MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016445	TGA	2	6	101977	101982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_016445	TTTC	2	8	102034	102041	0 %	75 %	0 %	25 %	360034492
2003	NC_016445	GCC	2	6	102045	102050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034492
2004	NC_016445	GT	3	6	102086	102091	0 %	50 %	50 %	0 %	360034492
2005	NC_016445	GCG	3	9	102114	102122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034492
2006	NC_016445	GC	4	8	102178	102185	0 %	0 %	50 %	50 %	360034492
2007	NC_016445	ACAG	2	8	102204	102211	50 %	0 %	25 %	25 %	360034492
2008	NC_016445	AGC	2	6	102281	102286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034492
2009	NC_016445	A	6	6	102293	102298	100 %	0 %	0 %	0 %	360034492
2010	NC_016445	GC	3	6	102362	102367	0 %	0 %	50 %	50 %	360034492
2011	NC_016445	CGC	2	6	102377	102382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034492
2012	NC_016445	ATG	2	6	102393	102398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034492
2013	NC_016445	CTGC	2	8	102424	102431	0 %	25 %	25 %	50 %	360034492
2014	NC_016445	ACG	2	6	102453	102458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034492
2015	NC_016445	GAT	2	6	102468	102473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034492
2016	NC_016445	CAC	2	6	102535	102540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034492
2017	NC_016445	CGAG	2	8	102580	102587	25 %	0 %	50 %	25 %	360034492
2018	NC_016445	CG	3	6	102633	102638	0 %	0 %	50 %	50 %	360034492
2019	NC_016445	GCG	2	6	102663	102668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034492
2020	NC_016445	ATG	2	6	102813	102818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034492
2021	NC_016445	TAA	4	12	102844	102855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_016445	TAC	2	6	103241	103246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_016445	T	6	6	103370	103375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_016445	GAA	2	6	103381	103386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_016445	TCAAA	2	10	103487	103496	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2026	NC_016445	TCA	2	6	103547	103552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034493
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2029	NC_016445	CAAAAA	2	12	103600	103611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	360034493
2030	NC_016445	ACC	2	6	103691	103696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034493
2031	NC_016445	CTGG	2	8	103716	103723	0 %	25 %	50 %	25 %	360034493
2032	NC_016445	GCA	2	6	103824	103829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034493
2033	NC_016445	TGA	2	6	103911	103916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034493
2034	NC_016445	A	6	6	103975	103980	100 %	0 %	0 %	0 %	360034493
2035	NC_016445	ATC	2	6	103994	103999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034493
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2040	NC_016445	GCAA	2	8	104216	104223	50 %	0 %	25 %	25 %	360034493
2041	NC_016445	AAG	2	6	104225	104230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034493
2042	NC_016445	CAA	2	6	104248	104253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034493
2043	NC_016445	TCCTG	2	10	104261	104270	0 %	40 %	20 %	40 %	360034493
2044	NC_016445	TGA	2	6	104337	104342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034493
2045	NC_016445	AGT	2	6	104358	104363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034493
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2048	NC_016445	A	6	6	104425	104430	100 %	0 %	0 %	0 %	360034493
2049	NC_016445	CGT	2	6	104553	104558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034493
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2053	NC_016445	CTT	2	6	104725	104730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034494
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2057	NC_016445	TTA	2	6	104909	104914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034494
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2063	NC_016445	TGC	2	6	105392	105397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034494
2064	NC_016445	CATC	2	8	105411	105418	25 %	25 %	0 %	50 %	360034494
2065	NC_016445	GA	3	6	105435	105440	50 %	0 %	50 %	0 %	360034494
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2070	NC_016445	CGCT	2	8	105742	105749	0 %	25 %	25 %	50 %	360034494
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2096	NC_016445	TGTT	2	8	107328	107335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_016445	ATGCT	2	10	107349	107358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2098	NC_016445	GTT	2	6	107393	107398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_016445	AT	3	6	107816	107821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_016445	A	7	7	107844	107850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_016445	AAT	2	6	107911	107916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_016445	TTG	2	6	108203	108208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034498
2110	NC_016445	TGA	2	6	108306	108311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034498
2111	NC_016445	GAT	2	6	108337	108342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034498
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2113	NC_016445	CA	3	6	108356	108361	50 %	0 %	0 %	50 %	360034498
2114	NC_016445	CTTT	2	8	108380	108387	0 %	75 %	0 %	25 %	360034498
2115	NC_016445	ATCT	2	8	108413	108420	25 %	50 %	0 %	25 %	360034498
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2123	NC_016445	GAT	2	6	108766	108771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034498
