	NC_016445	GCG	2	6	2100837	2100842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036325
40171	NC_016445	GTT	2	6	2100857	2100862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036325
40172	NC_016445	TTCAC	2	10	2100947	2100956	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40173	NC_016445	AACAT	2	10	2100997	2101006	60 %	20 %	0 %	20 %	360036326
40174	NC_016445	CG	3	6	2101034	2101039	0 %	0 %	50 %	50 %	360036326
40175	NC_016445	GTT	2	6	2101053	2101058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036326
40176	NC_016445	ATG	3	9	2101078	2101086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036326
40177	NC_016445	CTC	2	6	2101278	2101283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036326
40178	NC_016445	GCT	2	6	2101286	2101291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036326
40179	NC_016445	TCA	2	6	2101388	2101393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036326
40180	NC_016445	CCA	3	9	2101409	2101417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036326
40181	NC_016445	GTTTT	2	10	2101450	2101459	0 %	80 %	20 %	0 %	360036326
40182	NC_016445	TCT	2	6	2101486	2101491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036326
40183	NC_016445	CGGT	2	8	2101499	2101506	0 %	25 %	50 %	25 %	360036326
40184	NC_016445	TGAT	2	8	2101540	2101547	25 %	50 %	25 %	0 %	360036326
40185	NC_016445	TCCCG	2	10	2101675	2101684	0 %	20 %	20 %	60 %	360036326
40186	NC_016445	T	7	7	2101693	2101699	0 %	100 %	0 %	0 %	360036326
40187	NC_016445	GC	4	8	2101735	2101742	0 %	0 %	50 %	50 %	360036326
40188	NC_016445	TGAA	2	8	2101749	2101756	50 %	25 %	25 %	0 %	360036326
40189	NC_016445	TGA	2	6	2101811	2101816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036326
40190	NC_016445	ATC	2	6	2101992	2101997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036326
40191	NC_016445	TCG	2	6	2102017	2102022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036326
40192	NC_016445	TCT	2	6	2102047	2102052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036326
40193	NC_016445	TCT	2	6	2102084	2102089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036326
40194	NC_016445	TGC	2	6	2102106	2102111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036326
40195	NC_016445	CTG	2	6	2102113	2102118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036326
40196	NC_016445	GGATCT	2	12	2102183	2102194	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360036326
40197	NC_016445	TCA	2	6	2102272	2102277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036326
40198	NC_016445	GCG	2	6	2102323	2102328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036326
40199	NC_016445	AAT	2	6	2102352	2102357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036326
40200	NC_016445	CCGCA	2	10	2102358	2102367	20 %	0 %	20 %	60 %	360036326
40201	NC_016445	TCA	2	6	2102383	2102388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036326
40202	NC_016445	CACG	2	8	2102522	2102529	25 %	0 %	25 %	50 %	360036326
40203	NC_016445	GCG	2	6	2102532	2102537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036326
40204	NC_016445	GTT	2	6	2102576	2102581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036326
40205	NC_016445	TTCAC	2	10	2102707	2102716	20 %	40 %	0 %	40 %	360036326
40206	NC_016445	CAC	2	6	2102748	2102753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036326
40207	NC_016445	ATC	2	6	2102763	2102768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036326
40208	NC_016445	CATG	2	8	2102825	2102832	25 %	25 %	25 %	25 %	360036326
40209	NC_016445	CGC	2	6	2102853	2102858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036326
40210	NC_016445	CAC	2	6	2102933	2102938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036326
40211	NC_016445	TGG	2	6	2102939	2102944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036326
40212	NC_016445	GCC	2	6	2102962	2102967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036326
40213	NC_016445	AGC	2	6	2103031	2103036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036326
40214	NC_016445	GGCT	2	8	2103125	2103132	0 %	25 %	50 %	25 %	360036326
40215	NC_016445	TAA	2	6	2103206	2103211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40216	NC_016445	CAAA	2	8	2103272	2103279	75 %	0 %	0 %	25 %	360036327
40217	NC_016445	ACACG	2	10	2103393	2103402	40 %	0 %	20 %	40 %	360036327
40218	NC_016445	AG	3	6	2103429	2103434	50 %	0 %	50 %	0 %	360036327
40219	NC_016445	CTGCGC	2	12	2103452	2103463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	360036327
40220	NC_016445	CTG	2	6	2103495	2103500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036327
40221	NC_016445	ATT	2	6	2103555	2103560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036327
40222	NC_016445	TCA	2	6	2103604	2103609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036327
40223	NC_016445	CAC	2	6	2103624	2103629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036327
40224	NC_016445	CGCTTG	2	12	2103630	2103641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036327
40225	NC_016445	AGA	2	6	2103677	2103682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036327
40226	NC_016445	CG	3	6	2103753	2103758	0 %	0 %	50 %	50 %	360036327
40227	NC_016445	TTC	2	6	2103807	2103812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036327
40228	NC_016445	AGTC	2	8	2103896	2103903	25 %	25 %	25 %	25 %	360036327
40229	NC_016445	GCT	2	6	2103908	2103913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036327
40230	NC_016445	GC	3	6	2103929	2103934	0 %	0 %	50 %	50 %	360036327
40231	NC_016445	GCA	2	6	2103944	2103949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036327
40232	NC_016445	CACT	2	8	2104012	2104019	25 %	25 %	0 %	50 %	360036327
40233	NC_016445	CAA	2	6	2104020	2104025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036327
40234	NC_016445	GCG	2	6	2104110	2104115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036327
40235	NC_016445	CGA	2	6	2104171	2104176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036327
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40352	NC_016445	TGA	2	6	2110594	2110599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40353	NC_016445	TTC	2	6	2110682	2110687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40354	NC_016445	CGC	2	6	2110761	2110766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40355	NC_016445	TCG	2	6	2110811	2110816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036332
40356	NC_016445	GCC	2	6	2110973	2110978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036332
40357	NC_016445	GGC	2	6	2110984	2110989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036332
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40359	NC_016445	GCG	2	6	2111062	2111067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036332
40360	NC_016445	GC	3	6	2111086	2111091	0 %	0 %	50 %	50 %	360036332
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40362	NC_016445	ATG	2	6	2111171	2111176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036333
40363	NC_016445	CG	3	6	2111218	2111223	0 %	0 %	50 %	50 %	360036333
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40370	NC_016445	TG	3	6	2111816	2111821	0 %	50 %	50 %	0 %	360036333
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40384	NC_016445	GC	3	6	2112709	2112714	0 %	0 %	50 %	50 %	360036335
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40421	NC_016445	CCA	2	6	2115074	2115079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036337
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40423	NC_016445	A	6	6	2115266	2115271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40424	NC_016445	CTT	2	6	2115377	2115382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036338
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40454	NC_016445	GGC	2	6	2117188	2117193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40455	NC_016445	ATTC	2	8	2117195	2117202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40456	NC_016445	CAT	2	6	2117239	2117244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40460	NC_016445	CAT	2	6	2117437	2117442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036339
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40465	NC_016445	TG	3	6	2117537	2117542	0 %	50 %	50 %	0 %	360036339
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