2124	NC_016445	ATC	2	6	108776	108781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034498
2125	NC_016445	CAA	2	6	108912	108917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_016445	CAT	2	6	108984	108989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034499
2127	NC_016445	TGC	2	6	109088	109093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034499
2128	NC_016445	GA	3	6	109133	109138	50 %	0 %	50 %	0 %	360034499
2129	NC_016445	ATCGC	2	10	109182	109191	20 %	20 %	20 %	40 %	360034499
2130	NC_016445	GTG	2	6	109201	109206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034499
2131	NC_016445	AAT	2	6	109331	109336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_016445	GAT	2	6	109346	109351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_016445	TAA	2	6	109355	109360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_016445	ATG	2	6	109555	109560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034500
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2159	NC_016445	AGA	2	6	111157	111162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034501
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2162	NC_016445	CAAA	2	8	111290	111297	75 %	0 %	0 %	25 %	360034502
2163	NC_016445	TCG	2	6	111341	111346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034502
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2166	NC_016445	TAC	2	6	111513	111518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034502
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2224	NC_016445	GCT	2	6	115226	115231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034503
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2229	NC_016445	TGA	2	6	115405	115410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034503
2230	NC_016445	TGC	2	6	115457	115462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034503
2231	NC_016445	GAA	2	6	115476	115481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034503
2232	NC_016445	AACT	2	8	115486	115493	50 %	25 %	0 %	25 %	360034503
2233	NC_016445	AG	3	6	115555	115560	50 %	0 %	50 %	0 %	360034504
2234	NC_016445	GCC	2	6	115570	115575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034504
2235	NC_016445	GCC	2	6	115780	115785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034504
2236	NC_016445	CAGC	2	8	115802	115809	25 %	0 %	25 %	50 %	360034504
2237	NC_016445	TGA	2	6	115899	115904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034504
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2239	NC_016445	ATT	2	6	116026	116031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034504
2240	NC_016445	TCA	2	6	116074	116079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034504
2241	NC_016445	TGA	2	6	116100	116105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034504
2242	NC_016445	CGC	2	6	116216	116221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034504
2243	NC_016445	GGT	2	6	116226	116231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034504
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2245	NC_016445	CAA	2	6	116324	116329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034504
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2368	NC_016445	ACC	2	6	123587	123592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034506
2369	NC_016445	AAT	2	6	123630	123635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034506
2370	NC_016445	A	6	6	123649	123654	100 %	0 %	0 %	0 %	360034506
2371	NC_016445	TTG	2	6	123681	123686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2372	NC_016445	GAT	2	6	123693	123698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034507
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2374	NC_016445	ATT	2	6	123761	123766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034507
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2391	NC_016445	TTGG	2	8	124710	124717	0 %	50 %	50 %	0 %	360034508
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2393	NC_016445	TG	3	6	124967	124972	0 %	50 %	50 %	0 %	360034508
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2399	NC_016445	TGG	2	6	125338	125343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_016445	AAC	2	6	125395	125400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2441	NC_016445	CTGA	2	8	127741	127748	25 %	25 %	25 %	25 %	360034510
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2479	NC_016445	GCTC	2	8	129519	129526	0 %	25 %	25 %	50 %	360034511
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2488	NC_016445	TGC	2	6	129978	129983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034511
2489	NC_016445	AGA	2	6	129999	130004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034511
2490	NC_016445	AGCA	2	8	130019	130026	50 %	0 %	25 %	25 %	360034511
2491	NC_016445	ATT	2	6	130067	130072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034512
2492	NC_016445	GT	3	6	130080	130085	0 %	50 %	50 %	0 %	360034512
2493	NC_016445	ATTGG	2	10	130167	130176	20 %	40 %	40 %	0 %	360034512
2494	NC_016445	T	6	6	130243	130248	0 %	100 %	0 %	0 %	360034512
2495	NC_016445	TG	3	6	130312	130317	0 %	50 %	50 %	0 %	360034512
2496	NC_016445	AGA	2	6	130321	130326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034512
2497	NC_016445	T	6	6	130340	130345	0 %	100 %	0 %	0 %	360034512
2498	NC_016445	TGT	2	6	130350	130355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034512
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2500	NC_016445	AAG	2	6	130457	130462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034512

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